Candidatus Comchoanobacter bicostacola: MMH89_02820
Help
Entry
MMH89_02820 CDS
T08376
Name
(GenBank) tyrosine-type recombinase/integrase
Organism
gbac
Candidatus Comchoanobacter bicostacola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Phage_integrase
Phage_int_SAM_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTC24156
LinkDB
All DBs
Position
complement(584455..585627)
Genome browser
AA seq
390 aa
AA seq
DB search
MKQKYIPKSIVPSAHILARVNLSGPYEQDVYYLRLFLLSYANSKDTYNAYRRDVERFLQW
LWYIKGQQLTEVNRETCLEYIAFFKAPPLHWIADKNYPRFEDESVLAFNQDWRPFVAKLG
QYQPSASGLKAMLACLSTFFTFLIQEVYLSINPVQCLKQKKQIVGTQVSMQIKRRLTPSQ
WRHVIDVIQKKAGLNPSYQRHLFMLTIFYLLGVRISEVSCSDKRIVMMSSFYKDRNNCWW
YEAHGKGNKIRSIAVPDALLDALLVYRKHLGIVGYPTPSETVYLFPKLRGIGGLGQRQIR
SVIAESFELAEHSLRVKGRVDDADHLKSATVHWLRHTSISDDVQNRPGEHVRDDAGHANI
STTSLYIDVLDEQRHASAKRKKLLPDDTSV
NT seq
1173 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaaaatacatacctaagtctattgttcctagtgctcatatactggcacgagtc
aacctttctgggccttatgagcaagatgtttattatttgaggctgtttttactcagttat
gctaattcaaaggatacttataatgcttatcgtcgtgatgtagagcgatttttgcaatgg
ctatggtatataaaagggcagcaattgaccgaggtcaatcgtgaaacatgtctggaatat
attgctttttttaaggcgcctcctttacattggattgcagataaaaactatccgcgcttt
gaggatgagtctgtgcttgcttttaatcaagattggcgaccgtttgtagccaagctgggg
cagtatcagcccagtgcatctggccttaaagccatgctggcttgtttatctaccttcttt
actttcttaatacaggaggtgtatctatctattaatcctgtgcagtgcttaaagcaaaaa
aaacaaattgtaggaactcaagtttctatgcagattaaaaggcgcttgacgccgagtcag
tggagacacgtcattgatgtgattcaaaaaaaggcagggttaaatccaagctatcagcgt
catttgtttatgttgactatcttttatttactcggcgtacgtatttcagaagtgtcctgc
tcagataaacgtatagtgatgatgtcttcattttataaagatcgcaataattgctggtgg
tatgaagcgcatggaaaagggaataagatacgttccatagcggttcctgatgctttactg
gatgcattgctggtttacagaaaacatttaggtatagtgggttacccaacgcccagtgag
acggtgtacttattccctaagctaagaggaataggaggacttggccaaagacagattcgt
tcagtgattgctgaaagttttgagttagcggagcactcacttagagttaaaggcagggta
gatgatgcggatcatttgaaaagtgctacagtgcattggttgcgtcatacttctatctca
gatgatgtgcaaaataggccaggagaacatgttcgtgatgatgccggccatgctaacatt
tctacaaccagcctgtatattgatgttttggatgagcaaagacatgctagtgctaagcgt
aaaaagcttttgcctgatgatacttcagtttag
DBGET
integrated database retrieval system