Glycine max (soybean): 100787039
Help
Entry
100787039 CDS
T01710
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
gmx
Glycine max (soybean)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
COG5_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100787039
NCBI-ProteinID:
XP_003539627
UniProt:
K7LTA8
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(4370939..4378241)
Genome browser
AA seq
1053 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPMLGSNEGSFGDELEKEIGMLLREQRRQEADDRERELNIFRSGSAPPTVEGS
LSAVGGLFAAGGGGGPATGAPAAFLEFRGAKDVNGIASEEELRSDPAYLSYYYSNVNLNP
RLPPPLLSKEDWRFQQRLKGGASALGGIGDRRKVNRTDDNAGRLLFATPPGFNMRKLESE
VDNEKTRGSAEWGGDGLIGLPGLGLSKQKSFAEFFQDDLGHNTSITRLPSRPASRNAFDE
NDIISSAEPELAHVRRESTPTDALRSGSNVQGSSAAQNVGLPASYSYAAAVGSSLSRSTT
PDPQLIARAPSPCITPIGGGRAIASDKRAIANPDAFNGVSSGINESADLVAALSVMNLSA
DDVLDGENHFPSQVESDVDSHQRYLFGRQGGQDHGKQQAYLKKSESAHLQNSSKSSRSGS
GLNNPSLDRQVELQKSTVPSNNSYFKGSPTSHFSGGGSMPPQYQPLDGTNSSFTNYGMSG
YAGNPALASLMTNQLGTGNLPPLFQNVAAASAMAAPGMDSRILGCGLASGTAAPSDVHNL
GRMGNQIQGSALQAPFVDPMYLQYLRTSEFAAAQLAALNDPSVDRNYLGNSYMNLLELQK
AYLGSVLSPQKSQYNVPPGGKSGSFTPHGYYGNPAYGAGLSYPGSPMANSVVSTSPVGSG
SPVRHNELNMHFASGMRNLAGVMGPWHVDNENIDESFASSLLEEFKSNKTKCFELSEIAG
HVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKNMVYQEIMPHALALMTDVFGNYVVQKFFEHGLA
SQRRELANKLLGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIEMVQELDGNVMRCVRDQNGN
HVIQKCIECVPEDAIHFIVSTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCKDPTTQQKVMDEIL
GAVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSSIIKELADKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGG
PSERQLLVSQMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNAL
KKYTYGKHIVSRVEKLVAAGERRIAAQAPPQPA
NT seq
3162 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtctgaattgggaagaagacctatgcttggaagtaacgagggttcttttggtgat
gaattggagaaagagatagggatgttacttcgtgagcaacgcagacaagaggctgatgat
cgtgagcgagagcttaatatttttaggagtggatcggcacctccaactgtggagggttct
ttgagtgccgttggagggttgtttgctgctggtggtggtggtggtcctgctactggtgct
cctgctgcctttttggagtttcgaggagcgaaggatgtgaatgggattgcttctgaggaa
gagcttaggtctgatccagcgtatctttcatactactactccaatgtgaatttgaatcct
aggctgccacctcctttgctgtcaaaggaggattggagatttcaacaaagacttaaaggt
ggagcttctgctctaggtggaattggagataggaggaaagtgaacaggactgatgataat
gctggaagattgctttttgctaccccaccaggttttaacatgaggaaactagagagtgag
gtggataatgaaaaaacaagaggttcggccgagtggggtggtgatggactgattggtttg
cctggactagggctgagcaaacagaagagctttgcagaattttttcaggatgatttgggg
cataatacctctatcacacgccttccttctcgcccagccagtcgtaatgcatttgatgaa
aatgatatcattagttctgctgaaccagagttggctcatgtacgtcgtgagtccactccc
actgatgcactaaggtcaggatcaaatgttcaaggatcatctgcagcccaaaatgttggc
ttaccagcttcatattcttatgctgctgcagtaggatcttccttgtcaagaagcactact
cctgatccacaacttattgctagggctcccagtccctgcatcactcccattggtggcggc
agagccattgcttctgacaagagagctattgccaatccagatgcatttaatggtgtttca
tctggcatcaatgagtcagcagatcttgtggctgcattatcagtgatgaacttgtcagca
gatgatgtgttagatggtgaaaaccatttcccatcacaagttgaatcagatgtagatagt
catcagagatatctttttggtaggcaaggtggtcaggatcatgggaagcaacaggcttat
ttaaagaaatctgaatcagcacacttgcaaaattcaagtaagagcagcaggagtggatca
ggtctcaacaatccatccttggataggcaggttgagctacaaaagtctactgttccttcc
aataactcatacttcaaaggatcgcctacctcccattttagtggaggaggaagtatgcca
cctcagtaccagcctttagatggtacaaattcatcatttactaactatggtatgagtggc
tatgctggaaatccagcattggcatccttgatgactaaccaactaggcactggtaatctg
ccacccttgtttcaaaatgttgctgcggcatcagcaatggctgcccctggaatggactcg
agaattcttggatgtggtttggcttctggaactgctgctccatctgatgtgcataatctt
ggtaggatgggaaatcaaattcaaggcagtgctcttcaggctccttttgtcgatcccatg
tatcttcagtacctgaggacgtctgagtttgctgcagcacaacttgctgctctcaatgac
ccctctgtggacaggaactacttgggcaattcatacatgaatttgcttgagctccagaaa
gcttatcttgggtctgtcctctcacctcagaaatcccaatacaatgtaccgccgggtggt
aaatcaggcagcttcactcctcatggttattatggaaatcctgcatatggtgctgggttg
tcttacccaggaagtcctatggcaaactctgttgtgtccacttctccagttggatctgga
agtcctgttaggcacaatgaactgaatatgcattttgcttctggaatgaggaatttagct
ggggtcatgggaccttggcatgtagataatgagaacattgatgaaagttttgcttcttct
ctgttggaagagtttaaaagcaataaaacgaagtgttttgagctgtctgaaattgctggt
catgttgttgaattcagtgcggatcaatacgggagtcgatttattcaacaaaagcttgaa
acagctactacagaagaaaaaaacatggtttatcaggaaatcatgccacatgcccttgct
ttgatgactgatgtctttggtaattatgtggttcaaaagttttttgagcatggacttgca
tcccagagaagagaattagccaacaaacttcttggccatgttctgacacttagccttcaa
atgtatggttgccgtgtcatccagaaggccatcgaagttgttgatctggatcagaagata
gagatggttcaagagcttgatggtaatgttatgcgctgtgtacgtgatcagaatggtaat
catgtcattcagaagtgtattgaatgtgtccctgaagatgcaatccactttattgtgtca
acattttttgatcaagttgtgacactctcaacccatccatatggttgccgggtgatacag
cgagtgctggaacactgcaaagaccctacaacacaacagaaagttatggatgaaatttta
ggagcagttagcatgttagctcaggatcagtatggcaactacgttgttcagcatgtgctg
gaacatgggaagcctcatgagcgttcttctataataaaggaattagcagacaagatagtg
caaatgagtcaacagaagtttgcctccaatgttgtggagaaatgtttgacctttggaggt
ccttctgaacgccaattactagtgagtcagatgcttggcaccacagatgaaaacgaacct
cttcaggcgatgatgaaagatcaatttgcaaattacgttgtacaaaaggtgctggaaact
tgtgatgatcaacagcgcgagctgattctttcccgaattaaggttcatttgaatgcattg
aaaaagtacacctatggaaagcacattgtctctcgtgtagaaaaacttgttgcagctgga
gaaaggagaattgctgctcaggctcctcctcaacccgcttag
DBGET
integrated database retrieval system