Glaciimonas sp. PAMC28666: JQN73_17625
Help
Entry
JQN73_17625 CDS
T07066
Name
(GenBank) collagen-like triple helix repeat-containing protein
Organism
glc
Glaciimonas sp. PAMC28666
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen_mid
Collagen
PT-VENN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QRX81929
LinkDB
All DBs
Position
4146169..4148058
Genome browser
AA seq
629 aa
AA seq
DB search
MKTTQKRTLVAVSLLFAGLLSGCAGNGTLGKVGGASSGTAAAGTTGTSGGTTGGGSTGGA
GGATGGSGTDGGTGTSGGTGTAGTNGSNGTNGTNGTSGSNGSNGSNGANGANGATGATGP
TGATGPTGGTGPTGPTGGNVPPGGNSNASTSNLLSNTGSVISSVGTAVNGLSTTLTSQLP
LSSAATNDLNGVVSNGSGILTTLGAGVTTGLGQIGTATDPVGITVGSVGGVIGKVGDTAQ
SAGHLVADLGSGQLAALAPVTTPVGGLVIAVGGVVKEVAGPLTQTLTTGPVEQITLALST
AIVPLTSTVNTVTQTIGNTTGLNQPVNGLLVTVGGALVAAGNQVSGSNTPVSAGLGGVVT
TTGNTVIGLANNSLTNSLQPLLGNQVNGFLGGLGGTAGAGGNPLTSVTGLLGNLTGGLGG
VTGTGTDPLAALTSLVSGATGTLGGLPSAPGVGSLTSVTVLVNSLTSPLSGIAGTPGAGL
LSPLTGLISGLTGTLNGVSGTTSGVGSLASLTGVVSGLTTTISGVAGAPGAGSLAPVTGL
VGTLATTLSGVTSGSAGAGSLTPVTGVITSLTGTLSGVVTPGAGALAPVTSIVSGLTSGV
SGLTGSAGTGPLAPVTGLLNGLLAASPKK
NT seq
1890 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactacgcaaaaaagaacactcgtcgcggtatcactattgttcgccggcttgttg
tcgggatgtgctggcaacggcaccttaggcaaggttggtggagcgagtagtggtactgca
gccgctggaaccaccggcacaagtggtggaactactggaggtggatccacaggtggcgct
ggcggagccactggaggctcaggaacagatggcggcacaggaacatcgggcggcacagga
acagctggcactaatggttctaacggcacgaacggcacgaacggcactagtggttctaat
ggttctaacggttcgaatggtgcgaatggcgcaaacggcgccactggtgccaccggccca
accggcgctaccggtccaaccgggggcaccggcccaactggcccaaccgggggcaatgtc
cctccgggcggcaatagcaatgcctctacttcaaatctcctttcgaacacaggctcagtc
atatccagcgtaggaactgcagtgaatgggctgagtacaacattgactagccaattgccc
ttgtcctctgctgcaaccaacgatttgaatggtgttgtcagcaacggtagcggaatcttg
acaacgctcggcgctggcgtaaccactggccttggacaaattgggactgcaactgacccg
gtcggtatcaccgtcggaagtgtcggtggggtgattggcaaggttggcgatacggctcaa
agcgcgggccatttggtcgctgatttgggtagcggtcagcttgcggctctggctccggtc
acgacgccggttgggggcttggtaatcgcggtcgggggtgtcgtcaaagaagtcgcagga
cccttgacccaaacattgactaccgggccggttgaacagatcacgttggcattaagcact
gctatcgttcctttgaccagtacggttaacacagtgacacaaacgatcggcaacaccaca
ggccttaaccaacctgttaatggcctgcttgttacggttggtggcgctttagtcgcggct
ggcaatcaggtgagcggttcgaatacgccagtatccgcaggtttgggtggcgttgttacg
actaccggtaacacggtgatcggcctggctaataacagcttgaccaatagtttacaaccg
ttattaggcaaccaggtcaatggctttttgggtggactgggcggcacggcaggcgcaggt
ggtaatcctttgacctcggtaaccggcctgcttggtaacctgaccggcgggttgggtggc
gttaccgggacaggtaccgatccattagcagcgctgactagcttggtcagcggcgccacg
ggtactttaggcggcttgccaagcgcgcctggtgttggatcgctgacttctgtgacggta
ttggttaatagcctgactagcccgctgagtggcatagccggtacgccaggcgccggttta
ttgtcgccactgaccggactgatcagcggtttgaccggtacattaaacggcgtgtccggt
actacgtcgggcgtcggttcattagcctcattgacaggcgtggtaagcggtttaacaacc
acaataagcggtgttgcaggtgccccaggcgctggctcattggcgcctgtaaccggattg
gttggcacccttgccaccacattaagcggtgttaccagtggttctgccggcgctggctct
ctgacgccagtgacgggcgttattacgagtctgactggtacgttaagcggtgtagtgact
cctggtgccggagcattggcaccggtaacaagcatcgtgagtggcttgactagcggagtt
agcggcttaactggctctgctggcaccggcccattggcccctgtaacagggctgctcaac
ggattgctcgccgcctcgcctaaaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
