Granulicatella elegans: LK443_07090
Help
Entry
LK443_07090 CDS
T09296
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
geg
Granulicatella elegans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
Glucosaminidase
LysM3_LYK4_5
LysM_RLK
PDH_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UEA31036
LinkDB
All DBs
Position
1419293..1421317
Genome browser
AA seq
674 aa
AA seq
DB search
MLETRNERFLRMKKEKQSQKVQMMNQSLKRSLIVVGTTACVGLYISPVEQLLSANYSVVE
ASTAATQFLRNIIPAAQNVARGKDIYTSVMIAQAALESGWGTSALSKAPNHNLFGVKGSY
NGQSVNMQTLEDSGGQNYYSIQANFRKYPSYKESLEDYVDKIVNGISGAPLFYSGAWKSK
TNSYQDATSYLTGRYATDTAYGAKLNRIIEQFGLTKYDTETAVNMAEKIASNETTTTTGN
SYTVVSGDSLYAIARKTGTSIQELLSLNGLNLNSIIHPGQVLALSSKAATTETKQEESAS
KEEKAAEETTNEETSTNTKQASEGGTYTVVSGDGLYAIARKTGTSIDDLLSLNGLSLNST
IYPGQVLKLSVSSETSAHESSTSNEEESSTKETTSEESAASSEQESTGGTYTVVSGDGLY
AIARKTGTSIDDLLSLNGLSLNSTIYPGQVLKLSVSSETSAYESSTSNEEESSSSTKETT
SEESAASSEQESTGGTYTVVSGDGLYAIARKTGTSIGDLLSLNGLSLNSTIYPGQVLTLS
ANSEVATSEETTSSTNAKMYYVHSGDSLYRIAYNHGISLSTLLEWNHLSVDSIIHPGQGL
IVSNGSSSSSEEAETTAEVSEEASSGSVTTYTVQPGDGLWRIAKNHGLTLDELKSLNQLT
SNIIQPGQVLIVSK
NT seq
2025 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctagagactagaaatgaaagatttttgagaatgaaaaaagaaaaacagtcacaaaag
gttcaaatgatgaatcaatcgttaaaaagatctttaattgtagtgggaacaacagcctgt
gttggtttatatatttcaccagtcgaacaattattatcagcaaactatagtgtagtagag
gcttcaactgctgctacgcaatttttacggaatattattccagcagctcaaaatgttgca
agaggaaaagatatttatacttcagttatgattgctcaagctgctcttgaatcaggttgg
ggaacaagtgccttatcaaaagcaccaaaccataatttatttggtgtaaaaggaagctat
aatggacaatctgtcaatatgcaaacattagaagatagtggtggacaaaactattacagt
attcaagcgaactttagaaaatatccgtcttacaaagaatcattagaagattatgtagat
aaaattgttaatgggatttctggtgcgccattattttattctggtgcttggaagagtaag
acgaatagttatcaagatgctacatcttatttaactggacgttatgcaacggatactgca
tacggtgcaaaattaaatcgtattattgaacaatttggtttaacaaaatatgatacagaa
actgctgtcaatatggcagagaaaattgcaagtaatgaaacaactacaacaactggaaat
agttatacagttgttagtggagatagcttatatgcgattgctcgtaaaacaggaacaagt
attcaagagttattaagcttaaatggattaaatttaaactccattattcaccctggacaa
gtgttagcattatcttcaaaagcagcaacaactgaaacaaaacaagaagaaagtgcttct
aaagaagaaaaggctgctgaagaaactacaaacgaagaaacttcaacaaatactaaacaa
gcttcagaaggtggaacgtatacagttgtcagtggagatggtttatatgcgattgctcga
aaaacaggaacgtcaattgatgatttattgagcttaaatggattaagtttaaattcaacc
atttatccaggacaagtcttaaaattatcagtaagcagtgaaacatctgcacatgaatca
agtacttcaaatgaggaagaaagttcaacaaaagaaacaacgagtgaagaaagtgcagca
agttcagaacaagaatcaacaggaggaacgtacacagttgttagtggcgatggtttatat
gcgattgctcgaaaaacaggaacgtcaattgatgatttattaagtttaaacggattaagt
ttaaactcaaccatttatccaggacaagtcttaaaattatcagtaagcagtgaaacatct
gcatatgaatcaagtacttcaaatgaggaagaaagttcaagttcaacaaaagaaacaacg
agtgaagaaagtgcagcaagttcagaacaagaatcaacaggaggaacgtacacagttgtt
agtggcgatggtttatatgcgattgctcgtaaaacaggaacgtcaattggggatttatta
agtttaaatggattaagtttaaactcaaccatttatccaggacaagttctaacattatca
gcgaatagtgaagttgctacatctgaagaaacgacttcttcaacaaatgcaaaaatgtat
tatgttcatagtggagattcgttataccgtatagcgtataatcacggaatttctttatca
accttattagaatggaatcacttaagtgtcgatagtatcattcaccctggtcaaggttta
attgtttctaatggatcaagtagttcatctgaagaagcagaaacaactgcagaagtgtca
gaagaagcaagttcaggttctgtaactacttatactgttcaaccaggtgatggtctatgg
cgaattgcgaaaaatcacggattaactttagatgaattaaaatctttaaatcaattaact
tctaacattattcaaccaggacaagtcttgattgtttcaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
