| Entry |
|
|---|
| Name |
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: ABC transporter C family member 13
|
|---|
| KO |
| K05674 | ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 10 |
|
|---|
| Organism |
ghi Gossypium hirsutum (upland cotton)
|
|---|
| Pathway |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:ghi00001]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
107958463
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:ghi02000]
107958463
Transporters [BR:ghi02000]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCC (CFTR/MRP) subfamily
ABCC1, 2, 3, 4, 5, 6, 10, 11, 12, 13 subgroups
107958463
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
A05:11485144..11511709
|
|---|
| AA seq |
1462 aa
MKQLKFLLCPNSPFVWDGNGFSQCFDDLVLGFGINAASIAVICIVGIMRRRARTNWTVKF
SEKALLHSIAVIGACLSCVDAILLVKKKLHGDXVLYHELLFRFSHFMVWATIVFSLRCAC
FQHIFCNMVLCIWWTIKPLFGIPHLQKAFSSMEVLDCLKESSVLFLDIMFCVSINCIRIK
QASASSSPMEDSLLCAEMDIEEGCHRDSRRMQGCWDHIVFRSIISVMNSGLGKQLGFDDL
LLLPTDMDPSICHEKLLSCWQHQHNNSSSNASLFRAIFSAYGWPYIRLGLLKVFNDFIGF
AGPLLLNKLIRFLQQGSGNLDGYVLAISLGLVSVVKSFSDTQYTFHLSKLKLKLRSSIMT
VIYHKCLSVSIAERSKFSEGEIQTFMSIDADRTVNLCNSFHDMWSLPIQIGVALYLLYTQ
VKLAFMAGLAITILLIPVNKWISELIASATEKMMKQKDERIRRTGELLAHIRTLKMYSWE
ILFSSWLMDTRSLELKHLATRKYLDAWCVFFWATTPTLFSLCTFGLFTLMGHQLDAAMVF
TCLALFNNLISPLNSFPWVINGLIDAFISSRRLSRFLCCSEQKPELEQKAKFQPSFSNEK
YDLVSNDMVVVMHDASCAWSSDDEDQNLVLNHVTLSLPKGLLVAVVGEVGSGKSSLLNSI
LGEMRLVFGSIYSSGSVAYAPQVPWILSGTIRDNILFGKNLDSQRYADVLEACALDVDIS
LMAGRDLAYIGEKGTNLSGGQRARLALARAMYQGSDVYLLDDILSAVDAHVAKWILQNAI
LGPLVEHKTRILCTHNVQAISSADMIVVMERGHVKWVGNSSDLAVSAYSGFASVNEFDAS
YIHSKLYSTNTSYMDKQSPLLENNTLDVPLEAQDIIEAEQRKEGKVELIVYKKYAGFAGW
FISVVILLSAILMQASRNGNDLWLSYWVDTTGISQGKYSTSFYLLVLCIFCIINSSLTLV
RAFSFAFGGLKAAVQVHNTLLNKVINAPAQFFDQTPGGRILNRFSSDLYTIDDSLPFILN
ILLANFVGLLGIAVVLSYVQVFFLLLLFPFWYIYSKLQFFYRSTSRELRRLDSVSRSPIY
ASFTETLDGSSTIRAFHSEDYFLARFTELVAQYQRTSYSELVASLWLSLRLQLLAASIIS
FIAVMAIIRSYGSLPISFGTPGLVGLALSYAAPIVSLLGSFLTSFTETEKEMVSMERALQ
YMDVPQEELCGFQYLNSSWPFEGVVEFQNVTMKYIPSLPAALNDITFTIARGTQVGIVGR
TGAGKSSVLNALFRLNPICGGRILVDGLNIVDIPVRDLRARLAVVPQSPFLFEASLRDNL
DPLWMSNDEKIWDVLEKCHVKEEVEVAGGLEAKVKEAGTSFSVGQRQLLCLARALLKSSK
VLCLDECTANVDTQTASILQKTISTECQGMTVITIAHRISTVLNMDNVFVLNQGTLVEEG
NPNALLQDESSIFSSFAKASTM |
|---|
| NT seq |
4389 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaagcaactcaaattcctcctttgccctaattctcctttcgtttgggatggaaatggc
ttctcgcaatgttttgatgacttggtcttgggttttggtataaatgcagcaagtattgcc
gtgatttgcatagttggaataatgagaagaagggcccgaacaaactggacggtaaaattt
tcagagaaggctcttctacattctatagcagtcattggagcatgtttatcatgcgtggat
gccattttgcttgtgaagaaaaagcttcatggagatnttgtcttatatcatgagttgctt
ttcagattttcgcatttcatggtctgggcaactattgtattctccttgaggtgtgcctgt
tttcaacacatattttgcaatatggtcctctgtatatggtggactataaaacctctgttt
ggaatccctcatctccaaaaggcattctcttcaatggaggttttagattgtcttaaagaa
agctctgttttatttttggatattatgttttgcgtatccattaactgtatccggataaaa
caggcatccgccagtagcagcccaatggaagattcacttctttgtgctgagatggacatt
gaggaaggttgtcacagggattctagaagaatgcagggctgttgggatcatattgtgttc
agatctatcatttctgtaatgaattctggtttgggaaagcagcttggctttgatgattta
cttttgctgccgactgatatggatccttctatatgtcacgaaaaactattaagctgctgg
caacaccagcacaataattcttcctcaaatgcatcattatttagagcaatcttctctgca
tatggatggccatatattcgtctaggtttattaaaggtttttaatgatttcattggtttt
gctggaccactgcttctgaataagctaattcggtttcttcaacaaggttctggaaatttg
gatggctatgttcttgcaatatcgttaggcctagtatcagttgtcaaatccttttctgat
acacagtatactttccatctttcaaagctgaagctaaagttacgatctagtatcatgact
gttatctatcataagtgtttatcagtcagcatagcagaacgatcaaagttttcggagggg
gaaattcaaacatttatgtctatagacgctgatcgaactgtcaatttatgcaacagtttc
catgacatgtggagcctacctatacaaattggagttgcactgtatcttctgtatacgcaa
gtcaaattggctttcatggctggacttgcaataaccatcttactaataccagtaaataaa
tggatctctgaattgattgccagtgccactgagaaaatgatgaagcagaaggatgagagg
attaggaggacaggggaacttttggctcacattcgcactttaaagatgtatagctgggag
atccttttctctagttggttgatggatacaagatctttggaattgaaacacttagctaca
cggaagtacttggatgcctggtgtgtattcttttgggctacaacaccaactcttttctct
ttatgcacatttggactctttacattgatgggacatcagctcgatgctgcaatggttttc
acatgtcttgctctttttaataatttgatatctcctctcaattcattcccatgggttatc
aatggacttattgatgcctttatatctagcagaaggttgagcaggttcctttgttgttca
gaacaaaaacctgaactggaacagaaagctaaatttcaaccaagtttctcaaatgaaaaa
tatgatcttgtctccaatgatatggtagtagttatgcatgatgcatcttgtgcttggtca
agcgatgatgaagatcagaatttggttttgaatcatgtcacactaagtctcccaaagggt
cttttggttgcagtagttggagaggttggttcaggcaaatcatcattgttaaattctata
ttgggagaaatgaggcttgtttttggatcaatatattcaagtggttctgttgcatatgca
ccacaggttccatggatcttatctggaacaatacgtgacaatatattgtttggaaagaat
ctagattcccaaaggtacgcagatgttttagaggcatgtgctctagatgttgatatttca
ttgatggctggacgtgacttggcttatattggagagaaaggaactaatttatcaggtgga
cagagagctcgtcttgctttagcaagggccatgtatcagggttccgatgtttatttgctt
gatgacatccttagtgcagttgatgcacatgttgctaaatggattttgcaaaatgctatt
cttggtcctcttgtggaacataagactcgtatcctctgtactcataatgtccaggcaata
tcttctgctgacatgattgttgtaatggaaagagggcacgtgaagtgggtaggaaactcg
tctgacttggcagtttcagcatattcggggttcgcatcagttaatgaatttgatgcatca
tatattcatagtaaattatacagcacaaatacttcctacatggacaaacaaagccccctg
ttggagaataatactttggatgtcccactggaagcacaagatattattgaagctgagcag
aggaaagagggtaaagttgaacttattgtttacaaaaagtatgctggatttgctggttgg
ttcatttcagttgtgatattgctttctgcaatcttaatgcaagcttctcgaaatggaaat
gatttgtggctatcatattgggttgatacaacagggatcagtcaaggaaaatactcaaca
tccttttatctgctggtactttgcatcttctgcatcattaattcttctctgaccttggtg
agggctttctcatttgcatttggcggtctaaaagctgcagttcaggtgcataatacactg
cttaataaggttattaatgcacctgcccagttctttgatcaaacaccaggtggacgaata
cttaacaggttctcatcggatctctatacaattgatgattctctcccattcatcctcaac
attctcctggctaattttgtgggcctgttaggaatagcggtagttttgtcctatgttcag
gtctttttcttgcttctactatttccattttggtacatctatagcaagctgcagttcttc
tacaggtcgacatctagagaactgcgaaggttggacagtgtctcacgctctccaatttat
gcatccttcacagagacactcgatggatcatcaactatacgagctttccattctgaggat
tatttcttggctagattcactgagcttgtagcacagtatcagagaacttcatattcagag
ttagtagcaagtttgtggctttccctgcgccttcagttattagctgcatccataatatca
tttattgctgtgatggctatcattcgatcttatggaagtttaccaattagttttggtacc
ccagggctggtaggattagccctttcatatgcagctccaattgtttccttgttgggaagc
ttcttgacaagttttactgaaacagaaaaagaaatggtttcaatggagagagctcttcag
tatatggacgtgcctcaagaagaactctgtggattccagtatttaaattcgagttggcca
tttgaaggagtggttgaatttcagaatgttaccatgaaatatatcccatctttaccagca
gcactaaatgatatcaccttcaccatagcaagaggaacacaggttggaattgttggaaga
actggtgctggaaaatctagtgttttgaatgccctttttcgcctaaacccaatatgcgga
ggacggattttggtggatggcttgaacatagttgatattccagttagagatcttcgtgca
cgcttggctgttgtaccccagagcccatttttatttgaagcatcattaagggacaaccta
gatcctctctggatgagcaacgacgagaaaatatgggatgtcttggagaaatgtcatgtt
aaggaggaagtagaagtggcaggaggactggaagctaaggtaaaggaagctgggacgtca
ttttctgttgggcaaaggcagcttctttgccttgcacgtgctcttctcaagtcttctaag
gttctttgtttggacgaatgcactgcaaatgtggatacgcagacagcttcaattctacag
aaaactatatccacagaatgccaaggaatgacggtgatcacaatcgcacaccgtatttca
acagttttgaatatggacaatgtatttgttctcaatcaaggaactctggtggaggaaggt
aacccaaatgcgcttctacaagatgaatcctccatattttcaagctttgctaaagcgtct
acaatgtaa |
|---|
