Gracilinanus agilis (agile gracile opossum): 123244352
Help
Entry
123244352 CDS
T07702
Symbol
HNRNPM
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M isoform X1
KO
K12887
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M
Organism
gas
Gracilinanus agilis (agile gracile opossum)
Pathway
gas03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gas00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
123244352 (HNRNPM)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
gas03041
]
123244352 (HNRNPM)
Spliceosome [BR:
gas03041
]
Common components
Common spliceosomal components
hnRNP proteins
123244352 (HNRNPM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
HnRNP_M_NLS
RRM_MARF1
RRM_3
RRM_5
Collagen_mid
RRM_occluded
RBD_DEAH11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123244352
NCBI-ProteinID:
XP_044528713
LinkDB
All DBs
Position
1:737758816..737804070
Genome browser
AA seq
743 aa
AA seq
DB search
MAAGVEAAVEVAATESKMEEESGAPGIVSGNGTPTPKSEGERSSQNEKRKEKNVKRGGNR
FEPYANPTKRYRAFITNIPFDVKWQSLKDLVKEKVGEVTYVELLMDAEGKSRGCAVVEFK
MEESMKKAAEVLNKHSLSGRPLKVKEDPDGEHARRAMQKVMATTGGMGMGPGGPGMINIP
PSILNNPNIPNEIIHALQAGRLGSTVFVANLDYKVGWKKLKEVFCMAGVVVRADILEDKD
GKSRGIGTVTFEQSIEAVQAISMFNGQLLFDRPMHVKMDERALPKGDFFPPERPQQLPHG
LGGIGMGLGPGGQPIDANHLNKGIGMGNIGPAGMGMEGMGFGINKMGGMEGPFGGGGMEN
MGRFGSGMNMGRMSEMDRGMGGGFERDFARNEMGMARSFGEPLGRGMGGGGGSVPGIERM
GPGIDRIGGAGMERMGSGLGHGMDRVGSEMERMGLVMDRMGSTVERMGSGIERMGPLGID
HMTTSIERMGQTMDRIGSGVERMGAGMGFGIERMAAPIDRVGSTIERMGSGVDRMGTTMD
RMGLSMDRMVPAGMGTGIDRMGPVMDRMSTGLDRMGANNMERMGLDRMGANNIERMGLDR
MGANNIERMGPTMGPALGSGMERMGLAMGGSFDRAMEMDRGNFGGSFAGSFGGAGGHVPG
VARKACQIFVRNLPFDFTWKMLKDKFNECGHVLYADIKMENGKSKGCGVVKFESPEVAER
ACRMMNGIKLSGREIDVRIDRNA
NT seq
2232 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggcaggggtggaagcggctgtagaggtggcggcgactgaatccaaaatggaggag
gaaagcggagcgcccggcatagtgagcgggaacgggaccccaacccccaaaagtgaaggc
gaacgatcaagtcaaaatgagaagaggaaggagaaaaatgtgaaaagaggagggaatcga
tttgaaccctatgccaatcctactaaaagatacagagccttcattacaaatataccattt
gatgtgaaatggcagtcccttaaagacctggtcaaagaaaaagttggtgaggtaacatac
gtggagctcttaatggacgctgaaggaaagtcaaggggatgtgctgttgttgaattcaag
atggaagaaagcatgaaaaaagctgctgaagttttgaacaagcatagtctgagtggaaga
cctttgaaagtcaaagaagatcctgatggcgaacatgccaggagagcaatgcaaaaggtg
atggctacaactggtgggatgggtatgggaccaggtggcccaggaatgattaatatccca
cccagtatcctaaataatcctaacatcccaaatgagattatccatgcattacaggccgga
agacttggaagcacagtatttgtagcaaatctggattataaagttggctggaagaaactg
aaagaagtgttctgtatggctggcgtagtggttagagcagatattcttgaagataaagat
gggaaaagtcgtggaattggcactgttacttttgaacagtcgattgaagcagttcaggct
atatcaatgttcaatggccagctgctattcgatagaccaatgcatgtgaagatggatgaa
agggccttaccaaaaggtgactttttccctcctgagcgcccccagcaactccctcatgga
cttggtggcattggcatggggctaggaccaggaggacagcctattgatgccaatcatcta
aacaaaggcataggaatgggcaacataggacctgcaggaatgggaatggaaggcatggga
tttggaataaacaaaatgggaggcatggagggcccctttggtggtggcggcatggaaaac
atgggtcggtttggatctggcatgaacatgggccgaatgagtgagatggatcgaggaatg
ggtggaggatttgagagagactttgcacggaatgagatgggaatggctcggagttttgga
gaacctcttggcaggggaatgggtggtggtggtggcagtgttccaggaatcgagaggatg
gggcctgggattgatcgtataggtggtgctgggatggaaagaatgggttctggcctaggc
catggaatggatagagtggggtctgagatggagagaatgggccttgtcatggatcgtatg
gggtctactgtagagagaatggggtcaggaatagaacggatgggtcctcttggcatagac
cacatgacaacaagcatcgagagaatgggccagaccatggataggataggttccggtgta
gaacgaatgggagctggcatgggttttggtattgagagaatggctgctcctatagatcgg
gttggctcaactatagagaggatgggatcaggtgtggatcgcatgggtaccaccatggat
cgcatgggtctaagtatggatcggatggtgcctgctggcatgggaactggcatagatcgc
atgggcccagttatggatcgaatgtctactggtttggaccgtatgggtgccaataacatg
gagcgcatgggattggaccgtatgggtgccaataacatagagcgcatgggattggaccgt
atgggagccaataacatagaaagaatgggtcccactatgggaccagccctaggttcagga
atggagcgcatgggacttgccatgggaggtagttttgacagagctatggaaatggatagg
ggaaactttggaggcagttttgcaggatcttttggaggtgctggtggccacgtgcctggg
gttgctcgaaaagcctgccagatatttgtgagaaatctcccttttgactttacatggaaa
atgctaaaagataaattcaatgaatgtggccatgtgttgtatgcagacatcaagatggag
aatggcaaatccaagggttgtggcgtggttaagtttgagtccccggaggtggcagagaga
gcctgccggatgatgaatgggataaaactcagtggcagagagattgatgtgcgaattgat
agaaatgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
