Gadus morhua (Atlantic cod): 115546521
Help
Entry
115546521 CDS
T10832
Name
(RefSeq) fibroin heavy chain-like isoform X1
Organism
gmh Gadus morhua (Atlantic cod)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
115546521
NCBI-ProteinID:
XP_030215897
Ensembl:
ENSGMOG00000029071
LinkDB
All DBs
Position
7:15074741..15103613
Genome browser
AA seq
2945 aa
AA seq
DB search
MARGTVTSYLCGVALLALWKPSLQGGVYVPAGGGVGPGQGYGPGGGGAGPGPGGFGPGAG
GGGSAGPGPGGADPGHGGFGPGGDGGLGGGTLGGGAGRGQGPAGVQPGQGAGRYSPGGGQ
GGPVGGYGPGSGGQYPGMGGTGPNAGGTGTALGGTGVGPGGAGSFGPGGVGPGGAGSFGP
GGVGPGGAGGFGPGGVGPGGAGGVGPGGAGGFGPGGVGPGGVGPGGVGPGGVGPGGVGPG
GAGGIVHVMPQTGLTGAGPGGKSGGKASKQVPGVGLPGLYQGGIVPGLGYGGRGVLPGVA
TGSGLAPQTGQGVLGQGGAGLGAGAGRGGFSSQQISGVFRGYPLITPKSGSGKSKKAAKL
AAKYGAGGALGQGGLGGGGGGGGAGGLPGGGAGSIPGFGGGAGTGAGGVPGLGGGVAAGG
TGGGTRPGAGVGPGGTGTGYGPGGGAGTGSAGTGTGLGPGSGGAGYGPGRGAGVGPGGAG
SVPGGAGFGPGGAGSVPGGAGFGPGGAGSVPGGAGFGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPG
GAGYGPGGAGSVPGGAGFGPGGAGSVPGGTGYGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGYGPGGAGY
GPGGGAGTRAGGYDANAKARKYGMLSGGLGGGLGAGTGGAGPGGAGYGPAGGGTGGGTRP
GAGVGPGGTGTGYGPGGGAGTGSAGTGTGLGPGSGGAGYGPGRGAGVGPGGAGSVPGGAG
VGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPGGAGFGPGGAGSVPGGAGFGPAGAGSVPGGAGYGPG
GAGVGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGYGPGGGAGTRTGGYDANAKARKYGMLSGGLGGGLGA
GTGGAGPGGAGYGPAGGGTGAGTRPVAGVGPGGTGTGYGPGGGAGTGSAGTGTGLGPGSG
GAGYGPGRGAGVGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPGGAGYGPGGAG
SVSGGAGYGPGGAGSVSGGAGYGPGGAGFGPGGVGSQSGGAGTAAGGYDANAKARKYGML
SGGLGGGLGAGTGGAGPGGAGYGPAGGGTGGGTRPGAGVGPGGTGTGYGPGGGAGTGSAG
TGTGLGPGSGGAGYGPGRGAGVGPGGAGSVPGGAGFGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPG
GAGFGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPGGAGFGPGGAGSVPGGAGFGPGGAGSVPGGAGV
GPGGAGSVPGGAGFGPGGAGYGPGGAGFGPGGAGYGPGGAGYGPGGVGSQSGGAGTAAGG
YDANAKARKYGMLSGALGGGQAAGTGGAGLGGAGYGPAGGGTGGGTRPGAGVGPGGTGTG
YGPGGGTGTGSAGTGTGLGPGSGGAGYGPGRGAGVGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPGG
AGYGPGGAGSVPGGTGYGPGGAGSVPGGAGFGPGGVGSVPGGAGSVPGGAGYGPGGAGYG
PGGAGYGPGGGAGTRTGGYDANAKARKYGMLSGALGGGLGAGTGGTGTGYGPGGGTGTGS
AGTGTGLGPGSGGAGYGPGRGAGVGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSV
PGGAGYGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPGGAGYGPGGAGSVPGGTGYGPGGAGYGPGGA
GSVPGGAGYGPGGASTGYGPGAGFGPGAGYGPGAGYGPGAGYGPGAGYGPGAGYGPWAGY
GTQAGVGPGYGPGSGVAQGYRPGSGYGGVVGGAVRPGSGLGPGFGPGSKASKYGQGVAGT
GGVLGGGAGRRGYGQGVGSKSAKYGQQGGLGVGAGTGATGTGLGTGTGTGVTGTGLGTGT
GTGVTGTGLGTGTGIGATGTGLGTGTGTGATGTGLGTGTGLGTGTGLGTGATGTGLGTGT
GLGTGATGTGLGTGTRTAGPGIGTGSGIATDTGATGSGTGSTGIGPGVSGTGPGTGSHIG
TGGGLGAVGLTPTPGTEGGASSSAGGGGTGAGQDGIEGKEPGDSLDLDVLEGSGVSGDGT
GLTGLGLGSDGDGLTATGIPILGAKPAGAGGNATGGTQPKAKPVKPPVILRGDTPGEGNG
EGGEDGEFLATPATSTGGALGGQGGDLVGGPTGGSAGPAKPTQVYGADGATVGGVGGTGV
LATGAGGVGGTGAGGVGATGVGATGSGGVGATGVGATGVGAAGAGGVGATGVGATGAGGV
GATGVGATGVGATGVGATGAGGVGATGTGVIGGTGVGGVGGTGVGGGAGTSKPGKSYGTG
GGARYPTGAGQGQGTGKRGKGYGNLGAGGVRPGGYGTGPGGYGAGPGGYGTGPGGYGAGP
GGYGTGPGGYGTGPGGYGTGPGYGTGPGGYGTGPGGYGTGPGGYGTGPGGYGTGSSGRVP
EGAGSLGIGGAGTGPGGYGTGPGLGGSGYATPGGGAASGSRKPSKSYGAAAAGSRPVGAG
FGSGVAGIGPGGAGFGPGGVGTRPGGAGTGPGSVGSAAGGFGTGGYGPGSTGQGGYGQGA
AGVGPQGAATGGFGPGGVGAGPGGFGPGGIGMGPGGYPVGGQGYGKRKPFKSNKYGSGNL
GPGGAGQGGAAFGQGGVGTDGAGFGPGGAGAGTGGAGFGPGSAGTGPGGFGPGGAGTGPG
GFGPGGAGTGPGRFGPGGAGAGTGGAGFGQGGAGTGPGRFGPGAGGAGTGGAGQGGAGFG
PGGAGQGGAGPRPGGFGPGGAGQGGAGFGPGGAGAGTGGFGPGGAGAGGGAGTGTGGAGP
GGAGQGGAGGASFGPGSTQGLGPRKPSKSGYGSSSLGGTGYGPGGAGANAGGVGHGPGGV
GPGGYQPAGTGTGGYGPGGAGQGRYGPAGGAGGFGPGGQGLGTRKAPKSGYGSSSGGTGF
GPAGGAIGGVPSAGTAGGVGGGAGGNLGFFGGAGYRPGGGAGGVGGAGGAGQAAGGVGGG
QGVVPGGVGPGSGGVNRGNYPGYALAGQKTKQQKAAKYAAMQAFLGSGGYRGAGCQGKYC
GRRRK
NT seq
8838 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgagaggcacggtgacctcgtacctttgtggagttgcgctgctcgccctttggaag
ccttcgctgcaaggaggtgtatacgtacctgcaggtggcggcgtaggacctggacaaggc
tatggaccgggtggagggggcgctggtccaggaccgggaggctttggacctggagcagga
ggaggaggatcagcgggaccgggaccaggtggagccgaccctggccatggaggcttcgga
cccggaggcgacgggggcctgggtggagggacgttaggaggaggagctggcagaggtcag
ggccctgctggggttcagccagggcaaggagctggaagatactctcctggtggtggtcaa
ggaggacctgttgggggttatggaccaggcagcggaggtcagtacccagggatgggtgga
acaggccccaatgcaggaggcactggaacagcacttggtggaactggtgttggaccagga
ggtgcaggaagttttggaccaggaggggttggaccaggaggtgcaggaagctttggacca
ggaggggttggaccaggaggtgcaggaggttttggaccaggaggggttggaccaggaggt
gcaggaggtgttggaccaggaggtgcaggaggttttggaccaggaggtgttggaccagga
ggagttggaccaggtggagttggtccaggaggagttggaccaggaggtgtaggacctggc
ggagctggaggaatcgtccatgtgatgccgcagacaggtctaactggggctggacccgga
gggaagagtggtggtaaagcatccaaacaagtaccaggtgtaggcttgcccggactttat
caaggtggaatagtccccggtctaggttacggaggccgtggtgttctccctggagtggcc
acaggatccggacttgcacctcagaccgggcaaggagtgctgggccaggggggcgctgga
ctgggggccggagcgggtcgtggagggttcagcagccagcagatctccggagtgttccgg
ggttatcctcttatcacccccaaatcaggatcgggtaaatcaaagaaagcagcgaagttg
gcagctaaatatggggcaggaggtgcacttggacaaggaggtcttggtggaggtggtggt
ggaggtggtgctgggggacttcctggaggaggagctggtagcatacctgggtttggaggt
ggggctggaacaggagctggtggtgtacctggacttggaggtggagttgctgctggtggg
accggtggtgggaccagacctggagccggggttggaccaggtggaaccggaacaggatat
ggacccgggggtggagccggaactggttctgctggcactggaactggccttggaccagga
agtggaggggcaggctatggacctggtcgaggggctggagtgggaccaggtggggccgga
tcagttcctggtggggctgggtttggaccaggtggggccggatcagttcctggtggggct
gggtttggaccaggtggggccggatcagttcctggtggggctgggtttggaccaggtggg
gctggatcagttcctggtggggctgggtatggaccaggtggggccggatcagttcctggt
ggggctgggtatggaccaggtggggctggatcagttccgggtggggctgggtttggacca
ggtggggctgggtcagttccaggtgggactggttatggaccaggtggggccggatcagtt
cctggtggggctgggtatggaccaggtggagccgggtatggaccaggtggagctggatat
ggaccaggtggaggagcaggtacaagagctggagggtatgatgccaacgccaaagcccgt
aaatatggtatgttaagtggaggactaggaggaggactaggagcaggaacaggtggagct
ggacctggtggtgctgggtatggaccagctgggggtggcaccggtggtgggaccagacct
ggagccggggttggacctggtggaaccggaacaggatatggacctgggggtggagccgga
actggttctgctggcactggaactggccttggaccaggaagtggaggggcaggctatgga
cctggtcgaggggctggagttggaccaggtggggccggatcagttccaggtggggctgga
gttggaccaggtggggccggatcagttcctggtggcgctgggtatggaccaggtggggcc
ggatcagttcctggtggggctgggtttggaccaggtggggccggatcagttcctggtggg
gctgggtttggaccagctggggctggatcagttcctggtggggctgggtatggaccaggt
ggggctggagttggaccaggtggggctggatcagttcctggtggggctggatatggacca
ggtggggctgggtatggaccaggaggaggtgcaggtacaagaactggagggtatgatgcc
aatgccaaagcccgtaaatatggtatgttaagtggaggactaggaggaggactaggagca
ggaacaggtggagctggacctggtggtgctgggtatggaccagctgggggtggcaccggt
gctgggaccagacctgtagccggggttggacctggtggaaccggaacaggatatggacct
gggggtggagccggaactggttctgctggcactggaactggccttggaccaggaagtgga
ggggcaggctatggacctggtcgaggggctggagttggaccaggtggggccggatcagtt
cctggtggcgctgggtatggaccaggtggggctggatcagttcctggtggggctgggtat
ggaccaggtggggctggatcagttcctggtggggctgggtatggaccaggtggggctgga
tcagtttctggtggcgctgggtatggaccaggtggggctggatcagtttctggtggggct
gggtatggaccaggtggagccgggtttggaccaggtggagtgggatctcaaagtggagga
gcagggacagcagccggagggtatgatgccaatgccaaagcccgtaaatatggtatgtta
agtggaggactaggaggaggactaggagcaggaacaggtggagctggacctggtggtgct
gggtatggaccagctgggggtggcaccggtggtgggaccagacctggagccggggttgga
cctggtggaaccggaacaggatatggacctgggggtggagccggaactggttctgctggc
actggaactggccttggaccaggaagtggaggggcaggctatggacctggtcgaggggct
ggagttggaccaggtggggccggatcagttcctggtggggctgggtttggaccaggtggg
gccggatcagttcctggtggggctgggtatggaccaggtggggccggatcagttcctggt
ggggctgggtttggaccaggtggggccggatcagttcctggtggggctgggtatggacca
ggtggggctggatcagttcctggtggggctgggtttggaccaggtggggccggatcagtt
cctggtggggctgggtttggaccaggtggagccggatcagttcctggtggggctggagtt
ggaccaggtggagccggatcagttcctggtggggctgggtttggaccaggtggggccggc
tatggaccaggtggagcagggtttggaccaggtggagctgggtatggaccaggtggagcc
gggtacggaccaggtggagtgggatctcaaagtggaggagcagggacagcagctggaggg
tatgatgccaatgccaaagcacgcaaatatggtatgttaagtggagctcttggaggagga
caagcggcaggaacaggtggagctggacttggtggtgctgggtatggaccagctgggggt
ggcaccggtggtgggaccagacctggagccggggttggacctggtggaaccggaacagga
tatggacccgggggtggaacaggaactggttctgctggcactggaactggccttggacca
ggaagtggaggggcaggctatggacctggtcgaggggctggagttggaccaggtggggcc
ggatcagttcctggtggggctgggtatggaccaggtggggccggatcagttcctggtggg
gctgggtatggaccaggtggggccggatcagttcctggtgggactgggtatggaccaggt
ggagccggatcagttcctggtggggctgggtttggaccaggtggggttggatcagttcca
ggtggggccggatcagttcctggtggggctgggtatggaccaggtggggctgggtatgga
ccaggtggagctggatatggaccaggaggaggagcaggtacaagaactggagggtatgat
gccaatgccaaagcccgtaaatatggcatgttaagtggagcccttggaggcggtcttgga
gcaggaacaggtggaaccggaacaggatatggacccgggggtggaacaggaactggttct
gctggcactggaactggccttggaccaggaagtggaggggcaggctatggacctggtcga
ggggctggagttggaccaggtggggccggatcagttcctggtggggctgggtatggacca
ggtggggccggatcagttcctggtggggctgggtatggaccaggtggagccggatcagtt
ccaggtggggctgggtatggaccaggtggggccggatcagttcctggtggggctgggtat
ggaccaggtggggctggatcagttcctggtggggctgggtatggaccaggtggagccgga
tcagttcctggtgggactgggtatggaccaggtggggctgggtatggaccaggtggagcc
ggatcagttccgggtggggctggctatggaccaggtggagctagtactggatatggacct
ggggccggcttcggacctggggccggctatggacctggggccggctatggacctggggcc
ggctatggacctggggccggctatggacctggggccggctatggaccttgggccggctat
ggaacccaggctggagtgggacctggttatggccctggcagtggagttgcacaaggatac
cgcccagggtctggttatggtggtgtggtaggaggagcagtaaggccagggtctggactt
ggacctggttttggacctggatcaaaagcttccaaatatggccagggtgtagcgggcacc
ggaggcgtgcttgggggcggtgctggtcgccgcggctatggtcaaggtgtcggatctaaa
agtgcgaaatacggacaacaaggtggattaggtgtaggggctggaactggagcaactggt
actggcctcggtactggtactggtactggagtaactggtactggcctcggtactggtact
ggtactggagtaactggtactggcctcggtactggtactggtattggagccactggtact
ggtcttggcactggtactggtactggagccactggtactggtctaggtactggtactggt
cttggtactggtactggccttggtactggagcaactggtactggtcttggtactggtact
ggccttggtactggagcaactggtactggtcttggtactggtacaaggactgctggacct
ggtatcggaactggttctggtatcgctactgatacaggagcaactggttctggtacggga
tcgactggcattggtccaggagtgtcgggtactggtccgggtacaggatcacacataggg
acaggaggaggactaggtgctgtaggactcacccccacccctggcacagaaggtggtgcc
tcaagctcagcaggaggaggaggtacgggcgctggacaggacggcatagagggtaaggag
ccaggagacagccttgatcttgatgttttagagggctctggagtctccggagatggcact
ggtctcactgggctgggattaggttctgatggagatggcctgacagcaacaggaatcccc
atccttggcgcaaaaccagcaggtgctggtggaaatgccacgggaggaactcagcctaaa
gccaaaccagttaaacccccagtcatcctcagaggagacacgccaggcgaggggaatggg
gaagggggagaagacggtgaatttcttgccactccagctacgtctaccggaggggcactg
ggaggacaaggaggagatctggtgggaggtcccacaggagggtcagcaggaccagcaaaa
cccacccaagtgtatggtgctgacggagctactgttggtggtgtcgggggcactggtgtt
ctagccactggtgctgggggtgttggaggcactggtgctgggggtgttggagccactggt
gtaggagccactgggtctgggggtgttggagccactggtgtaggagccactggtgtagga
gccgctggtgctgggggtgttggagccactggtgtaggagccactggtgctgggggtgtt
ggagccactggtgtaggagccactggtgtaggagccactggtgtaggagccactggtgct
gggggtgttggagccactggtactggggttatcggaggcactggtgttggtggagtcgga
ggcactggtgtgggtggaggtgcaggaacctctaaaccaggaaaaagctatggaacaggt
ggaggtgcacgttatcccactggagctggacagggacagggaacaggaaagagaggaaaa
ggatatgggaaccttggagcaggtggagtccggcctggagggtacgggactggccctggg
gggtacggggccggccctggagggtacgggactggccctggggggtacggggccggccct
ggagggtacgggactggccctggggggtacggcaccggccctggggggtacggcaccggc
cctgggtatggcaccggccctggggggtacgggaccggccctggggggtacggcactggc
cctgggggatacggcaccggccctggagggtacggaaccgggtcaagtggcagagtacct
gaaggagcgggcagccttgggattggtggagcagggactggaccaggaggttacggtact
ggaccaggtcttggaggctccgggtatgccactccaggtgggggagcagcttctggctcc
aggaaaccttccaaaagttatggggcagccgctgctggatccagaccagtcggtgctggc
tttggttctggggttgctggtattggacctggtggtgctggatttggacccggtggtgtc
ggaaccagaccaggcggtgctgggactggacccggtagtgttgggtctgcagcaggaggt
tttggaacaggtggctatgggcctggatccactggacaaggtggatacgggcagggggct
gctggtgtcggaccccaaggtgcggcaacaggcggttttggccctggcggagtgggagcc
ggaccaggcggctttggtcctggtgggataggcatggggcctggaggctaccctgtcggt
ggtcaaggatacgggaaacggaagccattcaaatcaaacaaatatgggtctggtaattta
ggacctggtggtgctggacaaggaggtgctgcctttgggcaaggaggtgttggaacagat
ggtgctggctttggacctggcggtgctggtgccgggacaggtggtgctggctttggacct
ggtagtgcaggaaccggtccaggcggctttggacctggtggtgcaggaaccggaccaggc
ggctttggacctggtggtgcaggaaccggaccaggccgctttggacctggtggtgctggt
gccggtacaggtggtgctggctttggacaaggaggtgcgggaaccggacccggcagattt
ggacctggtgctggtggtgctggtacaggtggcgctggacaaggaggtgctggcttcgga
cctggcggtgctggacaaggaggtgctggacccagaccaggcggctttggtcctggcggt
gctggccaaggaggtgctggcttcggaccgggtggtgctggtgctgggactggtggcttc
ggaccgggtggtgctggtgccggaggtggtgctggtaccgggacaggaggtgctggacca
ggtggtgctggacaaggaggtgctgggggggctagttttggacccgggagcactcaaggt
ctcggaccaagaaaaccatctaaatcaggttacggatcctcatctctgggtggaaccggc
tatgggccaggtggggcaggtgctaacgctgggggagtcggtcatggtcccggaggagtc
ggaccaggtgggtaccaacctgcaggaactggcacgggaggttacgggcccggaggtgct
ggacaaggcagatatggaccagcaggtggggctggtggatttggccctggtggacaggga
ctaggaacaagaaaagctcctaaatcgggttacggttcctcatccggtggaacaggcttt
ggaccagcaggtggtgccattggaggtgttcccagtgcaggaacagcaggtggagtggga
ggaggtgcaggaggtaatcttggattttttggtggagctggctacagaccaggtggtgga
gcaggaggagtaggtggagcaggaggtgctggccaggcagcaggaggagtaggtggaggc
caaggcgtagtaccgggtggcgttggtcctggaagtgggggtgtgaatcgtgggaattat
ccaggatatgccttggctggacaaaagaccaaacaacagaaggcagccaagtatgcagcc
atgcaggccttcctgggctctgggggctacagaggagctggatgccagggtaaatactgt
ggccggaggaggaagtga
DBGET
integrated database retrieval system
