Gossypium hirsutum (upland cotton): 107963856
Help
Entry
107963856 CDS
T04793
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
Pathway
ghi03015
mRNA surveillance pathway
ghi03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ghi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
107963856
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
107963856
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ghi03041
]
107963856
Spliceosome [BR:
ghi03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
107963856
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107963856
NCBI-ProteinID:
XP_016755846
UniProt:
A0A1U8PXH5
LinkDB
All DBs
Position
A03:complement(4992699..4995773)
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MYGQDGGEAAPPSYGGGYGGSGGYGGGGGGYGGGGRGGSGGHGGRGGGGRGGGGGYGGGY
QNRGGGGGYQGGERAGRGGGGRGGGRGGSGRDGDWLCPNPSCGNLNFARRVECNKCGAPS
PAGAGGDRGSGSTGGGYSRGGGGGYGGNRGGRDGGRGGYDSGRNNNYDGGRGGNNDNRSS
GSRGGSYGSSQGGEDSGYGQVPPPAPNSYGGNYPPAPNAYGGNANYGMDSVPPPTSYTGG
PTSYPPSYGGPAGGYAGEGLSDARTGGRGGPPGGYDGGYGSGGPRNQGGGYGGPPVEAPA
KIKQCDGNCGDSCDNSRIYITNLPPDVTIEEIRDLFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIK
IYTDEKGNQKGDAVLSYEDPQAAHSAGSFFHNHVMRGYSIGVAMAEKTAPKVYDHGGGKG
GYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHYHGGNRSRPY
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggtcaagacggaggcgaagctgctccgccttcatatggtggtggttatggcggt
tctggaggctatggaggcggcggcgggggttatggtggaggcggacgaggtggaagtgga
ggtcatgggggtcgaggtggaggcggcagaggaggtggtggaggatatggcggtggttat
caaaatcgaggaggcggtggaggctatcaaggaggagagcgtgctggaagaggtggcgga
ggaagaggtggtggtcgtggtggaagcggccgtgatggtgattggctttgccctaacccc
agctgtgggaacttgaactttgcaagaagagttgaatgtaacaaatgcggtgcaccatct
cctgcgggtgctggtggtgatcgtggtagtggtagtactggtggtggttatagcagaggt
ggtggtgggggatatggcggtaatcgcggaggtagagatgggggtagaggtggttatgat
agtgggaggaataacaactatgatggaggcagaggtggaaacaatgataatagaagcagt
ggtagtagaggtggttcttatggaagtagtcaagggggagaagatagtgggtacggtcaa
gttcctcctccagcacccaattcttatggtgggaattatccacctgctcctaatgcatat
ggtgggaatgcaaattatggaatggactcagtccctccacctacaagctatactggtgga
cctacatcataccctccatcttatggtggccctgcaggtggctatgctggtgagggtttg
agtgatgcacggactggtggtcgcggtggacctcctggtggatatgacggtgggtatggt
tctggtggtcctcgaaatcagggaggtggttatggtggtcctcctgttgaagcaccagct
aagatcaagcagtgtgacggcaactgtggggattcttgcgacaactcaagaatatacata
acaaatttgccaccagatgttactattgaagaaataagagacctttttggcggcattgga
caagttggaagaattaagcagaagcgtggctataaagatcaatggccatggaatattaaa
atatacacagatgagaaaggaaaccagaaaggcgatgcagttttgtcttatgaagatcct
caggctgcccactctgctggcagtttctttcacaatcatgtcatgagaggctattcgatc
ggtgtggctatggcagagaagactgcgcccaaagtatatgatcatggaggtggtaaaggt
ggctatggaggtggtggtgacaggcgcagggatagttacagagatggtggttctgggcca
gataggcattaccatggcggaaatcgttcgcgcccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
