Gossypium hirsutum (upland cotton): 107904350
Help
Entry
107904350 CDS
T04793
Name
(RefSeq) pullulanase 1, chloroplastic isoform X3
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pullulanase_N2
Pullul_strch_C
CBM_48
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107904350
NCBI-ProteinID:
XP_016686185
UniProt:
A0A1U8J784
LinkDB
All DBs
Position
A05:36112562..36126797
Genome browser
AA seq
829 aa
AA seq
DB search
MPLQLSSLSQDRLLYSRAYWVTKTIIAWNVDVVEGSCYLYASKVAALSVTDNGIQGHDLE
IKLEEDRSGLHPYVIEKFPHIRDYKAFKLPPVLDAKNLVKCQLAVAEFNSQGKCRNATGL
QLPGVLDELFSYDGPLGAFYSAEAVSLCLWAPTAQAVYAHIYKDPVGGSPLEIIPLEETN
GVWSTKGPKSWEGCYYMYEVSVYHPSTLHIEKCYANDPYARGLSADGKRTLFVNLHADDL
KPEGWNELADMKSDILSFSDISIYELHIRDFSANDDTVNADFRGGYMAFTLKDSAGVLHL
KKLSKAGITHVHLLPTFQFAAVDDEKENWKYVDSKILEKLPPDSAEQQEKITAIQDDDAY
NWGYNPVLWGVPKGSYSSDPNGPCRIVEFRKMIQALTHIGLRVVLDVVYNHLHANGPFDK
DSVLDKIVPGYYLRRNTDGFIENSTCVNNTASEHYMVERLIVDDLLSWAINYKVDGFRFD
LMGHIMKRTMVKAKDALCSLTKERDGVDGSRIYIYGEGWDFGEVAKNGRGINASQFNICG
TGIGSFNDRIRDAMLGGSPFGPPLQQGFVTGLLLEPNGHDHGTKDVEKAMLASAKDHIQV
GLAANLRDFVLTDFEGKERKGSEVLCYGGTPVGYALCPTETVNYVSAHDNETLFDIISLK
TPVGISVEDRCRMNHFATSIIALTQGIPFFHAGDEMLRSKSLDRDSYNSGDWFNRLDFTY
NSNNWGVGLPPKQKNENSWPLIQPRLADPSFKPQRSHILAAVENFTDVLRIRFPLLPCEP
IILKLKTNAFFPLLALVFLRMDLLKGTSTVPQHRSIKCPWLHCDEYRRW
NT seq
2490 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccccttcaactctcctctttgtctcaggacaggttgttgtactcgagggcctattgg
gttacaaaaactataatcgcgtggaatgtggatgttgtagaaggttcttgctacttgtat
gcaagtaaagttgctgctttgtctgttacagataatggaattcaaggccatgatttggaa
attaagcttgaggaagaccggagtgggctacatccatatgtaattgagaagtttcctcat
attcgagattataaagcttttaagttgcctcctgtgctggatgccaaaaatctcgtcaaa
tgccaattagctgttgctgaattcaactcacaaggaaaatgcagaaatgctaccggtttg
cagttacctggtgttctggatgaattgttctcatatgatggtcctcttggtgctttttat
tctgcagaagcagtgtctctatgcctctgggctcccactgcccaagcagtttatgctcac
atctataaggatccagtgggtgggagtcccctggaaattatcccgctggaggaaactaat
ggtgtttggagtactaaaggaccaaaaagttgggaaggctgttactacatgtatgaagta
tctgtctaccatccaagcacgttgcatattgaaaaatgttatgcaaatgatccatatgca
agagggctttcagcagatggaaagcgaactttatttgttaatcttcatgctgatgattta
aaacctgaaggatggaatgaattggcagacatgaagtcggatatactttctttctctgac
ataagcatatatgaattacacatacgggatttcagtgccaatgatgatactgtcaatgct
gactttcgtggtggttatatggctttcaccttgaaggactcagcaggcgtgctccatctg
aaaaaattatcgaaagctggtattactcatgttcatttgctgccaaccttccaatttgct
gctgttgatgatgagaaggagaattggaagtatgtggattctaagattctggagaagcta
cccccagattcagctgagcagcaagagaaaatcactgccatccaggatgatgatgcgtat
aactgggggtacaatcctgttctctggggtgtccctaagggaagctattcaagtgatcca
aatggtccatgccgtatagttgaatttagaaagatgattcaggcactcacccatattggc
cttcgtgttgtgttggatgtcgtctataatcacttgcatgcaaatggcccttttgataag
gattctgtccttgataagattgttccaggttactatctgagaagaaacactgatggtttt
attgagaacagtacatgtgttaacaatactgctagtgagcattatatggtcgagcgcctt
attgttgatgatcttttgagctgggcaataaattataaggttgatgggtttcgttttgat
ctcatgggtcacatcatgaaacgcacgatggtgaaagcaaaagatgcactttgtagccta
actaaggaaagggatggggttgatggttcaagaatttatatatacggtgaaggatgggac
tttggcgaagttgcaaaaaatgggcgtgggataaatgcatcacaatttaatatttgtggg
actggaataggaagttttaatgatcgaattcgggatgcaatgcttggtgggtctccattt
ggtcctccactccagcagggatttgtaacaggcctgttgttggagcctaatggtcatgat
catggtacaaaggatgttgaaaaagcaatgcttgcttcagcaaaggaccacatccaggtt
ggtctggctgcaaatttgagggattttgtgcttactgattttgaaggaaaagagaggaaa
ggatcggaagttctctgttatggtgggacacctgtcggttatgctttatgccccacagaa
acggtcaattatgtttctgctcatgacaatgaaaccctcttcgacattatcagcttgaag
actccagtgggaatatcggtggaagataggtgcaggatgaatcattttgcaacaagtata
attgcactgacacagggaataccattttttcatgctggggatgaaatgcttcgctcaaaa
tcacttgatcgtgattcatacaactctggtgattggttcaatagactagacttcacgtac
aattctaacaactggggcgttgggcttcctccaaaacagaaaaatgaaaacagctggcca
ttgatacagccaagactagcagatccctccttcaagcctcaaaggagtcacattcttgca
gctgtagagaactttacggatgtcttacgtatacgcttccctttgttaccttgcgaaccc
atcattctgaagctgaagaccaacgccttcttccccctgttagctttagtctttttaaga
atggatctattgaaaggaacgagtacggttccacaacaccggtccatcaagtgtccctgg
cttcattgtgatgagtatcgaagatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
