KEGG   Gossypium hirsutum (upland cotton): 107957881
Entry
107957881         CDS       T04793                                 
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase 1-like isoform X1
Organism
ghi  Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Motif
Pfam: CBM_4_9 Glyco_hydro_10
Other DBs
NCBI-GeneID: 107957881
NCBI-ProteinID: XP_016748987
UniProt: A0A1U8PCR0
LinkDB
Position
A05:complement(21473277..21477449)
AA seq 920 aa
MVVRGNCFCICDSGTCNWWFFMGNCRSGNPTDNIIVNHDFYKGLYSWHPNCCNGFIVSAN
SGNRVGLSPKSGGNYAVIKNRTEHWQGLEQDITSKISPGSTYSVSACVGVSGPLSGSTDV
MATLKLLNHGSGASYMFIGKTSVSKGKWEMVEGIFSLPTVPNQVIFYLEGPPPGVELLID
SVVIRCPSSSKSEKSTSIGCSAVGDEVIINPQFENGLSNWSGRGCQVVLHDSMADGKILP
ETGKFFASASERTQNWNGIQQEITGRVQRKLAYNVTAVVRIFGNNVTTATIQATLWVHTP
DRGEQYIGIGKVQATDKDWVQLQGKFLLNGSPSRVIIYLEGPPPGTDILVNALSVKHAEK
IPPLPPPIIENPDYGVNIVTNSQLSDGTDGWFPLGNCNFSAASGSPKILPPMARDSLGVH
EPLSGRYILVKNRTQTWMGPAQMITDKLKLFLTYQVSAWVRIGSGASGPQNVNVALGVDN
QWVNGGQAEIKDRRWHEIGGSFRIEKQPLKVMVYVQGPAAGVDLMVAGLQIFPVDRVARF
KHLARQTDKTRKRDIILQFSGSESSSLFGTSVTVMQTQNSFPIGSCINRTNIENEDFVDF
FVKNFNWAVFGNELKWYWTEPQRGNFNYKDADDMLALCQNNKIETRGHCIFWEVQSTVQQ
WIQALNKNDLMKAVQNRLTGLLTRYKGKFRHYDVNNEMLHGSFYQDRLGKDIRTYMFKTA
NQLDPSATLFVNDYHVEDGTDTRSYPEKYIEQILDLQQQGAPVGGIGIQGHIDNPVGPIV
CSALDKLGVVGLPIWFTELDVSSLNEHIRGEDLEVMLREAFAHPAVEGVMLWGFWELFMS
RDNAHLVDAEGEINEAGKRFLALKHEWLSHAHGRIDIQGQFEFRGFHGTYVVEVETESNK
VSRTFVVDKGDSPLVVSIDL
NT seq 2763 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtggttcgtgggaactgtttttgtatctgtgatagtgggacgtgtaattggtggttt
tttatggggaattgtagaagtgggaatccaactgataatatcatagtaaaccatgacttc
tacaagggactgtactcttggcatcccaattgctgcaatggctttatagtatcagccaat
tctggtaaccgggttggattgtcaccaaagtcaggtggtaattatgcagttatcaaaaat
cgcacagaacactggcagggtctggagcaagatatcacaagcaaaatttcaccaggttct
acgtactcagtttctgcttgtgttggagtatcggggcccctttcagggtctacagatgtc
atggcaaccttgaagctattaaaccatggttcaggagcgagctatatgttcattggaaaa
acatctgtgtcaaagggaaaatgggaaatggtggaaggtatattctcattaccaacagtg
cctaatcaggttatattttatttggaagggcctcctccgggtgttgagctgcttattgat
tcagtggttattaggtgtcctagttcaagcaagtcagagaagagtacaagcataggatgc
agtgctgttggagacgaggtcatcataaaccctcaatttgaaaatggtctcagtaactgg
tctggaagaggctgccaggttgttttgcatgattctatggcagatgggaagattttacca
gaaactgggaaattttttgcatctgcatcagagcgcactcagaactggaatggaatccag
caggagatcactggaagagtgcagcgaaagctagcatataatgtaacagctgttgtacgg
atatttggtaacaatgtcacaactgctactatacaagctacattatgggtccacacacca
gatcgtggtgaacagtacatcggaattggcaaagtgcaggcgaccgataaggattgggtg
caattgcagggaaagttccttctaaatggttctccttcaagagtaatcatctatttagaa
ggcccacctccaggcacagacattcttgtcaatgccttaagcgtaaagcatgccgagaaa
atccctcctttaccaccaccgattattgagaatcctgattatggagttaatatagttaca
aatagccaactaagtgatggaaccgatggatggtttcctcttggtaactgcaattttagt
gctgcatcaggctcaccaaagatacttcctccaatggctagagattcccttggtgtccat
gaacctttaagcggccgctatatcctggtgaaaaatcgcacgcaaacttggatgggccca
gctcagatgatcactgataagctgaaacttttcttgacataccaagtatctgcttgggtt
cgaattggttctggagcaagtggtcctcaaaatgtgaatgtcgcacttggtgtggacaac
cagtgggtaaatggtggacaagctgagattaaagatcgtagatggcatgaaatcggtggt
tcctttagaattgagaagcaaccattgaaggttatggtttatgtccagggtccagctgca
ggtgttgatttaatggttgctggacttcagattttccctgttgatcgtgtggcccggttt
aagcatttggcgaggcaaactgacaagactcgaaagcgtgatattatccttcaattctca
ggatctgaatcaagcagtttgtttggaacctctgttacagtcatgcaaacacaaaatagt
ttccctatagggtcttgcatcaatagaacaaatatagagaacgaagattttgttgatttc
tttgtgaaaaacttcaactgggcggtgttcggaaatgaattgaaatggtattggacggaa
ccacaaagaggaaatttcaactacaaagatgctgatgatatgttggctttatgtcaaaac
aacaaaatagaaacccgaggtcattgtattttctgggaagttcagtccaccgtccagcaa
tggattcaagcattgaacaaaaatgacttgatgaaagctgttcaaaatcgtctaacaggc
cttctcacacgttacaagggaaagttcaggcactatgatgtgaacaacgagatgttgcat
gggtcattttatcaagaccggctgggcaaagatatccgaacatacatgtttaagactgca
aatcagcttgatccatctgccacgctatttgtgaatgattatcatgttgaagatggaacg
gataccagatcatatcctgaaaagtatattgaacaaattcttgatttgcagcagcaaggt
gcacctgttggagggattgggattcaaggacatatagataatccagtaggaccaatagtg
tgtagtgctctggataagttaggcgttgttggtcttcctatctggtttacagagcttgat
gtgtcttccctcaatgaacacattcgaggggaggatttggaagttatgcttagagaagct
tttgcacatcctgctgtggagggtgtaatgctgtggggattttgggaattgttcatgagc
cgggacaatgcccatctggttgatgcagaaggtgaaatcaatgaagctgggaagagattt
cttgctcttaaacatgaatggttgtctcatgcacacggacgtatcgatattcaaggacaa
ttcgaattcagaggctttcatgggacatatgttgtggaagttgaaactgaatcgaacaaa
gtttcgagaacatttgttgttgacaagggcgactccccattggtggtgtccatagatctg
taa

DBGET integrated database retrieval system