KEGG   Gemella sp. ND 6198: CG018_04200
Entry
CG018_04200       CDS       T05584                                 
Name
(GenBank) ATP-dependent deoxyribonuclease subunit A
  KO
K16898  ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
geq  Gemella sp. ND 6198
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:geq00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:geq03400]
    CG018_04200
Enzymes [BR:geq01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     CG018_04200
DNA repair and recombination proteins [BR:geq03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     CG018_04200
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 PDDEXK_1 UvrD_C_2 DEAD
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXI26667
UniProt: A0AAD0PYS5
LinkDB
Position
934141..937779
AA seq 1212 aa
MIKIDKIDKFTLNKKYPPTPAQWQAIGIDGADILVAAAAGSGKTEVLSERISRKVAIDRW
DIDKILVLTFTTAAAKNMKVRIENKIADRLLSFDNEEALHFLRKQRMLMNDALITTIDSF
CLSVLRKFYYLVEENIDGEMIYLSPNFNVLPNSKTLLTQVINTVLENTVEISPKLTDILF
TVFNGKKDIVASLQDTYYKLLTIPNFENYLEKEFLININSTVKNFDESVLSEFNLLTDLT
TNNSLQTARQFTKYLESFIENDKNIRRIEDIVISVDLNNVKKEKIFNFFSGDIEQETIFG
SRIENKTKLKKIVNILDENIFLMQDTKQINAQLLETTFLELKSYSEKFNILRSIKDFACS
YQKILRTIHFEFVKTKRKSNFLDFSDLNHLAIKALTKKENGKMILTAAAKYYQKYFLEIY
VDEYQDNNNLQEYILNIIRGENVYFFRVGDVKQAIYGFRGSNPDLFEEKYNSYEKLNIED
YSMEKEYHLKTTKTGICVMLKENFRSEVNVLSSCNYIFNRLMKNFNAGISYDKENALYYP
AVKEKTKLTIPTKIINGKIDYFSGQEIENKKGYREQSIKNIAFEILNGVEQGNNYSDYAI
LVRNSTKMASFKEIFSSYNIPLFFKEKDGFTSSNTFNILYNIFKFLDNTNRDSSLVAILR
SELFSYTNDELLKLSLNNEKTFYKKLKISDEVKDRHTINILNSWLNYSLNNSIRTILEKI
VIDTDFINYLRTVDINDEEVDYYENFLDVVYEYENVNNNLSDFIVYLENIREQEKFETKK
RVSNNSVTLSTIHISKGLEYKYVFIADLDTDFNNQGFSGEVLFTSEFGFSVDVENIATKH
NYEYQSVFPVKLYKLNAQLIKLREREEEIRNLYVALTRAEKGLYLVSPNGIMLNDEEKKQ
ISVTGSVFEAVNFEEILSVVLSNYNNEDRAENELTAEFEYYEPNQNKKVFSVENEREVNF
VEIYKELEVENKDKLIKQKTNKIFPAKTSYSAMKKINKDKDEIIKKDNKEINYLELSNLN
KITTATKALQRGNIIHKLFERIVQSVFEKEEIIDVQSYVENLVRTDNIIYNIKNKTLLTK
EEYNLINNEDDLTKVKMFLESEVISFVKDADTCETELSFTTLKKAKELYNESESNIEVIL
QGVVDLLINIDGQYLIIDYKTDNVSKKNGESILEKRHGEQLKIYKEAVKKYYNCTEVKTY
IYSYTLSKLIEV
NT seq 3639 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattaagattgataaaatagataaatttacgttaaataaaaaatatccgccaacgccg
gcacaatggcaagctatagggatagacggtgctgatatattagtagctgcggcagcagga
agtgggaaaacggaagttttatcagagagaatttcaaggaaagtggcaatagatagatgg
gatattgataaaattttagtacttacttttacaacggcggcggcaaaaaatatgaaagta
agaatagaaaataaaatagcagatagattgttgagttttgataacgaagaggctttgcac
tttttaagaaagcagagaatgttgatgaatgatgctttgataactacgatagatagtttt
tgcttgagtgtattgagaaaattttattatcttgttgaagaaaatattgacggggaaatg
atttatttatcaccaaactttaatgtactgccaaatagtaagaccttgttaactcaagta
ataaatacagttttagaaaatactgtggaaatttctccaaaattaacagatattttattt
acagtgtttaatggaaaaaaggatattgtagctagtttacaagatacttattataaattg
ctcacaattcctaactttgaaaattatttggaaaaagagtttttgattaatataaattca
acggttaaaaattttgatgaaagtgtcttgtctgaatttaatttgttaacagatttaaca
acgaataattcgttgcaaacggcaaggcaatttacaaaatatttagaaagttttatagaa
aatgataaaaatattagaagaatagaagacattgttatttctgtcgatttgaataatgta
aaaaaagaaaaaatattcaatttttttagtggagatatagaacaagaaacgatttttggt
agtagaatagaaaataagactaaactaaagaaaatagttaatattttagatgaaaatatt
tttctaatgcaggatacaaaacaaattaatgctcagttgcttgaaacaacttttttagaa
ttaaaaagttattccgaaaaatttaatattttaagaagtataaaagattttgcctgttct
tatcaaaaaatacttagaacaattcatttcgagtttgtaaaaacgaagagaaaaagtaat
tttttagatttttccgacttaaatcatttagcaataaaagctttgactaaaaaagaaaat
ggaaaaatgatattaacggctgctgctaaatattatcaaaaatattttttagaaatttat
gtagatgaatatcaagataataataatcttcaggagtatattctaaacattattcgtggg
gagaatgtctatttttttagagtaggtgatgtaaaacaggcgatttatgggtttagaggt
tcaaatccggatctttttgaagaaaaatataatagttatgaaaagttgaatatagaagac
tacagcatggaaaaagaatatcatttgaaaacaaccaaaaccggaatttgtgtaatgttg
aaagaaaatttccgcagtgaagtaaatgttttaagtagctgtaactatatttttaatcga
cttatgaagaattttaacgccggaattagttatgataaagaaaatgctctttactatccg
gctgttaaagaaaagacgaaattaacaataccgacaaagataataaatggtaaaatcgat
tattttagcggtcaggaaattgaaaataaaaaaggatatagagaacaatcgataaaaaat
atcgcttttgaaatattaaacggtgtagaacaaggtaataattatagtgattatgctatt
ttagtaagaaatagtacaaaaatggcaagttttaaagaaattttttcaagttataatatt
ccgctgttttttaaagagaaagatggatttacttcatcaaacacatttaatattctttat
aatatttttaaatttttagataatactaatagagatagcagccttgtggctatacttcgt
agcgaacttttttcttataccaatgatgagttattgaaattatcattaaataatgaaaaa
actttttataaaaaattaaaaattagtgatgaggtaaaagatagacatactataaacatt
ttaaattcatggctgaattacagccttaataattcaataagaactatcttagaaaaaata
gtcatcgatacagattttattaattatttgagaacagttgatataaatgatgaggaagtt
gattactatgagaattttttagatgtcgtttatgaatatgaaaatgtaaataataatttg
agtgattttattgtgtatttggaaaatataagagaacaagagaagtttgaaactaagaag
agagtttcaaataatagcgtaacgttatctactatccatatttctaagggattggagtat
aagtatgtttttatcgctgatttagataccgattttaacaatcaaggttttagcggcgaa
gtattattcacttctgaatttgggtttagtgttgatgtggaaaatatagcaaccaagcat
aattatgaatatcagagcgtttttcctgttaagttgtataaattaaatgcacagttaata
aaattaagagaacgtgaggaagaaataagaaatctttatgtagcgttaacaagagcggag
aaaggtttgtatttggtaagtccaaacggtattatgctaaatgacgaagaaaaaaaacaa
ataagtgtaaccggtagcgtttttgaagcagtaaattttgaagaaatattaagcgttgtc
ttgagtaattataataacgaagatcgtgcagaaaatgaattaacggcggagtttgaatat
tatgaacctaatcaaaataagaaagtattttccgttgaaaatgagagagaagttaatttt
gttgaaatttataaagaattggaagtcgaaaataaagataaattaattaaacaaaagact
aacaaaatatttccggcgaaaacttcatatagtgctatgaagaaaattaataaggataaa
gatgagataataaaaaaagataataaagaaatcaattacttggaattatctaacctaaat
aaaataactaccgctacaaaagctttacaacggggtaatattattcataaattgtttgaa
agaatagtacaaagcgtctttgagaaagaggaaataattgatgttcaatcgtatgtagaa
aatttagttagaacggataatattatctataatataaaaaataaaactttattgacaaaa
gaagagtataatctaataaataacgaagatgatttaactaaagtaaaaatgtttttagaa
agtgaagtgatcagttttgtaaaagatgcagatacttgtgaaactgaattgtcttttaca
acattaaaaaaagcaaaagagctttataatgaaagtgaaagcaatattgaggtaatactt
caaggtgttgtcgatttgttaattaatatagatgggcaatatttaataatagattataaa
actgataatgtttcaaagaaaaacggtgaaagtattttagaaaaacgtcatggtgaacag
ttgaaaatatataaagaagcggtaaaaaaatattataattgcactgaggtgaagacttac
atctattcttacactttatcaaaattaatagaagtgtag

DBGET integrated database retrieval system