Geospiza fortis (medium ground-finch): 102039104
Help
Entry
102039104 CDS
T03755
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin 2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
gfr
Geospiza fortis (medium ground-finch)
Pathway
gfr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gfr00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
102039104 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
gfr00536
]
102039104 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
gfr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
102039104 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102039104
NCBI-ProteinID:
XP_005429574
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
2699 aa
AA seq
DB search
MCTCASGQISPTCGSRPAQQCSISCRNGGTCVDERCQCQKGFSGAHCEQPVCDSGCQNGG
RCVGPNRCACVYGFTGPQCQRDYRTGPCFTQVSKQMCQGQLTGIVCTKSLCCATVGRAWG
HPCEMCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGVCQGGNCINSVGSYECKCPVGHK
QNEATQKCDDIDECSIIPGICEGGVCSNTVGSYFCVCPRGFVTSVDGSCTPDQRAGSCFS
SSASGRCAQELPGRFTRRQCCCESGHCWASASGPEVCPARGSDEHRRLCVDSAPARGGSR
RSGAGGNGFHPGGNGNGFGPRGAGFIPIPGSNGFSPAAGGAGVGAGGHNPTGSGPIITGL
TILNQTIDNCKHHPNLCLNGRCIPTPSSYRCECNMGYKQDENGDCIDVDECTSNPCSNGD
CVNTPGSYYCKCHAGFQRTPTKQACIDIDECVQNGVLCKNGRCVNTEGSFQCICNAGFEL
TANGRNCVDHDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPDGRYCTDIDECQTSGIC
MNGHCINTEGSFRCDCPPGLVVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIRKGLCVRPFPGAVTKSEC
CCANPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALDPDICSNGICENLR
GSYRCNCNSGYQPDPAGTNCVDIDECSVNGLLCDNGLCRNTPGSYSCSCPRGYLFSSETD
TCEDINECESSPCVNGACRNNLGSFHCECSSGSKLDPTGLICIDSLKGTCWLNIRDSHCE
VNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFARVKGVTCEDVNECEVFPGVCPN
GRCINSRGSFRCECPEGLTLDGTGRVCLDIRTEQCYLRWEEEELCPRGPGFSNRGDLLTG
RPFYKDINECKVFPGMCMNGKCRNTIGSFKCRCNSGFTLDMDERNCTDIDECRISPDLCG
SGTCVNTPGSFECECFDGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFRCDCPL
GHELSPSQEECLDVNECSLSDSLCRNGKCVNMVGTYQCFCDSGYQPTPDRQGCTDIDECM
IMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSDGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYR
CLCYDGFMVSIDMKACVDVNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQVGYSVKKGTTGCTD
VNECEIAAHNCDMHASCVNVPGSFKCSCREGWVGNGIKCIDLDECSNGTQRCSTNAQCVN
SPGSYHCACAEGFTGDGFTCSDVDECAEDVELCENGQCLNAPGAFRCECEMGFTPASDSR
SCQDTDECSFQNICVFGTCNNLPGMFRCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLC
VNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCVDNRVGSCYLKFGPRGDGGLSCSTEIGVGVTRSSCC
CSLGKAWGNPCETCPPVNSTEYNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCI
NTFGSFQCECPRGYYLSEETRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVN
GGHNCMDMRKSFCYRSYNGTSCENELLFNVTKRMCCCTYNIGKAWNKPCEPCPAPGTVDF
KSLCGNIPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLV
CEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPGSYRCECAAGFKLSPNGACIDRNECLEIPNVCSHGL
CVDMQGSYQCICHNGFKASQDQTMCMDVDECEQYPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTR
NNDCVDIDECSSFGQVCRNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTLDGKNCVDTNECVALPGSCS
PGTCQNLEGSFRCICPPGYEVKSESCIDINECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGFV
LSDNGRRCFDTRQSFCFTSFENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEE
VAFQDLCPYGHGTIPGIDDTREDVNECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDFTG
VHCIDTDECSIGNPCGNGTCSNVVGSFECSCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRC
INTYGFYECTCPVGYELREDQKMCKDLDECAEGLHDCESRGMICKNLIGTFVCICPPGMT
QRPDGEGCTDENECRSKPGVCENGRCVNVVGSYRCECNEGFLSSPSGIECLDNRRGFCFA
EVLQTMCQMASSSQSLVTRSECCCDGGRGWGNQCRLCPLPGTTQYKKLCPHGSGYTTDGR
DIDECKVLPNLCRNGQCINTMGSFRCFCKAGYTTDITGTSCNDLDECSQSPRPCNFICKN
SEGSYQCSCPRGYVLQEDGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTA
CIDNNECGSHPSLCGSKGICQNTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGC
QNILGGYRCGCPQGFIQHYQWNQCVDENECSNPHMCGSASCYNTLGSYRCVCPSGFSYDQ
FSHACHDVNECSSAKNPCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPVD
GDADGENALSPEVCYECKINGYSKKDSRRKRSANNTEQVSWGSLDTESPLKVRVAMSRLG
SREPILELLPALRRRARYITSVALPEEKEMEQLGSSHEDGGLRGEKGEALRLRLWVRLY
NT seq
8100 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcacttgtgccagtgggcagatatcacccacgtgtgggtcaagacctgcgcagcag
tgcagcatcagctgcaggaatggtgggacgtgcgtggatgagcggtgccagtgccagaag
ggcttctctggtgcccactgtgagcagcctgtctgtgacagtggctgtcagaatggagga
aggtgtgtcggacccaaccgctgcgcttgtgtctacggcttcactggccctcagtgccaa
agagattacaggacaggcccgtgtttcacgcaggtgagcaagcagatgtgccagggccag
ctgacagggattgtgtgcaccaagtccctgtgctgtgccaccgtgggacgggcctggggc
cacccctgtgagatgtgccctgcccagccccagccctgccgccgcggcttcatcccaaat
atccgcactggggcctgccaagatgttgatgagtgccaggctatccctggagtctgccaa
ggaggaaactgcattaattcagtaggttcatacgagtgcaagtgtcctgtgggccacaaa
cagaatgaggcaactcagaaatgtgatgatattgatgaatgcagcatcatcccagggatt
tgtgagggtggcgtttgctccaacactgtggggagttatttctgcgtctgcccacggggt
tttgtcacgtctgtggatggatcctgcactcctgatcagcgagcaggcagctgtttctcc
agctctgcgagcggccgctgcgcccaggagctgcccgggaggttcaccagaaggcagtgc
tgctgtgagtctggccactgctgggccagtgcctctggcccagaggtgtgtcctgccaga
ggatctgatgagcaccgcaggctgtgcgtggacagtgcccctgcccgaggcggctcccgg
cgcagcggagcgggagggaacggcttccatcccgggggcaatgggaatggattcggacca
agaggagctggcttcatccccatcccaggaagcaacggattctccccagctgcgggcgga
gcaggggtaggagcaggtggtcacaaccccactggaagtggcccgatcattacagggctg
acaatactcaaccagacaatagacaactgcaagcaccatcccaacctttgtttgaatgga
cgttgtataccaaccccctctagttacagatgtgaatgcaacatgggatataagcaggat
gaaaatggggattgtattgatgttgatgagtgcacatccaacccctgctccaatggggac
tgtgtcaacacacctggttcctattactgcaagtgccacgcaggtttccagagaactccc
accaagcaagcctgcattgatatcgatgagtgtgttcagaatggtgttctttgtaaaaat
gggaggtgtgtgaacactgagggaagcttccagtgcatttgcaatgctgggtttgagctg
actgcaaacggaagaaactgtgtggaccacgatgagtgtgccaccacaaacatgtgcctg
aatgggatgtgcataaatgaggatgggagttttaaatgcatctgtaaaccaggatttgtc
ctggctccagatggacgttactgtactgatattgatgaatgccagacatcaggaatttgc
atgaatggccattgcataaatactgaaggctcatttaggtgtgattgtccacctggcttg
gttgttggagttgatggtcgtgtgtgtgtagatactcacatgcgtagcacatgctatggg
ggcatcaggaaagggctgtgtgtccgtcccttccctggtgccgtgacaaagtctgaatgc
tgctgtgccaaccctgactatggctttggagagccgtgccatccctgccctgctaaaaac
tcagctgagttccatggcctgtgtagcagtggaataggcattactgttgatggaagagat
attaatgagtgtgctttggatcctgatatttgctccaatgggatttgtgaaaacctgcgt
ggcagctatcgctgtaactgcaacagtggctaccagcctgatcctgctggaaccaattgt
gtggacattgacgagtgctctgtgaacgggctgctgtgtgacaacgggctctgccgcaac
accccgggcagctacagctgctcctgcccccggggttacctgttcagctcggagacagac
acctgtgaagatataaacgaatgtgaaagcagcccatgtgtcaatggtgcctgcaggaac
aaccttgggtcgttccactgtgagtgttcatctggcagcaagttggaccctacaggactg
atttgtattgacagcctgaaggggacttgttggctcaatatccgagacagccactgtgaa
gtcaacatcaatggtgccacgctgaaatctgagtgctgtgctactttaggagcggcttgg
ggcagcccatgtgaacgctgtgaattggacacagcttgctcaagaggatttgccagagtg
aagggtgttacctgtgaagacgtaaacgagtgcgaggttttcccgggggtttgtcccaat
gggcggtgcatcaacagcagaggctccttccgctgcgagtgccccgaggggctgaccctg
gacggcacagggcgggtgtgtttagatatccgcacggagcagtgctacctgcgctgggag
gaggaggaattgtgccccaggggccccggattctccaacaggggggatcttctcactggc
aggccattctacaaagatatcaatgaatgtaaagtgttccctggcatgtgcatgaatggt
aaatgtagaaacacaattggaagtttcaaatgcaggtgtaacagtgggttcactttagat
atggacgaaagaaactgtacagacattgatgagtgcaggatctccccagacttgtgtgga
agtggcacttgtgtcaacactcctggcagctttgagtgtgagtgctttgatggctacgaa
agtggatttatgatgatgaagaactgcatggatatagatgagtgtgaacgcaaccctctg
ctgtgcagaggtggcacctgtgtgaacactgaggggagctttcgctgtgactgtcccctg
gggcatgagctgtcaccatcccaggaggaatgcttggatgtaaacgagtgctccttgagt
gacagcctctgcagaaatggcaagtgtgtgaacatggttgggacgtaccagtgcttctgt
gactctgggtaccagcccactcctgacagacagggatgcacagatattgatgagtgtatg
ataatgaatggaggctgtgacacccactgcactaactcagaaggcagctatgagtgcagc
tgcagtgatggctatgctctgatgccagatgtcaggacctgtgcagatattgatgaatgt
gaaaacaatccagatatctgtgatggtgggcagtgtaccaatatcccaggggaatatcgc
tgtctctgttacgatggatttatggtttctatagacatgaaagcttgtgttgatgtgaat
gaatgtgatttgaattccaacatctgcatgtttggggagtgtgaaaacaccaaaggctcc
ttcatttgtcactgtcaagttgggtattcagtcaagaaaggaaccacagggtgcacagat
gtgaatgagtgtgaaattgcagcccacaactgtgacatgcatgcctcgtgtgtcaatgtg
ccaggaagttttaaatgcagctgcagagaaggttgggttggaaatggcattaagtgtatt
gatcttgatgaatgctccaacgggacccagcggtgcagcaccaacgcccagtgtgtgaac
agcccgggctcctaccattgtgcctgtgcagagggattcactggagatggcttcacctgc
tctgatgtggatgagtgcgcagaggatgtggagctgtgtgaaaacgggcagtgcctgaac
gcgcccggcgccttccgctgtgagtgcgagatgggcttcacccctgcctctgacagcagg
tcctgccaagacacggatgaatgctccttccagaatatttgtgtgtttggcacctgcaat
aatctcccaggaatgtttcgttgtatctgtgatgatggctatgaactggatagaactggg
ggaaattgcacagatattgatgaatgtgctgaccccattaattgtgtcaatggtctttgt
gtaaacactcctggaagatacgagtgtaactgtcctccagacttccagctgaatcctact
ggagtgggttgtgtggataaccgtgtgggcagctgctacctgaagtttgggccgagaggg
gacgggggcctgtcctgcagcactgagattggggttggagtcactcgctcctcgtgctgc
tgctcgctgggaaaggcttgggggaacccctgtgagacctgtccccctgtcaacagcact
gaatacaacactctctgtccagggggagaaggattcagaccaaatcccattactattatt
ttagaagacattgatgaatgtcaggagctgccaggcctctgccaaggtggaaattgcatc
aacacttttggcagcttccagtgtgaatgcccaagaggttactacctcagtgaagagaca
agaatctgcgaagatattgatgagtgtgttgcacaccctggtgtgtgtggtcctggcacc
tgctacaacaccttggggaactacacctgcatttgcccacctgaatatatgcaggtgaac
ggaggacacaactgcatggacatgaggaaaagcttttgctacaggagctataatggaacc
tcctgtgagaatgaactgctcttcaatgtgaccaaaaggatgtgctgctgcacatacaat
attgggaaagcctggaacaaaccttgtgagccgtgtccagctccaggaacagttgatttc
aagagcctatgtggaaatattcctggcttcacttttgacatccatactggaaaagctgtt
gacattgatgaatgtaaggaaatcccaggaatctgtgccaatggagtttgcatcaatcag
attggcagcttccgctgtgagtgccccactggattcagttacaatgacctgctcctggtc
tgtgaagatattgatgagtgcagcaatggggacaacctctgccagagaaatgctgactgt
atcaacagccctgggagctaccgctgtgaatgtgctgctggctttaaactgtcacccaat
ggtgcctgcattgatcgcaatgaatgtctggaaattcctaacgtttgcagtcatggcttg
tgtgtggacatgcagggaagctaccagtgcatatgtcacaatggcttcaaggcatctcaa
gatcagactatgtgcatggatgttgatgagtgtgaacagtatccatgtggaaatggaacc
tgcaagaacacagttggatcatacaactgcctgtgttatccaggatttgagttaactcgt
aataatgactgtgtggatattgatgagtgcagttcctttggtcaggtgtgcaggaatgga
cggtgtttcaatgaaattggttctttcaagtgtttgtgtaatgaaggatatgagcttact
ctggatggcaagaattgtgttgataccaacgagtgtgtggcactgcctggctcgtgctct
cctggtacctgccagaatttggaaggctcattcaggtgcatctgtccaccaggatacgaa
gtaaaaagtgaaagttgtattgatattaatgagtgcaacgaggatcccaacatctgcctc
ttcgggtcctgcaccaacaccccgggaggtttccagtgcatctgtcccacaggttttgtg
ctgtctgataacgggcggaggtgctttgatactcgtcagagcttctgtttcaccagcttt
gagaatgggaagtgctctgtgccaaaggctttcaacaccacaaaggccaagtgttgctgc
agtaaaatgccaggagaaggatggggtgatccttgtgagctctgtccaaaggaagaggaa
gttgcttttcaggatctgtgcccatatggtcatggaactattcctggaattgatgataca
cgtgaagatgttaatgaatgtcttgaaagcccagggatttgctccaatggtcactgcatc
aacactgatggatccttccgctgcgagtgccccatggggtacaacttggatttcacaggg
gtgcattgcatagatacagatgaatgttccattggcaacccctgtggaaacggaacgtgc
tccaatgtggttggcagctttgagtgcagctgtcacgaaggatttgagccaggcccaatg
atgaattgtgaagatatcaatgagtgtgctcagaaccccctgctgtgtgcttttcgttgt
atcaacacttacggtttctatgagtgcacctgcccagtgggatatgagctaagggaagac
caaaagatgtgcaaagatctagatgagtgtgctgaaggtctccatgactgtgaatcaaga
ggcatgatttgcaaaaatctgattggtaccttcgtgtgcatttgtcctcctgggatgacc
cagagacctgatggagaaggatgcacagatgaaaatgagtgccgctccaagccaggtgtc
tgtgaaaatgggcgttgtgtgaatgttgttggcagctacagatgtgaatgtaatgaagga
ttcctgtccagcccatcaggcattgagtgccttgataatcgccgggggttttgctttgct
gaagttctgcagaccatgtgccagatggcttccagcagccagagccttgtcaccaggtcc
gagtgctgctgtgacggcggccggggctgggggaaccagtgcaggctctgccctctgccc
ggaaccacccagtacaagaaactctgcccacacggatcaggctacaccacagatggaaga
gatattgatgagtgtaaggtcctgccaaacctgtgcaggaatgggcagtgcattaacacc
atgggctccttccggtgcttttgcaaagctggctacaccactgacataactggcacatct
tgtaatgatcttgatgagtgctcccagtcccccagaccatgcaattttatttgcaagaac
tccgaagggagctatcagtgctcatgtccccggggctatgtccttcaggaagatggaaag
acatgtaaagatcttgatgaatgtcaaaccaagcaacacaactgtcagtttctctgtgtc
aacacccttggaggcttcacatgcaaatgtccacctggttttacacaacatcacacagct
tgtattgataacaacgaatgtggttctcatccatcactgtgtggatcaaaaggaatctgc
caaaacactcctgggagttttacctgtgaatgtcaaaggggattttctctggattctact
ggattgaactgtgaagatgtggatgagtgtgatggaaaccacaggtgccagcatggctgt
cagaacatcctgggtggatacagatgtgggtgcccgcaaggatttatccagcactaccag
tggaatcagtgtgttgatgaaaacgaatgctccaatcctcacatgtgtggttctgcttct
tgctacaacaccctggggagttacaggtgtgtgtgcccatcagggttctcctatgaccag
ttctcccatgcctgccacgatgtgaatgagtgctcctctgccaagaacccctgcaattat
ggctgctccaacactgagggtggttatctctgtggctgcccgcctggctattacagagtt
ggacaaggacactgtgtctcagggatgggatttaacaaaggccagtacctgccagtggat
ggagatgctgatggagagaatgctttgtcccctgaagtgtgttatgagtgcaaaatcaat
ggctactccaaaaaagacagcaggaggaagagaagtgctaacaatactgagcaggtgagc
tgggggagcctggacacggagagtcccctgaaggtgcgggtggccatgtccaggctgggc
agccgggagcccatcctggagctgctgccggccctcaggcgccgcgcgcgctacatcacc
agcgtggccctgcccgaggagaaggagatggagcagctggggagcagccatgaggacggc
ggcctgcgaggggagaagggagaggccctcaggctgaggctgtgggtgcgcctctattag
DBGET
integrated database retrieval system