Geminocystis sp. NIES-3708: GM3708_1869
Help
Entry
GM3708_1869 CDS
T04168
Name
(GenBank) phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter
KO
K24846
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial PglK [EC:7.5.2.-]
Organism
gee
Geminocystis sp. NIES-3708
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gee00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gee02000
]
GM3708_1869
Transporters [BR:
gee02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
GM3708_1869
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
SMC_N
AAA_29
Mg_chelatase
RsgA_GTPase
nSTAND3
AAA_22
AAA_18
DUF2544
SbcC_Walker_B
RavZ_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAQ61463
UniProt:
A0A0D6AFA5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2043866..2045662)
Genome browser
AA seq
598 aa
AA seq
DB search
MAKVNLKFLQLFDSHAQFHAFSLVIFMIIGAILETFSIGIIPTFIYLLNKPDIIENNVYL
HWLSQLLRVNSNQQFLIYLTIALIIIYVFKNTYLTFFAYIQSRFIFTQQINLSRRLFSSY
LSYSYTFHLERNSAELIFHLNNEVNTAFRQVIIPIMTLATELIIVTFIVVFLIIVQPLAS
LISVCLIGISVSIFYKFIHKKAQILGKKRQYHHSKMIQGINECLGGIKEIKVLRREKFFI
DEFINHSRKYNNISLWITTINATPRLFLETIAVTSILLIVIIILIQGKNIDSILPIISLF
AIASFRLIPSANRILVSLISIRSHYNSIDVIHHDLELISENKTKNQSNQSPETILQFTDS
ISIKNIHYQYPNSSYSSLENICLSIPKNHSIAFIGTSGAGKTTLVDIILGLLTPIQGKVL
VDGNNIQDYLKDWQQKIGYIPQNIYLADDSILANIAFGLPAEKIDKEKVYQALEAAQLKE
LIDSLPRKLETKVGDRGIRLSGGQKQRIGIARALYHNPEILVMDEATTALDNETEREFIK
ALDRFSGKKTIIIIAHRLTTVQKCDHLYLMEKGKIVSSGNYDQLSTNCDKFMKLNGVK
NT seq
1797 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaaagttaatttaaaatttttacaactatttgattctcatgcacaatttcacgca
tttagtcttgttattttcatgattattggtgcaatattagaaacttttagtatcggtatt
attcccacatttatttacttacttaataaaccagatattatcgaaaataatgtctacctt
cactggttatctcaacttttaagggtaaattctaatcaacaatttctgatttatttaacc
atcgctttaatcatcatttatgtttttaaaaacacttatttaactttttttgcttatatt
caatctcgctttatttttactcaacaaattaacttatctcgtcgtttatttagtagttat
ttatcttactcttatacatttcatcttgaacgaaattctgcggaattaatttttcatctt
aacaatgaagtaaatactgcttttcgtcaggtaataattcccataatgactttagccaca
gagttaattattgttacttttattgtagtttttttgattatagttcaacctttagcttct
ttaatatccgtctgtttaattggaataagtgtttctattttttataagtttattcataaa
aaagctcaaattttaggaaaaaaaagacagtaccatcatagcaaaatgattcaaggaatt
aatgaatgtttaggtggcataaaagagataaaagttttaagacgagaaaaattttttatc
gatgaatttattaatcattcccgtaaatataacaatatttccctttggataacaactatt
aacgctactcctcgattatttttagaaactatagcggttacgtccattttattgatagtt
attatcatcttaattcaaggtaaaaatattgactctattcttccaataatctctcttttc
gccatcgcttcttttcgtttaataccttcggctaatcgaattttggtatcattaatttct
attcgttctcattataattctatagatgttattcatcatgatttagagttaatttctgaa
aataaaacgaaaaatcaatcaaatcaatcaccggaaacaatattacaatttaccgattct
attagcatcaaaaatattcactatcaatatcctaattcttcttattcttctcttgaaaat
atttgtctttctattcctaaaaatcattctatcgcctttattggcacttcaggtgctgga
aaaactactttagtcgatataattttaggtttattaacccctattcaaggaaaagtgtta
gtagatggtaataatattcaagactatctcaaagattggcaacaaaaaatcggttatatt
ccccaaaatatttatctagcggatgattcgattctagctaatattgctttcggtttacct
gcagaaaaaattgataaggaaaaagtttatcaagctttagaagccgcacaattaaaagaa
ttaattgatagtcttcctcgaaaattagagacgaaagtgggtgatagaggtattcgttta
tcaggtggacaaaaacagagaataggtattgctagagcactatatcacaatcccgaaatt
ttagtaatggatgaagccaccaccgccttagataatgaaacggagagagaatttatcaaa
gcattagatcgatttagtggtaaaaaaactattattattattgcccatcgtttaactaca
gtgcaaaaatgtgatcatctttatttaatggaaaaaggtaaaattgttagcagtggtaat
tatgatcaattatcaacaaattgtgataaatttatgaaacttaatggtgtaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
