Gossypium hirsutum (upland cotton): 107914689
Help
Entry
107914689 CDS
T04793
Name
(RefSeq) clathrin interactor EPSIN 3 isoform X1
KO
K12471
epsin
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
Pathway
ghi04144
Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ghi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
107914689
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ghi04131
]
107914689
Membrane trafficking [BR:
ghi04131
]
Endocytosis
Clathrin-mediated endocytosis
Other core components
107914689
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ENTH
ANTH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107914689
NCBI-ProteinID:
XP_040958173
LinkDB
All DBs
Position
D10:24277401..24285992
Genome browser
AA seq
1171 aa
AA seq
DB search
MKKALGQTVRDLKRGVNKKVLKVPGIEQKVLDATSNEPWGPHGSLLADIAMATRNYHEYQ
IIMAVIWKRICDTGKNWRHVYKGLTVLEHLVAHGSERVIDDIREHAYQISSLSDFQYIDS
SGRDQGSNIRKKSQSLVVLVNDKERIIEVRQKAAANKDKFRSTSTGGMNRAGLGGQGDRY
DYDYQYGYRDDDRYGRYTDSNSRDGDRYSRDNEDRYGRDGYRDDDYKGRSTSVDGDQYGT
RSRSSDRDRAFDDDGDSSRGSNARADDYSQDGSFYRRHEQKFSEQNNGAPPSYEAVNESH
SPVHSERDGETSVAAAPRSSSPPASNNPNLATSDFGTIFVIYTPLFVCSSGVSLIMVVLC
SSNKNLVDVVTFCLNNHHAKSASAGAPVSTPAPAPPTASTSSEIDLLGALSDSWAVVPTL
SETPAAEADAHAKGSIPSFAANPSASNSGNQGFDDPFGDGPFKAFPSGDAASAQQQISTP
ATTFQATMSQIMEASQPPSVKSEIVTGFDFGESFSASAYSTLNASNSQPPSGNSLFLPQD
LSDPNQEDDILAEILPPSGPANDVASHTVFSAPSSQSSLPVATYGQHAQSGANMYQPAQP
SANPYGQLAQPSANPYGQNGQPSANPYGQPAQPSANPYGQNGQPSANPYGQPAQPSANPY
GQNGHSSANPYGQPVQPSANPYSQNGQPSANPYGLPAQPSANPYGQSSANPYGQPTQPNA
IPYGQSAQPNANPYGQPAQPNANPYSQPVQVHANPYGQPAQPNANPYSQPTQPNANPYSQ
PTQPNANPYGQPVQPSANPYAQPTQSVSAAPQIPGSAAQSSNGSLMIGSNGPLCSQMAAQ
PPSPAAPATQFNTGSFISQQGSAVPVESQSAPQTTNDSGAHNNSDVLGGFFSQPGSNTSV
APQTATPSSIGALAIVPQPSKDKFEPKSAVWADTLSRGLVNLNISGPKTNPLSDIGVDFD
AINRKEKRLEKPAPTAVTSTVTMGKAMGSGSGIGRAGASVLRAPANPMVGSGMGMGMGGG
PVGGVGMRGYGGMNQQPMGMGMGMNMGMNPGMGMNNMGMNPGMGMSNMGMNPGMGMSNMG
MNPGMGMSSMGMNQGMGMNMGMNPGMGMNNMGMNRGMEMNNIGMSAGMGMNMGMGQATHM
QSQSGMPGGYNPMMGSSAYSQQPHGGDGGYR
NT seq
3516 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaggccttgggccaaactgttagagaccttaagagaggagttaataagaaagtt
cttaaagttcctggaatagagcagaaggttcttgatgccaccagcaatgagccctggggt
cctcatgggtcacttcttgcagatattgcaatggctactagaaactatcatgaataccag
ataatcatggcagtaatctggaaacgtatatgtgacactggaaagaattggcgtcatgtc
tacaagggtctgactgttttggagcaccttgttgcccatggatcagagcgtgtcatagat
gacataagagaacacgcatatcaaatatcaagtttgtccgactttcagtacattgattcc
agtggaagggaccagggtagcaatattcgaaaaaaatctcagagccttgtggttcttgta
aatgataaagaaaggataattgaagtaagacagaaggctgcagccaacaaggacaagttt
cggagcacatcaacaggtggaatgaatagggcaggtttggggggacagggggacagatat
gattatgattatcaatatggttatagagatgatgatcggtatggtagatatacagattca
aacagtcgtgatggagatcgctacagccgagataatgaagatcgctatggcagggatggt
tacagggatgatgactacaaaggtagaagtacaagtgttgatggtgatcaatatggcacc
agaagtaggagctctgatagagaccgtgcttttgatgatgatggtgattcatcacggggc
agcaatgctagagctgatgattattctcaggatggaagtttctataggcggcatgagcag
aagttctctgaacaaaataatggtgctcctcctagttatgaagcagtaaatgaatctcat
agtcctgtccatagtgaaagggatggagaaacttcagtagcagctgctcccaggtcatct
tctcctcctgctagcaataatcctaacctagcaacgtctgattttggtactatatttgta
atatatacaccattgtttgtatgttccagtggtgtttccttgatcatggttgttttatgc
tcatccaataagaacttagttgatgtggtgacgttttgcttgaacaatcaccatgcaaaa
tctgcctctgccggtgctcctgtttctacacctgcccctgctcctcccactgcttcaacc
agttctgaaatagacttactcggtgcactgtcagattcatgggcggttgtgccaactcta
tctgaaacccctgctgctgaggctgatgcccatgctaaaggttctataccctcctttgct
gctaatccatcagcatctaactccggaaatcagggttttgatgatccatttggtgatggt
ccatttaaagctttcccttcaggggatgctgcctcagctcagcaacaaatatcgactccc
gcgactactttccaggctacaatgagccaaattatggaagcatctcagccaccttctgta
aaatctgagattgtcacaggctttgacttcggggaatcattctctgccagtgcttactcc
actctcaatgcctcaaacagtcaacctccctcaggaaattcactgtttttgcctcaagat
ttgtcggatccaaatcaggaagatgatatattggcagaaatccttccaccctctggacct
gcaaatgatgtagcttcacatacagtcttttcagcaccatccagccaatcatcactacct
gtagctacttatggccagcatgcacaatcaggtgctaatatgtaccaacccgcgcagcca
agtgcgaatccatatggccagcttgctcagcccagtgctaatccatatggccaaaatggg
caaccaagtgctaatccctatggccagcctgcgcagcccagtgctaatccatatggccaa
aatgggcaaccaagtgctaatccctatggccagcctgcgcagcccagtgctaacccatat
ggccaaaatgggcactcaagtgctaatccctatggccagcctgtgcagcccagtgctaac
ccatacagccaaaacgggcagccaagtgctaatccctatggcctgcctgcgcaacccagt
gcaaacccatatggccagtcaagtgctaatccctatggccagccaacacaaccaaatgct
attccttatggtcaatctgcacaaccaaatgctaatccgtatggtcaacctgcacaacca
aatgctaatccatacagccaacctgtacaggtacatgctaatccatatggccaacctgct
cagccgaatgctaatccatacagccagcctacacagccgaatgctaatccatacagccag
cctacacagccgaatgctaatccatacggccaacctgtacagccaagtgctaatccatat
gcccaacccacacagtctgtatctgcagcccctcaaattccaggatctgctgctcagagc
agcaatgggagcttaatgataggttctaatggtcctctctgttcacaaatggctgctcaa
cctccaagtcctgctgcaccagctactcagtttaacactggaagctttatttcacagcag
ggttctgctgtgccagttgagtcgcagagtgctcctcaaaccacaaacgattcaggtgca
cataataacagtgatgtcctgggaggctttttttcacaaccaggatcgaacacttcagtg
gcgccacagactgctactccctcatcaataggagcacttgctatagttccgcaaccctcg
aaggataaatttgagcccaagtcagcagtttgggctgatacattgagcagaggactggtc
aatttgaatatatctggacctaaaacaaacccactgtctgatattggagttgactttgat
gctattaatcggaaggaaaagaggttggaaaagcctgccccaactgcagtaacgtctact
gtcacaatgggtaaagctatgggatctggttctggaattggccgtgctggtgctagtgtt
ctcagagctccagcaaatcctatggtgggttccggcatgggtatgggaatgggtggtggt
cctgttggaggtgttggcatgagaggctacggtggtatgaatcaacaacctatgggcatg
ggaatggggatgaacatgggtatgaacccaggcatggggatgaacaacatgggcatgaat
ccaggcatggggatgagcaatatgggcatgaatccaggcatggggatgagcaatatgggc
atgaatccaggcatggggatgagcagtatgggcatgaatcaaggcatggggatgaacatg
ggcatgaatccaggcatggggatgaacaacatgggcatgaatcgaggcatggagatgaac
aatataggcatgagcgcaggcatggggatgaacatgggaatggggcaggcaacccacatg
caatcacaaagtgggatgcctggcggttacaaccctatgatgggttccagtgcctactct
caacagccacatggtggtgatggtggttaccggtga
DBGET
integrated database retrieval system
