Geminocystis sp. NIES-3709: GM3709_2112
Help
Entry
GM3709_2112 CDS
T04142
Name
(GenBank) putative polysaccharide export protein
KO
K01991
polysaccharide biosynthesis/export protein
Organism
gen
Geminocystis sp. NIES-3709
Pathway
gen02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gen00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
GM3709_2112
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gen02000
]
GM3709_2112
Transporters [BR:
gen02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
GM3709_2112
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLBB_2
SLBB
Poly_export
DUF5122
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAQ65347
UniProt:
A0A0D6AR61
LinkDB
All DBs
Position
complement(2403626..2405182)
Genome browser
AA seq
518 aa
AA seq
DB search
MIKTNFYDRLLLTSIFVLGYSPLLLAQNISPRQPLKPLSPNSPTNSNTNNFKYDTSRQSN
PSQQFPYTLDSGDVISLDIFNVPEYSKEYQVLVDGTINLPLINRLSVVGLTLAETEALIY
DEYVRSELLKDPIVSINLVSPRPITVAIVGEIRTPGSYSIPFEGSTGTSQGRKFPNLISA
LQLANGINASADSRRVQVVRNYKGQEYIIPVNFWDFLEKGDLSQNIILRDGDRIIIPSAE
EINPVEVLRVATANFSANLSIPITVSIVGEVNRPGPYTLSGDDVRANSLTDSLNFQNTTT
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EDALLQNGDRVFIPTIETIKDSEVRQVAIASFSPNTINVSVVGEVKTPGVKQLPPNVSLQ
QALLQAGGFDNRRANESVAELIRLNPDGTVTRRSIKVDFSSPLSDENNPPLLNNDVIFVE
RSNLAVASDATFAIINPFAQILGIIANTALVVDRFSGN
NT seq
1557 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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tctccattacttttagctcaaaatatcagtcctagacaaccattaaaacctttatctccc
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atactaggaattattgctaatactgcattggtagtcgatcgatttagtggaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
