Gossypium hirsutum (upland cotton): 107954098
Help
Entry
107954098 CDS
T04793
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
DUF445
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107954098
NCBI-ProteinID:
XP_016745063
UniProt:
A0A1U8P3Y7
A0A1U8P4C2
LinkDB
All DBs
Position
D07:13932070..13939014
Genome browser
AA seq
1042 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPMIQNSEGSFGDDLEEIDLLLREQRCRQDADDLERELNLYRSGSAPPTVDGS
LSAVGGLFGGGAAASGGSGATPFSAFHGIKNGNGFASEEELRSDPSYHSYYYSNVNLNPR
LPPPLLSKEDWKYAQRLKGGNSVIGGVGDRRKMNRVDNGSSRSMFSTPPGFDSRKQEIEV
EVEKGRSSAEWGGNGLIGISGIGLGSKQKSLAENFQDDLGHTAPVARIPSRPASCNAFDE
NLENGGSAELTSSDTLQSSVNLQGSSAVHNIGPPTSYTYADAVGASLSRSTTPDPQLVAR
APSPCLTPIGGGRVGNLDKRSINSPSTFGGITSGLNESGDLVAAMSGMNLSSNGVIDEDN
QLPSQIEQDVENHQNYLFGLQDGQSHIKQQAYLKKSESGHLHMPSANGNGVRSDLKNPSL
LSERQAQLQKSALPSNNSYLKGPPTSTLNGGGSLPAWYQHNVLSGYSLNPALASVMASQP
GTGNLPPLFESVAASSAIAVPGMDSRVLGRGLGSGQSNSNAASELHTFGRVGSQIAGNAL
QASLIDPMYLQYLRTSDYTAAQLSALNDPSMDRNFLGNSYMNLLELQKAYLGTLLSPQKS
PYGVPLGAKSGSSNIHGFYGSPTFGAGMSYPGSPLANPVIPNSPVGPGSPMRHSDLNMCF
PSGMRNLAGGVMGPWHFDAGCNMDESFASSLLEEFKSNKTKCFELLEIAGHVVEFSADQY
GSRFIQQKLETATTEEKNMVYEEIMPQALALMTDVFGNYVIQKFFEHGLPAQRRELADKL
FGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDTDQKIKMVQELDGSVMRCVRDQNGNHVIQKCIECV
PEEHIQFIVTTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRILEHCRNPKTQNKVMDEILGSVSMLAQDQ
YGNYVVQHVLEHGKPHERSIIIKELAGKIVHMSQQKFASNVVEKCLTFGGPAERLLLVNE
MLGSTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIV
ARVEKLVAAGERRIAAQSPRPA
NT seq
3129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatctgaactgggcaggagaccgatgatacaaaatagtgaaggatcatttggggat
gatttggaggagatagaccttttgctccgtgaacagcgttgtaggcaagacgctgatgat
ctcgaacgtgagctaaacttgtacagaagtggctccgcgcctcctaccgtggacggctca
ctgagtgcagttggtgggttgtttgggggaggagctgctgcttctggtggtagtggggct
acccccttttcagcttttcatgggataaaaaatggaaatgggtttgcgtcggaggaagag
cttaggtctgatccatcatatcattcatactattactcaaatgtgaatctcaacccgagg
cttccaccccctttgctttccaaggaggattggaagtatgcacagaggttgaaaggaggg
aattcagtcataggtggggttggagataggagaaaaatgaatagggttgataatggtagt
agtaggtcgatgttttcgacgccaccagggtttgattcaaggaaacaagagattgaagta
gaggtagagaagggtcgtagctcagcggagtggggtggcaatggactgattggtatatct
ggtatcggacttggaagcaaacagaaaagccttgctgaaaattttcaggatgatttggga
cacactgctccagtcgcaaggataccatctcgtcctgccagctgtaatgcttttgatgag
aaccttgagaatggaggttctgctgaactgacatcttcagatactttacagtcaagtgtg
aatcttcaaggatcatctgcagtccataacattgggccacctacttcatacacttatgct
gatgctgtaggggcttccttgtctaggagtactactcctgatcctcaacttgttgctagg
gctcctagtccttgtcttacacctattggaggaggcagagttggtaacttggacaaaaga
agcataaatagtccaagcacatttggtggtatcacatctggtctcaatgagtctggagat
ctggtagctgctatgtctggcatgaatctgtcatctaatggagtgattgatgaagataac
caattaccgtcacagattgaacaagatgttgaaaaccatcagaattatttatttggcctt
caagatggtcagagtcatatcaagcagcaggcgtacttgaagaaatctgaatctggccat
ttacatatgccttcagctaacggtaatggggtcaggtcagacctcaaaaacccatccttg
ctatctgaaaggcaagctcagctccagaaatctgcccttccctctaacaattcttacttg
aaaggaccacctacttccacactcaatggtggaggcagtttacctgcttggtatcagcat
aatgtgttaagtggttactctctaaatcctgctttagcttctgtgatggctagccaacct
ggaactggtaatctgccaccactgtttgaaagtgttgctgcttcgtcagctattgctgtc
cctggaatggactccagagtgcttggaagaggtttgggatctggacaaagcaattcaaat
gctgcttccgagttgcatacttttggtagagttggaagccaaatagcagggaatgctctg
caggcgtctttgattgatcctatgtatcttcagtatctgaggacttctgattacactgca
gcacagctttcagctcttaatgatccctccatggataggaacttcctgggtaattcatac
atgaacttgcttgagcttcaaaaagcttatcttggaactctgctatcacctcagaaatct
ccttatggtgttcccttaggtgctaaatctggtagttctaatattcatggtttttatgga
agccccacttttggagctggcatgtcgtatccgggaagccccttagcaaatcctgttatt
cccaattctccagttggacctggtagtcctatgagacacagtgacctgaatatgtgtttt
ccttccgggatgaggaatctagctgggggtgtcatgggaccctggcatttcgatgcagga
tgtaacatggatgaaagctttgcctcctccctacttgaagagtttaaaagcaataaaaca
aagtgttttgaacttttggaaattgctggtcatgttgttgagttcagcgcggatcagtat
ggcagccgatttattcagcaaaagcttgaaaccgctaccacggaagagaaaaatatggtt
tatgaggagatcatgcctcaagctcttgctttgatgactgatgtctttggtaattatgtc
attcaaaagttttttgaacatggacttccagctcagagaagagaacttgctgacaagctt
tttggccatgttttaacactaagtcttcaaatgtatggttgtcgggtgatccagaaggct
atagaagttgttgatacggatcagaagattaaaatggttcaagagcttgatggtagtgtt
atgcgttgtgtacgtgatcagaatggcaaccatgtcattcagaagtgtatcgaatgtgtt
cctgaggagcacattcaatttatagttacaacgttttttgatcaagttgtgaccctttcc
actcatccatatgggtgccgagtgatacagaggatactggagcactgcaggaacccaaaa
acacagaataaggttatggatgagattttaggatctgttagcatgttggcacaagaccag
tatggcaattatgttgtccagcatgtgctagagcatggaaagcctcatgagcgttcaatt
ataataaaggagttagctggaaagattgtccacatgagtcagcagaagtttgcctctaat
gtggttgagaagtgcttaacttttggtggtcctgctgaacgactgttattggtgaatgaa
atgcttggttctactgatgagaatgagcctctacaggcaatgatgaaagatcagtttgca
aactatgtggtacagaaagtactcgagacttgtgatgaccagcaacgtgagctgatcctt
tctcgaattaaggtccatttaaatgcattgaagaagtacacttacggaaagcatattgtt
gcgcgtgtagagaaacttgttgctgctggggaaaggagaattgccgcgcagtctccacgc
cctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system
