Gilliamella apicola: GAPWK_1003
Help
Entry
GAPWK_1003 CDS
T03066
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16087
hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor protein
Organism
gap
Gilliamella apicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gap00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gap02000
]
GAPWK_1003
Transporters [BR:
gap02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
GAPWK_1003
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN25580
LinkDB
All DBs
Position
complement(1117618..1119765)
Genome browser
AA seq
715 aa
AA seq
DB search
MRTFSTKNFVKPSCYIAILNLCIYADAFAEERKNNPQDTIVVTADRNEKTVWDSSVSVSA
VNRDDIEKQNGDSVVESLRDIPGVEITDNALAGRKQIMIRGEAPSRILMLIDGQEVTYHR
SGHGSSAGVLIDMESVERIEVIKGPHSVLYGSQAIGGVVNFITRKGSKNGSPINGDMKFI
YNQSTDGFTEMGTVNGSIDGIFDYRISGTYAENNDRKAYQGKLHNTDFGNNSLSSWFGLN
LDKHKFGVSLDRYKLDTKTYTDKDDTSPEVKEFWVKLPKLQREKVGLFYDYEANGDFLKR
LHYDAYTQKLNRQFRNHVVVSPAPIMNVTTNTATDDEQKTYGMTLQSDFELRKNINLITG
MQYQQDNVDQDSHNVVVSKMPSPRASYTQHKYLTNKWQQSSISLFGQNDWAITNDISWNI
GARQYWVQSKLKKGHTTINKVPVIGAASANYKIDNKKKDHDNNFVVSSGLTYSGIENTQL
RASFAQGYVYPTLSHLYAVTSAASQTIYGNSNLKAEKSNNYELGLRYNNNQWLIDGAIYF
SDAKDYITQMNCNGSAICDGISGRNYTYYGNANKAKTHGLELSIEYLELPVNPYLKGNYL
RRKIETETYNTYDTGNPRFTGNAGIKHTAYFDKFDIDSDLFIRFATKATQRSDSSVYHYS
GWSTLNLSATTSFGTDRQYHIGIDLNNILNKNYRTAYESIPAAKFHAIISASMKF
NT seq
2148 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaacgtttagtaccaaaaatttcgttaaaccaagctgttatattgcaatattaaac
ttatgcatttatgcagatgcttttgcagaagagcgaaaaaataatccacaagataccatt
gttgttacagccgatcgtaatgaaaaaactgtttgggatagctctgtatcagtaagtgca
gtcaatcgtgatgacatcgaaaaacaaaatggtgattctgttgttgaatcattacgtgat
attcctggagtagaaattaccgataatgctcttgctgggcgcaaacagataatgatccgc
ggtgaagccccttcacgtattttgatgttaatcgatgggcaagaagtaacttaccatcgt
tctggacacggttcgagtgccggggtgttaattgatatggaatccgttgaacgcatagag
gtgattaaaggacctcattcagtattatacggttcacaagccattggtggtgtggttaat
tttataacccgtaaaggtagcaaaaatggttctcccatcaatggggatatgaaatttatt
tataatcaatcaacagatggttttaccgaaatgggcactgtaaatggttcaattgacggc
atttttgattaccgtattagtggaacttatgctgaaaataatgatcgtaaagcctatcaa
ggcaaactacataataccgattttggtaataacagtttaagttcatggtttggacttaat
ctagataaacataaatttggtgtatcattagatcgttataaacttgatactaaaacctat
actgacaaagatgatacctcaccagaagttaaggaattctgggttaaactacctaaatta
caacgtgaaaaagttggattattctatgattatgaagctaatggtgattttttaaaaaga
cttcattatgatgcttacacacaaaaattaaatcgtcaatttagaaaccatgttgtggta
tccccggcacctattatgaatgtaacaaccaataccgcaactgatgatgaacaaaaaaca
tatgggatgacattacaatcagattttgagttacgtaagaatataaatctcattacaggt
atgcaatatcaacaagataatgtcgatcaagattcgcataacgtagtcgtatcaaaaatg
ccttcaccaagagcaagttacacacaacacaaatatctaaccaataaatggcagcaatca
agtatttcactattcggacaaaatgattgggcaattaccaatgatatttcttggaatatt
ggtgctcgtcaatattgggtacaatccaaactaaaaaaaggtcatacaacaatcaacaaa
gttccagttataggtgcggcttcagccaattataaaattgataacaaaaagaaagatcat
gataataactttgtcgtgtcatcaggtttaacctattctggtattgaaaatacacaatta
agagcctcttttgcacaaggatatgtttatccaacactttcacatctttatgcagtcacc
tctgcggcttcgcaaacaatctatggtaactctaatctaaaagctgaaaaatccaataac
tacgaacttggtttacgttataataataaccaatggttaattgatggggcgatttatttt
tcagatgcaaaagattacattacgcaaatgaattgtaatggttctgcgatttgtgatggc
atatctgggcgaaattacacttattacggtaatgccaataaagccaaaactcatggtctt
gaattgagtattgaatatttagaactacccgttaacccttatttaaaaggcaattattta
cgtcgtaaaattgaaacagaaacctataatacttatgatactggtaaccctcgctttaca
ggaaatgcagggataaaacatacagcttacttcgataaatttgatattgattccgatctg
tttatacgatttgcgaccaaagccacacagcgtagtgattcatcggtatatcattacagc
ggatggtcaacactgaatttatcggcaaccacctcgtttggtacagatcgtcaataccat
attgggatagatctcaataatattttaaataagaattatagaactgcttatgaatcgatt
cctgctgccaaattccatgccataattagcgcaagtatgaaattctag
DBGET
integrated database retrieval system