Gloeomargaritales cyanobacterium VI4D9: LQF76_07675
Help
Entry
LQF76_07675 CDS
T08937
Name
(GenBank) CHAT domain-containing protein
Organism
gcy
Gloeomargaritales cyanobacterium VI4D9
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHAT
DUF5649
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAS03919
LinkDB
All DBs
Position
1652880..1659059
Genome browser
AA seq
2059 aa
AA seq
DB search
MSGSGTKISSDSGAISITGTGQGTGFNNYGIIQQSSAQVSTTSGKITYTGMGAGTDDAIR
TEFGSNIIGDNTSGKITLTSTNNGITLDNVTVKTTNNITINSPGNVIQNNTGGLFADGLE
LQGTGAYTLTNPNNDIAKLAANGTGNIKYTDVNGFAIGTVNTTNGVNVGANNLTLKAGGA
VTQSEAITASGLELLGSGSYDLDNTSNNISTLAANTNNIKYTDTDGFAIGTVNTVGIDTN
NNNLTLKSNSTTDTITFTQNVTTGTGNLVVEAGTIDQTGGVITTTGTASFTATKANTGNV
IAKNVNAGGTVLGTSEIGGDFTLTSTGNVTQAGGATLKVAGKTTITAPGATTTNPGNVLP
YYIDPAGNVTIEKVGSINLSAQTVTGNLSVTSLASGNAYASVFSGSAINLNQANSFGGTV
SFNTKTDTYGATSGTPGISQSGAQTVAGTSTFNAVGGTITLNDASNTFTGAVTLNTGATG
GNISFTNNATTSLGNVTTANTANVTLNISGATTQVTGTAITAGGLELLGSGSYDLDNTSN
NISTLAANTNNIKYTDTDGFAIGTVNTVGVNTGGNLTLTAGGAVTQSEAITASGLELTGA
TATYTLTNPNNDITTLAVSTNNNFSYTDISGFAIGTVGSTSGISAPGKDVTLTAGGAVTQ
SEAITASGLELLGSGSYDLDNTSNNISTLAANTNNFIKYTDTNGFAIGTVNTTNGVNVGA
NNLTLKAGGAVTQSEAITAGGLELLGSGSYTLTNATNNINTLAANTTNNIKYTDTDGFAI
GTVNTVGVNTGGNLTLTAGGAVTQSQAITASGLELLGSGSYDLDNTSNNISTLAANTNNF
IKYTDTNGFAIGTVNTTNGVNVGANNLTLKAGGAVTQSEAITAGGLELLGSGSYTLTNAT
NNINTLAANTTNNIKYTDTDGFAIGTVNTVGVNTGGNLTLTAGGAVTQSQAITASGLELL
GSGSYDLDNTSNNISTLAANTNNIKYTDTDGFAIGTVNTTNGVNVGANNLTLKAGGAVTQ
SEAITASGLELLGSGSYTLTNATNDINTLAANTTNDIKYTDANGFAIGTVNTVGVNTGGN
NLTLTAGGAVTQSQAITASGLELTGATATYTLTNPNNDITTLAVSTNNNFSYTDISGFDI
GTVGSTNGISAPGKDVTLTAGGAVTQTQKITASGLELKGTGSYTLTNTSNDISTLAANTT
NDIKYTDTNGFVVGTVNTTNGISSPGKNVTLTAGGAVTQTQKITASGLELKGTGSYTLTN
TSNDISTLAANTTNDIKYTDTNGFVVGTVNTTNGISAPGKNVTLTAGGAVTQTQKITTGG
LELSGSGNYTFTNASNNVQTLTVKTSGNVNYQDADALSFNTVGIVGGLDLDAVGSITQTS
NVTSTGKVDIASLSGSILASGKDITTTTTNKGILLTATSGVITAGNLTTQGGQVGIQTSA
GLIQVGDVKTNGGQISVISPSSIKTGILNSSGNISITGNGVQVDHIIGGSGSVSIFSSNG
FKATGQNSSGFSIQTTGGLIDIQYAPSGIFKVGSTAGNGTQGKITNGFITLDTGLTFICF
PSDCGVFKNMSIRTTDSASTSQKSKSLEDASKIVREVLPTLTLREVPTRQILDVSEVLRT
QLDVATEEAILSLDVAFGAEFANYLGVKPANTLRSAADVRKLLEDIYKQTGRKTAIIYWV
LDQLYLNIVLITPGVPQGVAQNQGVLVASVDLATGLVQQPKTAPLTYRGVPTARRDEVIR
VINRFRNQVADRRLVGNRDYLKDAQALHRWLIEPIEPELQAQGIDTLLVVPDKGIRLLPL
GALYDGKQFLIEKYNVAMTPSINLISTRYRPLQGAEVLAMGASTFANESPLPSVPTELKT
ITNIWPGRYFLNQDFTPERLMQERKAGQFRMVHLATHAFFKPGDLSESYIVFGNNQKLPV
TKLPDLSLQGVELFSLGACRTLIGDGTDPTVEFGFAGLAVKTGVETAVASLWNVEDTATM
ALMTEFYRSLQKTPIKAEALRQAQLALMQGQTKVEGGQLRLVTRSGQSIPLPPELTKVKD
LDFSHPYFWSGFSMIGSPW
NT seq
6180 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtccggttctggcaccaaaatcagtagtgatagtggagccattagcatcacaggtacg
gggcagggtacaggtttcaataactatggcattattcaacaaagtagtgctcaagtaagt
accactagcggcaaaattacctatacaggcatgggtgctggcacagatgatgctatccgt
acagaatttggcagtaacatcatcggtgacaatacgagtgggaagattaccctcacctcc
acaaataatggcatcaccctagataatgtcaccgtcaaaactactaacaacatcactatt
aattctcccggtaatgtaattcaaaataatactggtggtctatttgcagatggattggaa
ttacaaggcacgggggcatatactctcaccaatccgaataatgacattgccaagttagcc
gccaacggtacaggtaacatcaaatacaccgatgtgaatgggtttgcgattgggacggtt
aatacgaccaatggggtcaatgttggggcaaataatctcaccttaaaagcgggtggagca
gtcacccaaagcgaagcgattacagcgagtggtttggagttgttgggcagtgggagctac
gacctggataataccagcaacaacatcagcaccttagcggcgaataccaataacatcaaa
tacaccgacaccgatgggtttgcaattggcacggtgaataccgttgggatagacacgaat
aacaacaatttaaccctcaagagcaattcaaccaccgatacgattacttttacccaaaat
gtcacaacgggcacgggtaatttagtggttgaagctggcactattgaccaaacagggggt
gtgataacgacaaccggcacagcgagtttcactgctacgaaagcgaatacgggaaatgtt
attgccaagaatgtgaatgctggtggcactgttttgggtacatcagaaattggtggcgac
tttaccctaacctctaccggcaatgttacccaggcggggggcgcaacgttgaaagtagca
gggaaaaccaccatcactgctcctggtgcaacaactactaatccagggaatgtgcttccg
tactacatagacccagcggggaatgtcacgattgagaaggtggggtcgattaatttatca
gctcaaacggtgacgggtaatttgagtgtgacatcacttgcgagtgggaatgcctatgcc
agtgtatttagtggcagtgcgataaacctgaatcaagccaatagttttggtggcacggtc
agttttaatacaaagacggacacctatggggcaacaagtggcacaccaggaattagccag
tctggggcacaaacggttgcaggtaccagcacctttaatgcggtgggtggcacgattaca
ttgaatgatgcgagtaataccttcactggggcggtcacgctgaacacgggggcgacgggt
gggaacattagttttaccaataatgcaacgaccagtttgggtaatgtcacgactgcaaat
actgcaaatgtgacgcttaacatcagtggtgcgaccacgcaggttacagggacggcgata
acagcgggtggtttggagttgttgggcagtgggagctacgacctggataataccagcaac
aacatcagcaccttagcggcgaataccaataacatcaaatacaccgacaccgatgggttt
gcaattggcacggtgaataccgttggggtgaatacaggtggtaacctgaccttaaccgca
gggggagccgtcacgcaaagtgaagcgataacagcgagtgggttggaactgacgggagca
accgccacctacaccctcaccaatccgaataatgacatcactacacttgccgtaagtacg
aataacaacttcagctacaccgacattagtgggtttgcgattgggacagtaggcagtact
agtgggattagtgcccctggtaaggatgtgaccttaaccgcagggggagccgttacgcaa
agtgaagcgataacagcgagtgggttggagttgttgggcagtgggagctacgacctggat
aataccagcaacaacatcagcaccttagcggcgaataccaataatttcatcaaatatacg
gatacaaatgggtttgcgattgggacggttaatacgaccaatggggtcaatgttggggcg
aataatctcaccttaaaagcgggtggggcagtcacgcaaagtgaagcgataacagcgggt
ggtttggagttgttgggcagtgggagttacaccctgaccaacgcaacaaacaacatcaac
accttggcggcgaataccaccaataacatcaaatacaccgacaccgatgggtttgcaatt
ggcacggttaataccgttggggtgaatacaggtggtaacctgaccttaaccgcaggggga
gccgttacgcaaagtcaagcgataacagcgagtggtttggagttgttgggcagtgggagc
tacgacctggataataccagcaacaacatcagcaccttagcggcgaataccaataatttc
atcaaatatacggatacaaatgggtttgcgattgggacggttaatacgaccaatggggtc
aatgttggggcgaataatctcaccttaaaagcgggtggggcagtcacgcaaagtgaagcg
ataacagcgggtggtttggagttgttgggcagtgggagttacaccctgaccaacgcaaca
aacaacatcaacaccttggcggcgaataccaccaataacatcaaatacaccgacaccgat
gggtttgcaattggcacggttaataccgttggggtgaatacaggtggtaacctgacctta
accgcagggggagccgttacgcaaagtcaagcgataacagcgagtggtttggagttgttg
ggcagtgggagctacgacctggataataccagcaacaacatcagcaccttagcggcgaat
accaataacatcaaatacaccgacaccgatgggtttgcaattggcacggtgaatacgacc
aatggggtcaatgttggggcgaataatctcaccttaaaagcgggtggagcagtcacccaa
agcgaagcgataacagcgagtgggttggagttgttgggcagtgggagttacaccctgacc
aacgcaacaaacgacattaacaccttagcggcgaatacaactaacgacatcaaatacacc
gatgcgaatgggtttgcaattggcacggttaataccgttggggtgaatacaggtggtaat
aacctgaccttaaccgcagggggagccgttacgcaaagtcaagcgataacagcgagtggg
ttggaactgacgggagcaaccgccacctacaccctcaccaatccgaataatgacatcaca
acacttgccgtaagtacgaataacaacttcagctacaccgacattagtgggtttgatatt
gggacagtaggcagtaccaatgggattagtgcccctggcaaggatgtgactttgacggca
gggggagccgttacacaaactcagaagattacagcaagtgggttggaattaaagggtact
ggaagctacaccttaaccaacaccagtaatgacatcagcaccttggcggcaaatacgacc
aatgacatcaaatacacggatacaaatgggtttgtcgttgggacggtgaatacaaccaac
gggattagttcccctggcaaaaatgtgactttgacggcagggggagccgttacacaaact
cagaagattacagcaagtgggttggaattaaagggtactggaagctacaccttaaccaac
accagtaatgacatcagcaccttggcggcaaatacgaccaatgacatcaaatacacggat
acaaatgggtttgtcgttgggacggtgaatacaaccaatgggattagtgcccctggtaag
aatgtgactttgaccgcagggggagccgttacccaaactcagaaaattacaaccggtgga
ttggagttatctggtagtgggaactataccttcacaaatgctagtaataatgtgcagact
ttaactgtgaaaacaagtggaaatgtaaactatcaagatgctgatgcacttagttttaat
actgttggtattgtgggtggactggacttagacgcagtgggaagtattactcagacctca
aatgttacttcgactggcaaagttgatatagcatcgctcagtggtagtattttagcttct
gggaaagacatcactacaacaactacaaacaaaggaatactattgactgctactagcggt
gtaatcacagcaggtaatttaaccacacaaggtgggcaggttggaattcaaacttctgcc
ggtttaattcaggtgggtgatgtgaaaacgaatggtgggcaaattagtgtcattagtcct
agctcaataaagactggaatcttgaattcaagcggtaacatctcaatcactggcaatggt
gtgcaggttgaccatattatcggtgggtctggatcggttagtattttttcctctaatggt
ttcaaggctactgggcaaaattctagtgggtttagtatccaaactactggtggattgatt
gacattcagtatgctccgagcggtatattcaaagtgggttcaacagccggtaatggtact
caggggaaaatcaccaatgggtttataactctcgacacaggcttgaccttcatatgtttc
ccaagcgactgtggtgtttttaagaacatgtctattcgtacaactgattccgcatccaca
tctcaaaaatcgaaatcgcttgaagacgcttctaaaattgttcgagaagttttgcctaca
ttaacacttcgtgaagttcctacacgacaaatcttagatgtatcggaagtcctcaggacg
caactagatgtggcgacggaggaggcgatcctctccctagatgtggccttcggtgctgag
tttgccaactatttgggagtcaaaccagccaataccctccgttcggcggctgatgtacgc
aaactactcgaagacatttataaacaaaccgggcgtaagacggccattatctattgggtg
ctggatcaactctacttgaatattgtgttgattactcccggtgttccccaaggggttgcc
caaaatcagggagtcctagtggcctcagtagatttggcgactggccttgtccagcaacct
aaaactgcaccgcttacttatcggggtgtaccgactgcgcgacgggatgaggtgattcgg
gtgatcaaccgcttccgcaaccaggtggcggatcggcgcttggtgggaaatagagactac
ctcaaggatgctcaagccttgcatcggtggttgattgagccgattgagccagaattgcaa
gcgcaagggattgataccctgctggtggtgccggacaaggggattcgtctcctgccgttg
ggtgcgctatacgacggtaagcaattcctgatcgagaagtacaatgtggcgatgaccccc
agcatcaacctcatctccacccggtatcgtccactccagggtgctgaagtattggcgatg
ggtgcttccacctttgccaacgaaagccctttgccctccgtgccgacagaattaaagacc
attaccaacatctggccgggtcgctatttcctgaatcaggacttcaccccagagcggttg
atgcaggagcgcaaagcgggacaattccgcatggtgcatttggcaacccacgccttcttc
aaacctggggatttgagtgaatcgtacattgtttttgggaataatcaaaaattgccagtt
accaaattgcccgacctatcactacagggggtggaattgttctctttgggagcctgccgc
accctcatcggtgatggcaccgacccgaccgtggaatttggctttgcgggcttggcggtg
aaaaccggtgtggaaaccgcagtggcctccctgtggaatgtggaggatactgccacaatg
gcgttgatgacggaattttatcgttccctccagaaaacccccatcaaggcagaggcattg
cgacaagcccaactggcgttaatgcaaggccaaaccaaagtggaaggcggtcagctacga
ttggtgacccggagcggccagagtatccccttaccgccagaactgaccaaagtcaaagac
ctagacttttcccatccctacttctggtctgggtttagtatgattggcagtccctggtag
DBGET
integrated database retrieval system