Gimesia benthica: F1728_06510
Help
Entry
F1728_06510 CDS
T06296
Name
(GenBank) cadherin repeat domain-containing protein
Organism
gim
Gimesia benthica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
CshA_repeat
ADPRTs_Tse2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGQ22344
UniProt:
A0A6I6A7E8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1705671..1713599)
Genome browser
AA seq
2642 aa
AA seq
DB search
MVLKDWLYSLRLNFQFNPKRRVRRSLRRRKKLTHQHYATVQSLEQRQLLSGTNEPPEFDN
GEMGYWWSVAEDTAVGSVIGTVSATDPESDSITYALTSGASIFSIDGSTGEITLIVSLDY
ETSEYASFGVSATDSEGNVANSWGEIAVTDVAESPAFNDGEMGYWWSLPEDTAIGSVIGT
VSATDPQGSSVTYALSAGAETFSIDSTTGEITLIAPLDYETSQYASFGVTATDTDGNSTS
SWGEINVTDVNEAPQFSNGEMGYWWSLPEDTPVGTIVGTVSANDPQGDAVTYELTSGSGT
FAVDSSSGEITLITALDYETSEYASFGVKATDTDGNYSTSWAEVSVTDVVEAPIFSSGEM
GYWWTVSEATTIGTVIGTVSANDPQGGSVTYEITSGSDTFAVDANSGEITLIAPLDYETS
EFASFGVKATDADGYFATSWGEIYVEDAAESSGSGSSSGSSSASSSGSGSGSGSASGGTS
SGSGSGTASSSGSSSGSSSGSGSNSAPVFSEGEMGYWWTVAEDAPVGSVIGTVSATDADG
DEVSYALTSGAEYFAVDTLSGEITLIAALDYETSSFVSFGISAIDTAGNVATSWGEVTVT
DVTESSGSGSASSSGSSSTSGSTSGSASGSGSSSGSGSSSSSTSGSTSGSSSGSSSNSAP
TFSAGETGYWWTVAEDTSIGSVIGTVSATDPDGDGITYALTSGTNTFSIDSTTGAVTLVA
ALDYETSQSASFQVSATDSNGNIASSSVYVLITDVNEVPEFTDNRMGYSWNVAENTAIGS
VIGTVSAIDPQGDSVTYALISGTQTFSIDSATGDVTLIAALDYEVSAVATFEVSATDVNG
NSSTTWGNIFVENVSESSGSGSSSTSGSSSSSTSGSSSSSSSTSGSTSGSSSSSGSGGSS
SSGGSSSSTSGSSSGSGSSSTSGSSSSSGGSSSGSSSGSGSSTMSGGSSGSGSSSSSGSG
FVEEEAPQFSTNYQGEGYYYWKVSEDTAVGTVIGKVEATDAQDQVITFSLTSGTETFSID
SSTGEVTLIAELDYATAMYLVFSVQAIDTDGNISNAQVDVVVEQIQDAPQFGKTTNYLTV
SEDAAVGTQIGVMQATDAQGDAITYTITYGGDTFGIDATTGVVTLLAALDYETSSFDLFA
VQASDTNGNSTTIWTQVTIDDVENESHNNSSGSGSGSGSSSSSTSGSTSGSTSGSGSGSS
STSGSSTGSSSTSGSSSSSTSGSSSTSGSTSGSSSTSGSSSTSGSSSSSSSGSSSTSGST
SGSTSGSSSTSGSGSSSSSSSTSSSASSSGSGSSSSSGSSSASSSTSGSSSTSGSSSSST
SGSSSVSGSTSGSTSGSASTSGSSSSSGSSSSSTSGSTSGSTSSSASTSTSGSASTSGST
SGSSSSSTDGSGSTSGSTSGSSSGSASSSGSSSGGSGSSSGGTSSSGSGSGSSSGSNSGS
GSSSGSNSGSGSSSGSGSASGSASGEDPYVDLIDAFNSGAEAASNAWNQAATTANSEHET
QIDAAVSDYNTTFSNLLSAYETEIAAAENVFNTAVDTIISNTSNQIDADKQQAISDLAAA
ANAYNAAVAQANLDYPSVAAYLNNTSGSGSSSGSSSSSTSGSTSSSSSTSGSGSSSSSSS
TSGSASGSASGSNSSSTSGSTSGSSSSSSSGSSSTSGSSSNSGSGSGSSSTASPFGSLVT
VSADGTLSSNSTGNTYVDGSVNAWIDYNSNLIAASDAFDSAVTAAATTWIDSTSNNINGY
VDSISASEDTYANSVGTAIISYVSGTFQAFSDFVDQRDSAVTTYNSTVTQAETAWVTRSV
AAGKTYISTVNAAWGAYETTVVQAALDAKNLMEQAIYAYQDWYENEPYPHGYSGEDLDGD
GIYEVPGGPDLATAKQHDLAVTIATINMDLQTKYANAKYTYVVAEWDAWLAFYTETTNAD
KEHDIAVRNAEKDYDIAVNTATASLDSRLASLNAAYGKALTDADVDYMIDITAAVSGFVT
TQASNDANLTIANSNAGLAWLQAENNSWGALLNAESTSWYAYRRENSNATPNQIADTYEG
EQYESAISNANITYGNTVNSIQTSFGISLIGTVSGATGGLSGASNTYAQSTANSGRNYSN
GLKDASADLWGAKIAADEGLANAMASANADWDNAFISLWTSFRIGTANVSAALGKQRAAL
DRDAQIKTAQDHLDNVTNNSGDPDYYLDGNQYQNAFDFVGEAYYYANGLYLDFGIPLGSI
VVEVQEWIDNLQGTTSGSGSSSGAGLTSDITSGSGTGSGSTSGETSNSGSGSTSSSGSGS
SSGSSSSSGSGETSSGGTTEMETEPLGFVEAPPPPNPGLQPGGHPTWYHPGNLYRWLYTG
DFNAPDEIYQDALNAGGESYAASAGVAHQALHVTGPLGIVTSTALEEIEGNALHNQVMQD
APPEPVRARGIALPLDPNEVNQLPEEAQEILIEGGADHVNKVIGQQRQQKQLPNANQQAN
NFIQAIRDYLPFTIIVAGFIEAANQDGDDGDSGPDEADADQLEELENKVNEPLDKAPTKL
HAFGRSPKTENHPKDIRLDTDLGLPPDTPLDSDYPLPQPGEWPKGNSAFGNPDTAPLTGH
YWKIDEGTELPSGLVVTPDGSDLGGPPDRFPTHHTIHPDRPMTIQEYIDLYRKIPWDYVK
KK
NT seq
7929 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgttgaaggactggttgtactctttacgtctaaacttccaatttaacccaaagagg
cgggtacgacgcagtctccgtcggcgtaaaaagcttacccatcagcattacgctacagtc
caaagcttagagcaacgccagttactaagcggtaccaatgagccaccagaatttgataat
ggagaaatgggttattggtggagtgtcgcagaagacacagccgtaggatctgtaattgga
acggtctcagcaacagatcctgagagtgactccatcacctatgcactgacatctggtgcc
agcatcttttccatcgatggatctactggcgaaattaccctcattgtaagtctcgattac
gagaccagtgagtacgcatcatttggagttagtgctaccgattcggagggaaatgttgct
aactcatggggtgagattgctgtaacggatgttgctgaatctccggcattcaatgatggt
gaaatggggtactggtggagtttgccagaggacactgccattggctctgtgattggtact
gtttccgcaacagaccctcaaggtagttctgtcacatatgcattatccgcaggagctgaa
accttctccatcgattccactactggagaaatcactttaattgctccactcgattatgaa
accagccaatatgcttcgtttggagtcactgctaccgacactgatggtaactccacatca
agttggggtgaaatcaatgtaactgatgtaaatgaagcacctcaattttcaaacggagag
atgggatactggtggagtttaccagaagacactccagtggggacaatcgtaggaacagtc
tctgccaatgatccacagggggatgctgtcacctatgaactaacctctggaagcgggacc
tttgctgtcgattcatccagcggcgaaattacgctgatcacagccttggattatgaaact
agcgaatacgcatcctttggggtgaaggcaacggatacggacggaaattattccaccagt
tgggcagaagtcagcgtcactgacgtagtggaagctcctattttctctagtggggagatg
ggctattggtggacagtttcagaagcgacgacgattggtacagtgatcgggactgtatct
gccaatgatccgcagggaggatctgtcacttacgaaatcacatcgggcagtgacactttt
gccgttgatgccaactctggtgaaattaccctgatcgccccactggattatgaaacgagt
gaatttgcgtcatttggtgtaaaagctaccgatgctgatggctattttgccacaagctgg
ggagagatctatgtagaggatgctgcagaatcatctgggagtggttcaagctctggtagc
agttcagcatcttctagtggatcaggcagcggttcaggatctgcttccggtggaacttct
tcgggttctggtagtgggacagcatcatccagcggttcttcatcaggaagttcctctgga
tcaggtagcaactcagctccagtgttcagcgaaggcgaaatgggttactggtggactgtg
gccgaagatgctcctgtaggaagcgtaatcggaacggtctctgctacagatgctgatgga
gatgaagtatcatatgcattgacttcgggagctgagtattttgctgtcgacacactttca
ggtgaaattactttaattgccgcactggactacgaaacaagttcattcgtctcgtttggc
atttccgcaattgataccgcaggtaatgtcgctacttcatggggagaagtaactgttacc
gatgtaactgaatcctctggaagcggttctgcttcatcaagtggctccagctcaacatcg
ggcagcacctctggttctgcctctggaagtggttcatcctctggatctggcagttcatct
tcctcgacaagtggttcaacatcagggagttcttcaggttcgagcagtaactcagccccg
acctttagtgcaggagaaactggttattggtggactgtcgccgaagacacttccataggc
agcgtcattggaacggtttcagccaccgatcctgatggtgatggcatcacttatgctctg
acttccgggacgaatactttttcgatcgattccactactggagctgtaacattggttgct
gctctggattatgaaaccagtcaatctgcttcgtttcaagttagtgcaacagattctaac
gggaatattgcttcatcttcggtctacgtacttataaccgacgtaaatgaggtccctgaa
ttcacagacaacagaatgggatattcgtggaatgttgctgaaaatactgccattggatct
gttattggaaccgtatcagcaatcgatcctcaaggcgattccgttacatacgcactaata
tccggtactcaaactttttctattgattccgccactggagatgtgacgctgatcgcagct
ctcgactacgaagtaagtgctgtcgccacattcgaagtgagtgccacagatgttaatgga
aattcctcaacaacttgggggaacatttttgttgaaaacgtatctgagtcatctgggagc
ggatcatcatcgacttctggcagtagctcgtcttccaccagcggatcgtcttcatcaagc
agctcaaccagtgggtcaacatcaggaagcagttcttcaagcggttccggcggaagttca
tcgtcaggtggcagttcctcatcgaccagcgggtcatcttcgggcagcggttcttcatcc
acatcaggtagtagttccagttctggcggctcttcttctggtagcagctcaggatcggga
agttcaacgatgtccggtggttcatcaggcagcggaagtagttcttccagtggttcaggc
tttgttgaagaggaagctccccagttcagcacgaactatcagggagaaggctattactac
tggaaagtgtcggaagatacggcagtgggcactgttatcggaaaagttgaggccaccgat
gctcaggatcaagtcattactttcagtctaacatcaggaacagaaacgttttccattgat
tcttcgactggtgaagtaaccttaatcgctgaactggattatgcaaccgccatgtatctt
gtcttctctgtacaagcaatcgatacggatggaaatatatcaaatgctcaagttgatgtt
gttgtggaacagattcaggatgctccgcagtttggtaaaacaaccaactacctgactgtg
tctgaggatgctgctgtaggtacacagattggcgtcatgcaagcaactgatgctcaaggc
gatgctattacatatacaatcacctacggtggagatacgtttggtatcgatgccacaacc
ggtgttgtcaccttgctggcagcccttgattatgaaaccagcagtttcgatctctttgca
gttcaggcaagcgataccaatgggaacagtacaactatctggactcaggtaactattgat
gatgtcgaaaatgagtcgcataataacagctcaggttcaggtagtggatctggaagcagt
tcttcttcaacgagtggttcaacctctggcagcacgtctggttctggaagcggttcatcc
tcgaccagtggctcatctaccggaagttcgtccacgtctggaagtagttcgtcatccaca
agtggatcttcttcaaccagtggcagcacatctggatcttcatcgacatcaggtagtagc
tccacttctggaagttcttcaagctcatccagcggatcgagttcgaccagcggttctaca
tcgggcagtacgtctggctcgtcttctacttctggcagtggatcatcatcatcgagcagc
tctacttccagttcagcatccagctctgggagcggttcgtcgtcatcgagtggctcctct
tctgctagttcctccacgtctggaagtagctcaacatcgggtagttcttccagttctacg
agtgggtctagttccgtaagtggttccacatcgggtagtacgtctggttcagcctccact
tccggcagcagctcttcctctggaagtagttcttcttcaaccagtggttccacatcgggg
agcacatccagttctgcttcaacatctactagtggatcggcttcaacaagcggttctact
tcgggtagctcctccagctcaacagacggctcaggctctacgagtggatcaacatctgga
agttcatctggttcagcttcgtcaagcggatcttcgtcaggggggagtggttcttcaagc
ggtggcacttccagctcaggaagcggctctggctcttccagtggatcaaattcgggtagt
ggttcgagttctggatcgaatagtggatcaggttcgtctagtggttcaggatcagcaagt
ggttcggcatcgggagaagatccatatgtagatttaattgatgcatttaactcaggggca
gaagctgcgtcaaatgcgtggaaccaagctgccaccactgcgaatagtgaacacgaaaca
cagattgacgctgcggtatctgactacaacacaactttttcaaatttgctaagtgcttac
gaaacagaaattgctgcagctgaaaatgttttcaacaccgcagtagatacaatcatatcc
aatacaagtaatcagatagacgcagataaacagcaggctatttcagatctcgctgcagca
gcaaatgcatacaatgctgccgttgcacaagctaatcttgactatccatccgtggctgcc
tatctgaacaatacgagcggttcaggctcgtcgtctggaagttcatccagttcaacttcg
ggtagcacttccagttcgtcttctacctctggtagtggatcttcatcatcaagtagttct
acttccggaagtgcctctggttccgcttccggtagcaactcatcctcgacgagtggatcc
acatctggaagttcatctagctcttcaagcggttccagctccaccagtggatcgagttct
aatagcggatctggttccggaagtagttcgaccgcttcgccctttggaagtctggtcacg
gtttctgctgatggaacactctcttcaaattcaactggtaacacatacgtagatgggagt
gtcaatgcatggattgattacaattctaatttgattgccgcaagcgatgcattcgattct
gcagtgacggctgcagcaactacttggattgattccacttcaaataatatcaatggttat
gtagattctatcagtgcatcagaagacacttatgcaaattcggttgggacggcaatcatc
agttatgtttctggaacgttccaagcatttagtgactttgttgaccagagagattcggca
gttacaacatacaattcaactgtgacacaagccgaaacggcatgggtcacacggtctgta
gctgctggtaaaacttatatcagcactgtgaatgctgcctggggagcttatgagacgacg
gtagtccaggcagcacttgacgcaaaaaatttaatggaacaggcaatttatgcttatcag
gactggtatgaaaatgaaccgtacccacatggatatagtggggaagacttagatggtgat
ggaatctatgaagttcccggtggaccggaccttgctacagctaaacaacatgatttggca
gttacgatcgcaacgatcaatatggacttacaaactaaatatgcaaatgccaaatatact
tatgttgtcgcagaatgggatgcatggttggcattttatactgaaacaacaaacgccgat
aaagaacacgatatcgcagtccggaatgctgaaaaagactatgacattgcggttaacacc
gcgacggcatcactcgacagcagacttgcatcactgaatgcggcctatggtaaagcatta
actgatgctgatgttgattatatgattgatataacagcagcagtatcaggctttgtcaca
acgcaagcttcgaatgatgcgaatttaacgattgcaaacagtaacgcaggcttagcttgg
ctccaggctgaaaacaatagttggggagcacttttgaatgccgaatcaacatcgtggtat
gcctatcgacgagaaaattccaatgccactccaaatcaaattgccgatacatatgagggc
gaacaatacgaatctgcgatctccaatgctaatatcacatacgggaatacagttaacagt
atccagacaagttttggtatctcactcatcgggacagtatcaggggcgacaggaggactt
tctggagcaagtaacacctacgctcagtctacggcaaattcgggaagaaattattctaat
ggtttgaaagatgcttctgcagatctttggggggcgaagattgcagcagacgagggtctt
gcaaatgcaatggcatccgcaaatgcagactgggataatgcttttatctctctctggacc
agttttaggatcggaacggccaatgtgtctgcggctcttggcaagcaaagggcagctctt
gaccgtgatgcacagatcaaaactgcacaagaccatctcgacaatgtaacgaacaatagc
ggtgatcctgattactatctggatggtaatcagtaccaaaatgctttcgattttgtagga
gaggcatactattatgctaacggtctctatttagatttcggcatcccccttggttctatc
gtagttgaggttcaggaatggattgacaacttgcagggaacaacctctggaagtggatct
tcttcgggggctggtttaacttcggacattacctcagggtcgggtactggctcaggctcc
acaagcggagaaacttcaaacagcggttccggatcgacttcctcttctggttcaggtagt
tcatcaggtagctcttccagttctggaagtggagagacgtcatccggtggtactaccgag
atggaaacagaacccttagggtttgttgaagctcctcctccaccaaatcctggattgcag
ccgggaggacatcccacgtggtatcatccgggcaatttgtacagatggctctatactggt
gatttcaatgctcccgacgaaatctaccaggatgcacttaatgcgggaggggaatcgtat
gcagctagtgctggtgtggctcatcaggctcttcatgtcacagggcctcttggtatcgtg
acatctacagctttagaagagattgaaggtaatgcattacataaccaggtgatgcaagat
gctccccctgaaccggtgagggcgagagggattgccttgccgcttgatccgaacgaggtt
aaccagttacctgaggaagcacaggaaattctgattgaaggaggagctgatcacgtcaat
aaggtaataggccaacaaaggcagcagaaacagttgccaaatgcaaatcagcaggctaat
aactttattcaggcaattagagattatcttccgtttactattatcgttgcaggattcatt
gaagctgctaatcaagatggagacgatggtgacagtggaccggatgaagcggatgctgac
caattagaagagttggaaaacaaagtaaacgagcccttagataaggcaccaacaaagcta
cacgcatttggtagatcgccgaaaacggaaaatcatcccaaggatattaggttagatacg
gaccttggacttccccccgacacacctttagattctgattacccattgcctcagcctggt
gaatggccaaaaggaaattcagcatttggaaaccctgacacagctccgttaaccggtcac
tattggaaaattgacgaaggaactgagcttccgtcaggactcgtggttacgcctgatgga
tccgatttaggtggaccacctgatcggtttccaacacatcatacgatacatccagatcgg
ccaatgacaatccaagaatatatcgatctttaccgaaaaataccgtgggattatgttaag
aaaaagtga
DBGET
integrated database retrieval system