Gambusia affinis (western mosquitofish): 122835563
Help
Entry
122835563 CDS
T07758
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: mucin-2-like
KO
K22023
mucin-6/19
Organism
gaf
Gambusia affinis (western mosquitofish)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gaf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
gaf04131
]
122835563
Membrane trafficking [BR:
gaf04131
]
Others
Mucins
Secretory mucins
122835563
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VWD
C8
Mucin2_WxxW
TIL
VWF
VWC
Mucin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122835563
NCBI-ProteinID:
XP_043980657
LinkDB
All DBs
Position
LG08:6988600..7006044
Genome browser
AA seq
3034 aa
AA seq
DB search
MRWRSVLWSFLALSITTFSEVQTTLVHNHVSSICSTWGRDHFKTFDGDVYQFPGMCEYNL
ISNCHDSYQLFSVHIRRAEKDGNPTISYLAVTINELLFHISKTWVTVNYDKVPLPYYKAG
VQVENNAAYIKFQSKVGFTVMWNREDAVMVEIDTDFANRTCGLCGDFNGVPVYNEFIHNG
RKISPIEFGNKHKAHHPNDDCEDPYEEDLVDVATVSDSCKKFLTFCENMFLSESWSSCAK
LIHPEVYIQACVKDMCGCSNNTNDFCVCSTLSEFSRQCSHAGGQPPNWRKTQFCAKECPY
NMVYEESGSPCMDTCTHQDTSSLCEDHKTDGCFCPSGTVFDDISERGCIPQSECQCKHDK
IYNSGEVYRQDQEECTCFKGMWDCITLETPATCAIEQGSYFTTFDGKTYTFHGDCYYTLA
KVESKDRASPKFTLLAQLVPCAHQQFDTCLKSLKILLNNDKNNVLSFTSDGVVQQNMQTV
TLPYQSGDIDIFHASSFHILLQTRFGLQIQIQHVPLMQVYISLEQSYRSKTRGLCGNFNM
ILSDEMKTPQGIVEGTAATFSNSWKANFMCSDIEERLDDPCSLSLENEMYAKHWCALLVS
PDSAFAQCRSVVDPEMFYKRCIYSTCSCEKSEACLCAVFSSYARACAEKGVLLTNWRENV
CDTYAKSCPASQTFSYTHQRCQLTCRSLSSEQQSCTSDFLPVDGCSCAEGLYLNENGLCV
PVEKCSCFYNGNYIKPGTSINIRDDHCVCNNGILHCHSWRSRMSLCHYPKVYFNCSSATA
GELGLQCAKTCSNLESDECVFTECESGCRCPDGLLEDGKGGCVKEADCPCKHDGRIFAPG
AVIPNLCNTCKCKSGKWQCTEKKCPASCIIYGSGHYNTFDQRPYGFQGECGYIAVKNKCG
NKTAENNFGVITENVPCGTSGTTCSKTVRIQLGRTEIKLMKGKYVEEDLGQGVLIQYRIR
RVGLYLVVESNIGLAVIWDRKTAVRILLEPQHSGSVCGLCGNFDGNGLNDFTTQGQLVVS
NPLEFANSWKVQSTCPDKEEIVDSCVAAPMRHQWAKMMCSIVTGKTFKDCHHKVDPQPFY
DNCVKDSCACDTGGDCECFCSAVAAYAQACNEAGVCVAWRTPDICPVFCDYYNNPEDCTW
HYSPCHTPCYKTCLNPQGICNNPIPNLEGCYPVCPEDKPQTTTTTTTTPPTTTTETPTTT
TTTPTTTTPEPHTITTTTPPTTTPCIPTCEWSDWYNVHDPITDKNDWETYENVTNNGLII
CENPMEIDCRAAVLPDMDFEDYLEDTQQVVSCDINYGLICKKEDQPKRPGKCFDYKFRLC
CPVCEITTTLRTTPTTTTTTPTTTTPEPPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPT
TTTTTPTTTTIETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTTETP
TTTKSTTASPTTTTPKPPTTTTPPTTTTETPTTTKTTTAPPTTTTPKPPTTTTPPTTTTE
TPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPTTTTIETPTTTKTTTAPPTTT
TPKPPTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTXTAPPTTTTTETPTTTTTTPPTTT
TETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPSTTS
PKTPTTTTPSTTTTETPTTTTTTPPTTTPKPPTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETP
TTTKTTTASPTTTTPKPPTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTET
PTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPXTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTET
PTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTET
PTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTTTAPPTTTTTETPTTTTTPPTTTT
ETPTTTTTTPPTTTTETPTTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTTTETPTTTKTTTAPPTTT
TPKPPTTTTPPTTTTETPTTTKTTTTPPTTTTPKPPTTTTPPTTTTETPTTTTTTPPTTT
TETPTTTKTTTAPPTTTTPKPPTTTTPPTTTTETPTTTKTTTAPPTTTTPKPPTTTTPPT
TTTETPTTTTTTPPTTTPSTTTESIVTGPPLSTVTIPATPVVVVTTQSTSSSSTTECFCV
FNGTVYLPGDEIFLMYPIGSGLCLTMICSDVCEIHNNTEMCQSTSTLGPAPSPTPYIPTC
PEWDVVQNETFFLCNCTMARCIENNTIEIIPYECPPLQNITCTNGKKPVLVYDEYHCCQH
YVCDCVCEGWGDPHYITFDGLYYSYQGNCTYILMEEITAKYHLKIYVDNVFCDPTEDVSC
PRSIIIAYGFHVVTLINHNLIGAPQLEVLKNGEILKLPYAQQGIKIVSSGINLVYEIPLL
NVVVTFGMTGFSVNLPYKYFGSNTQGHCGTCTNNQADDCKLPTGELLENCAVMADYWPAN
DIYQPNCPTPPEVPTQVPEPPLEPTPCKPDSICDLLKSSVFAECHPLVSPDNFYRGCVFD
SCHVSNPAVECTSLQTYAAACAQAGICIHWRNHTKICASDCPSDKVYKPCGPAEQPTCED
NPNEPNINFITEGCFCPDGMKLFNKESGICVEKCGCLDPEGIPREFNERFEYKCQDCICD
EPTKTVICKPKTCPAPPTANCTEPGFVVVNQTNPADPCCYAYTCQCNINKCPVSSMNCPV
GYKPVISVPEGKCCPEHTCEPKRVCVHKDVEYLPGSSVPAYACQDCTCSNEVDPKSGLFK
ITCVFQQCKETCEPGYEYVETNSYDCCGKCVQKQCVLNLHGTKHLLNEGETWSPPENMCD
HYTCMRSGDTLTALSSHIICPVFQQSNCQPDTIQTAANGCCKTCVEKDKACKLVSMKTRV
SHHGCQSEHEVEIPYCEGSCNTFTKYSEAAAAMEHSCSCCKETRSTNRTVDLLCLNGDKL
THSYMYVEECGCGQSECTTAAGLSARRKRRSTLL
NT seq
9105 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggtggagatctgtgttgtggagtttccttgctttatctatcaccactttctctgag
gtccaaaccacactggttcacaaccatgtcagcagcatctgcagcacatggggcagggat
cacttcaagaccttcgatggtgatgtgtaccagtttcccggcatgtgtgaatacaacctg
atctccaactgccacgactcctatcagctcttctcagtgcacataaggagagcagaaaag
gatggaaacccgaccatcagctacttggcagtcaccatcaatgaacttttgtttcacatc
agtaaaacctgggtcactgtcaactatgacaaagtccctctaccttattacaaggcaggg
gtgcaagtggaaaacaatgctgcttacatcaagtttcagagcaaagttgggttcactgtc
atgtggaatagagaagatgctgtgatggtggaaattgatactgactttgcaaaccgaact
tgtggactttgtggagacttcaatggtgtcccagtatacaatgagttcattcacaatggt
cggaaaatcagtcccattgagtttggcaacaaacacaaagcccaccacccaaatgatgac
tgcgaggacccttatgaggaggatttggtggacgttgcgactgtctcagattcctgcaag
aaatttctaactttctgtgaaaacatgtttttgtcagagtcctggagctcatgcgctaaa
ctgattcaccctgaagtttacatccaggcctgtgtaaaggacatgtgtggctgcagtaac
aataccaatgacttctgtgtctgcagcacgctgtctgagttttctcgacagtgttcccat
gcaggaggacagcctcccaactggaggaaaactcagttctgtgccaaagaatgcccttac
aacatggtgtatgaagaaagtggttccccttgcatggatacttgcacacatcaggacaca
agttcactctgtgaggaccacaaaacggacggctgcttctgtccttctggaacggtgttt
gatgatatttctgagagaggctgtattcctcagtctgaatgtcagtgcaaacatgacaaa
atctacaactctggagaggtttaccgacaggatcaagaggaatgcacatgctttaaggga
atgtgggattgcatcactctagaaacaccggctacatgcgcaattgaacaaggttcatat
ttcactacttttgatgggaaaacttacactttccatggggattgttactacactctggca
aaggtggaaagtaaggacagagcgagcccaaagtttaccctcctggcccagctggtgcct
tgtgctcaccaacagtttgacacatgtctgaagtcccttaaaatcctgctaaacaatgac
aaaaataacgtgctatccttcacctctgatggtgtagttcaacagaacatgcagactgtc
actttgccgtaccaatcaggagacatcgatattttccacgcctcatcctttcacatcttg
ctgcagaccagatttgggttgcagattcagatccagcatgtccctctcatgcaagtctac
atcagcctggagcaaagctacagatcaaagacacgtggtttatgtgggaacttcaacatg
atcttgagtgatgaaatgaagactcctcaggggatcgtggagggaactgcagcgaccttc
agtaactcttggaaggctaacttcatgtgctcagacattgaggaaagacttgatgatcca
tgttccctcagtttggaaaatgagatgtatgccaaacactggtgcgccttacttgtgagt
ccagacagtgcttttgcccagtgccgatcggtggtggatcccgagatgttttacaagcga
tgcatctactccacctgtagttgtgagaagagcgaggcgtgtttgtgtgccgtcttctct
tcttatgctcgagcttgtgcagaaaagggggttctcctgacaaactggagagagaatgtg
tgcgatacatatgcaaagagctgcccagcatctcagaccttctcttacacacatcagaga
tgccagctgacatgcaggtctttgagctcggagcagcagagctgcacctcggacttcttg
cctgtggatggctgctcctgtgctgagggtctctacttgaatgaaaatggcctttgtgtt
ccagtggaaaaatgttcctgcttctataacggcaattacattaagccagggacatccatc
aacatcagagatgaccactgcgtgtgcaataatggaatacttcattgtcattcttggaga
agccgcatgtcattgtgtcattatccaaaagtctatttcaactgttcctctgcaaccgcg
ggagaacttggactacagtgtgctaaaacttgttcaaatctggaaagcgatgaatgtgtt
tttacagagtgtgagtctggctgtcggtgtccggatggccttcttgaagatggcaaaggg
ggctgtgtgaaagaggctgactgtccatgtaagcatgatggacgtatttttgctcccgga
gcagtgattcctaacctgtgcaatacctgcaaatgtaaaagtggaaaatggcagtgcact
gagaaaaaatgcccagcatcttgcattatttatggaagtgggcactacaacacatttgat
caaaggccatatggatttcagggtgaatgtggttacatcgctgtcaagaataaatgtggc
aacaaaacagctgaaaacaactttggagttattacagaaaatgtaccctgtggcacttcg
ggaaccacctgctccaaaactgtcagaattcaacttgggcgaacagaaatcaaactaatg
aagggtaaatacgtagaggaagatctgggacaaggggtcctgatacaatacagaataagg
agagtcggcttgtatctggtggtagaatcaaacattggtctggcggtgatatgggatcga
aaaacagctgttcgcatccttctggagccccagcacagcggctcagtgtgtggcttgtgt
ggaaattttgatggaaatggactgaacgacttcaccacccagggtcagctggtggtgagc
aaccctctagagtttgcaaacagctggaaagttcagagcacttgcccagataaggaagag
attgtggattcttgtgtagctgcacccatgagacatcaatgggcaaaaatgatgtgcagc
atcgtaacagggaagacattcaaagactgccaccataaggttgatccccagcccttctat
gataactgtgtgaaagactcgtgtgcctgcgacactggaggagactgtgagtgtttctgc
tcagctgtcgcagcctacgctcaggcttgcaatgaggctggagtgtgtgttgcatggcga
accccagacatctgccctgttttttgtgattactataataacccagaagattgtacatgg
cactacagcccttgccacacaccttgttacaaaacctgtttgaacccacaaggaatttgt
aataacccgatacctaatctggagggttgttatccagtatgcccagaagataagccacaa
actacaactaccacaactacaactccccctacaacaactacagagactccaacaaccaca
acaacaactcccactacaacaactccagaacctcatacaatcacaactacaactccccct
acaacaactccatgcattccaacttgtgagtggtctgactggtataatgtgcatgatcca
atcacagacaaaaatgactgggaaacctatgaaaatgtcacaaacaatggtctaattata
tgtgaaaatccaatggaaattgattgtagggcagcggttttaccagacatggactttgag
gactatttggaagacactcagcaggttgtaagttgtgatataaactatggcttaatctgt
aaaaaagaagaccagccaaagcgaccaggaaagtgttttgactacaaattcagattgtgc
tgtccagtatgtgaaataacaacaacactcagaacaactcccacaaccacaactacaact
cccactacgacaactccagagcctcctacaaccacaactacaactcccccaacgacaact
acagagactcctacaaccacaactacaactccccctactacaactacagagactcctaca
accacaactacaactcccactacaacaactatagagactcctacaaccacaactacaact
ccccctacgacaactacagagactcctacaaccacaactacaactccccctacgacaact
acagagactcctacaaccacaactacaactccccctacaacaacaacaacagagactcct
acaaccacaaaaagtacaactgcatctcccactacaacaactccaaagcctcccacaacc
acaactccccctacaacaacaacagagactcctacaaccacaaaaactacaactgcacct
cctactacaacaactccaaagcctcccacaaccacaactccccctacaacaactacagag
actcctacaaccacaactacaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccaca
actacaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaactacaactcccact
acaacaactatagagactcctacaaccacaaaaactacaactgcacctcctactacaaca
actccaaagcctcccacaaccacaactccccctacaacaactacagagactcctacaacc
acaactacaactccccctacaacaacaacagagactcctacaaccacancaactgcaccc
cctactacaacaactacagagactcctacaaccacaactacaactccccctacaacaact
acagagactcctacaaccacaacaacaactccccctacaacaactacagagactcctaca
accacaactacaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaacaacaact
ccccccacaacaactacagagactcctacaaccacaacaacaactccctctactacatct
ccaaagactcccacaaccacaactccctctacaacaactacagagactcctacaaccaca
acaacaactccccctacaacaactccaaagcctcccacaaccacaactccccctacaaca
actacagagactcctacaaccacaactacaactccccctacaacaactacagagactcct
acaaccacaaaaactacaactgcatctcccactacaacaactccaaagcctcccacaacc
acaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaacaacaactccccctaca
acaactacagagactcctacaaccacaactacaactccccctacaacaactacagagact
cctacaaccacaacaacaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaaca
acaactcccnatacaacaactacagagactcctacaaccacaacaacaactccccctaca
acaactacagagactcctacaaccacaactacaactccccctacaacaactacagagact
cctacaaccacaacaacaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaact
acaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaacaacaactccccctaca
acaactacagagactcctacaaccacaactacaactccccctacaacaactacagagact
cctacaaccacaactacaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaact
acaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaacaactacaactgcacct
cctactacaacaactacagagactcctacaaccacaacaactccccctacaacaactaca
gagactcctacaaccacaacaacaactccccctacaacaactacagagactcctacaacc
acaacaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaactacaactccccct
acaacaactacagagactcctacaaccacaaaaactacaactgcacctcccactacgaca
actccaaagcctcccacaaccacaactccccctacaacaactacagagactcctacaacc
acaaaaactacaactacacctcctactacgacaactccaaagcctcccacaaccacaact
ccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaactacaactccccctacaactact
acagagactcctacaaccacaaaaactacaactgcacctcccactacgacaactccaaag
cctcccacaaccacaactccccctacaacaactacagagactcctacaaccacaaaaact
acaactgcacctcctactacaacaactccaaagcctcccacaactacaactccccctaca
acaactacagagactcctacaaccacaactacaactccccctacgacaactccaagcact
accacagaatcaattgttactggcccaccattgtcaacagtgacaattccagctacacca
gtagtagtggttacaacccaatcaacttcgtcaagttccacgacagagtgcttctgtgtt
ttcaatggcacagtttatctgccaggggatgaaatatttttaatgtaccccattggatca
ggcctttgtctcacaatgatttgttctgatgtttgtgaaattcataacaacactgaaatg
tgtcagagtacctcaaccttgggaccagcaccctctcccacaccctacattcctacatgt
cctgaatgggatgttgttcaaaatgagaccttcttcttgtgcaactgcactatggccaga
tgcattgagaacaacacaattgaaataattccatatgagtgtccacccctccagaacata
acttgtaccaatggaaagaaaccagttcttgtgtatgatgagtaccactgctgccaacat
tatgtttgtgactgtgtatgcgaaggctggggagatcctcattacatcacatttgatgga
ttatactacagttatcaaggaaattgtacttacattttgatggaggagatcacagcaaaa
tatcatttgaagatctatgttgacaatgtattttgtgatcccacggaagatgtttcttgt
ccaagatcaataatcatagcatatggatttcacgttgtcacactcatcaatcataacctt
atcggagctccacaattagaggtattaaaaaatggtgaaatattgaaattaccctatgca
caacaaggtattaagattgtgagttctggtattaacttggtttatgagatccctctccta
aatgtggttgttacatttggaatgactggctttagtgtcaaccttccatataagtatttt
gggagcaacacacagggtcattgtggtacatgcaccaacaatcaggctgatgactgcaag
ttgccgacaggcgaactgttggaaaattgtgcagtgatggcagactattggccagcaaat
gacatttatcaacctaactgcccaacaccacctgaagtacccactcaagttcctgaacca
ccgctagagccaactccatgcaagccagattccatttgtgatctgctgaagagcagtgtt
tttgcagaatgtcacccattggtttccccagacaatttctacagaggttgtgtttttgat
agttgccatgtttcgaatcctgcagtagagtgcacaagtttgcaaacttatgctgctgcc
tgtgctcaggctggaatttgcatccactggagaaaccacaccaaaatatgtgctagtgac
tgtccatcagacaaagtttataaaccttgtggccctgcagaacagcccacttgtgaggac
aatcccaatgaaccaaacataaactttattactgagggctgcttctgtcctgatggaatg
aaactcttcaacaaagagtcaggaatatgtgttgaaaagtgtggatgtcttgatcctgaa
ggcattcctcgagagtttaatgagaggtttgagtacaaatgccaggactgcatttgtgat
gagcctaccaaaactgtaatttgcaaaccaaagacttgcccagcaccacccactgctaac
tgcactgagccagggtttgttgttgtgaaccaaaccaatcctgcggatccctgttgctat
gcctacacttgtcaatgcaacatcaacaaatgcccagtaagcagcatgaactgtccagtt
ggatacaaaccagtcatcagtgttccagagggaaaatgctgtccagaacatacatgtgag
cctaagcgagtttgtgtccacaaggatgttgaatacctgcctggttcctcagttcctgcg
tatgcatgccaggactgtacctgcagcaatgaggtcgacccaaaatccggtctgtttaaa
ataacttgtgtgtttcaacaatgtaaagagacctgtgagccgggatatgaatatgtggaa
actaactcttatgactgctgtgggaagtgtgtacagaaacaatgtgtcctgaatttacat
ggtaccaagcatctcttgaatgaaggagaaacctggtcaccgcctgaaaacatgtgtgat
cactacacctgtatgaggagtggggacacactaacagccctaagttcacacatcatttgc
ccggttttccaacagagtaactgccagcctgacacaattcaaacagctgcaaatgggtgc
tgtaaaacttgtgtggagaaagacaaagcctgcaaactagtgagcatgaaaactcgagtt
tcgcaccatggctgtcagtctgaacatgaagtggaaataccgtactgtgaaggatcttgc
aacacattcactaagtactctgaagcagcagctgctatggaacattcttgctcctgctgc
aaggaaacgcgctccaccaatcgcaccgttgatttgctgtgcctgaatggagacaagttg
acccacagctacatgtatgtggaggagtgcggctgcggccagtcggagtgcaccacagct
gcagggctgtctgctcgcagaaaacgaagatccacgctgctgtga
DBGET
integrated database retrieval system