Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5: Glaag_0173
Help
Entry
Glaag_0173 CDS
T01483
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
gag
Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gag00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gag02000
]
Glaag_0173
Transporters [BR:
gag02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Glaag_0173
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Cthe_2159
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEE21142
LinkDB
All DBs
Position
200447..204202
Genome browser
AA seq
1251 aa
AA seq
DB search
MKILKYCAIFIGSLLVLLALTASPWGTRGVLLLADSSLDELDIDYGSGSLLSQLTLNRVA
YVTPDMSLKVGKLAVDVNWSCVATMQACLTALSAQSVAVQLSSSEEQSPPSNEPLERITL
PIPVSVDALDIRNIRVDVANTLEMKINSVSSEVSMFRTLNIEHLTLSGTRIILPNEPTEA
PDKDGSALDIQAIANWHYTPIKLPPIVFPIVMRANNVAVDDLLISQGKEPVFDISALRAA
IDITPKLLTVKKLQVSSSLGEAELTASVNKQWRHQLKMQLKSAQDSTYPIDAQLNLKGNL
QRSELNLTTSGVLDLAANASVDLQSAQLPLSLEVNWQPVDWPPEQANIQLEKGQLSVSGN
LNQYQLALDTALKGQSVPHTLVAMRAEGNNRQANIKHITLDTLGGRVQATAKVTIDTLLK
WQSHIEFNNIQPQQFWPELEANVEGNVDIDGQYDGQIVRAHMRELSASGDWLDYQLNASG
EAKFNSQEGIEVPELLVKTGDNQVTMTGTLEAFDDVQAQLSLDAQDLSQLYPTFAGKAQL
NAQIDGTLTAPEIDFDGLADKLTLPDMRISQLATKGQVIWDEDKQAKVELQLSNAMIAQQ
NIANLNVALNGDAQEHQISLSLNSDVANVVTKLHGSLAQSQWDGVLDVATIALDAGQFSL
EQQEPSIHANWAKNEYRLSPFCLSDDEASVCIKQAEYLASTAQFDIAINELPLSPVLSAN
LPQLQGVDTDAKLNLLAKGQWNTKELPIVEADISLTPSVWTVEGAATPLELDALNVKVNT
ITQKNTSSQRITSKLTLESKQLGAIRSDVSLQVNGDEKPISGQLTLDTITLGAAAQFVPQ
LTELAGIVDGTVDISGSLTTPLIKGEVKLHDGAVAGSMLPSRVNQVEQRINFTGQAATLT
GSFQLGNGKGQVDGEFDWQDTPSAVVNVKGSEMEIDYQNMVRAKLSPDVNVEFGAAGLSV
KGEVTLPYARIRVRELPPSAISPSSDVVLVNDQQAVVEDKMPLKLSLQVNIDPKKNNDVK
VDAFGLTSDLQGSLLLTQDGEVLNANGELNLVNGRYKAYGQDLVIREGEIQFSGPIDSPY
LVVEAVRDPDKTADDVIAGLRIQGSASQPQVSVFSDPSMDQPEALSYLLRGTAINSEDET
SSDAALASALIGFGLGKSENKVTNIGRKIGVEDLALNTSGAGDETKLSVSGYIAPGVQIR
YGVGVFDSVSEVALRYQLIPKLYLEAVSSLNSELNLYYQFSLDDEEDTKPE
NT seq
3756 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagatattaaaatactgcgcaatttttattggcagtttgcttgtgttacttgccctg
actgcatcgccgtggggaacaagaggtgtactattattggccgatagtagccttgatgaa
ttggacatcgactatggctcagggagcttactatcccagctgacgttgaatcgtgtggcc
tatgtgactccagatatgagtttaaaagtcggtaaactcgctgttgatgtcaattggtcg
tgcgtggcgacgatgcaagcatgtttaactgcactaagtgcgcaaagtgttgctgtgcaa
ctgtcttcgagtgaagagcaatctccgccaagtaacgagccactagaacgtattacttta
cctattcctgttagcgtagatgcactggatattcgcaatattcgggttgatgtcgccaac
acgcttgagatgaaaattaactcagtatcgagtgaagttagcatgttccgcacattgaat
atcgagcatctcaccttgagcggtacccgtattatattgccaaatgaacctactgaggca
cctgataaggacggctcagcgctcgacattcaggccattgcgaattggcattacacgcca
attaaactaccgcctattgtgttcccgatcgtgatgcgagctaacaatgtggccgtggat
gacctgttaatctcccaaggcaaagaacccgtattcgacattagtgcactgcgggcagcc
attgatattacccctaagttactcacagtaaaaaaactgcaggtgagctcaagtttgggt
gaggctgagttaaccgctagcgtgaataaacaatggcggcaccagttaaaaatgcagctc
aaaagtgcacaggacagtacataccctattgatgctcagttgaatttaaaaggaaactta
cagcgcagtgaacttaacctcaccaccagcggagtccttgatctagccgctaatgccagc
gttgatttgcagtcggcacaattgcctctttcgctagaggttaattggcagcctgtggat
tggcccccagaacaagcaaatattcagctcgagaaaggtcagctgtctgttagtggcaac
ttaaatcagtatcagctagcactcgatactgcattaaaaggccagtctgttccgcacaca
ttagtggcgatgcgagcagaagggaacaaccgtcaagccaatataaaacacatcacttta
gacacgctaggtggtcgagttcaagcaaccgctaaagtgacgatagatacattgctgaaa
tggcaaagtcatattgagtttaataacattcagcctcagcaattttggcccgaactagaa
gctaatgtagaaggtaatgtggatattgatggtcaatatgatggccaaattgtgcgtgcc
cacatgcgtgagctttccgcgtcaggcgactggttagattatcaattaaacgcatcagga
gaggctaagttcaattcacaagaggggattgaagtacccgaactgctggtgaaaaccggg
gacaatcaagtcacgatgaccggcacattggaagcttttgacgatgttcaagcgcaatta
tcgctagacgctcaagatctatctcagttgtaccccacttttgctggtaaagctcagctt
aacgcacagattgatggcacgttgaccgcgcctgaaatcgactttgatggcttagcggac
aaacttactttgcctgatatgcgtatttctcagctagcaaccaaaggacaggttatttgg
gatgaagataagcaagctaaggtcgaactacaacttagcaatgcgatgatcgctcagcaa
aatattgccaacctaaatgtcgcacttaatggtgacgcccaagaacaccaaataagctta
tccctcaacagcgatgtagccaatgtcgtgactaaacttcatggcagcctagcacaaagc
cagtgggatggggtgttagacgtagcgaccatcgcgttagacgcagggcaatttagttta
gagcagcaagagccatccatacatgcaaattgggcgaaaaatgagtatcgcttatcccca
ttttgtttgtccgatgatgaggccagtgtgtgtatcaaacaagctgaatatctagccagc
acggcgcaatttgatattgcgataaacgagttacctttatcacctgtgctcagtgctaat
ctacctcagctacaaggggtagatacggatgctaaattaaacctgttggcaaaagggcaa
tggaatactaaagagctaccaatagttgaggcagatattagcctaacgccatctgtatgg
acggtcgaaggggcggctactccccttgagcttgatgcactgaatgttaaagtcaatacg
atcacccagaagaacacttcatctcaacgtattaccagcaaacttaccttagaaagtaaa
caattgggtgctatccgctctgatgtgagtttgcaagtcaatggtgatgaaaaacccatt
tcagggcaacttactttagacacaattaccttaggcgcggcagcgcaatttgtacctcag
ttaactgaattagcaggcattgttgatggcacggtggatatcagcggtagtttaaccaca
ccgctaatcaagggtgaagtgaaattacatgacggtgctgttgcaggttcaatgctccct
tcgcgggttaatcaggtggaacaacgaatcaactttacaggtcaggcagctacgcttact
ggttcgtttcaattaggcaacggcaaaggacaagtggatggcgagtttgattggcaagat
accccaagcgcggtggtgaatgttaaaggtagcgaaatggaaatcgactatcaaaatatg
gtgcgggctaagttatcacctgacgtcaacgttgaattcggtgccgcgggattgtcggta
aaaggtgaagtcaccctaccttatgcgcggatcagagtgcgagaattaccgcctagtgct
atatcgccttctagtgatgtggtgttggtcaatgatcaacaggcagtagtagaagataaa
atgccgttgaagctttcgttgcaggtgaatattgacccgaaaaagaataatgacgttaaa
gtggatgcgtttggattaacctctgatttgcaaggctctttgttattaacacaagacggc
gaagtgcttaacgccaatggtgagctgaatttagtcaacggtcgctataaagcatacggc
caggatttggtaatacgtgaaggagaaatccaatttagcggtcctatcgatagcccgtac
cttgtggttgaagccgttcgagatccagataaaacggcagacgatgttatagcaggtttg
cgaatacaaggcagtgcctcgcaaccacaagtgagtgtgttttctgacccaagtatggac
cagccagaagccttgtcttatctgttgcgaggcaccgctatcaacagtgaagatgaaacc
tcaagtgatgcggcactcgccagtgccttaattggcttcggtttaggcaaaagtgaaaac
aaggtgaccaacattgggcgcaaaataggtgttgaagatttagcactaaacaccagtggt
gcgggtgatgaaactaagctttctgtctcaggctatatcgcgcccggtgtacagattcgt
tatggtgttggggtgtttgattcagtttctgaggttgctttacgctatcagttaatacct
aaactgtatcttgaagcggtcagcagtttaaatagtgagctaaacttatattatcaattc
tccttagatgacgaggaagataccaagcctgagtag
DBGET
integrated database retrieval system
