KEGG   Glycine max (soybean): 100801928
Entry
100801928         CDS       T01710                                 
Name
(RefSeq) glycine-rich cell wall structural protein 1.8 isoform X1
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
gmx  Glycine max (soybean)
Pathway
gmx03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:gmx00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    100801928
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:gmx03019]
    100801928
   03041 Spliceosome [BR:gmx03041]
    100801928
Messenger RNA biogenesis [BR:gmx03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     100801928
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     100801928
Spliceosome [BR:gmx03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    100801928
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1
Other DBs
NCBI-GeneID: 100801928
NCBI-ProteinID: XP_003528224
UniProt: K7KW68
LinkDB
Position
6:complement(18907527..18912174)
AA seq 674 aa
MWCAEYNFSVYVFSQVAGMAFFGRVGNILRQATNQKIGLEIRSLSSVFQATRCMSNAPNS
RLFIGGVSYSIDAQSLGEICSQYGQVVDARIIMDRETGRHRGFGFITYSNVDEASRALQA
LDGQDLDGRRVEVKFAIERSHGFGGGGFGGSYGNTPYDAGAGTGHPGSYGNTPYGAASGG
YDNTGGGNAAGVYGRGEDGGGGNWPSGNFGVSSFGNNYGDAGVYAGNSAGGYDNNGYGGG
SGGDAGPYGSNAARDYDNGVGGSGSSFGDRSSGKNYGDAGAFRANAASEYGGGSGGSFGD
SSSVNNYGAGGGYNGTGTSYRNAGSFATSNPYNDGPGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYG
SAAAAGGRQSFAGSQHPGSAMANASDGTDTGNGFAGGSYGNAGSFATSKTYNDGTGAAGF
GKNNKYDSSAGFGSSSRYDSAASVGSQSFAGKQHPGMVNGSDGTGTGNGFAGGSYGNAGS
YATSNTDKDGTGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYGSAAAGGRQCFAGSQHPGIAMANASD
GTDTGNGFAGGSYGNAGSFATCNSYNDGTGTAGFGKSNKYDSSAGFGSSSRYGSAAAVGS
QSFASSQHPGSAMANASNGTGTGNDFADRYHGSGGQFGSNQSSNVGQHGRDFGGSFDEDF
RIGNYENDAFAGRA
NT seq 2025 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtggtgtgcagaatataacttcagtgtttatgtcttttctcaggttgcaggaatggct
ttctttggtagagtcgggaatatactgagacaagcaacgaatcagaagatcggtttggag
atacgttctttgtcatctgttttccaggctacacggtgcatgtcaaatgctccaaattca
aggctgtttataggaggtgtttcgtattctattgacgcgcaaagtttgggggaaatttgt
tcacaatatggccaagttgttgatgcaaggataattatggatcgtgaaactggtaggcac
agaggatttggttttatcacttacagtaatgttgatgaggcatcgcgtgcccttcaagcc
ttggatggacaggatcttgacggtcgtcgggttgaggtaaaatttgcaattgaaagatcc
catggatttggtggtggcggctttggtggatcttatggcaatactccctatgatgctgga
gctggcactgggcatccaggtagttatggcaacactccatatggtgctgcaagtggtggg
tatgacaatactggtggtggcaatgctgctggagtttatggcaggggtgaagatggtgga
ggtggcaattggccgagtggtaattttggggtaagcagctttggtaataactatggcgat
gctggtgtctatgctggcaattctgctggaggttatgacaacaatggatatggtggagga
tctggcggtgacgcgggtccctatggtagcaatgctgctagagattatgacaacggcgtt
ggaggatcaggtagcagttttggggacagaagctctggcaagaactatggtgatgccggt
gccttcagagccaatgctgccagtgaatatggtggaggatcaggtggcagttttggggac
agcagctctgtcaacaactatggtgctggtggtggttataatggaaccggaacgagttac
aggaatgctggtagctttgcaaccagtaacccttacaacgatggaccaggtgctgccgga
tttggcaagaataataattatgacagttctgcaggatttggtagtggcagtaggtatggt
agtgctgctgctgctggaggaaggcagagttttgccggtagtcagcaccctggaagtgcc
atggcgaatgccagtgacggtacagatactggaaatggctttgctggtggaagttatggg
aatgctggtagctttgcaaccagtaaaacatacaatgatggaacaggtgctgctggattt
ggcaagaataataagtatgacagttctgcaggatttggtagcagcagtaggtatgatagt
gctgcctctgttggcagccagagttttgccggtaaacagcaccctggaatggtgaatggc
agtgatggtacaggtactggaaatggctttgctggtggaagttatgggaatgctggtagc
tatgcaaccagtaacactgacaaggatggaacaggtgctgccggatttggcaagaataat
aattatgacagttctgctggatttggtagtggcagtaggtatggtagtgctgctgctggt
ggaaggcagtgttttgccggtagtcagcaccctggaattgccatggcgaatgccagtgat
ggtacagatactggaaatggctttgctggtggaagttatgggaatgctggtagctttgca
acatgtaacagttacaacgatggaacaggtactgctggatttggcaagagtaataagtat
gacagttctgcaggatttggtagcagcagtaggtatggtagtgctgctgctgttggcagc
cagagttttgccagtagtcagcaccctggaagtgccatggcgaatgccagtaatggtaca
ggtaccggaaatgactttgctgatagatatcatggcagcggtggccaattcggtagcaat
caaagcagcaatgtgggtcaacatggtcgagattttggaggctcgttcgacgaagatttc
aggatcggcaattatgaaaatgatgcctttgctggacgggcatga

DBGET integrated database retrieval system