Glycine max (soybean): 100786882
Help
Entry
100786882 CDS
T01710
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
gmx
Glycine max (soybean)
Pathway
gmx03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gmx00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
100786882
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
gmx03019
]
100786882
Messenger RNA biogenesis [BR:
gmx03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
100786882
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100786882
NCBI-ProteinID:
XP_003556346
UniProt:
I1NI06
LinkDB
All DBs
Position
20:43771642..43775376
Genome browser
AA seq
476 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTTEDKLKEHFGNYGDVLSTSVMREKNTGKPRGFGFVVFADPNIL
DRVLEDKHVIDGRTVDAKKAFSREDQQISVTSRGGNSNSGMNSENGGNIRTKKIFVGGLP
PTLTEEKFRLYFESYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKSFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGASGRMMGGAGGGGAGIGGYQGYGASGGSQNAYDGRMDSSRYMQPQ
SAAGGFPPYGSSAYSAPGYGYGPANNGIGYGAYGSYGSATAGYGGPAGATYGNPNVPNAA
YAGGPPGGPRSSWPAQAPSGYGSMGYGNTAAWGAPSGGAGSGGGGPGSATAGQSPGGAAG
YGNQGYGYGGYAGYGGSDSSYGNSSAYGTVGGRTGSGPNSNASAPGGTELTSSGGSGNYM
GGGYGDANGNSGYGNAAWRSEQTHASGNYGTPQGNGGQVGYGGGYGGAQSRQAQQQ
NT seq
1431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaaggcaagcttttcatcggtgggatttcatgggatacgacggaggac
aagctcaaggagcatttcggtaactacggcgacgttttgagcacttccgtcatgcgggag
aagaacactgggaagccaaggggctttggtttcgtcgtttttgcggatcctaacattcta
gatagggttttggaagacaaacatgtcatagacggcagaacggttgatgccaaaaaggcc
ttctcaagagaggatcaacaaatttctgtcacttccagaggtggaaattccaattctggc
atgaattctgaaaatggaggaaacatcaggactaaaaagatatttgttggagggttgcct
cccaccctgactgaagaaaaatttcgtctgtactttgagtcttatggacatgtaactgat
gtagtagtcatgtatgaccagaatactgggcgtccacggggatttgggtttatttcattt
gatactgaggaggcagttgatagggttttgcacaaatcatttcatgatttaaatggtaaa
caagttgaggtaaagcgtgcacttcccaaggatgccaatcctggtgcaagtggccgtatg
atgggtggtgctggaggtggtggtgctggaattggtgggtatcaaggttatggggcatct
ggtggcagccaaaatgcatatgatggtcgtatggattctagtaggtatatgcagcctcaa
agcgctgcaggtggattccctccttacggttcttctgcctatagtgctcctgggtatggt
tatggtccggctaataatggcattggttatggtgcatatggaagttatggtagtgccact
gctgggtatggtggacctgctggtgcaacatatgggaatcctaatgtccctaatgctgct
tatgctggtggtccacctggtggcccaagaagttcatggcctgctcaggctccttctggt
tatggatctatgggttatgggaacactgctgcttggggtgctcctagtggtggtgctgga
tctggtggtggcggtcctggttcagcaactgcaggtcagtcccctggtggagctgctgga
tatgggaatcaaggttatggatatggtgggtatgctggatatggtggaagtgatagttct
tatgggaattcaagtgcatatggtactgttggtggacgtactgggagtggtccaaacagt
aatgctagtgctcctggtgggactgaactaacaagtagtggtggcagtggcaactatatg
ggtggtggctatggggatgcaaatggaaattcaggttatggaaatgcagcttggagatct
gaacaaactcatgcatctggaaattatgggactcctcagggaaatggtgggcaagttggt
tatggtggtggctatggtggtgctcagtctcgacaagcccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
