Gossypium hirsutum (upland cotton): 107943640
Help
Entry
107943640 CDS
T04793
Name
(RefSeq) pumilio homolog 4-like isoform X1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107943640
NCBI-ProteinID:
XP_040947507
LinkDB
All DBs
Position
D04:complement(925388..932884)
Genome browser
AA seq
1030 aa
AA seq
DB search
MVTGSNIDMLPTMDNGFEIPSGSLEESLTELELLLRARHNQQSVGHDRDLNIYRSGSAPP
TVEGSLSAVGSLFAYPDFGDNNGVSGVGDSTTGNNGMLSEDEIRSHPAYLSYYYSHENIN
PRLPPPLLSKEDWRVAQRFQASGSSIGNIGDWRKKKLVDGGDSSSLFSMQPGLYVQQGQN
DLMELRNTNARNMSRKMSAEWLDRGPDGLAPLSATGIGARRKSFADILQGGLDRPAILTG
HLSRPASRNTFSDMLDVASIADPSPPGFGSGAESLEGLPAGVAHLKSHGKTTSHSFASAV
GSSLSRSTTPEQHLVGRSPGSGLPPVGSKVSLVDKKNIVGSNAQNGHPSAVPELAELAAT
ISGLNLSKTRHADENSHMRSHLQADLGNQQNFPLNLPNGHSHSVQQQFIDKSSAEKLLFS
PNYIDFAREKGIAPNINASKISSNGEVRIPKRTSSSADLYAKVHPSGFGSLEGSDVAHPN
VNLLNTDFIGRLPGAYSVNQKLNSAVKNNLSAGFSLTGTGDRQSSNRAGNQGSDLLSPLV
DPRFMQYLQRTSYGTHTAASPDSLLAGNHGGTLHGDLDGLQKAYIEAILAQQKQQYELSL
LGKAGGLNQGYYGNSSYGLGMPYAGNPLANSVLANIGSGSIQNDRTARFNSMMRSSSGSW
HSDISSSMDGRYVSSLLDEFKNNKTRSFELLDIVDHVVEFSTDQYGSRFIQQKLETATEE
EKIKIFPKIIPHACALMTDVFGNYVIQKFFEHGTESQRAELATQLTGHVLPLSLQMYGCR
VIQKALEVVDVDQQTRMVAELDGSIMKCVHDQNGNHVIQKCIECVPQDRIQFIISAFYGQ
VVALSTHPYGCRVIQRVLEHCYDAKTQQIIMDEVMQSVCTLAQDQYGNYVIQHVLEHGKP
HERSTIISKLAGQIVKMSQQKFASNVVEKCLTFGGPEERQILVNEMLGSTDENEPLQAMM
KDQFGNYVVQKVLETCDDQNLELILSRIKVHLNGLKRYTYGKHIVSRVEKLIATGERRIG
LLSSLSSLSS
NT seq
3093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaccggcagtaacatagatatgctaccaacgatggataatggttttgaaatacct
agtgggagtttggaagagagtttgactgaactagaattgcttttgcgagctcgtcataac
caacaatctgtgggtcatgacagggatcttaacatatatagaagtggcagtgcgccaccc
acggttgagggatccttgagtgctgttggtagtctttttgcttatcctgattttggagac
aataatggtgtcagtggtgttggtgatagtactactggcaataatggaatgctgtctgaa
gatgagatacgctcgcatcctgcatatctttcatactattactcccacgaaaacataaat
ccaaggctgcctccaccattgttatcaaaagaggattggcgagttgcacaaaggttccag
gctagtggctcttccattgggaacattggggactggagaaagaagaagttggttgatggt
ggtgatagttcatcattattttcgatgcaacctggtctttatgtgcaacaagggcaaaat
gatttgatggaactgaggaataccaatgcaaggaatatgtcccggaagatgtctgctgag
tggcttgatagaggcccagatggtttggctccgctgtctgctactgggattggtgcaagg
aggaagagttttgctgacattcttcagggtggacttgatcgacctgccatcttaactggc
cacctgtcaaggccagcaagtcgaaatactttcagtgatatgttggatgtggctagcatt
gctgatcccagccctcctggttttggtagtggagcagagtccttggagggcttgcctgct
ggtgtagctcatcttaagagccatggtaaaaccacttctcactcttttgcctctgctgtg
ggttcttcactatcgaggagtacaactcctgaacaacatttagttgggaggtctcctggt
tctggacttcctcctgttgggagcaaggtcagcctagtagataaaaagaatattgttgga
tcaaatgctcaaaatgggcatccgtctgctgtgcctgaacttgctgaacttgcagctaca
atatctgggttgaacttatcgaaaactagacatgcagatgagaatagccacatgcgatct
catcttcaggctgatctgggtaatcagcagaattttccattaaacttgccaaatggtcat
agtcatagtgtgcagcagcaattcattgacaagtctagtgctgaaaagctcttattttct
ccaaactatattgacttcgcaagggaaaaggggattgcacctaatattaatgcttctaag
attagttccaatggggaagtcaggattcccaaaagaacttcctcttctgcagatctttat
gcaaaagtgcatccttctggatttggaagtttggaaggatctgatgttgcacatcccaat
gtgaatcttttgaacacagatttcattggccgtctacctggtgcttattcggttaaccag
aagctaaattctgcagttaagaacaatttaagtgcgggtttctccttgactggtactggt
gataggcaaagttcaaatagagcaggaaatcaagggtctgacctcctttctccacttgta
gatcctcgttttatgcaatacttacaaagaacttcttatgggacacatactgcggctagt
cctgattctttgcttgccgggaaccatggtggtactttgcatggggatttggatggcctt
caaaaggcatacattgaggcaatactagctcagcagaagcagcagtatgaattgtcgctt
ttaggtaaagctggtggtctaaatcagggctattatgggaattcttcatatggcctcggc
atgccatatgctggaaatccactggcaaattctgtacttgcgaacattggttctgggagc
atacagaatgatagaactgcacgttttaattcaatgatgagaagctcatcagggtcatgg
cactcggatatcagtagtagtatggatggaagatatgtatcatctttattggatgaattt
aagaacaacaagactaggtcttttgaactcttagacattgttgaccatgttgttgaattc
agtacggatcagtacggtagtcgctttattcagcagaaattagaaactgccacagaggaa
gagaagatcaaaatatttcctaagattattccccatgcttgtgctttgatgactgatgtc
tttggaaattatgtcatacagaaattttttgagcatggtacagaaagtcaaagagcggag
ttagccactcagcttacaggtcatgtgttgcctcttagccttcaaatgtacggttgcaga
gtgattcaaaaggctttagaagtggttgatgtggaccagcaaaccagaatggtggcagag
cttgatggttcaatcatgaaatgtgttcatgatcagaacggtaatcatgttattcaaaag
tgtatagagtgtgtccctcaggatcgaattcaatttatcatttcagctttctatggccaa
gtcgtggcgctttctacccacccttatggttgtcgtgtcattcagagggtgctggaacat
tgctatgatgcaaaaacccaacaaatcattatggatgaggtcatgcaatctgtatgcact
ctagcacaagatcaatatgggaattatgttattcagcatgttcttgaacacggtaagcca
catgagcggtccacgatcatcagcaagcttgctggacaaattgtgaagatgagtcagcag
aaatttgcttctaatgtcgttgaaaagtgcttgacttttggtgggccagaggaacgacaa
attctggtcaacgagatgcttggttcaactgatgaaaatgagccattacaggctatgatg
aaagatcaatttggaaactatgtcgtgcaaaaggttcttgaaacatgcgatgatcaaaat
cttgagttgattctttctcgaatcaaggtccatttaaatggcctgaagaggtatacttac
ggcaaacatattgtttcccgtgttgagaagcttattgcaactggagaaaggcgtatagga
ttactatctagcctatcctcattgagctcctga
DBGET
integrated database retrieval system
