Gimesia benthica: F1728_19335
Help
Entry
F1728_19335 CDS
T06296
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
gim
Gimesia benthica
Brite
Spliceosome [BR:
gim03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U4/U6.U5 tri-snRNP related factors
F1728_19335
Complex C
U4/U6.U5 tri-SnRNP related factors
F1728_19335
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
Helicase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGQ24707
UniProt:
A0A6I6AEC2
LinkDB
All DBs
Position
complement(4995331..4998768)
Genome browser
AA seq
1145 aa
AA seq
DB search
MFDQHAKALFTDFPEFEGLFADESVRTLSQAYLAVLEYRINSSISDLEGLANVQSFLRRL
ANTLIFHVVLDEGREENARQAAAFVAAEAIALMADYLEIASTIDKEISESHIRSSERYAR
LESSLLYLLAGYDACAAGVLRVFRMMDSEDASLVDHAAEYFFKRIEQLCRMSMYPPFSDE
FDYELSSSNALETIGLEEDTLCRLYLQLGQIVTEFSSWLIGTRGQLGNVVASLEEFIGVL
SGESIDNTISLYGNDYSRLYYVGVLIRLVFPALGTRALVHVVPLPLDESGKYQNYLLNRA
LGNEDSISRPVLWPSAFEYVKQSLIGDAQNAVVAMPTGSGKSFVGELAVSQVVHSGWVLY
LAPTNALTEQIRGDLGKGLKELGTEIFAFIGDQEYSVFTADRVNKMPVNSVAVMTPEKCA
LALRLSPEAFNDCRLVVFDECHLLGDTGSTRGPLAELVLTQLMIRSDDVKFLLMSAIIQN
PEELAEWLSEASGLKSQAVTIRWRPTRTLRGVLGVDNHSVQEQSKEAIEWLKGRADRIKK
RAFSSKCALAVNLQGPWQSEESIDYSVCQLECEAPLKVKRIKRLDDWKYFWEGDSWVNQC
AISIARKFTESDIQTLVFTPANKHYPFNNGKKVQFSNSFLSELPSRHSIVEVCRVLAEYE
LGTESQVFWLLDKGVSVHTSLMLETEKIAAESMFRSRSAPLMFATGTLAQGLNLPAIAVV
IAGSRIGDTRGEEVDEVNRRKFSQLLNAAGRAGRAGFANQGVVVAVPDKPVAFNNFESLI
KARAQVDYLQQHDGSVRVESGLAPFLDAVCANALRTDHASELELQVMSLLTGGDENQIEP
DVVLKKTYAAYLRQKNGEPDVNEENIAHLESVANEYVESTGAPEWLPIAAQRAGLDFFLM
HALYQAWNRIRPELPMDFSTWDVQIWKEELLKIISNVPPGFLHNYLKPEKIKHISEEFNQ
CVSHSDINNLDVRDLDWTPSETWEAAWMSAELPLGAWMEGKSIAEIACIITGDTVDEISI
DRTGGKPIPKALSVCQDVWSSLALIAGGLLSIAEQILDGEVPICLASLPLCVKYGCNSPG
ELAWFRFGIRLRRASHLLSSIYPPPDFTSDDELKQWVRSTRAEWLKTEDDKDEVVGAIRN
FITQS
NT seq
3438 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgatcaacatgccaaggctctctttactgattttccagagttcgagggattgttc
gcggatgagtccgtacgcacattatcacaagcgtatttggcagtgcttgagtatcgaatc
aacagttcaatatcagatcttgaggggcttgcaaacgttcaatcttttctccgtcgtctt
gcgaatacactgatttttcatgtggtcttagatgaaggacgagaagagaatgctcggcaa
gcagctgcatttgttgcggctgaggcaatcgccctgatggctgactatctggaaattgca
agtacaatagacaaagaaatatctgagagccatatcagatcctcagaacgctatgccaga
ctcgaatcttctctcctttatctcttagcagggtatgatgcctgcgcagctggggtactt
cgtgtcttcagaatgatggattcagaagatgcatctctggtcgatcatgcagcagaatat
ttttttaagcgaatagaacaactatgtcgcatgagtatgtacccacctttctctgatgaa
tttgattatgaattgtccagctcaaatgccttggaaacaattgggcttgaggaagacaca
ctgtgtcgactctatttgcaattaggacaaatagtgacagagttcagctcttggttaatc
ggtaccaggggacagttgggtaatgttgtagcaagcttagaagagtttattggtgttctg
tcaggagaaagtatcgacaatacaatatctttatacgggaatgattacagtcgtctgtat
tatgtcggtgtattaattcgcttagtctttcctgcgctagggacgagagctttggttcat
gtagtacctcttccattagatgaatccggaaaataccagaattaccttctaaatcgcgct
ttgggaaatgaagactcgatcagccgaccagtcttgtggccatcggcttttgaatatgta
aaacaatctctaatcggtgatgctcaaaacgcagttgtcgcgatgcctacaggcagtgga
aagtcattcgtaggtgaacttgctgtgtcacaagtagttcatagtgggtgggtattgtac
ttagcaccaactaatgccctgacggaacagattcgtggtgaccttggtaaggggcttaaa
gagctggggacagagatatttgcatttattggtgaccaggagtattcggtttttacagct
gacagggttaataagatgcccgttaattcagttgctgtaatgacaccagaaaagtgcgct
cttgctttacgtttatcgcctgaagcatttaacgactgccgtctggtagtatttgatgaa
tgtcatctattaggagatacgggttcgacacgaggccctttggcggagttggttttgacg
caattgatgattcggtctgatgacgttaaatttctgttgatgtcggccatcatccaaaat
ccggaagagcttgccgaatggcttagtgaggcatctggtttgaaaagtcaggctgtaact
attcgttggaggccgacgagaacacttcgtggtgtcttaggcgtcgataatcattctgtt
caagaacagtcaaaggaagcgattgagtggcttaagggacgtgctgatcgaatcaagaaa
agagcgttttcctcaaaatgcgcgttggcagtcaacctccaggggccttggcaatctgag
gaatcaatagactactctgtttgtcaattagaatgcgaagcacctttaaaagtaaagcgt
ataaaacgcttggatgattggaaatacttttgggagggtgacagctgggtgaatcagtgt
gctattagtattgcaaggaaatttactgaatctgatattcagacattggtattcactcca
gccaataagcactatccattcaataatggaaaaaaggttcaattttctaattcatttcta
agtgagctaccatcacgacattcgattgtagaagtctgtcgtgttttggctgagtatgaa
ttagggaccgaatctcaagtattttggctactcgataaaggggtttctgtacatacttct
ctgatgctggaaacagagaaaattgctgcagaatcaatgtttcgatctcgaagtgctccg
ctgatgtttgctacaggaacactggcacaaggcctcaatttacccgcgattgcagtcgtg
attgcgggatcgcgaatcggagatactcgaggagaagaggttgacgaggttaatcgtagg
aaattttcacaattattaaatgcagcaggaagggcaggacgcgctggttttgcaaatcag
ggggtcgtagttgcagttccagacaaaccagtagcctttaataactttgagtcacttata
aaagcaagagcccaggttgattacctacagcagcacgatggttcggtacgtgttgaaagt
ggtttggctccttttttggatgctgtttgtgctaatgcattaaggacagatcatgcaagt
gaactagaattgcaggttatgtctttacttactgggggagatgaaaatcagattgagcca
gatgttgtcttgaagaaaacttatgcagcttacctgcggcagaaaaatggtgaacctgat
gtaaacgaagaaaacatcgcccacctcgaatcagtcgccaatgagtatgttgaatctact
ggcgctccagagtggttaccgatagcagctcaaagagctgggcttgatttttttcttatg
cacgctttatatcaggcttggaatcgtatccgccctgaactacctatggatttctctaca
tgggatgttcaaatatggaaagaggaattacttaagattatctcaaatgtgccaccagga
tttcttcataattatcttaagccagaaaaaattaagcatatttcagaagagtttaatcag
tgtgtaagtcactctgatataaacaatcttgatgttcgtgatcttgattggactccatcg
gaaacatgggaagctgcctggatgtcggcagaattgcctttgggagcttggatggaaggg
aagagtatagcagagattgcatgtattattacaggtgatactgttgatgaaatatcaatt
gatcggacgggagggaaaccgattcctaaagcactttcggtttgtcaggatgtctggtct
tcgctcgcattaatagctggaggtttactctcaatcgcagaacagattctcgatggagaa
gttccaatatgtttggcaagtcttccgctgtgcgtgaaatatggttgcaattcaccaggt
gagctggcatggtttaggtttgggatacgcttaaggcgggcatcccatctattatcaagt
atctatcctccacctgatttcacaagcgacgatgaacttaagcaatgggtgcgtagtact
agagcagagtggctaaaaacagaagatgacaaggatgaagtggttggtgctatccgcaac
tttattacccagtcataa
DBGET
integrated database retrieval system