Gossypium hirsutum (upland cotton): 107904273
Help
Entry
107904273 CDS
T04793
Name
(RefSeq) pumilio homolog 4-like isoform X1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107904273
NCBI-ProteinID:
XP_016686074
UniProt:
A0A1U8JCW3
LinkDB
All DBs
Position
A05:110511550..110519061
Genome browser
AA seq
1029 aa
AA seq
DB search
MVTGSNIDMLPTMDNGFEIPSGSLEESLTELELLLRARHNQQSVGRDRDLNIYRSGSAPP
TVEGSLSAVGSLFAYPDFGDNNGISGVGDSTTGNNGMLSEDEIRSHPAYLSYYYSHENIN
PRLPPPLLSKEDWRVAQRFQASGSSSGNIGDWRKKKLVDGGDSSSLFSMQPGLYVQQGQN
DLMELRNANARNMSRKMSAEWLDRGPDGLAPLSGTGIGARRKSFADILQGGLDRPAVLTG
HLSRPASRNTFSDMLDVASIADPSPPGFGSGAESLEGLPAGVAHLKSHGKTTSHSFASAV
GSSLSRSTTPEQHLVGRSPGSGLPPVGSKVSLVDKKNIVGSNAQNGHSSAVPELAELAAT
ISGLNLSKTRHADENSHMRSHLQADLGNQLNFPLSMPNGHSHSVQQQFIDKSSAEKLSFS
PNYIDFAREKGIAPNINASKISSNGEVRIPKRTSSSADLYAKVHPSGFGSLEGSDVAHPN
VNLLNTDFIGRLPGAYSVNQKLNSAVKNNLSAGSSLTGTGDRQSSNRAGNQGSDLLSPLV
DPRFIQYLQRTSYGTTAASPDSLLAGNHGGTLHGDLDGLQKAYIEAILAQQKQQYELSLL
GKAGGLNQGYYGNSSYGLGMPYAGNPLANSVLANIGSGSIQNDRTARFNSMMRSSSGSWH
SDISSSMDGRYVSSLLDEFKNNKTRSFELSDIVDHVVEFSTDQYGSRFIQQKLETATEEE
KIKIFPKIIPHARALMTDVFGNYVIQKFFEHGTESQRVELATQLTGHVLPLSLQMYGCRV
IQKALEVVNVDQQTRMVAELDGSIMKCVHDQNGNHVIQKCIECVPQDRIQFIISAFHGQV
VALSSHPYGCRVIQRVLEHCNDAKTQQIIMDEIMQSVCTLAQDQYGNYVIQHVLEHGKPH
ERSTIISKLAGQIVKMSQQKFASNVVEKCLTFGGPQERQILVNEMLGSTDENEPLQAMMK
DQFGNYVVQKVLETCDDQNLELILSRIKVHLNGLKRYTYGKHIVSRVEKLIATGERRIGL
LSSLSSLSS
NT seq
3090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaccggcagtaacatagatatgctaccaacgatggataatggttttgaaatacct
agtgggagtttggaagagagtttgactgaactagaattgcttttgcgagctcgtcataac
caacaatctgtgggtcgtgacagggatcttaacatatatagaagtggcagtgcgccaccc
acggttgagggatccttgagtgctgttggtagtctttttgcctatcctgattttggagac
aataatggtatcagtggtgttggtgatagtactactggcaataatggaatgctgtctgaa
gatgagatacgctcgcatcctgcatatctttcatactattactcccacgaaaacataaat
ccaaggctgcctccaccattgttatcaaaagaggattggcgagttgcacaaaggttccag
gctagtggctcttccagtgggaacattggggactggagaaagaagaagttggttgatggt
ggcgatagttcatcattattttcgatgcaacctggtctttatgtgcaacaaggacaaaat
gatttgatggaactgaggaatgccaatgcaaggaatatgtccaggaagatgtctgctgag
tggcttgatagaggcccagatggtttggctccactgtctggtactgggattggtgcaaga
aggaagagttttgctgacattcttcagggtggacttgatcgacctgccgtcttaactggc
cacctgtcaaggccagcaagtcgaaatactttcagtgatatgttggatgtggctagcatt
gctgatcccagccctcctggttttggtagtggagcagagtccttggagggcttgcctgct
ggtgtagctcatcttaagagccatggtaaaaccacttctcactcttttgcctctgctgtg
ggttcttcgctatcaaggagtacaactcctgaacaacatttagttgggaggtctcctggt
tctggacttcctcctgttgggagcaaggtcagcctagtagataaaaagaatattgttgga
tcaaatgctcaaaatgggcattcgtctgctgtgcctgaacttgctgaacttgcagctaca
atatctgggttgaacttatcgaaaactagacatgcagatgagaatagccacatgcgatct
catcttcaggctgatctgggtaatcagctgaattttccattaagcatgccaaatggtcat
agtcatagtgtgcagcagcaattcattgacaagtccagtgctgaaaagctctcattttct
ccaaactatattgactttgcaagggaaaaggggattgcacctaatattaatgcttctaag
attagttccaatggggaagtcaggattcccaaaagaacttcctcttctgcagatctttat
gcaaaagtgcatccttctggatttggaagtttggaaggatctgatgttgcacatcccaat
gtgaatcttttgaacacagatttcattggccgtctacctggtgcttattcggttaaccag
aagctaaattctgcggttaagaacaatttaagtgcaggttcctccttgactggtactggt
gataggcaaagttcaaatagagcaggaaatcaagggtctgacctcctttctccacttgta
gatcctcgttttatccaatacttacaaagaacttcttatgggacaactgcggctagtcct
gattctttgcttgctgggaaccatggtggtactttgcatggggatttggatggccttcaa
aaggcatacattgaggcaatactagctcagcagaagcagcagtatgaattgtcgctttta
ggtaaagctggtggtctaaatcagggctattatgggaattcttcatatggtctcggcatg
ccatatgctggaaacccactggcaaattctgtacttgcgaacattggttctgggagcata
cagaatgatagaactgcacgttttaattcaatgatgagaagctcatcagggtcatggcac
tcagatatcagtagtagtatggatggaagatatgtatcatctttattggatgaatttaag
aacaacaagactaggtcttttgaactctcagacattgttgaccatgttgttgaattcagt
acggatcagtacgggagtcgctttattcagcagaaattagaaactgccacggaggaagag
aagatcaaaatatttcctaagattattccccatgctcgtgctttgatgactgatgtcttt
ggaaattatgttatacagaaattttttgagcatggtacagaaagtcaaagagtggagtta
gccactcagcttacaggtcatgtgttgcctcttagccttcaaatgtatggttgcagagtg
attcaaaaggctttagaagtggttaatgtggaccagcaaaccagaatggtggcagagctt
gatggttcaatcatgaaatgtgttcatgatcagaatggtaatcatgttattcaaaagtgt
atagagtgtgtccctcaggaccgaattcaatttatcatttcagctttccatggccaagtg
gtggcgctttcttcccacccttatggttgtcgtgtcattcagagggtgctggaacattgc
aatgatgcaaaaacccaacaaatcattatggatgagatcatgcaatctgtatgcactcta
gcacaagatcaatatgggaattatgttattcagcatgttcttgaacacggtaagccacat
gagcggtccactatcatcagcaagcttgctggacaaattgtgaagatgagtcagcagaaa
tttgcttctaatgtcgttgaaaagtgcttgacttttggtgggccacaggaacgacaaatt
ctggtcaacgagatgcttggttcaaccgatgaaaatgagccattacaggctatgatgaaa
gatcaatttggaaactatgtcgtgcaaaaggttctcgaaacatgcgatgatcaaaatctt
gagttgattctttctcgaatcaaggtccatttaaatggcctgaagaggtatacttacggg
aaacatattgtttcccgtgttgagaagcttattgcaactggagaaaggcgtataggatta
ctatccagcctatcctcattgagctcctga
DBGET
integrated database retrieval system
