Gordonia amarae: GII34_10005
Help
Entry
GII34_10005 CDS
T07320
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
gam
Gordonia amarae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gam00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gam02000
]
GII34_10005
Transporters [BR:
gam02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
GII34_10005
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHN21825
LinkDB
All DBs
Position
2252625..2254136
Genome browser
AA seq
503 aa
AA seq
DB search
MGGVVAREGQDRPGSAGRCPRRRRSSACRRLQRQRDGARRDRPVPEVPLTTHPDPPSTGV
RRIAVLSVSALLVLVAPPLYLLLDLAVVGRLGGHELAALGVGTLVLATISTQLTFLSYGT
TARSARLFGAGDRVGAVREGVQATWVALGVGVVLIILAYPLAPVAMGALVGSGEDGAAEV
VDEATRWLRIAMFGVPLILASMAGNGWMRGVQETRRPVLFVLCGLSFGAVGVVGLVHGLG
WFPRLGLTGSAVANVVGQSITGALFVGRLVGESRRGDTPLPLRPDWSIIAAQLLMARDLI
LRSLSFQVCFVSATAVAARFGIAAVAAHQVAVQVWDFLSLLLDSVAIAAQALVGAALGAG
ATGVAVTVARRVTVVAVAIAVAVAVVFAVGAGMIPGVFTHDAEVRDAMAVPWWFLVGMLP
IAAVVFALDGVLLGAGDVVFLRKATMFSALCGFLPLIWLSLVFGWGLAGIWSGLVALMVL
RLVLVVGRVLGGRWQRVGADAVT
NT seq
1512 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgggcggtgtcgttgcgcgcgaaggacaagatcgacctggttccgctggccggtgccca
cggcggcggcggtcatcggcgtgccgccggctacagcgacagcgggacggcgcaagacgt
gatcgaccggttcctgaggtccctctgacaacccacccggatcctccgtccaccggtgtg
cgccgtatcgcggtgctgtcggtatccgctctgctggtgctggtggcaccgcctctgtac
ctgctgctcgatctggccgtggtcggccggctcggcggtcatgaactcgccgctctcggt
gtcggcacgctcgtgttggccaccatcagcacccagctcaccttcctgtcctacggcacc
acggcgcggtcggcgcggctgttcggtgccggtgatcgtgtgggcgcggtccgggagggt
gtgcaggcgacgtgggtcgcgctgggtgtgggtgtcgtcctgatcatcctcgcctatccg
ctggcgccggtggcgatgggtgcgttggtgggttcgggcgaggacggtgcggccgaggtg
gtcgacgaggcgacccggtggctgcggatcgcgatgttcggggttccgttgatattggca
tcgatggccggcaacggctggatgcgcggggtgcaggaaacccggcgaccggtgctgttc
gtgctgtgcggactgtcgttcggtgctgtcggggtggtcggtctcgtgcacggactcggc
tggtttccccggctcggcctgaccggcagcgccgtcgccaacgtggtggggcagtcgatc
accggggccctgttcgtgggccggctggtgggtgagtcccgccgcggggacacacccctg
ccgctgcgtccggattggtcgatcatcgcggcgcaactgctgatggcgcgcgacctgatt
ctgcgcagtctgtcgttccaggtgtgtttcgtgtcggcgacggcggtggcggcccggttc
gggatcgccgcggtggccgcgcaccaggtcgccgtccaggtgtgggatttcctgtcgctg
ctcctcgattcggtggcgatcgccgcgcaggcgctggtgggggcggcgttgggtgccggt
gcgaccggtgtggcggtgaccgtcgcccgtcgggtcaccgtggtggcggtggcgatcgcg
gttgcggtggcggtggtcttcgcggtcggtgcgggaatgattccgggtgtgttcacccat
gatgccgaggtacgcgatgcgatggccgtgccgtggtggtttctggtggggatgctgccg
atcgccgcggtggtcttcgcgctcgacggtgtgctcctcggcgccggggacgtggtgttc
cttcgcaaggccacgatgttctcggcgctgtgcggattcctgccgctgatctggttgtcg
ctggtgttcggctggggcctggcgggtatctggtcgggtctggttgcactgatggtgctg
cgtctggtcctggtggtcgggcgggtgctgggcggccggtggcaacgtgtcggcgccgat
gcggtgacctga
DBGET
integrated database retrieval system