Grimontia kaedaensis: K6Q96_07585
Help
Entry
K6Q96_07585 CDS
T09175
Name
(GenBank) type I secretion C-terminal target domain-containing protein
Organism
gkd
Grimontia kaedaensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
DUF4114
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USH03840
LinkDB
All DBs
Position
I:1626344..1630957
Genome browser
AA seq
1537 aa
AA seq
DB search
MSDSSFNETDGNDVIIGTGSGDTINGALGDDSINGGQGNDVIYGNGTDRTTGSSTQTSTI
EGGVDSTIYNIQAETALKVTLSDIVSGAGFKNSIGYYIVDDNGMVIQSSVLIDNAKEANS
AALEITAPENAAKLGMFLIPNGDSRGFDIGDVTLDLSNDSPTVTQDNVTVGVYLTEAPLN
NNDQDHEHFDGETSGWEDLWNLGDRDYDDVTFKIEVTQIQVIETTDNDTIRAGKGDDEVY
GNGGDDTIYGGKGEDFLSGGSGNDVINGGRGADEIQGGTGNDELSGGRGNDSIWGGDGDD
VLKGNKGADLLQGGEGDDQLFGGKGADELYGASGDDVLNGNRGADRLFGGDGDDIVNGGR
GNDYVKGDAGDDTLSGGRGSDELKGGMGNDVLRGNQGADVLYGDDGDGATRGPNLVLNGG
FESYGDDDRRMWSLVNDEDVPGWESEGNIKMEFQQGGFGGGPANDVTNTVMELDSTANAT
VFQQFDVSSISAQQDAAMEISFDHANRYRGSNTTTSAFSVSVTDQDGDVLYYQYFDNDQS
NQAYESFSSLLLLPEGTESIKVAFSGEGQSDSYGALIDNISLAQVYETVEIDGETVTFTG
NADTLYGGNGKDELYGESGDDTLHGGKGADLLDGGTGDDVLKGGRGADVLEGGVGEDTLF
GGRGQDTLDGGDGNDVLKGGRGADVLDGGDGDDSLFGGRGQDTLNGGDGNDALHGGRGAD
TLNGGEGEDTLKGGRGADELNGGLGDDTLFGGRGSDILNGGDGVDSLRGGRGDDELNGGK
DDDTLKGGRGSDVLKGDSGEDTLYGGRGADTLYGGSDNDMLYGGLGDDTLRGDSGNDTLH
AGNGNDLVYGGSGDDVANGGAGDDSLYGGTGADILNGDVGADKLYGGDGNDIVNGGDGND
YVKGDDGDDVLNGGEGDDTLLGGIGNDVLNGGLGADTLRGEDGNDTLNGGDGNDELIAGI
GDDVLNGGIGDDLMYGDAGDDNLNGGEGSDILQAGTGDDVLNGGDGNDELYGAEGNDVLN
GGDGNDILKSGIGNDSLSGGDGNDSIWGDDGNDNIQGGDGDDLAYGGEGNDFVKGGLGND
TLYGSNGDDIVWGDNGNDTLYGGSGADVLVGGSGDDTLNGGGDDDIMLGGWGNDTLSGSS
GSDIVYGGGGDNSLELGSGNNTVAYDGKGNDAVIDFSTRDDKVVISRSTNVLSFGALAMA
QVGVDVVITMGSKTLTLEDTLLQNLSEDNFEFVSEEDFSALLNNDGAPTFSQEGIVEQSA
GNFLVAGNLLAEADTSGNWNMKTVEVDGAVYEVPEGTLVVQTERGELTIYGSDDDRHAEG
EYVYQLSSDASLGEEIEHFELKLENDFGDTADMSLDINAGEDVDIPLGNLMEVIEGSELD
DNLNGGDVNNDIYGYAGNDIIDGGLGNDLIAGGAGSDDMYGGEGSDTFIFLQGDAAVGTV
DTIHDYEPELDVLDFADVLGEVSDDDLGSYLVALEENDEGEAVLSIATEGDAVDQQVVFA
STSIEDMVNAFGLDSDASGQDVINSMIEESKLITQSF
NT seq
4614 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccgattctagcttcaatgaaacagatggaaatgacgtaataataggaacaggctct
ggggacacgataaatggtgctctaggtgatgattctattaatggcggccaaggcaacgat
gttatctatggcaacggcacggaccgaacgacaggctcatcgacgcagacctccacgata
gaaggtggggtagatagcacgatctacaacattcaagcagagacggcactgaaggtaacg
ctgtctgatatcgtttctggtgcgggtttcaaaaacagcatcggctactatattgtcgac
gacaatggaatggtcattcagtcctccgttttaatcgataacgctaaagaggctaactca
gctgctctcgagataaccgcgccggagaatgcggccaaactcggtatgtttctcatcccg
aacggcgatagccgtggctttgacatcggtgacgtaacactcgacttatcaaatgacagt
ccgacagtgacacaagacaatgtcactgttggcgtgtatctcacagaagctcctcttaat
aacaacgaccaagaccatgaacactttgatggcgaaacctctggttgggaagacctctgg
aacttaggtgacagagattacgacgatgtcacgtttaaaattgaagttacccaaatacaa
gtcattgagacaaccgacaacgacaccattcgcgccggaaagggtgatgatgaggtctac
ggtaatggaggtgacgacaccatatacggtggcaaaggtgaggacttcttaagcggcggt
agtggtaacgatgttataaacggtggtcgcggtgcagatgaaattcagggcggaacggga
aacgacgagctctctgggggtcgtggtaacgattcaatttggggtggcgacggcgatgat
gtcctgaaaggaaacaaaggcgcagacttgctgcaaggtggcgagggcgacgatcaactc
tttggcggcaaaggcgcagatgagctttatggtgccagtggagatgatgtactaaacgga
aaccgcggcgctgaccgtctgttcggtggcgatggtgacgacatcgttaatggcggtcgt
ggtaatgactatgtgaaaggcgacgccggggacgatacgctctctggtggcagaggcagt
gatgaattaaaaggcggcatgggcaacgatgtgctgcgcggtaatcaaggcgctgatgtg
ctctatggcgatgacggtgatggagcaacacgcgggccaaaccttgtgctcaacggcggg
ttcgaatcttacggtgacgacgataggagaatgtggagcctagtcaacgatgaagacgta
cctggctgggaaagtgaaggcaatattaagatggaattccagcagggtggctttggcggc
ggtcctgccaatgatgtaacaaacactgtgatggaacttgattccaccgcaaacgcgact
gttttccaacaattcgatgtttcatctatttctgcgcaacaagatgcggcgatggaaatc
agtttcgaccatgccaaccgatatcgtggtagtaacaccacaaccagtgctttttcggtc
agtgtgacggaccaagatggtgatgtgctgtattaccaatatttcgataacgaccaatca
aatcaagcctacgaatctttcagcagtctactgctactgcctgaggggacagaaagcatc
aaggttgctttttccggtgaagggcaatctgatagctatggcgcactgatcgacaatatt
tctctggctcaagtctatgaaactgtagagattgacggagagaccgtcacctttacaggc
aatgccgacactctctatggcggtaacggaaaagacgaactctatggcgagtctggagat
gacacgctccacggcggtaaaggtgctgatcttttggatggtggcaccggagatgatgtg
ctcaaaggcggcagaggcgctgacgtccttgaagggggcgttggggaagacaccttgttc
ggcggccgaggacaagacacgcttgacggtggagacggaaacgacgtcctgaaaggtggc
agaggtgctgacgttttagacggcggtgatggtgacgattcactgttcggtggtagagga
caggacactctcaacggtggtgacggaaatgatgctctccatggcggtagaggtgctgac
actctcaatggtggtgaaggagaagacacgctcaaaggcggaagaggggccgatgaactt
aacggcggcctcggtgacgatacactctttggcggccgcgggagtgacattttaaatggc
ggtgatggcgttgattcccttcgcggcggcagaggtgatgacgagctcaacggcggcaag
gacgacgatacacttaaaggcggcagaggaagtgatgtcctgaaaggcgactctggtgaa
gataccttatacggtggcaggggcgcagatacgctctatggcggttctgacaacgacatg
ctctatggcggattaggcgatgatacgctccgtggtgacagtggtaacgatactctgcac
gcagggaacggaaacgaccttgtctacggcggatcgggcgatgatgtggccaacggcgga
gcaggtgatgatagcctctacggcggcaccggtgctgacatactgaatggtgatgtgggt
gctgacaaactatatgggggcgacggcaacgatatcgtcaacggtggtgatggcaacgac
tatgtcaaaggcgacgacggcgatgatgtgctcaatggcggtgaaggtgacgataccctc
ctaggcggtattggtaatgatgtcttgaatggcggtctcggcgctgacactctgagggga
gaggacggtaacgatacgctcaacggtggcgacggtaacgatgaactcattgctggcatc
ggcgacgatgttctgaacggcggtattggcgatgatctcatgtatggcgatgcaggcgat
gacaacctaaacggtggcgagggctcagacatcctgcaagcgggtactggtgacgacgtc
ctcaacggcggtgatggtaatgacgagctttatggcgctgagggcaatgacgtcctcaac
ggcggtgacggcaatgacatcctgaaaagtggtatcggtaacgactctctttcaggtggt
gatggcaatgactccatctggggtgatgatggcaacgacaacatccaaggtggagatggt
gatgacctggcatacggcggtgaaggtaatgacttcgtcaaaggtggcttaggtaatgac
actctatatggcagtaacggtgacgacattgtctggggtgataatggcaatgacaccctc
tacggcggctcaggtgccgatgtgctggttggtggcagcggtgatgataccctgaacggt
ggcggtgatgacgatatcatgctcggcggttggggtaacgacaccctgtctggtagcagc
ggcagcgatatcgtatacggcggcggcggtgataatagtctggagcttggaagcggcaac
aataccgtcgcttacgacggcaaaggtaatgatgctgttatagacttcagcacccgtgat
gacaaagtcgtgatttcgcgctctacgaatgtgctgtcattcggtgcacttgcgatggcg
caagtcggtgtagatgtagttatcactatgggcagcaaaaccctgacgctggaagacaca
ctgctgcaaaacctttcggaagataactttgagtttgtcagtgaagaggatttctcagca
ctacttaataatgacggcgcgccgactttcagccaggaaggcattgttgagcaatcagcg
ggtaacttcttggtggctggaaatctgcttgccgaagcggatacttccggtaattggaac
atgaagactgtcgaggttgatggcgcagtctatgaagttcccgaaggtaccttggttgtt
cagactgaacgcggcgaactcaccatttacggttcagacgatgatcgtcacgctgagggt
gaatacgtttaccaactgtcgtctgatgcttcattgggcgaagagattgaacactttgaa
ctgaagttggaaaatgacttcggcgatacagcagacatgtccttggatatcaatgcaggt
gaagatgttgatatcccgctcggaaacctgatggaagttattgaaggctcagaattggac
gacaaccttaacggtggtgatgtaaacaacgacatctacggatatgccggcaacgatatc
attgatggtggcttaggcaacgatctgatcgcagggggagcaggctcggatgacatgtac
ggcggtgaaggctcagacaccttcatcttcctgcaaggtgatgcggctgtcggaacagta
gatacaatccatgactatgagcctgaactggacgtgctggattttgcagacgtactgggt
gaggttagcgatgacgaccttggcagttatctcgttgcgctggaagagaacgacgaaggc
gaagcggtactttcaattgccacagaaggcgacgcagttgaccagcaagtagtgtttgca
tcaacctcgattgaggacatggttaacgccttcggattggatagtgatgcttccggtcag
gatgtcatcaactccatgatcgaagagagcaagctaattacacagtcgttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
