KEGG   Gossypium hirsutum (upland cotton): 107953100
Entry
107953100         CDS       T04793                                 
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2
  KO
K17943  pumilio RNA-binding family
Organism
ghi  Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Motif
Pfam: NABP PUF PUF_NOP9
Other DBs
NCBI-GeneID: 107953100
NCBI-ProteinID: XP_016743813
UniProt: A0A1U8P0E8
LinkDB
Position
A08:409342..415679
AA seq 1067 aa
MMLSELDRRPMIGSSEGSFGDDLEKEIGLLLREQHSRQDADDLERELNLYRSGSAPPTVE
GSLSAVGGLFGGATSSAATGGGFAATAFSAFAGAKNGNGFASEEELRSDPAYHSYYYSNV
NLNPRLPPPLLSKEDWKFAQRLKGEGLAIGGIGDRRKLNRADNGSNRSLFSMPPGFDTRK
QENEVEAEKVHSSADWGGDGLIGLSGIGLGSKQKSFAEIFQDDLGHTAPVARIPSRPASR
NAFDENFENVGSAESELAHLRRQLTSADPLRSSGSGQGSSAVHNIGPPSSYTYAAAVGAS
MSRSTTPDPQLVARASSPCLTPIGGGRVGNSEKRNINSPSTFSGVTSGVNGSDDLVAALS
GMNLSSNHGIDEDNQLASQIEQDVENHQNYLFGLQDGQDHIKQQACLKKPESGHLHMPSV
KSNGIRSDLKSPSLLSDRQAVLQKSAVPSNNSYLKGSPASTLNGSGSLPAQYPHGDGANA
SFPNYGLSGYSLNPALANMVPSQLGSGNLPLLFENVAAASAMAVPGMDSRVLGGAFGSGQ
NISNAASESHNLGRVGSQIAGNALNAPFIDPLYLQYLRTSDYAAAQQAALNDPTVDRNFL
GNSYMNLLELQKAYLGALLSPQKSQYGVPLGAKSTSSNLHGFYGNTTFGAGMSYSGSPLA
NAVLPNSPVGPGSPIRHTDLNMRFPSGMRNLAGSVIGPWHLDSGCNIDESFSSSLLEEFK
GNKTKCFELSEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKTMVYEEIIPQALALMTDVF
GNYVIQKFFEHGLPSQRRELAGKLFGHVLTLGLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIKMVQEL
DGSVMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEENIQFIVTTFFDQVVTLSAHPYGCRVIQRILEHC
KDPKTQSKVMDEILGSVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSIIIKELAGKIVQMSQQK
FASNVVEKCLTFGGPSERQLLVNEMLGSTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQR
ELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAAQSPHPTA
NT seq 3204 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatgttatctgagttagataggagaccaatgataggaagtagtgaaggatcattcggg
gatgatttagagaaagagataggattattgctccgtgaacagcatagtaggcaagatgct
gatgatcttgaacgcgagctgaacttgtatagaagtggctctgctcctcctaccgtggag
ggttcactgagtgcggttggcggtttgtttgggggtgccacctcctccgctgctactggt
ggtggttttgctgccaccgccttttcagcttttgctggagctaaaaatggaaatggattt
gcatctgaggaagaactcaggtctgatccagcttatcattcatactattactcgaatgtg
aatctcaacccgaggctcccacctcctttgctttcaaaggaggattggaagtttgcacag
aggttgaagggagagggtttagctataggtgggattggagataggaggaagttgaatagg
gctgataatggtagcaataggtcgttgttctcgatgccgcctgggtttgataccaggaaa
caagagaacgaagtagaggcagagaaagtgcatagctctgcagactggggtggtgatgga
ctgattggtttgtctggtataggacttggaagcaaacagaaaagctttgccgaaattttt
caggatgatttgggacacactgctccagtcgctaggataccatctcgtcctgcgagtcgt
aatgcttttgatgagaactttgagaatgtaggttctgctgaatctgagctcgctcatttg
cggcgacaacttacttctgcagatcctttaaggtcaagtggaagtggtcagggatcgtct
gctgtccataacatcgggccaccttcttcatacacctatgcagctgctgtaggtgcttca
atgtctaggagtaccactcctgatccccaactcgtagctagggcttctagtccttgcctg
acaccaattggtggaggcagagttggcaactcagagaaaagaaacataaatagtccaagc
acatttagtggcgtcacatctggtgtcaacggatctgatgatcttgttgctgctttatca
ggcatgaacttgtcatcaaatcatgggatagatgaagataatcagttagcatcacaaatt
gaacaagatgttgagaatcaccagaattatctgtttggtttgcaagatggtcaggatcat
atcaaacagcaggcatgcttgaagaaaccagaatctggccatttacatatgccttcagtt
aagagtaatgggattagatcggacctgaaaagcccttccttgctttctgataggcaagct
gtgctccagaaatctgctgttccctcaaacaattcttacttgaaaggatcacctgcttcc
acacttaatggcagtggcagcttacctgctcaatatccgcatggtgatggtgccaatgca
tcatttccaaactatgggttaagtggttactctttaaatcctgctttggccaatatggtg
cccagccaacttggatctgggaatttgccactactgtttgaaaatgttgctgctgcatca
gctatggcagtccctggaatggactccagagtgcttgggggagcttttggttctggacag
aacatttcaaatgctgcatctgagtcccataatcttggtagagttggaagccaaatagct
ggaaatgctctgaatgcacctttcattgatcctttgtatcttcagtatttaaggacttct
gattatgctgcagcacagcaggcagctcttaatgaccccactgtggatagaaatttcctt
ggtaattcatacatgaacttgcttgagcttcaaaaagcttatctcggagctctgctatca
cctcaaaaatcccaatatggtgttccattgggtgctaaatctactagttcaaatctccat
ggcttttatggaaataccacctttggagctggcatgtcttattctggaagtcccttagca
aatgctgttcttccaaattctccagttggacccggtagtcctatcagacacactgacctg
aatatgcgttttccatctgggatgaggaatctagctgggagtgtaattggaccgtggcat
ttggattcaggatgtaatattgatgaaagcttttcctcctccctacttgaagagtttaag
ggcaataagacgaagtgttttgaactttcagaaattgctggtcatgttgttgagttcagt
gcagatcagtatggcagcaggtttattcagcaaaaacttgaaacagccacaactgaagag
aaaactatggtttatgaggaaatcattcctcaagctcttgctttgatgactgatgttttt
ggtaattatgttattcaaaagttttttgaacacggacttccaagtcagagaagggaactt
gctggcaagctttttggtcatgtattaactcttggtctgcaaatgtatggatgtcgggtg
atccagaaggccatagaagttgtcgatctggatcagaagattaaaatggttcaagagctt
gatggtagtgtgatgcgttgtgtacgtgatcagaatggcaaccatgttatccaaaaatgc
atcgaatgtgttcctgaggagaacatacaatttatagttacaacattttttgatcaagtt
gtgaccctttctgctcatccatatgggtgccgagtgatacagagaatattggagcactgc
aaggacccaaaaacacagagcaaggttatggacgagattctaggatctgttagcatgttg
gcccaagaccagtatggcaattacgttgttcagcatgtactggagcatggaaagcctcat
gagcgctcaattataattaaggagttagctggaaagattgtccagatgagtcaacagaag
tttgcctctaatgttgttgagaagtgcttaacttttggcggtccttctgaacgtcagtta
ttggtgaatgaaatgcttggttctactgatgagaatgaacctcttcaggcaatgatgaaa
gatcagtttgcaaattatgttgtacagaaagtactggagacttgtgatgaccagcagcgt
gagctgatcctttctcgaattaaggtccatttaaatgcattgaagaagtacacttacgga
aaacatattgttgcacgtgtagagaaacttgttgctgctggggaaaggagaattgctgct
caatctccacaccctactgcttag

DBGET integrated database retrieval system