Gimesia aquarii: V144x_21290
Help
Entry
V144x_21290 CDS
T09973
Name
(GenBank) NPCBM-associated, NEW3 domain of alpha-galactosidase
Organism
gaw
Gimesia aquarii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_4
Big_9
Cadherin_5
NPCBM_assoc
Dockerin_1
EF-hand_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDT96671
UniProt:
A0A517VUJ2
LinkDB
All DBs
Position
2568450..2576762
Genome browser
AA seq
2770 aa
AA seq
DB search
MKSLKRLFGRKSARKINRRLPFRVSRPIGYASHVERLEDRTLLASNILASLESSVNQPND
TTELTLNVGPGSSPTLGFEVRAAANSVFDPAAIRIFDANTNAVVPLELAENDHNGSTNSL
ALATLSPSTSYRIEVNGQTSDIGGFIVDVFLPGDMDGSGSVSDTERLHAFVAMQQHLFGF
NGVTPHLVQQLGLDPSASFYSEELDGDRDGDVDNYDLELVEGNQNLPAVQLELIGDQDAP
QIIAGLQIDSGVSDSDGITNDLTILGNISDESLITQFKVGLDGAPLVDFVDIFPLISGGA
NGGSFTLSRSWIETNLNNGNSLEGGTHTLSFFAQDEHDNNNVDSFFDVTFELDVTDPTVT
GTQITNQNEDEDFGSLDLGPLTNFFNQNGGTALSFQVDSITNPIVTVDFSSGNLVLNSIQ
DAFGSTDIVILAMDLAGNSVLSNLFSVDVNPQNDAPVAIDDAFTTDEDTVLNGGSNVFAA
NPTTPDSDVENDPFTVTEVNGNAASVGNQITLTSGALLTLNSDGTFTYNPNGQFEYLAAG
ASATDSFTYTIDDGTGNLITTDTATVTITINGVNDDALIGGDNAGDMTEDEAGDSGTLTI
TDVDDGEDVFVTQSSTVGTHGTFSIDAAGNWTYTRTADLNALNAGDQVTDTFTVTSSDGT
ATEDVTITINGLNDDALIGGDNAGDMTEDEAGDSGTLTITDVDDGEDVFVTQSSTVGTHG
TFSIDAAGNWTYTRTADLNALNAGDQVTDTFTVTSSDGTATEDVTITINGLNDDALIGGD
NAGDMTEDEAGDSGTLTITDVDDGEDVFVTQSSTVGTHGTFSIDAAGNWTYTRTADLNAL
NAGDQVTDTFTVTSSDGTATEDVTITINGLNDDALIGGDNAGDMTEDEAGDSGTLTITDV
DDGEDVFVTQSSTVGTHGTFSIDAAGNWTYTRTADLNALNAGDQVTDTFTVTSSDGTAED
VTITINGVNDPPVAEADAFTTDEDTSTGGDLFADNGSGVDSDPDSSASFTITEVNGVSGD
VNNPIILASGATLTVNSDGTFTYDPSSSSQFNALAAGAQDTDSFSYTIDDGLSGTDTATV
TITINGVNDPPVAEADAITTDEDTSTGGDLFADNGSGVDSDPDNGASFTITEVNGVSGDV
NNPIVLASGATLTVNDDGTFSYDPSSSSQFNALADGEQGTDSFSYTIDDGLSGTDTATVT
ITINGVNDPVTAQDDAVTTSKNNTIEIDVTADNGNGPDTDPDTNDVLTVIVIDGQNVTLG
QTITLSGVDSVATVTLNNNGTLTYDPNGQFDGLNLPSETATDTFTYTIDDNNGSTSSATV
TVTVTGSNELLQVTNELPDISRDGLTTEIINLDNHFDDADPGDVVSYSVFSATLVGGDPL
PANFWANNIFISGIDSNELHIEYSDYAANQVRLPVEITVQASSSDGISNPVTSTFILSPD
PQETVDIRLIARSTASSGRDFTYFRAERSFEQIITEAGAGQFHLINNGQDLDYTIFLNSY
DIDLNTDLQAVRIIDTSDGDAVQFTIFNKVAADDNPVIDTSIGVNTLSGTWTAGEGLTSE
IIDKLYNGVLAIQVEEVGGTISIASGNNITVSPEVDDVNNLPTGQTEFFTEEDYVIEIWI
SDRLSQVLAGQSTTGLSGITFDLTWEGEGNIPQALQSFAGNGASAFHLLPDVANPDNDNN
IVADFRGSGINPGVGDGPRYARVGYVSFNADSETPVGNPVDYTINFSAGDSVSRNGVGEI
DLSQISIVGAAVTHLPTQEFLVQTDQSSISVSGTVDLNGEIVNLTPQAVGLDEASMSGRF
NVSLDDLDNPTMIQIVNSFVELNPSGLAIPNRGATGGLSDFDLADFGLVGNSTNGPLNIA
LRDAIAAVFSSQQSLSGGSFDITEAWQLENGQIDSFLVVGGNFPVNENSESTNGLSMTFF
DPQTTPPAGLASWSHAELTEVSPGIYELIIPISRRISFTDSNGAVIELDFVGSIATIFNS
DQSDQFGDTIATAEETGLSSSNLGTQVFQGTIGNNSSLDDPLTDVDMFKVELNVGDTVTV
DVDADMFGTGLDSVIYIFDSNGNQVAFSDNDLDAPNEFLIDLGAKDSFVSFTNQTGSQDT
FYIGVSALNDAFDISTPYNPENLVDRDVDNNPNVNVDVFDIGSYDLTISVSTGAAPLHGT
QTGTNNEVLTEGTAVDLVVVRNQTEIDSTGHVNSLPSSDTWIDEWSSFWVEIYIETADAK
AITEAMADLNYNTNFFTATEIEFGKAFADDGKAVIDDSTGVVSSLSGTTTIERTGSYKKA
LLARVKFESLEQDDVSIDFEDKFIGPHALGLSLSNVNVGLTDDVNTNIIVGDAPETDLWA
IAYDVNDDDTINFRDLMILASVYGQNVLDTNSPYVWALDADKSGSVNFKDLSFFATNYGV
YKGGNREVVYPSNFLQRWYGNTTDITGDSSIDDVMQEALGIWQDALGLEQPLDIQLVITD
LGGTQLGEGQITAVDEEGRPIAGIVTLDDDAAGLGWYSDISTTAFGGTELEGGVAHTADS
NSDAVGRYDLLTVLLHEIGHVAGFTQTYAPFGSHVEVGVGGTLSFVGSGFEATLTNDGLH
LDETVHAGDIMNATLDPGVRKLPSVLDTLILQTAHETAANGNFEIQVGVNAPLMANLPTT
DQLVADSAMNQQSIDVITDVESFVDLEPSVIQISSNLSDQSNRVLSQFNLASNLLNLKDS
GLDQDELDLTVLEDLVSDLRQNGLAIVGSGETNTVFDSDLDETELDLFGLDERVEAGFDD
VFSDWTGPIL
NT seq
8313 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagcctgaagagattgtttggccgtaaatctgctcgcaaaattaatcgtcgtttg
ccatttcgggtctctcgcccgattggctatgcgagccatgtcgaacggcttgaagatcga
actttactcgccagcaatattctggcttcgctcgaaagttcagtaaatcagcccaatgac
acgacggaactgaccctgaatgtcgggccaggtagttcacccacattgggatttgaagtt
agagcggccgccaactctgtctttgatccggcagcgatccgcattttcgatgctaataca
aatgcagttgttcccctagaactcgctgaaaatgatcataatggttcgacgaactcactt
gccttggctactttgagtcctagtacttcataccgaatcgaagtcaatgggcaaacttct
gacatcggtggttttattgttgatgtgttcctacccggtgacatggatggtagtggttct
gtttctgataccgaacgactacacgcatttgtagccatgcaacagcatctatttggtttc
aatggtgtcacacctcacttggtacagcaactgggattggaccccagcgccagcttctat
tcagaagagttagatggtgacagagatggtgacgtcgataattacgatttggaattggtg
gaaggaaatcaaaacctccccgccgttcaactcgaactgattggtgatcaggatgcacct
cagatcattgctggtttgcaaatcgattccggtgtttccgattccgatgggatcactaac
gatttaaccatcttggggaatatctctgatgagagcttgattacacaatttaaagtagga
ctggatggcgctcccctggtcgatttcgttgatattttcccactcatttctggtggtgcg
aatggtggctcgtttacgctttctcgtagttggatagagaccaatctgaataatggaaat
tctctggagggcggcacgcatactctcagcttctttgcacaggatgagcatgacaacaat
aatgtcgattccttcttcgatgtgactttcgagttggatgtaaccgatcccactgttaca
ggaacacagattacaaatcagaatgaagatgaagattttggttcactggatctgggacct
ctgaccaacttcttcaatcagaacggtggaacggcactcagcttccaggtcgatagtatc
acgaatccgattgtcaccgtggacttctcgtctggaaatttagtcttgaactctattcag
gatgcctttggctcaactgacattgtgattctggcaatggatttagctggtaactctgtt
ctctcaaatttattttccgttgatgtaaatccacagaacgatgcgccagtcgccatcgat
gatgcttttacgacagacgaagacacggtattgaacggtggcagcaatgtatttgccgcg
aaccccacaacgcctgattcggatgtcgaaaacgaccccttcactgttactgaagtcaac
ggaaatgctgcgagtgtcggcaatcagatcacactaacatcgggagcactgttgactctc
aactcggatggtacatttacttataatcccaacggtcagtttgagtatttggctgctggg
gcatcggcaactgatagttttacgtataccattgatgatggcacaggcaacttgattacg
accgatacggccacggtgacgatcacgatcaacggtgtgaacgatgacgccttgattggt
ggtgacaatgcgggtgacatgacggaagacgaagccggtgacagcggcacgctgacaatt
acggacgtggatgatggggaagatgtgtttgtgacacagtcatcgacagtggggacacat
ggtaccttctcgattgacgcggccggcaactggacctatacccggacagcggatctgaat
gcgttgaatgccggggatcaagtcaccgacacgttcactgtgacctccagcgatggtacg
gcgaccgaggatgtgacgatcacgatcaatggtctgaacgatgacgccttgattggtggt
gacaatgcgggtgacatgacggaagacgaagccggtgacagcggcacgctgacgattacg
gacgtggatgatggggaagatgtgtttgtgacacagtcatcgacagtggggacacatggt
accttctcgattgacgcggccggcaactggacctatacccggacagcggatctgaatgcg
ttgaatgccggggatcaagtcaccgacacgttcactgtgacctccagcgatggtacggcg
accgaggatgtgacgatcacgatcaatggtctgaacgatgacgccttgattggtggtgac
aatgcgggtgacatgacggaagacgaagccggtgacagcggcacgctgacgattacggac
gtggatgatggggaagatgtatttgtgacacagtcatcgacagtgggaacgcatggtacc
ttctcgatcgatgcggctggcaactggacctatacccggacagcggatctgaatgcgttg
aacgccggggatcaagtcaccgacacattcaccgtgacctccagcgatggtacggcgacc
gaggatgtgacgatcacgatcaatggtctgaacgatgacgccttgattggtggtgacaac
gcgggcgatatgacggaagacgaagccggtgacagcggcacgctgacaattacggacgtg
gacgatggggaagatgtatttgtgacacagtcatcgacagtgggaacgcatggtaccttc
tcgatcgatgcggctggcaactggacctatacccggactgcggatctgaatgcgttgaac
gccggggatcaagtcaccgacacattcaccgtgacctccagcgatggtacggcggaggat
gtgacgatcacaatcaatggtgtgaacgatcctccggtcgcggaagcggatgcgtttacg
acggacgaagacacgagtaccggcggtgatctgtttgccgataacgggagtggtgtggac
agcgatccggacagtagcgcgagtttcacaatcacggaagtcaatggtgtatccggtgat
gtgaataacccgatcattctggcatcgggtgcgacgctgacagtgaattccgatggtacg
tttacttacgatccttcaagttcgagccagttcaatgctctggcagccggtgcgcaggac
acggacagcttcagttatacgatcgacgatgggttgagtggtacagatacagccacggtg
acgattacaattaatggtgtgaatgatcctccggtcgcggaagcggatgcgattacaacg
gacgaagacacgagtaccggcggtgatctgtttgccgataacgggagtggtgtggacagc
gatccggataatggggcgagtttcacgatcacggaagtgaatggtgtatcaggtgatgtg
aataatccgatcgtcctggcatcgggtgcgacgttgacagtgaacgatgatggtactttc
agctacgatccttcaagttcgagccagtttaatgctctggcagacggtgagcagggcacg
gacagcttcagttatacgatcgacgatgggctgagtggtacggatacggccacagtgacg
atcacgatcaacggtgtgaacgatcccgtcacagcacaagatgacgctgtcacgactagc
aaaaacaacacgattgagattgatgtaacagccgacaatgggaatggtcctgatacggat
cctgatacgaacgatgtattgacggtgattgtaattgacggtcaaaacgttactttaggt
cagacgatcacattaagtggagtggattcggtcgctacagtcacactcaataataatggg
accctaacctatgatccaaatggccaattcgatggtttaaatctaccttcagagacagcg
acggatacatttacctatacgattgatgataataatggttcaacttcgagtgctacagta
actgttaccgtcactggtagtaatgaattattgcaagtgacgaatgagttgcctgatatc
tctcgggatggtctgacaaccgaaatcatcaacttggacaaccattttgatgatgctgat
cccggtgacgtagtcagttacagcgttttctccgcaactctggttggtggagatcctttg
ccggcaaacttctgggcgaataatatctttatttccggaattgattcaaatgaattgcat
atcgaatatagtgattacgctgcgaaccaggttcgtcttcctgtagaaattactgttcaa
gcatcttcaagtgacgggatctcgaatcctgttaccagtacgtttattttatctcctgat
cctcaggaaacagttgatattcgactgatagctcgttctacagcatcttcaggccgtgac
tttacttatttccgggctgagcgatcttttgaacaaattataactgaagcgggtgcagga
caattccatctcataaataatggacaggatttggactatacaatctttctgaatagctat
gacattgacctgaatactgatttgcaagcagtacggataatcgatacatcagatggagat
gcggttcaatttacaattttcaataaagtagctgctgatgataatccggtaatcgacacg
tcaataggtgttaatactctgtcaggaacatggactgctggtgaaggattgacaagcgag
attatagacaaactctacaatggagttttggcaattcaagtagaggaagtaggaggtaca
atcagcattgcttccggtaataatattactgtttcaccagaagttgatgatgttaataat
ctaccaacgggacagactgaatttttcacagaagaagattacgtaatagagatctggatc
agcgatcgactgtctcaagttttagcaggacaatcaacgactggtttatctggtattaca
tttgatctaacttgggaaggagaaggcaatattccccaagctctgcagtcattcgctgga
aatggggctagcgccttccatttacttccagatgtagctaaccctgataatgacaataat
atcgttgctgatttccgaggttcgggaattaatcctggtgttggagacgggccacgctat
gcaagagtcggttacgtatcattcaacgcagactctgaaacgcctgtggggaatccagtt
gattacacgattaattttagtgcaggtgattctgtttctagaaatggtgtcggagagatt
gatctcagtcaaatttcaatcgttggggctgcggttactcatcttccgactcaggagttt
cttgttcaaacagatcaaagcagtatctctgtttcagggactgtagaccttaatggcgaa
atagtgaatttaacccctcaggctgttgggctagatgaagctagcatgagtggtcgtttc
aatgtttctctcgatgatcttgataatccgacgatgattcaaattgtaaattcatttgtc
gaactcaatccttctggtttagcaattccaaatcgtggtgcaactggtggactaagtgat
tttgatttagccgatttcggtttggtaggaaatagtacaaatggtccattaaatattgcc
ttacgagatgcaattgctgcagtattttccagtcaacagtctctctctggtggatcattc
gatattacagaagcatggcaacttgagaatgggcaaatagattcatttctcgtggtaggt
ggtaattttccagtaaacgaaaactcagagtcgacgaatggtctttcaatgaccttcttt
gatccccaaacaactcctcctgctgggttagcttcatggagtcatgcagaattgactgaa
gtatcaccgggaatctacgaattgattattccaatcagtcgtagaatttcatttaccgat
tcaaacggagctgtgattgaattagatttcgttggatctatcgcaactatattcaactct
gatcaatcggatcagtttggtgataccattgctactgcggaagaaaccggactgtcatct
tctaatctagggacacaggtttttcagggaacgattggtaataacagctcgctagatgat
cccctgactgatgtggatatgttcaaggttgaattaaatgtcggtgatactgtcacagta
gatgtcgatgcagatatgtttgggactggacttgatagtgtgatttacatttttgattca
aatggaaatcaggttgcattttcagataatgacttggatgctccaaatgaatttcttata
gatctcggagcaaaagattcatttgtctcattcacgaaccagacagggagtcaagacacg
ttttatattggtgtgagtgctttgaatgatgcttttgatatttcaacgccttacaatcca
gagaatcttgttgaccgtgatgttgataataatccaaacgtaaatgttgatgtattcgat
attggcagttatgacctgactataagtgtcagtactggagcagcacctttacatggaaca
caaactggtacaaacaatgaagttttgacagaaggtactgccgttgatctggttgttgtg
cgaaatcagactgagattgattcaaccggtcatgttaatagtttgccaagcagtgatacc
tggatcgacgaatggagttcgttctgggtagaaatctatatagaaaccgctgatgcaaaa
gcaatcactgaagctatggcagatttgaattacaacacaaacttctttactgccacagaa
attgaatttggtaaggccttcgctgatgatggaaaagcggtaattgatgattccactggc
gtcgtgagttcattgagtggtacaacaaccattgagcgaacaggaagctacaagaaagct
ctattggcacgtgttaagtttgaatcgctggagcaggatgatgtttcgattgacttcgaa
gacaaattcatcggtcctcatgcattgggactttcactcagcaatgtcaacgtgggactg
actgatgatgttaatacaaacatcattgtcggggatgcccctgaaacggacttatgggcc
attgcctatgatgtaaatgacgatgataccatcaatttccgtgatctaatgatcttagcc
tccgtctatggccagaacgtactcgatacgaactctccctatgtctgggccctcgatgcc
gataaaagtggttcagttaactttaaagatttgtcgttctttgccaccaactatggggtg
tataaaggtggtaatagagaagtcgtttatccttcaaacttcctgcaacgttggtatggt
aacacaaccgacattaccggtgattcttctatagatgatgtaatgcaggaggctctcgga
atctggcaggatgcattagggctggaacaaccgcttgatattcaactggtaattaccgat
ctggggggaacccagttgggtgaggggcagattacggccgtcgatgaagagggacgtccc
attgccgggattgtgacgctcgatgatgatgcagccggattaggctggtattctgatatc
agcaccacagcctttggcggtactgaattggaggggggagtcgctcatactgctgatagt
aattcggacgcagtcggccgatatgacttgctgacggtattactacacgaaattggtcac
gtcgccgggtttactcaaacgtatgcaccattcggcagtcatgtcgaagtgggtgtgggt
ggaactttaagcttcgtcggtagcggatttgaagcgacattgacgaatgacggtttacac
ctggatgaaactgttcatgcaggcgatatcatgaatgcgaccttggatccgggagttcgc
aaactgccttcggtactggatacactcattctgcagactgcacatgaaacggcggctaat
gggaacttcgaaattcaggttggtgtcaatgctcctctgatggcgaatctgccgactact
gatcagttagtagcagactctgccatgaatcaacagtcaatagacgttatcactgatgtc
gaatcgtttgttgatttggaaccgagtgtcatccaaatttccagcaatctctcggatcag
agcaatcgcgtgctatcacaattcaatctagcgtcaaatctcttgaatcttaaagattcc
gggttggaccaggacgaactcgatctgacggtactcgaagatttggtcagtgacctgcgt
caaaatggattagcaattgtgggaagtggtgaaacgaacactgtttttgactctgatttg
gatgagacagaactggatctattcggtttggatgaacgagttgaagccggatttgatgac
gtcttctctgactggacaggaccaattctctag
DBGET
integrated database retrieval system