Gemmata massiliana: SOIL9_40540
Help
Entry
SOIL9_40540 CDS
T06634
Name
(GenBank) polysaccharide-degrading enzyme : Sheath polysaccharide-degrading enzyme OS=Paenibacillus koleovorans GN=dssA PE=4 SV=1: fn3: FG-GAP: VCBS
Organism
gms
Gemmata massiliana
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP
FG-GAP_3
fn3
Beta_helix
DUF5123
Beta-prop_BBS7
NosD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VTR93660
UniProt:
A0A6P2D2N8
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(3438090..3442178)
Genome browser
AA seq
1362 aa
AA seq
DB search
MAAQLLRVFGAWLRELAPAQHPNSRLLLGKPTITQVRIFMRRNSSIGPRLESLESRDLLN
AVNLTSLALSQSEVNLTWDLTGTADTAVVVERSVGSTGAFQTLTVLPSNENTFTDTSGWA
GTAYNYRVRTLTATGPTPYSAVSVAATKSVASGALVRVTNLLAQATSPTTATISFTDPNP
GDALRGYMLERSADGVSYQIIKSLGTSTTWVDTGLAPGGAYSYRVRGYSWNAPTSDYSAP
AAVALPSRAAGIPHEPTALQAVANAATSVTISWTNNDTASTRFRVERAVYNPWKTMAWTQ
IGLTTPGATSFTDTGTAAESAYVYRVRATNGAGDSGYAVPSSDVMYSLFGTGFGVVTPSA
GTGVPRVYDIGPGQKYQNIADLDWSKLGPGDTVNIHYKPGGYHELFQISTRGTATARITI
NGIPDPVTGALPVIDGYQAVLAPQFVNSYAALSGSGAVVIGVRPNYAVGYKPGYITIQNL
QVQNAYQGNSNNTFTDYNGLKKAYGLVGAGIYLERAENVTIKGCTINGNGQGVFGAGQSG
FDRLLMGVTLDGNYIYGNGNIGSDRQHNTYIEGIDTLYQNNRYGSLRSGALGAGLKDRSV
GLIIRNNYIEGGAHQLQLPEAENQSDLAVTLESYHQVFVYGNTLVAPSGSASSIVFYGGD
GGQDVKYRKGILSLYNNTMITRSDASQVYKITGVKLATSGETVDARNNIFAAVPNTAGAR
SPVFNLVADNNNAYFGQNWVPSNYAISFGAFTGHAGGTKNLIIGSSVEPGFVSPTNGDYH
LKATSAAIDASGQIAGTLSAHPVDREYLDPRTSRPRLVAGRALDLGAFEYTGGGSGGAVV
ESAVVVAKFGMSAPSITAAGSSFTITVTAIANSGAIATGYRGTVRFTSSDVLAGLPSDYT
FTAADAGVHTFTITLRTSGTRSINLADKATSSVVGSATLTVNAATVSVIQLSAPTVAASG
SSFSVTATAKDAYGNIATGYRGTVRFTSSDVLAGLPSDYTFTAADAGVHTFTITLRTSGT
RSINLADKATSSVVGSATLTVNATGQPYAVGTDAGPVTTVALFNSDGSVRFRVRPFGDSY
TGGASVATGDVTGDGIPDVVVGSKGGMFSQAVIIDGATGKVRSEQLLGANYYYGQVSVAV
GDVTGDGIADIALGTDEGGARVRVYRGGNYAKLTEFLAGPVIGYWGQTRLALGDLNADGK
ADLAVAGLYTTGTAVFGFDGSSLRVGGTPIAMFNSFSPGSVVTGKGVSLAIGDMNSDGYG
DLILGAGEWGNGRVVAYSGKSLVQSNAQVLLAQFLPPNVDFVTGVRVAARDLNGDGKSDV
LAASWDSLIAFAGGGLPTIGASPSVIRVSDPFSDSKGKMWVG
NT seq
4089 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgcccaactcttaagggtgttcggcgcgtggctgcgggaactcgcacccgcacaa
catcctaactcgcgcctcctgttggggaagccgacaataacccaggtacgcatttttatg
agacggaattcgtcgattggcccgcggctcgaatcgctggaatcccgagatttgcttaac
gctgtaaacctcacaagtttggctctgtctcaatctgaggtcaatctgacttgggatctc
acgggcactgctgacacggcagtggtggtcgagcgttctgtgggctcaacgggcgcattc
caaactttaactgttctcccgtctaacgagaacacatttaccgacaccagcggctgggcc
ggaacggcctacaattatcgtgtgcgcactcttaccgcaaccggtccgacgccctacagc
gcggtatcagtagcggctaccaaatcggtcgcctctggtgcgctcgttcgcgtcacaaat
ctgcttgcccaggctacttctccgactaccgcaacgatctcgtttacggatccaaacccc
ggcgacgccctacgcggatacatgctcgagaggtcggctgatggtgtctcgtatcagatt
attaaatcgcttggcacttcgacgacgtgggtggatacagggctcgcgccggggggggca
tattcttaccgggttcgcggttattcttggaatgcgccgacttccgactattcggccccc
gcagcggtcgcccttccttcccgtgcggccggaatcccacacgagccgactgcccttcag
gctgtcgcgaatgcggcaacctccgttacgatttcttggacaaacaatgacacagcgagt
acccgatttagggttgagcgcgcagtatacaacccgtggaagacgatggcgtggactcaa
attggcctgaccacgccgggggctacgtcgtttactgacaccggaacggctgctgaaagc
gcatatgtgtacagagtcagagcaacgaatggcgctggtgattcgggttacgccgtacca
tcaagcgatgtaatgtactcgcttttcgggacgggatttggtgtggttaccccgagtgcg
gggaccggtgtgccccgcgtgtacgatatcgggccgggccagaaatatcagaatatcgcc
gatctggattggagcaagctcgggccaggtgatacggtcaacattcactataagccgggc
ggctaccacgaactgtttcagatctcaacgcgagggacggcgaccgcaaggatcactatt
aacggaattcccgatccggttaccggtgccttgcctgtaatcgacggataccaagccgtt
cttgcgccacaatttgtcaacagttacgccgcgctcagtggttccggagccgtagttatt
ggcgtccgaccgaattacgcggttggctacaagccgggctatattacaatacagaatctt
caggtgcaaaacgcatatcagggaaattcgaataatacatttaccgattacaatggtctg
aaaaaggcatatgggttagtcggcgccggtatttatctagagcgtgccgagaatgtcaca
attaagggctgcacgattaatggcaatgggcaaggggtgttcggcgctggacaatccggg
tttgatcgcctgctgatgggcgtcactctcgacggaaattacatctacgggaacgggaac
ataggtagcgatcgccagcataatacttatatcgaaggaattgatacactgtatcagaat
aatcgttatggctcactcaggtcgggcgccctcggtgcaggtctgaaagatcgttcggtc
ggacttatcattaggaataattacattgagggcggcgcgcaccagcttcaactcccggag
gctgagaatcaatctgacttggccgtcacccttgaaagctatcatcaagtgtttgtatac
ggtaacactcttgttgctccatccggcagcgcttcgtcgattgtgttttatggcggagat
ggtgggcaagatgtgaaatatcgcaagggcatcctctcgctctataataatacgatgatt
accagatcggatgccagccaggtatacaagataactggtgtcaagctggctacgagtggc
gaaacagtagacgcgaggaataatatttttgctgcggtccctaatactgctggtgctaga
tcgccagtattcaatttggtagctgataataataatgcatactttgggcaaaattgggtg
ccttcaaattatgcgatctcattcggagcctttactggacatgctggtggaaccaaaaat
ctgattattggatcgtctgtcgagcccggctttgtgtctccgacaaatggggattaccac
ctcaaggcgacttcagctgcaattgacgcatcgggccaaatagcggggacgctctcagcc
cacccagtcgatcgcgagtacctcgatcctcggacgagtcgtcccagattagttgctgga
agggctttggatctaggtgcctttgagtacactggtggcgggtcgggaggcgcggttgtt
gagagtgcagtagtagttgcaaagttcggaatgtcggctccgtcaataacagctgcgggc
tcatcattcacaatcacagtgaccgctattgccaactctggggccattgcaaccgggtac
cgtggtacggttcggttcacgagtagtgacgtgttggcagggctcccgtctgattacacg
ttcaccgctgctgatgccggagtccacacgtttactatcacgctccggacctcgggtact
cgctcgattaacttggccgataaagccacgtcctcggtggttggtagtgccacactcacg
gtcaacgcggcgacggtgagtgtaatccaattgtcggctccgacggttgcggcctcagga
tcatcgtttagcgtcactgcaactgcaaaagacgcatacggtaacattgcaaccgggtac
cgtggtacggttcggttcacgagtagtgacgtgttggcagggctcccgtctgattacacg
ttcaccgctgctgatgccggagtccacacgtttactatcacgctccggacctcgggtact
cgctcgattaacttggccgataaagccacgtcctcggtggttggtagtgccacactcacg
gtcaacgcgactgggcagccgtatgcagtgggaaccgatgcggggcctgtaacgacagtt
gcactctttaattcggacggctcggttcgcttccgagttcgcccctttggtgatagctat
acaggtggggcgagcgtagccactggtgatgtgactggtgacggtatccccgatgtggtc
gtcgggtcgaaggggggtatgttttcgcaggcagttattattgatggggcaactggaaaa
gtgcgttcggagcagctactcggagcgaactattactacggtcaggtgtcggttgccgtt
ggagatgtaacaggagacggcatcgctgacattgcgctaggtactgacgaaggcggggcg
cgtgtgcgggtgtatcgcggcgggaattatgcaaaattgactgagtttctggctggtcct
gtgattgggtactgggggcaaacgcgattggctcttggcgatctcaatgctgacggaaaa
gccgatcttgcagttgctggtttatatacgactggtacagctgtatttggtttcgatggt
tcttcgctgcgagtcggcggtactccgattgcaatgtttaactctttttctcccggttcg
gttgtgactggtaagggtgtatctcttgcgattggagatatgaattctgacggatatggc
gatctgattctgggcgcaggcgagtggggtaacggtagagtggtcgcgtattctggtaaa
tcgcttgttcaatctaatgcccaagttctccttgcccagttcctgccgccaaacgtcgat
tttgtgaccggagttcgcgtggccgcgcgggatttgaatggtgacggtaaatctgacgtt
ctggctgcatcttgggattcgctaattgcttttgcgggtggaggtttacctacgattggt
gcttcgccctccgttattcgagtctctgatcctttctcagactccaagggcaagatgtgg
gtgggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
