Gallibacterium anatis: UMN179_00301
Help
Entry
UMN179_00301 CDS
T01482
Name
(GenBank) capsular polysacharride biosynthesis protein
Organism
gan
Gallibacterium anatis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glycos_transf_1
Glyco_trans_1_4
Glyco_transf_4
GT4-conflict
Glyco_trans_4_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEC16338
UniProt:
F4HBI1
LinkDB
All DBs
Position
complement(306550..307674)
Genome browser
AA seq
374 aa
AA seq
DB search
MQDNKIHILYLCGIAVHGGVGSYLKTVAQNFPQGNYVLHISYYAPQQFVEFENQILALNP
SVVFHHLPSFSIKNLITGKLWKATKQLYQQYHFDLVHAHNPYLSFMHFYCAKQKHIGRIL
HSHSSQPSGSKIKALINRLFYSLTKPLVTDRIACSRVAGEFLFKNQPYRIIYNAIDCNKF
VFKADIRALLRNQFNLSDNTIVLGHIGNFEPVKNHHFLLNLISILAKRTENYKLFLIGVG
AGENECKQWVQKHKLQDKVVFLGFRQDVPQLLNIFDLFLLPSFFEGFPLSVLEAQCNGLP
NLISDRVTNEVAITDLVQFYSIANIDQWIDAISVMQQNQKREDYAHIMSEKGFSIEHHIQ
QLMEVYQQVLQRSH
NT seq
1125 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaggataataaaatacatattttatatttgtgtggtattgcagtacacggtggagtg
ggtagttatttaaaaacagtagcacaaaatttcccacaaggaaattatgtcttgcatatt
agctattatgcgccacaacaatttgttgaatttgaaaatcaaattttagcacttaatcca
agtgttgtttttcatcatctaccgtcattttcaattaaaaatttaattaccggaaaatta
tggaaagcaaccaagcagctttatcaacaatatcattttgatttagtccacgcacataat
ccttatttatcttttatgcatttttattgtgcaaaacagaaacatataggacgtatttta
cattcacacagtagtcagccttcgggtagcaaaattaaagccctaattaatcgtttattt
tattcattaacaaaaccattagtgacggatcgaattgcgtgcagtcgggtagcaggagaa
tttttatttaaaaatcagccttatagaattatttataatgcgattgattgtaataaattc
gttttcaaagcagatattagagcattattacgtaatcaatttaatttatctgataatact
attgttttagggcatattggtaattttgaacctgttaaaaatcatcattttttattaaat
ttaatttcaatattagcgaaaagaacggaaaattataaattgtttttaattggtgtcggt
gctggagaaaatgagtgcaagcaatgggtgcaaaagcataaattacaagataaagttgtc
tttttaggttttcgtcaggatgtaccgcaattattaaatatatttgacctttttttatta
ccctctttttttgaagggtttccactttccgtgttggaagcacaatgtaacggactacct
aatttgatcagtgatcgagttacaaacgaagtggctattaccgatttagttcagttttat
tcaatagcaaatattgatcaatggattgatgcaattagtgtgatgcaacagaatcagaag
cgtgaggactatgctcatattatgtcggaaaaagggttttctattgaacatcatatacaa
caattaatggaagtatatcagcaagttttacaacgttcacattaa
DBGET
integrated database retrieval system