Geobacillus icigianus: ACPVTF_15225
Help
Entry
ACPVTF_15225 CDS
T11292
Name
(GenBank) leucine-rich repeat protein
Organism
gic Geobacillus icigianus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_5
Flg_new_2
CarboxypepD_reg
LRR_4
CarbopepD_reg_2
SdrD_B
Ig_DR_A0283-like
CooC_C
LRR_EndoS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XRN32524
LinkDB
All DBs
Position
complement(3012229..3017133)
Genome browser
AA seq
1634 aa
AA seq
DB search
MGLLVNSLPIGVFAEGVDESNIEITESEGIVNNEESQANQEINEGEENQENQNEETTTGT
GEASEATNTETPNKGSTEGTGGTAGPTTGESTGETTEEAIAGEVTDGAAGEAITESDTNT
EQSAPNENASEMSYNSNNDYEYFVENNEVTIFRYIGTDKDVVIPSTIDGYSVVEIAENAF
LNRGIRSVVIPEGVKLIGDQAFMGNELTSVDIPGSVTRIGDWAFFDNDLTSVTIGSSVEY
IGLRAFSQNNIDFINLPSSVKVIGDHAFSVNNLTSIDIPDSVTDIGKYAFADNHIEVAKL
PVGLTTISEGLFSHNNLTSIDIPESVVTIEAGSFFANNLVSVRVPDNVTSIGDGAFSANL
LASVMIGGKVETIGERAFRYNNLTEVVIPDSVKSIGQYVFADNKLTKVTLSNAITEIPTG
AFMNNDFTEFVIPDGIVVIGESAFVGNELTSVTFGQSLKQIKDFAFYGNNLTSVNLPKGV
NSIGSYAFGSNKLTSITVNGSWEKTSNGLIGVYFDYWAVEGNQTNPRDLKVYGYAGTMVE
EVANYRGYTFIDITPVPEPDQRLKINEVFPDENLAKYFAEWMSALPSWQGKSDSTFSMAE
LDARIKLNGALNFNASNRGIRSLKGMEIFGDVATKYSDIPVNFDFSGNLLEDVDPLYKIT
SVRTLFLNDNKLKDIKGLRNLKYVTRETAHGAASLYSDAALNLQNNLLTDISPLSNLKRV
ESKIDLSNNKLQNVDGLNAEFIGFLDVSNNYLTSLNTSVFDPDKVYAIKVDHNFIQNITS
VIPSEYVQRLYGENDYRPQYSFNFTQSSSVKVEYRVRGTNELISYDIVNDVGNFETRKYK
AKNLEGYILDDDLEKEFSGIGKAFTSVIKPVLGIKSRDGFTGIQNSSRKFSFVTHDSYSN
LPNSPYKTDGAVLSYDSASGDLVVVRESNDPFYVYTDVDVYEGNIYLGTYSVPVLGHGSP
DTAVVFYYKPVAKWTLTVNMEGQGYVSPYVGTYNYDNGSKVNLYASPNFGYRFDKWVVNG
TEFFSPSITITMDSNKTAVAHFVPLEQYKLSVNIVGEGEVNVLNEFTMSRQTYGSGDEGT
YDGGTSLSLTPAPKLGYRFVKWVVDGVEINGDYLPLYMDSNKTVEAHFESVPLVKPLIGH
IIVKFLDMLTMEKIKEDEEIKNVPVGEYTYTAEEKIGDYKIVGEAVKTVIITMTDFFKEI
IFLYEKEVPQPEPQPEPKPEPVQDPKPEPVQDPKPEPVQDPKPEPVQDPKPEPVQDPKPE
PVQDPKPEPVQDPKPEPVQDPKPEPVQDPKPESVQDPKPESVQDPKPVVKVQKRDKVTVI
AVDNKTDRVLMQKELTNLSYGYNEVRAPKIEGYEVTGPSLALVRVTDSGKEIVVKFRYEV
KKAYGTVFGVVIDSEGNPIEGVMVELHSKPRVTYTNEKGEYRFENVELGKHTVILKNPYT
LEEIAKIEVIVYKDVNDVNSGIKEVVQVSNEVRKSIELNETVNTQRIDFVIEPIKPKEEP
KDGPKDKPQNEPKEKPKDEPKDKSQDKPKGKPSKDLPIIPIVSAIPFIILLGYLRRKNVK
VYNEDGMVVAKLRVKARPETVIDLSGMKAETLKVVFRNPERFRKLELMVKYNDMKVRVEL
EEGKNYLVFKPTEE
NT seq
4905 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtttattagttaactcattgccaataggggtatttgcagagggtgtagatgaatca
aatattgaaataacagaaagcgaggggatagtaaataatgaagaaagccaagcgaatcaa
gaaattaatgaaggagaggaaaatcaagaaaatcagaatgaggaaactactacaggaaca
ggagaagcgtcggaggcaacaaatacggaaacgccgaataaaggaagcacagaaggaaca
ggaggaacagcaggaccaacaacaggagaatcaacaggagaaaccacagaagaagcaata
gcaggagaagtaacagacggagccgcaggagaagcgataacagaatcagataccaataca
gagcaatctgcaccaaatgagaatgcatcagaaatgtcatacaatagcaataatgattac
gagtattttgtggaaaataacgaggtaactattttcaggtatataggaacggataaagat
gtagttattccaagtacgatagatggttattcggtagtagagattgctgaaaatgctttt
ctaaaccgtgggataagatcggtagttataccagagggtgtaaaactgataggtgatcaa
gcgtttatgggtaatgagttgacctcggtagatataccggggagtgtaactcggataggc
gattgggcgttttttgataatgatttaacttctgtaactattgggagtagtgtagagtat
atcggtttaagggcattttctcagaacaatatagattttataaatttacctagttcagta
aaagtgataggtgatcatgctttttctgttaacaatcttacgagtattgatatacctgac
agtgtaacggatattggaaaatatgcgtttgctgacaatcacattgaagttgcgaaacta
ccagttggtcttacaactattagtgaaggtttattttctcataacaatttaacgagtata
gacatacctgagagtgtagttactattgaggctggttctttcttcgcaaataaccttgtt
agtgttagagtgccggacaatgttacttctattggtgatggtgctttttcggctaaccta
ttagcatcagtaatgatagggggaaaagttgaaacaattggagagagagcgtttaggtat
aacaatttaacagaagtagtaatacctgattcagttaaatcaattggtcagtatgttttt
gcggataacaaattaacaaaagtaacattatcgaatgcaatcacagaaattccaactggt
gcatttatgaataacgattttacagaattcgttattcctgatgggattgttgtaattgga
gagtctgcttttgtagggaacgagttgacttcagtgacatttggtcaatctttaaagcaa
attaaggactttgcgttttacggtaataacttaacatcagtaaatcttccaaaaggggta
aattcaattggttcttatgcatttggttctaacaaattaacatcaataacagtgaatggt
tcatgggaaaaaacatcgaatggtttaattggtgtctattttgattattgggcagtagag
ggaaatcaaacgaaccctcgtgatttaaaagtatatgggtatgcaggaacaatggtggag
gaggtagctaattaccgtggatacacgtttatagatataacacctgttcctgagccagac
caacgacttaaaataaatgaagtatttcctgatgagaatttagcaaagtactttgcggag
tggatgagtgctttaccaagttggcaaggtaaatcagattccacatttagtatggcagag
cttgacgcaagaattaaactgaatggtgctttaaatttcaatgctagtaatcgaggtatc
agaagcttaaaaggtatggagatatttggtgatgtagcaactaagtatagtgatattcca
gttaactttgatttttcgggtaatttactcgaagatgtagatcctttatataaaataact
tctgttcgaacattatttttaaacgataacaagctaaaggatataaagggtttaaggaat
ttaaaatatgtgactagggaaacagctcatggagcggcaagcttgtattcagatgcggca
ttaaatcttcaaaacaacttattaacggatatttctcctttaagtaatttaaagagagtg
gaatcaaaaatagacctttctaataataagttgcaaaatgttgatggtttaaacgcagaa
tttatagggtttttagatgtatcgaacaattatctaactagcttaaatacttcagttttc
gacccagacaaagtgtatgcgattaaggtagaccataattttattcaaaatatcacgtca
gtaataccttctgagtacgtacaaagactttatggtgagaatgattacagaccacagtat
tcatttaattttactcaatcatcatcagttaaagtagagtacagagttcggggtactaat
gagttaatcagttacgatatcgttaatgatgtagggaatttcgagactaggaaatataaa
gcgaagaatcttgagggttacattttagatgatgatttggaaaaggaatttagtggtata
ggtaaagcatttacttcagtgatcaaaccagttctaggtataaaaagtagggatggtttt
acaggtatacagaatagtagccgaaaattttcttttgtaacgcatgacagttattcaaat
cttcctaatagtccatataaaacggatggtgctgtattatcttatgattcagcaagtgga
gatttagttgtagtcagagaaagtaatgatcctttctatgtttataccgatgtagatgtg
tatgaaggtaatatttatctaggaacgtattcagttccagtgttaggtcatggcagtcca
gatacagcagtggtattttactataaacctgttgctaaatggactttaacagttaatatg
gaaggtcaggggtatgtatcaccttatgtgggaacatataattacgataatggaagcaaa
gtaaatttgtacgcatcaccgaattttggttatcgatttgataaatgggtagtaaacgga
acagagtttttctcacctagcattactataacaatggatagtaataaaacggcagtagct
cattttgtaccactagagcaatacaagttatcagtaaatatagtgggtgaaggcgaagta
aatgtattaaacgagtttacaatgtcaaggcagacgtatggctcaggtgatgaaggaaca
tatgatgggggtacgagtttatctttaacacctgcaccaaaattaggttatcggtttgta
aagtgggtagtggatggagttgaaataaatggtgattacttaccattatatatggacagc
aataaaacggtagaggctcattttgaaagtgtacctttagtaaaaccattaataggtcat
atcattgtaaagtttttagacatgttgacgatggaaaagattaaagaagatgaagaaatt
aagaacgtacctgtaggtgagtacacgtatacggcagaagaaaagataggagattataaa
atagttggtgaagcagttaaaacagttattattacaatgacggatttctttaaggaaatt
attttcttatatgagaaagaggtaccacaaccagaaccacagccagaaccgaagccagaa
ccagtacaagacccgaaaccagaaccagtacaagacccgaaaccggaaccagtacaagac
ccgaaaccggaaccagtacaagacccgaaaccagaaccagtacaagatccgaaaccggaa
ccagtacaagatccgaaaccggaaccagtacaagatccgaaaccggaaccagtacaagac
ccgaaaccggaaccagtacaagatccgaaaccggaatcagtacaagatccgaaaccggaa
tcagtacaagacccgaagccagtggtcaaggtgcaaaagcgtgataaggtaacagtaatt
gcagtagataataaaacggatagggtattaatgcaaaaagaattaacgaatttaagttat
ggttataacgaggtgagagcacctaaaattgaaggttatgaggtaacaggaccttcatta
gcgttagtaagagtgacggatagtggtaaggaaatagtagtaaaattcaggtatgaagtg
aaaaaagcatatggaacagtatttggcgtagttatcgatagtgaaggtaatccgattgaa
ggggtaatggttgaattacactctaaaccaagagtcacctatacaaatgaaaaaggtgag
tatagatttgaaaatgtggaattaggtaagcacacagtaatcctaaaaaatccgtacaca
ttagaagaaatagcaaaaatagaggttatagtttataaagatgtaaacgatgttaattca
gggataaaagaagtagttcaagtatctaatgaggtgcggaagtcaattgagttaaacgaa
acagtgaatacacaacgaattgactttgtaatcgaaccgattaaacctaaagaagagcca
aaggacggaccaaaagataagccacaaaatgaaccgaaagaaaaaccaaaggatgaacca
aaagataaatcacaagataaacctaaaggtaagccatcaaaagatttaccgatcatcccg
atagtttcagcgattcctttcatcatattattaggttatttaagacgtaaaaatgtcaag
gtatataatgaagatggtatggttgtagcgaagttaagagtaaaagctagaccagaaaca
gtaatagacctatctggaatgaaagctgaaacattaaaggtagtatttagaaatccagag
agatttagaaagttggagttaatggtcaagtataacgatatgaaggttagagtagaatta
gaagaaggtaagaactatcttgtatttaaaccaacagaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system