Geminocystis sp. NIES-3709: GM3709_1716
Help
Entry
GM3709_1716 CDS
T04142
Name
(GenBank) ATP-binding protein of ABC transporter
KO
K18889
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
gen
Geminocystis sp. NIES-3709
Pathway
gen02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gen00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
GM3709_1716
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gen02000
]
GM3709_1716
Transporters [BR:
gen02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
GM3709_1716
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_29
AAA_18
AAA_23
Secretin
NB-ARC
AAA_24
Prenyltrans
AAA_22
MMR_HSR1
AAA_16
DUF4957
AAA
APS_kinase
AAA_33
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAQ64951
LinkDB
All DBs
Position
complement(1910039..1911787)
Genome browser
AA seq
582 aa
AA seq
DB search
MVNNSRLKKLISYLKPHLDKLYWGISALFVVNVIGVYIPWLIRNIFDDLQDNFSLNTIIS
YVLLLFILACIMWAIRMFSRVLIFGIGRQVEFDLKQLIFEHLLKLEPAYFSINTSGDLIN
RATSDVDNIRRLVGFAILSLINTVFAYGLTLPAMLLINVKLSLMALAIYPLMLFTVQLFS
DKLRLDQLEVQEKLSDVSELIQEDMSGISLIKIYAQEDNEKKAFTEKNQSLLNANLKLAQ
TRNLLFPIIQGIANISLLILLWFGTNDIEKSLITVGDFIALIIYVERLVFPTALLGFTIT
TYQRGEVSIDRIDAIINAEPKIKNNASAVTLPIENIKGEIRAVNLNYAYPHSNYLALNNL
NFTIEAGELVAIVGLIGSGKSTLANAIPRLLDIDAGQLFLDGIDITTINLTDLRKSIAYV
PQESFLFSTTIKNNIAYSNPPGEMLDIEYAAKQAQIHPEIMIFPKQYDTLVGERGITLSG
GQRQRSSLARALFADAPILILDDALSSVDNKTATQILENLQQEKGKTIIFITHQLSAVQN
ADRIFVMEGGKIVQSGKHEELFYQEGLYKSLWQQHQLQEILS
NT seq
1749 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaacaactctcggctgaaaaaattaatatcctatttaaaacctcatctcgataaa
ttatattggggtatttcggctttatttgttgttaatgttatcggagtttatattccttgg
ttaattcgcaatatttttgatgatttacaagataatttttctttaaatacgattatcagt
tatgtcctcctattatttattttagcctgtataatgtgggctattcggatgttttctagg
gtattgatttttgggattggaagacaggtagaatttgatttaaaacaacttatttttgag
catttattaaaattagaaccagcttactttagtattaatacttcaggagacttaatcaat
cgtgccactagcgatgttgataatattcgccgattagtagggtttgctattctcagttta
attaatactgtttttgcttatggtttaactttacccgccatgcttttgatcaatgttaaa
ttgagtttaatggcattggctatttatcctttaatgttatttactgtccagttatttagc
gataaattaaggttggatcaattagaagtacaggaaaaactatcagatgttagtgagtta
attcaagaggatatgagcggtatttctttaataaaaatttacgctcaggaagataacgaa
aaaaaggcttttactgaaaaaaatcaaagtttattgaatgctaatttaaagttagctcaa
acccgtaatttattatttccaattattcaaggtatcgctaatattagtcttttaatttta
ttatggtttgggacgaatgatattgaaaaaagtttaattactgtaggggattttattgct
ttaattatttatgtcgaaaggttagtttttcccactgctttacttggttttactatcact
acatatcaaagaggagaggttagtatcgatcgaattgatgctattatcaatgccgaaccg
aaaatcaaaaataatgcttctgcggtaactttacccatagaaaacattaagggagaaatt
cgagccgttaatctcaattatgcttatcctcatagtaattatctcgctcttaataatctt
aattttacgatcgaagctggggaattagtagcgattgtggggttaattggttcaggaaaa
tctactcttgctaatgctattccccgtttattagatattgatgcaggacaactattttta
gatggtatcgatattaccaccattaatttgacagatttgagaaaatcgatcgcttatgta
ccacaggaaagtttcttattctccaccacgataaaaaataatattgcctatagtaatcct
ccaggagaaatgttagatatagaatatgccgctaaacaagcccaaattcatccagaaatc
atgatttttccgaaacaatatgatactttagtgggagaacgaggaattactctatcaggt
ggacaaagacaacgtagttcattagctagagcattatttgccgatgcccccattcttatt
ttagatgatgctttatccagtgttgataataaaaccgctacccaaatccttgaaaatcta
caacaagaaaagggtaaaacgattatttttattactcatcaactatctgctgtacaaaat
gctgatcgaatttttgtgatggaagggggcaaaattgtgcaatcaggcaaacatgaagaa
ttattctatcaagaaggcttatataaatccctttggcaacaacatcagttacaagaaatt
ttgagttga
DBGET
integrated database retrieval system