Gavialis gangeticus (Gharial): 109287050
Help
Entry
109287050 CDS
T07453
Symbol
NOTCH2
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2 isoform X1
KO
K20994
Notch 2
Organism
ggn
Gavialis gangeticus (Gharial)
Pathway
ggn04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ggn00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
109287050 (NOTCH2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
EGF_2
Ank
Notch
NOD
NODP
Ank_5
Ank_3
Ank_4
EGF_3
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
EGF_MSP1_1
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109287050
NCBI-ProteinID:
XP_019357527
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2435 aa
AA seq
DB search
MPRGTWGPGPALGALLALALALSRGDPAAALQCLDISKPCVNEGKCFSYPNGTGFCRCPE
GFLGDYCQHRNPCESGTCQNGGTCETTSVIGKATCKCAPGFRGEDCRYSDSHICFVSHPC
LNGGTCQLLGPDAYECVCRPGYTGKNCQWIDACMSQPCANGSTCIASGERFSCTCPSGYT
GQKCEVDVNECITPGQCQHGGTCLNVPGSYRCQCKPGFTGHRCESTYVPCSPSPCMNGGT
CHQTGDFVYECNCLPGFEGDTCEHNIDDCPNHKCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFC
TEDVDECQLQPNACQNGGTCTNHNGGYACVCVNGWSGDDCSKNIDDCLTASCANGSTCID
RVASFACICPEGKAGLLCHLDDACVSNPCQKGALCDTNPMNGHYICTCPQGYKGADCTED
VDECAMANSNPCEHAGKCVNTEGSFHCECLKGYTGPRCEMDINECHSNPCQNDATCLDKI
GGFTCLCMPGFKGMHCELEINECLSSPCVNNGECQDKVNHFLCKCPPGFTGAVCQIDIDD
CSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGILCEENINNCDPDPCHHGKCQDGIDSYTCVC
NPGYMGAICSEQIDECYSNPCLNQGRCIDLVNGYQCNCLPGTSGVNCENNFDDCANKPCI
HGTCIDGINQYSCICNPGVTGPRCNTDIDECISGPCHNGGTCVNEMNGFRCICPEGYHHP
TCHSQTDECLNSPCVHGNCTHDVNGYVCLCDPGWTGMDCEVEENECRSNPCQNGGTCDNL
VNGYRCTCRRGFKGVNCQIVQAPCSPDPCENSGICQESSGSDGYICLCAPGWEGERCTVD
IDECVSKPCRNHAVCHNIQGSYLCECNPGFTGGDCESNIDDCLSNPCQNGASCVDGVNSF
SCICLPGFQGEQCQTDTNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCPAGFEGTNCENNINECTE
SSCFNGATCVDGINSFTCQCPVGFTGTFCLMEINECDSHPCLNRGTCVDSLGTYNCVCPM
GYTGKNCQILVDLCSKFPCKNKGTCVQQNTHFHCNCSPGWSGAYCDVPNVSCQVAASQRG
VPVDQLCQHSGNCLNVGNSHRCQCRTGYTGSYCEEQVDECISSPCQNGATCRDYLGGYNC
ECVPGYQGVNCEYEVNECQFQPCQNGGTCIDLINHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCMPDS
GGPRCLNGGQCIDQIGGHSCLCPSGFGGKQCEGDINECLSNPCSPRGSRDCVQLVNNYTC
ICRSAFTGRHCETVIDVCPQKPCQNGGTCAVASNMPDGFICQCPPGYSGSKCEFSNTCGQ
MRCKKGELCIQTSSGPRCYCPELLVGEECQATAGCTSAPCQNGGSCHPRPQAPYYYCQCP
SYTEGSQCEHSVHPSREPEGCLGQHCMERAKDGYCDEDCNTHACQWDGGDCSLMIEDPWA
NCSSSLRCWEHFNGLCDEACNTPECLFDNFECQQNPKTCKYGKYCEDHYANGLCDKGCNN
EECGWDGLDCAGDKAEKLAEGTLIIVVLMPPDQLLSDVHSFLWTLGTLLHTNLRIKRDSQ
GELMVYPYYGEKSALRSRRSLLVIRKARELEQEAIGTKVFLEIDNRQCAEESDQCFKNTE
AAAALLAAQAIKGMVPYPFVSVESERISQGKTQMLYLLAVVALVGLIILLLGVMMAKRKR
KHGSLWLPEGFILHRDSSNHKRREPVGEDAVGLKNLSVQVSDGNLADYTAGEHWSGDRGP
QPKRAKSEDEALLPEADEQVDQCQWTQQHLRAADIDGTTSLALTPPQADQEVDVLDVNVR
GPDGCTPLMLASLRVGSSDISDEDEDGEDSSANIITDLIYQGANLQAQTDRTGEMALHLA
ARYSRADAAKRLLDAGADANARDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDG
TTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLVLLKNGANRD
MQDNKEETPLFLAAREGSFEAAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVAQDRMHHDIVQLLNE
YNVAHSPSGHPGTMLNSALSPVICGPNRSFLNLKHASLSKKSRKPNAKGVMAPNLAKEAK
RRRKKSLTESKGQFSESSVTLSPVDSLESPHAFASEQTSSPVMPSPGILHSSPSSLLTTS
VVQAAHPMSFSSLHEMQPLGQGSNTVLPSVSQLLSQHRTTPSSNGLGRLQPGNISTEWMN
HIDMNESQYNEMFGMIPQVVHAHPGGPQQGSLSQTDVKHVGVSRETLPPIMTFQLVPKSG
MNQQVLAQQAQSNCPQNVAGPLSSMYQITPDLAQLPSASFPVAVIPQQDGQVAQTILPAY
HQFQSSMGKYPTPPSQHSYTSSSATERTPSHNRHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSA
SDWSDVATSPSHGSTQRGPVARMSEQQRNNMQVYA
NT seq
7308 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccccggggcacgtgggggccgggcccggcgctcggggcgctgctggcgctggcactg
gcgctgagccgcggggaccccgctgctgccttacaatgtctggatatttctaagccttgt
gtcaatgagggaaagtgcttctcatatcccaatggcactggattttgcagatgtccagaa
ggttttcttggagactattgtcagcacagaaacccctgtgaaagcggtacctgtcagaat
ggaggaacatgtgaaaccacgtctgtgataggaaaggccacttgcaaatgtgctccaggg
ttcagaggcgaggactgcagatattccgattctcacatctgctttgtgtcacacccctgc
ttaaatggaggaacctgccagctgcttggcccagatgcatatgaatgtgtctgtaggcca
ggttacacaggaaagaactgtcagtggattgatgcttgtatgtctcagccgtgtgccaat
ggaagtacttgcatcgcatctggggagagattttcctgtacatgcccatctggttacact
ggacaaaaatgtgaagttgatgtgaatgaatgtatcacaccaggacaatgccagcatggt
ggaacctgtctcaatgtgcctggctcctatcgatgtcagtgcaagccaggctttactggc
caccgctgtgaaagcacatatgtgccatgttcaccttcaccgtgtatgaatggagggaca
tgtcatcaaaccggtgatttcgtctatgagtgcaactgtctgccaggctttgaaggagat
acctgtgagcacaacattgatgactgcccaaaccacaaatgccagaatggtggtgtatgc
gtggatggtgtaaacacttacaactgccgctgccctccacagtggacaggtcaattctgt
actgaggatgtggatgaatgtcagctgcagcccaatgcctgtcaaaatggaggtacctgc
accaaccacaatggcggctatgcctgtgtctgtgtcaatggctggagtggggatgattgc
agtaagaatattgatgactgtcttacggcttcctgtgccaatggatctacttgcattgat
cgtgtggcttcatttgcatgcatctgtccagaaggaaaggcaggcctcctgtgtcatctg
gatgatgcatgtgttagcaacccctgccagaagggggctctatgtgataccaaccctatg
aatggacactatatctgcacttgtccccaaggctacaaaggagcagactgtactgaagat
gtagatgagtgtgctatggcaaacagcaatccgtgtgaacatgctggaaaatgtgtgaat
actgaaggctccttccactgtgagtgtctgaagggatacacaggaccacgctgtgaaatg
gacattaatgagtgtcattccaatccatgtcaaaatgatgccacttgcctggataaaatt
gggggattcacatgtctgtgtatgccagggtttaaaggcatgcactgtgaactggagatc
aatgaatgccttagtagtccctgtgtgaacaatggagagtgtcaggataaggtcaatcac
tttctgtgcaaatgcccacctggttttactggagccgtgtgccagattgacattgatgac
tgctccagcacaccttgcctaaatggagcaaagtgcattgatcatcccaatggctatgag
tgccagtgtgccacaggttttactggcatcttgtgtgaggaaaatataaataattgtgat
cctgacccttgccaccatggtaaatgccaagatggtattgattcatacacatgtgtctgc
aatcctggatacatgggtgccatttgtagtgaacagattgatgaatgctacagcaacccg
tgccttaatcaaggacgctgcattgacttggtgaatggttaccaatgcaactgtttacca
ggcacatcaggagtgaactgcgagaataactttgatgactgtgcaaataaaccctgcatt
catgggacctgtatagatggcattaaccagtacagttgcatttgcaacccaggagttacc
ggtccaagatgtaatactgatattgatgaatgtatctctggtccctgtcacaatggtgga
acatgtgtcaatgaaatgaatggatttcgatgtatatgtcctgaaggctaccatcacccc
acctgtcactcacagacagatgaatgtcttaatagtccttgtgtgcatggcaactgcaca
catgatgtcaacgggtatgtgtgtctctgtgacccaggttggactggaatggactgtgaa
gtagaggaaaatgagtgtaggtcaaatccgtgccagaatggaggaacctgtgacaatctg
gtgaatggatatagatgcacctgcaggagaggattcaaaggtgtgaactgccagatagtg
caggctccttgctcccctgatccttgtgagaattctggaatctgccaagaatcatccggc
tctgatggatatatctgtctgtgtgctcctggctgggaaggagagagatgtacggtggat
attgatgagtgcgtgtcaaagccctgcaggaatcatgctgtctgccacaacattcaaggc
agctacctgtgtgaatgcaacccaggcttcactgggggagactgcgaaagcaacattgat
gactgcctttcaaacccctgccagaatggagcttcatgtgtggatggggtgaactctttc
tcatgcatctgtctgcctgggttccaaggggagcagtgtcagacagataccaatgagtgt
ctgagtgaaccatgcaagaatggaggcacctgctctgactatgtcaacagctacacatgc
aagtgcccagcaggatttgaggggaccaattgtgagaacaacatcaatgaatgcactgag
agttcgtgtttcaatggagccacttgtgtggatgggatcaactcctttacatgccagtgc
ccggttgggttcacgggaaccttttgtctcatggaaattaatgaatgtgattcacatcct
tgcttgaacagagggacttgtgtggatagcctggggacctataattgtgtttgtcccatg
ggttacactggaaagaactgtcagatacttgtggatctgtgtagcaagtttccctgtaag
aacaaaggtacatgtgtccagcagaatactcactttcattgcaactgttcccctggttgg
agtggtgcctactgtgatgttcccaatgtctcctgccaagtggctgcttcacagaggggg
gtccctgtagaccagttgtgtcagcactctggcaattgccttaacgttggaaacagccac
cgttgccaatgccggacaggctacactggtagctattgtgaagagcaggtggatgaatgc
atctccagtccttgtcagaatggcgccacctgcagggactatcttggaggatataactgt
gagtgtgtgccagggtaccagggtgtcaactgtgagtatgaagtgaatgagtgtcagttc
cagccctgccaaaatggaggaacctgcattgatctcatcaatcacttcaaatgctcctgt
ccaccaggaactcggggccttctttgtgaggagaacattgatgactgcatgccagattca
ggagggcctcgctgccttaatggaggacagtgcatagaccaaattgggggccacagctgt
ctttgtccttcaggcttcggaggcaagcagtgtgagggggacattaatgaatgcctctcc
aacccttgtagccctcgtggtagccgagactgtgttcagctggttaataattatacatgt
atctgccgcagtgcctttactggccgtcactgtgaaactgtgatagatgtgtgtcctcag
aagccttgtcagaatggaggtacttgtgctgttgccagtaatatgcctgatggattcatc
tgccagtgtcctccaggttattctgggtctaaatgtgaattcagcaatacttgtgggcaa
atgaggtgcaagaaaggggaactgtgcatccagacatcctcagggccccgttgttactgt
ccagagctcttggtgggtgaggagtgccaggctactgcgggctgtaccagtgcaccctgc
cagaatgggggaagttgccatcctaggcctcaggctccttattattactgccagtgtccc
agttacactgaaggcagccaatgtgagcattcagtacaccccagccgagaacctgaaggg
tgtctgggtcaacactgcatggaaagagcaaaagacggctactgtgatgaagactgcaac
acgcacgcgtgccagtgggatggaggggactgttcgctgatgatagaagatccctgggcc
aactgttcttcgtcactgcgctgctgggagcatttcaatggcttgtgcgatgaggcctgt
aatacacctgagtgcttgtttgacaactttgagtgtcagcagaaccctaagacgtgcaag
tatggtaaatattgtgaggatcactatgcgaatggcctctgtgacaaaggatgtaacaat
gaggagtgtggttgggatggtctggactgtgctggtgacaaagctgagaagctggcagaa
ggtacccttataattgtggtgctaatgccccctgaccagctgctttcagatgtccatagc
ttcctatggactctaggaacccttctacacaccaacctgagaataaaacgggattcccag
ggagagttgatggtatacccatactatggagagaagtcagcactacggagccggcgatcc
ctgttggtcattcgtaaggccagagagcttgaacaagaggccattggcacaaaggtgttc
ctggaaattgacaatcgacagtgcgctgaagagtcagaccagtgctttaaaaatacagaa
gctgcagcagctcttttagcagctcaggccattaagggcatggtgccttatccttttgtg
tcggttgaaagtgaacgcatatcacaagggaagacgcagatgctttacctgcttgctgtg
gtagctttggtcggccttataatccttcttttgggtgtgatgatggcaaagcgaaaacgg
aagcatggctccctctggctccctgagggctttattttgcacagagactccagtaaccac
aaacggagagaaccagtcggggaagacgcagttggattgaaaaatctgtcagtacaagtt
tctgacggcaatctggcagactatactgcaggggaacattggtcaggtgacaggggacct
cagccaaagagagctaagtccgaagatgaagcattgctcccagaagcagatgagcaggta
gatcaatgccaatggacacaacaacacctcagggcagctgacatagatgggaccacatcc
cttgctcttacaccacctcaggcagatcaagaagtagatgtcttggacgtcaatgttaga
ggaccagatgggtgcaccccactcatgttggcatctctgcgtgtgggcagctccgacatt
agtgatgaagatgaagatggggaggattcctcagcaaatataataacagacctgatctat
caaggggctaacttgcaagctcaaacagaccgcactggggagatggcactgcacttagca
gcccgctattcaagagcagatgcagcaaaacgcttgttggatgctggtgctgatgctaac
gcccgagacaacatggggaggactcctcttcatgcagctgtggcagctgatgcacagggt
gtcttccagatcttgatccggaacagagtaacagacctggatgctcgcatgaatgatgga
acaaccccgttaattctggcagctcgtttggctgtggagggaatggtggctgagctgatc
aactgccaggcagatgtcaacgcagtggatgaccacggtaaatctgctcttcattgggct
gcagctgttaacaatgtggaggcaacattagtgttgctgaaaaatggagccaaccgagac
atgcaggacaacaaggaggagacaccactcttcctggcagctcgggaagggagttttgaa
gcagctaaaattctgttggaccattttgctaatcgggacatcacagaccacatggaccgt
ctcccccgtgatgtggcgcaggaccgcatgcaccatgacatcgtgcagcttctcaatgag
tacaatgtggcccacagcccatctgggcaccctggcaccatgctaaactctgccctctcc
ccagtgatttgtggccccaatagatccttcctcaatttgaaacatgcttctctaagcaag
aagtcaaggaaaccaaatgccaagggtgtgatggccccaaatcttgccaaagaagcgaag
aggagaaggaagaaatctctgactgagagcaagggtcagttttctgagagctcagtgacc
ctctcaccagtcgactccctggaatctccccacgcttttgcatctgaacaaacgtcctcc
cctgtgatgccgtccccagggattctgcattcctcacccagctcactgcttacgacctca
gtcgtgcaggctgcacaccccatgtccttctccagtctccatgagatgcagccactgggg
caggggtctaacaccgtgcttccatctgtcagccagctgctttcccagcaccgaaccacc
ccttccagcaatgggcttggtagactccagccaggtaacatttccaccgaatggatgaac
cacatagatatgaatgaatcccaatacaatgagatgtttggcatgatcccacaggtagtc
catgctcaccccggcggccctcagcaaggaagtctgagtcaaacagatgtgaagcatgtg
ggagtctccagggagacactgccccctattatgactttccagctggttcccaaaagtggt
atgaaccagcaggtcctggcgcaacaggcccagtccaactgccctcagaatgtagctggt
cctcttagttcaatgtaccagataacaccagatctagctcagctgccaagtgcctccttt
cccgtggcagtaattcctcagcaggatgggcaggtcgctcagacaatcctcccagcctat
caccagttccagagctcaatgggaaagtatcccactccgccgtcacagcacagctacacc
tcttcctctgccacggagaggactcccagccataacaggcacttgcaaggggagcacccg
tatctgacgccatctcccgaatctcccgatcagtggtcaagctcctccccgcactctgcc
tcagattggtctgatgtggcgaccagccccagccatggtagtacccaacgtggtccggta
gcgcgaatgtcagagcagcagcggaacaacatgcaggtatatgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
