Granulosicoccus antarcticus: IMCC3135_11385
Help
Entry
IMCC3135_11385 CDS
T04938
Name
(GenBank) Alpha-agarase
Organism
gai
Granulosicoccus antarcticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASJ72367
UniProt:
A0A2Z2NXA2
LinkDB
All DBs
Position
2560835..2563261
Genome browser
AA seq
808 aa
AA seq
DB search
MICLDSVSTGQSNSYLKGALRSLGVLASVALLSACNQSDDSGKVDVVDGQASMAFSAPVF
LQTRNIDRSNLVLEVAFNGVAFPAAFPGEGEEYVLEATRPANSSTEVSVTWSEDIGELRL
PLATATKTLLVGSESSPASLGFASEEFKRDEFDLDEDGYSNYFERQSGDGTAFNDDTVPE
NPPGIVTLNVEFQMPQGVANASADIRALINAKAEVNGISLELTRDSDRDLWRGATQVAQS
TSPLITIGFFSTPERSIQIAFRQRSVEDVGSGVTSIFEANIYETEQYQDDADGISNIDEI
ANGTDPRDTSDPAPDSDNDGVIDVSDNCPAIANPDQADSDRDGTGDLCDDSNGLDPDNDG
INSAEDNCPSVTNADQADVDSDGVGDACDNTNGLDADGDGINNADDNCRNAANPDQNDSD
GDGFGDACDQSDGNDVDDDGVENGVDNCPVDANSNQADSDGDGVGNVCDDTNGLDTDGDG
IENDDDNCPAVANSNQADSDGDGVGNVCDDTNGLDMDDDGIDNDDDNCPVDANANQADDD
GDGVGNVCDDTNGLDTDEDGIENDDDNCPVDANANQADDDGDGVGNVCDDTDDSAPDVDG
DGVDDADDNCPSVANADQSDEDEDGVGDVCDVPDGSTDGSTTGSGTGTDSGTAGATDGTT
GTETGADTTTAGATDGTTGTETGADTTTAGATDGTTGTETGADTTTAGATDGTTGTETGA
DTTTAGATDGTDTTTTAGNTDSGTATAGDDSGLADAGNTSAGATDGSVTGGATDGGASDA
GTTGGDTAMTGTTTARAFISGVVFPLTA
NT seq
2427 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttgcctcgactcggtgtcaacaggtcagtcaaactcgtacctgaagggagctttg
cgttcgctgggcgtgcttgcctcagtggctcttctgagcgcttgtaatcagtcagatgat
agcgggaaggtggatgtagtcgatgggcaggccagcatggccttcagcgcaccggtattt
ctacagacgcgcaatattgatcgaagtaatctggtgctcgaggtggcttttaatggcgta
gcgttcccggcagcttttcctggtgaaggcgaagaatatgttctggaggcgactcgtcca
gccaattcatccactgaggtgagcgtcacgtggtcagaagacattggtgagttgcgcctg
cctctggcaactgcaacaaaaacactgttagtcggatccgagtccagtcctgcttcactg
ggatttgccagtgaagagttcaagcgtgatgagtttgatctggatgaggatggctattcg
aactacttcgaacggcaatcaggtgatggaactgccttcaatgacgacacagtgcctgag
aatcctccaggaatagtcaccctgaacgtcgagtttcagatgccgcaaggtgttgctaac
gcttccgccgacatccgtgctctgatcaatgccaaggcggaagtcaatggcatctctctg
gaactcacccgtgatagtgatcgtgatctttggcgtggcgcaacacaggtggcacagagt
acgtcgccgctgattacgatcggttttttctcaacgcctgagcgttctatccagattgcc
ttcaggcaacgcagtgtggaggatgtgggaagtggtgtgacatccatcttcgaggcaaat
atttatgagacagagcagtatcaggatgatgctgatggaatcagcaatattgatgagatt
gccaacggaaccgatccgagagataccagcgatccggcaccggatagcgataatgatggc
gtgatcgatgtcagtgacaattgcccggcgatcgccaatcctgatcaggcagacagcgac
cgtgacggtacaggcgacttgtgcgacgacagtaatggtctggatccggataacgacggg
atcaattctgctgaagataactgcccgtctgtaacgaacgctgatcaggctgacgttgac
agtgatggagtgggcgatgcctgtgacaataccaatggtctggatgccgatggtgacggt
atcaacaatgctgatgataattgccggaacgcggccaatcctgatcaaaacgattcggat
ggtgatggttttggtgatgcctgcgatcagtcagatggaaacgatgtagacgatgatggc
gtggaaaacggtgtcgataactgccctgttgatgcgaattcgaatcaggccgatagtgat
ggtgatggcgtaggtaatgtctgtgacgataccaatggtctcgatacagatggtgacggc
atcgagaatgatgacgacaattgtcccgctgtcgccaattcgaatcaggccgatagtgat
ggtgatggtgtcggtaacgtgtgtgacgataccaatggtctcgatatggacgatgatggt
attgacaatgatgacgacaactgtcccgttgatgccaatgcgaatcaggccgatgacgat
ggtgatggtgtcggtaacgtgtgtgacgataccaatggtctcgatactgacgaagatggc
atcgagaatgatgacgacaactgtcccgttgatgccaatgcgaatcaggccgatgacgat
ggtgatggtgtcggtaacgtttgtgacgatactgatgattcggctccggatgtagatggt
gatggagtcgacgatgccgatgataattgcccgagtgtggccaatgccgatcagagcgat
gaagatgaagacggcgtgggtgatgtctgtgacgtgcctgatggctcgactgatggaagc
acaacgggctcaggcaccggcactgattcgggaacagccggtgcgaccgatggaaccacg
ggtaccgagacaggggctgacacgacaacagccggtgcgaccgatggaaccacgggtact
gagacaggggctgatacaacaacagccggtgcgaccgatggaaccacgggtactgagaca
ggggctgacacgacaacagccggtgcgaccgatggaaccacgggtaccgagacaggggct
gatacgacaacagccggtgctactgatggtacggacacgacgacaacggcaggtaatacc
gatagtggaacagcgactgccggagatgatagtggactggcggatgcgggcaataccagc
gctggcgcgacggacggtagtgtgactggcggagcgactgatggtggtgcttctgatgcc
ggaacgacgggtggcgacaccgccatgacgggtacgacgacagccagagcatttataagt
ggtgtggttttcccacttacagcctga
DBGET
integrated database retrieval system
