Gossypium hirsutum (upland cotton): 107927097
Help
Entry
107927097 CDS
T04793
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
Pathway
ghi03015
mRNA surveillance pathway
ghi03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ghi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
107927097
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
107927097
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ghi03041
]
107927097
Spliceosome [BR:
ghi03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
107927097
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107927097
NCBI-ProteinID:
XP_016713561
UniProt:
A0A1U8LG36
LinkDB
All DBs
Position
D03:50392621..50395699
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MYGQDGGEAAPPSYGGGYGVSGGYGGGGGGYGGGGRGGSGGHGGRGGGGRGGGGGYGGGY
QNRGGGGGYQGGERAGRGGGGRGGGRGGSGRDGDWLCPNPSCGNLNFARRVECNKCGAPS
PAGAGGDRGSGSTGGGYSRGGGGGYGGNRGGRDGGRGGYDSGRNNNYDGGRGGNNDNRSS
GSRGGSYGSSQGVEDSGYGQVPPPAPNSYGGNYPPAPNTYGGNANYGMDSVPPPTSYTGG
PTSYPPSYGGPAGGYAGEGLSDARTGGRGGPPGGYDGGYGSGGPRNQGGGYGGPPVEAPA
KIKQCDGNCGDSCDNSRIYITNLPPDVTIEELRDLFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIK
IYTDEKGNQKGDAVLSYEDPQAAHSAGGFFHNHVMRGYTIGVAMAEKTAPKVYDHGGGKG
GYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHHHGGNRSRPY
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggtcaagacggaggcgaagctgctccgccttcatatggaggtggttacggcgtt
tctggaggctatggaggcggcggcgggggttatggtggaggcggacgaggtggaagtgga
ggtcatgggggtcgaggtggaggcggcagaggaggtggtggaggatatggcggtggttat
caaaatcgaggaggcggtggaggctatcaaggaggagagcgtgctggaagaggtggcggc
ggaagaggtggtggccgtggtggaagcggccgtgatggtgattggctttgccctaacccc
agctgtgggaacttgaactttgcaagaagagttgaatgtaacaaatgcggtgcaccatct
cctgcgggtgctggtggtgatcgtggtagtggtagtactggtggtggttatagcagaggt
ggtggtgggggatatggcggtaatcgcggaggtagagatgggggtagaggtggttatgat
agtggtaggaataacaactatgatggaggcagaggtggaaacaatgataatagaagcagt
ggtagtagaggtggttcttatggaagtagtcaaggggtagaagatagtgggtatggtcaa
gttcctcctccagcacccaattcttatggtgggaattatccacctgctcctaatacatat
ggtgggaatgcaaattatggaatggattcagtccctccacctacaagctatactggtgga
cctacatcataccctccatcttatggtggccctgcgggtggctatgctggtgagggtttg
agtgatgcacggactggtggtcgtggtggacctcctggtggatatgacggtgggtatggt
tctggtggtcctcgaaatcagggaggtggttatggtggtcctcctgttgaagcaccagct
aagatcaagcagtgtgacggcaactgtggggattcttgcgacaactcaagaatatacata
acaaatttgccacctgatgttactattgaagaattaagagacctttttggcggcattgga
caagttggaagaattaagcagaagcgtggctataaagatcaatggccatggaatattaaa
atatacacagatgagaaaggaaaccagaaaggtgatgcagttttgtcttatgaagatcct
caggctgcccactctgctggcggtttctttcacaatcatgtcatgagaggctatacaatc
ggagtggctatggcagagaagactgcgcccaaagtatatgatcatggaggtggtaaaggt
ggctacggaggtggtggcgacaggcgcagggatagttacagagatggtggttctggtcca
gataggcatcaccatggcggaaatcgttcgcgcccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
