Gavialis gangeticus (Gharial): 109294737
Help
Entry
109294737 CDS
T07453
Symbol
FBN3
Name
(RefSeq) fibrillin-3
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
ggn
Gavialis gangeticus (Gharial)
Pathway
ggn04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ggn00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
109294737 (FBN3)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ggn00536
]
109294737 (FBN3)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ggn00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
109294737 (FBN3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109294737
NCBI-ProteinID:
XP_019368736
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2873 aa
AA seq
DB search
MGVLWLAKFMLGCTALLYVEQAQCQYDGDLQTDRFSGYEERQPANRVRRRGQDTLRGPNV
CGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCSNGQLSTNCGSSGVQT
CSVRCMNGGSCNEESCLCQKGYTGTYCGQPICENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCE
RDYRTGPCFSQVNNQMCQGQLSGIVCTKTMCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPN
IRTGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHKQSETSHKCEDVDECSTISSV
CDGGECTNTAGSYVCTCPRGFMTSPDGSRCIDQRIGTCFSALIGGRCAGELPGQYTKMQC
CCDSGRCWAIGQTPEMCPVRGSDEYRRLCIEGLPVVPGFPGSFPGIPGFGPNGVGPGISG
PGGIGPNGANGQGGIPGLPGMGPGSSSIGTATLNQTIDICKHFTNLCLNGRCIPTPSSYR
CECNMGYKQDVRGECIDVDECSSSPCVHGDCVNTPGSYHCKCHEGFQSTPTKQACIDIDE
CIMNGVMCRNGRCVNTDGSFQCICNAGFEITPDGKNCVDHDECATTNMCLNGMCINEDGS
FKCICKPGFVLAPNGRYCVDIDECETPGICMNGWCINTEGSFRCECLGGLAIGVDGRVCV
DTHMRSTCYGGIKKGTCARPFPGAVTKSECCCANPDHGFGEPCQPCPAKNSAEFQALCSS
GIGITADGRDINECALNPDICPNGMCENLRGSYRCICNLGYESDPTGKNCVDVDECTVNR
LLCDNGLCRNTPGSYTCTCPKGFVFRTETDTCEDINECTSNPCVNGVCRNNAGSFACECS
PGSKLDPSGTICVDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCEID
PACPRGFARMKGVTCEDVNECDVFPSVCPNGRCVNTAGSFRCECPEGLTLDGTGRTCVDV
RVEQCYMKWDEDECNEPLPGKYRMDVCCCSVGSAWGIDCEECPKVGTSEYKAICPRGPGF
ANRGDVLSGRPFYKDVNECKVFSGLCTHGTCRNTIGSFRCICGNGFALDAEERNCTDIDE
CRISPDLCGHGTCINTPGSFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGICVNNE
GSFECICPPGHELTTEGSACVDINECSLSDNLCRNGRCVNVIGTYQCTCDSGFQATPDRQ
GCVDIDECTIMNGGCDTHCANSEGSYQCSCSEGYALMPDKRSCTDIDECEDNPDICDGGQ
CTNIPGEYRCLCFDGFMASLDMKTCIDVNECDLNPNICLHGECENTKGSFICHCQLGYFV
KKGTTGCTDIDECEIGAHNCDMHASCINVPGSFKCKCRTGWLGDGLKCNDLDECATEEHK
CNLNANCVNTPGSYRCACREGFNGDGFSCSDVDECADNVNLCENGQCLNAPGGYRCECEM
GFNPTEDSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCACDDGYELDRSGGNCTDINECAD
PVNCINGLCVNTPGSYLCNCPQDFELNPTGVGCVDTRVGNCFLDTQDRGDGGISCSAEIG
VGVTRASCCCSLGRAWGNPCELCPPANTTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELP
GLCQGGNCVNTFGSFQCECPLGYYLNEDTRICEDIDECSAHIGICGPGTCYNTLGNYTCV
CPPEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNYNDTCENELSFNMTKKMCCCSYNIGKAWNKPCEPC
PTPASPEYQILCGNQAPGFIIDIHTGKPIDIDECSEIPAICTNGVCINQIGSFRCECPIG
FSYNNILLICEDIDECSSGENLCQRNADCINIPGSYRCECSTGYKLSPSGACVGRNECQE
IPNVCSHGDCVDTEGSYICVCHNGFKATGEQTMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVGSYNCL
CFPGFELTHNNDCMDIDECSSLVGQVCRNGQCINSIGSFQCLCQEGYDRTPDGKNCVDIN
ECVSLPGTCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVQNDNCIDINECEEEPNICLFGTCTNTPGS
FQCICPPGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTRFDNGKCSVPKAFNTTKARCCCSKMPGEGWGD
PCELCPQEGNVAFQELCPYGHGAIPGPGDTREDVNECSENLGICINGACINTDGSFRCEC
PFGYNLDYTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCSNVVGGFECTCEEGFEPGPMMTCEDINECV
LNPLLCAFRCINTFGFYECTCPSGYALREDRRMCKDLDECAEGLHDCESRGMVCKNLIGT
FMCICPPGMQRRPDGESCTDENECRTKPGICPNGRCVNTVGSYRCDCNEGFQVSPSGTEC
IDTRQGFCFTEVLQTMCQMSSTNRNLATKSECCCNGGRGWGTQCELCPLPGTTQYKKMCP
HGPGYSTDGQDIDECKVLPNLCKNGQCINSIGSFRCHCKLGYTTDITGTACTDLDECNQS
PKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILHEDGKTCKDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGGFNCKC
PPGFTQHHSSCIDNNECTSQPSLCGAKGQCLNTPGSYNCECQKGFSLDSAGVNCEDVDEC
DGNHRCQHGCQNVLGGYRCGCPQGYVQHYQWNQCVDENECSSPTVCGSASCYNTLGSFKC
ICPSGFDFDQAFGGCQDVDECSAGSSPCSYGCSNTDGGYLCGCPGGYFRAGQGHCISGLG
FGKGPYLPAPQEEDEDNLLSPETCYECKINGYPKRGRQRRSVNGTERHQDHRVNLASVDT
DAPLPMSLNLSDLAHKKHILELLPAVEPLENHVRYMISHGNEDGYFRIHQKEGLSYLHLG
RKKIVPGTYMLEIMSVPLYRKKELQKLEAKNDLNYLAGELGQALRMRLQLQLY
NT seq
8622 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggtattatggctggccaaattcatgctgggatgtacagcacttttgtatgtggaa
caagcccagtgtcaatatgacggggacttgcagacagacagattttcaggctatgaggaa
agacagccagcaaacagagtgagaagaagaggccaagacactttacgaggaccaaatgtt
tgtggctcaaggttccactcttactgctgccctggatggaaaacactgcctggaggaaat
cagtgtattgttccaatttgcaggcactcctgtggtgatggattttgctcacggccaaat
atgtgcacgtgctccaatgggcagctttctaccaattgtggttcttctggagtccaaacc
tgcagtgtaagatgcatgaatggtggaagctgcaatgaggaatcctgcctctgtcagaaa
ggatacactggaacttactgcgggcaacctatctgtgaaaatggctgccagaatggaggt
cggtgcattggaccaaaccgctgtgcttgtgtgtatggattcactggccctcagtgtgaa
agagactatcgcactggtccctgcttcagccaagtgaataaccagatgtgccagggccag
ctcagtggcattgtctgcaccaaaactatgtgctgcgccaccatcggaagggcctggggt
catccatgtgaaatgtgccctgcccagcctcacccctgccggcggggcttcatccccaac
atacgcactggggcttgccaagatgtggatgaatgtcaggctatccctggcttgtgtcaa
ggtggtaactgcatcaacactgtgggttcatatgagtgcaaatgtcctgcaggacacaag
cagagtgagaccagtcacaagtgtgaagatgtagatgagtgtagcactatctccagcgtt
tgtgatggcggcgagtgcaccaacacagcaggcagctatgtgtgcacatgtccacggggc
ttcatgaccagcccagatggatcacgttgtattgaccagcggattggtacatgtttctca
gctctgattggtggacgctgcgctggggagctcccgggccaatacaccaagatgcaatgc
tgctgtgactctggacgctgctgggcaatcgggcagactcctgaaatgtgcccagtcagg
ggatctgatgaataccgcagactctgcattgaaggactcccagtagtgccagggttccct
gggagcttcccaggaattcctggatttgggccaaatggtgtcggacctggaatcagtgga
cctggaggcattggaccaaatggggctaatggacaaggcgggatcccaggcctgcctgga
atgggcccaggaagttcaagtattggaactgccaccttaaatcagaccattgacatctgc
aagcacttcaccaacctgtgtctgaatgggcgctgcatccccaccccctccagctaccga
tgtgagtgcaacatggggtacaagcaggacgtgcgtggagagtgcattgatgtggatgaa
tgctccagcagcccctgtgtgcatggagactgtgtaaatacacctgggtcctaccactgc
aagtgccatgagggcttccagagcacccccactaagcaggcctgtattgatatcgatgag
tgcatcatgaatggagtgatgtgtagaaatggccgctgtgtaaacactgatggcagcttc
cagtgcatctgtaatgctggctttgaaattacccctgatggcaagaactgtgttgatcac
gatgaatgtgctacaaccaatatgtgtctcaatgggatgtgtatcaatgaagatggcagt
ttcaaatgtatctgtaaaccaggctttgtactggctcccaatgggcgctactgtgttgat
atcgatgagtgcgagacccctggcatctgcatgaacggctggtgcattaacacagagggc
tcatttcggtgtgaatgcctgggtggcctggccattggcgtggatggacgagtctgtgtg
gacacccatatgcgcagcacgtgctatggaggcattaaaaagggtacctgtgcccgtccc
tttccaggagctgttaccaaatctgaatgttgctgtgctaacccagaccatggttttggg
gagccgtgtcaaccgtgtccagccaaaaactctgctgaattccaggcactctgcagcagt
ggcattggaataacagctgatggcagagatatcaatgaatgtgccctcaacccagacatc
tgccccaatggcatgtgtgagaacctgcgtgggagctaccgctgcatctgcaatttgggc
tacgaatcagatcccactggcaagaactgtgtggatgtcgatgagtgcactgttaatcgt
ttgctctgtgacaatggcctgtgccgtaacacacctggaagctacacctgcacctgtccc
aaaggctttgtcttcaggactgagacagatacctgtgaagatatcaatgaatgcacctca
aacccatgtgtgaatggtgtatgcaggaacaatgctggctcttttgcctgtgagtgctcc
ccaggcagcaaactggacccaagtggcaccatctgtgtggacagcatgaaagggacatgc
tggttgaacatccaggatggccgctgtgaggtgaacatcaatggggcaacactgaaatct
gagtgctgtgccacactgggagcagcctggggcagtccctgtgagcgctgtgagatcgat
cctgcctgtcccagagggtttgccaggatgaagggggtcacatgtgaagatgtgaatgaa
tgtgatgtcttccccagcgtctgtcccaatggtcgctgtgtgaacacagccggctctttc
cgatgcgagtgtccagaagggctgactctcgatggaactggcaggacatgtgtggatgtg
cgtgtagagcagtgctacatgaagtgggatgaggatgagtgcaatgagcccctgcctggg
aagtaccggatggatgtatgctgctgttctgtgggctcagcctggggcattgactgtgaa
gaatgtcccaaagttggcaccagtgagtacaaggccatctgcccaagggggccaggcttt
gccaacagaggagatgtgctgtcaggcagacccttctacaaagatgtgaatgagtgcaag
gtcttctctggtctctgcactcatgggacttgtcgaaacacaattggcagcttcagatgt
atctgtggcaatggctttgctttggatgctgaggagagaaactgcacagatatcgatgag
tgtcgcatctcaccagacctgtgtggccatggcacctgcatcaacacaccaggcagcttt
gaatgcgagtgcttcgagggctatgagagcgggttcatgatgatgaagaactgcatggat
attgatgagtgtgagcgggaccccctgctctgccgtggcgggatctgcgtcaacaatgag
ggcagctttgaatgcatctgccccccaggccatgagctaaccactgaaggcagtgcctgc
gtagatatcaacgaatgctctctcagtgataacctgtgccgcaatgggcgttgtgtgaat
gtcattggcacataccagtgcacatgtgactcgggctttcaggccactccagacaggcag
ggctgtgttgatattgatgagtgcaccatcatgaatggcggctgtgatacacactgtgcc
aattcagagggtagctaccagtgcagctgcagtgagggctacgcactgatgccagataag
aggtcgtgtacagatatcgatgaatgtgaggataacccagacatctgtgatgggggccag
tgcaccaacatccctggggaataccgctgtctctgctttgatggcttcatggcttcatta
gacatgaaaacatgtattgatgtgaatgagtgcgacctcaaccccaacatctgccttcat
ggggaatgtgaaaataccaagggctccttcatctgccactgccagcttggctacttcgtc
aagaagggaaccactggttgcacagatatcgatgagtgtgaaattggagcccacaactgt
gacatgcatgcctcatgcatcaatgtacctgggagcttcaagtgcaagtgccgcacaggc
tggcttggagatggtctgaaatgcaatgacttggatgaatgtgccactgaagaacacaag
tgcaatctgaatgccaactgtgtgaacacaccaggctcctaccgctgtgcatgccgagag
ggcttcaatggggatggcttttcctgctcagatgtggatgaatgtgcagacaatgtgaac
ctgtgtgagaatgggcaatgcctgaatgcgccaggaggctaccgctgtgaatgtgagatg
ggcttcaaccccacagaggacagcaaggcttgccaagacatcgatgaatgcactttccag
aacatttgtgtctttgggacctgccagaaccttccagggatgtttcgctgtgcctgtgac
gatggctacgagctagatcggagtggaggcaactgcacagatatcaatgagtgtgcagac
cctgtgaactgcatcaacggtctgtgtgtcaacaccccaggcagctacttgtgcaactgc
ccccaggactttgagctgaaccctactggtgtaggatgtgtggacacccgtgttggtaac
tgcttcctggacactcaggatcgaggggatggtgggatctcctgcagtgctgaaatcgga
gttggggtcactcgagcctcttgctgctgctcgctgggccgtgcctggggcaatccctgt
gagctctgccctcctgcaaatacaacggagtacaagaccctgtgtcctggaggagaaggc
ttcaggcccaaccccatcactgtcatcctggaggatatcgatgagtgccaggaactgcca
ggtctgtgccaggggggcaactgtgtgaacacatttggcagcttccagtgtgagtgtccc
cttggctactacctaaatgaggatacacgcatctgcgaagatattgatgagtgttcagcc
cacattgggatttgtggccctggaacctgctacaacacccttggcaactacacctgtgtc
tgcccccctgagtacatgcaggtcaatggaggaaacaattgcatggacatgaggaagagt
gtgtgctaccgcaactacaatgacacctgtgagaatgagctctccttcaacatgaccaag
aagatgtgctgctgctcctacaacattggcaaggcttggaacaagccctgcgagccctgt
cccacccctgccagccctgagtaccagatcctttgtggaaaccaggcccctggatttatc
attgacattcacacagggaagccaattgatattgatgagtgcagcgagatccctgctatc
tgcaccaatggtgtttgcattaaccagatcggcagcttccggtgcgagtgcccaattgga
ttcagctacaacaatattctgctcatctgcgaagacatcgatgaatgcagcagtggtgag
aatctttgccagcgcaatgctgactgcatcaacatcccaggcagttacaggtgcgagtgc
tcaactggatacaagctgtcgcctagtggagcctgtgtgggtcgtaatgaatgccaggaa
attcccaacgtctgcagccacggtgactgcgttgacactgagggcagctatatctgtgtc
tgtcacaacgggttcaaagccacaggagagcagaccatgtgcatggatattgatgaatgt
gaccggcagccttgtggaaatggcacctgcaagaacacagtgggttcctacaactgcctg
tgcttccctggctttgagctaacacacaacaatgattgcatggatatcgatgagtgctca
tccctggtggggcaggtgtgtcggaacggccagtgtataaacagcattgggtccttccag
tgtctgtgccaggaaggctacgaccggaccccagatgggaaaaactgtgttgacattaat
gagtgtgtgagcctgcctgggacctgttctcctggaacatgtcaaaacctggaaggctct
ttccgttgtatctgtcccccggggtacgaggtgcagaatgacaactgcatcgatatcaat
gagtgtgaagaggagcccaacatctgcctgtttggaacctgcaccaacacccccggcagc
ttccaatgcatttgtccccctggctttgtcctgtctgacaatggccgcaggtgctttgat
actcgccagagcttctgcttcacccgctttgataacgggaaatgctccgtccccaaggcc
ttcaataccaccaaagcccggtgctgctgcagcaagatgcctggagagggctggggtgac
ccatgtgagctgtgccctcaagaagggaatgttgcctttcaggagctgtgtccatatggc
catggggccatccctggcccaggcgatacccgagaagatgtgaatgaatgctctgagaac
ctgggcatctgcataaatggggcatgtattaacactgatggctccttccgctgtgagtgc
ccctttgggtataacctggactacactggagtcaactgtgttgacacagatgagtgctcc
attggtaacccctgtgggaatgggacctgcagcaacgtggtaggaggctttgaatgcacc
tgtgaggaaggatttgagccaggccccatgatgacatgtgaagacatcaatgaatgtgtg
ctgaaccccctgctctgtgccttccgctgtatcaacacctttggcttctatgagtgcacc
tgcccctctggatatgccctccgggaggacagaagaatgtgcaaagatctggacgagtgc
gctgagggcctccatgactgtgagtctcgaggaatggtgtgcaagaacctcattggtacc
ttcatgtgcatctgtccaccagggatgcagcgcaggcctgatggagaaagctgcacagat
gagaacgaatgtcgtaccaagccagggatctgtcccaatggccgctgcgttaacaccgtg
ggcagctatcgatgcgactgcaacgaagggttccaagtcagcccctctggcactgagtgc
attgacacccgccagggtttctgcttcactgaagtgctgcagactatgtgccagatgtcc
tccaccaaccgcaacctggctaccaagtccgagtgctgctgcaatggtggacgtggctgg
ggaactcagtgtgaactctgccctctcccaggaactacccaatacaagaagatgtgtcca
catggacctgggtactccactgatgggcaagatattgatgagtgcaaggtgctgcctaat
ctctgcaaaaacggacagtgcatcaacagcatcggctccttccgctgccattgcaagctg
ggctacaccacagacatcacaggcacagcctgcacagatctggatgagtgtaaccagtct
cctaagccatgtaacttcatctgcaagaataccgagggaagctatcagtgctcctgcccc
agagggtacatcctacatgaagatgggaagacgtgcaaagacttggatgaatgttccacc
aagcagcacaactgtcagttcctgtgtgtgaacaccattggcggattcaactgcaaatgc
cctcctggattcacccagcaccattcatcctgcattgacaataatgagtgcacttcccag
ccttccctgtgtggagctaaaggacagtgtctgaacacaccaggaagctacaactgcgag
tgtcagaaaggattttccctcgacagcgctggtgtcaactgtgaagatgtggatgagtgt
gatgggaaccatcgttgccagcatggctgccagaatgtactgggaggctatcgttgtggc
tgtccccagggttacgtgcaacattaccagtggaaccagtgtgtagatgaaaacgagtgc
tccagccccacagtctgtggctctgcctcttgctacaacaccctgggcagcttcaagtgc
atctgtccttctgggtttgactttgaccaggcctttggtgggtgccaggatgtggatgag
tgctcagctgggagcagtccctgcagctatgggtgctcaaacactgatgggggctactta
tgtggctgccctggaggatacttccgagctggacaagggcactgtatttctggacttggc
tttggcaaaggcccctacctgcccgccccacaggaggaagatgaggacaatttgctctct
cctgagacttgctacgagtgtaagataaatggctaccccaagaggggccgacaacggcgc
agcgtcaatgggactgagaggcaccaggaccacagagtgaatctggccagtgtggacact
gatgctcccttgcccatgtccctgaacctctcggacctggcccacaagaagcatatcctg
gagctgctgccagctgtggagcccctggagaaccatgtgcgctatatgatctctcacggg
aatgaggatggctacttccgcattcaccaaaaagaaggactcagctacttgcatctcggc
cgcaagaagatagtccctggcacctacatgctggagattatgagtgtgcccctgtaccgc
aaaaaggaactgcagaaactggaggccaagaatgacctcaactacctagcaggggagctt
ggccaagcactcaggatgaggctgcagctccagctttactag
DBGET
integrated database retrieval system