Glycine max (soybean): 106795173
Help
Entry
106795173 CDS
T01710
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
gmx
Glycine max (soybean)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
COG5_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106795173
NCBI-ProteinID:
XP_040862657
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(10370877..10378097)
Genome browser
AA seq
1047 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPMLGSNEGSFGDELEKEIGMLLREQRRQDADDRERELNIYRSGSAPPTVEGS
LSAVGGFFGGAAGAPATGAPVAFLEFQGTKDVNGITSEEEVRSDPAYLSYYYSNVNLNPR
LPPPLLSKEDWRFQQRLKGGASALGGIGDRRKVNRTDDNGGRLLFSTPPGFNMRKQESEV
DNEKTKGSAEWGGDGLIGLPGLGLSKQKSFVEIFQDDLGHNTSIARLPSRPSSRNAFDEN
DISSSADAELAHVHRESTPADVLRSGSSAAQNVGPPASYSYAAAVGSSLSRSTTPDPQLV
ARAPSPCITPIGGGRAIASDKRAIASQDAFNGVSSGINESADLVAALSVMNLSADDVLDG
ENHLPSQVESDVDNHQRYLFGRQGGQEHGKQHAYLKKSESAHLQNSRASSRSGSDLNNPS
LDRQVELQKSTVPSNNSYFKGSPTSHFSRGGSMPPQYQPLDSTNSSFGNYGLSGYAGNPA
LASLMTNQLGTGNLPPLFENVAAASAMASPGMDLRILGGGLASGAAAPSDVHNLGRMGNQ
IPGSALQAPFVDPMYLQYLRTSEFAAAQLAALNDPSVDRNYLGNSYMNLLELQKAYLGSI
LSPQKSQYNVPLGGKSGSSTPHGYYGNPAYGVGMSYPGSPMANSVVSTSPVGSASPVRHN
ELNMRFASGMRNLAGVMGPWHADTGNIDESFASSLLEEFKTNKTKCFELSEIAGHVVXXS
ADQYGSRFIQQKLETATTEEKNMVYQEIMPHSLALMTDVFGNYVVQKFFEHGLASQRREL
ANKLLGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIEMVQELDGNVMRCVRDQNGNHVIQKC
IECVPEDAIHFIVSTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCKDPTTQQKVMDEILGAVSML
AQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSCIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPSERQL
LVSEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNALKKYTYG
KHIVTRVEKLVAAGERRIAAQAPPQPA
NT seq
3144 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtctgaattgggaagaagacctatgcttgggagtaacgagggttcttttggtgat
gaattggagaaggagatcgggatgttgcttcgtgagcaacgcagacaagatgctgatgat
cgtgaacgagagcttaatatttataggagtggatcagcgcctccaactgtggagggttct
ttaagtgctgttgggggattttttggtggtgctgccggtgctcctgccactggtgctcct
gtcgcttttttggagtttcaagggactaaggatgtgaatgggattacttctgaggaagag
gttaggtctgatccagcgtatctttcatactactactccaatgtgaatttgaaccctagg
ctgccacctcctttgctgtcaaaggaggattggaggtttcaacaaagacttaaaggtgga
gcttcagctctaggtggaattggagataggaggaaagtgaacagaactgatgataatggt
ggaagattgcttttttctaccccaccaggttttaacatgaggaaacaagagagtgaggtg
gataatgaaaaaacaaaaggttcggccgagtggggtggtgatggactgattggtttgcct
ggactagggcttagcaaacaaaagagctttgtggaaatttttcaggatgatttggggcat
aatacctctattgcacgccttccttctcgtccatccagtcgtaatgcatttgatgaaaat
gatatcagtagttctgctgatgcagagttggctcatgtacaccgtgagtccacacccgct
gatgtgctcaggtcaggatcatctgcggcccaaaatgttggcccaccagcttcatattcc
tatgctgctgcagttggatcttccttgtcgagaagcactactcctgatccacaacttgtt
gctagggctcccagtccctgcatcacgccaattggtggtggcagagccattgcttctgac
aagagagctattgccagtcaagatgcatttaatggtgtttcatctggcattaatgagtca
gcggatcttgtggctgcattgtcagtaatgaacttgtcagctgatgatgtgcttgatggt
gaaaaccatttgccatcacaggttgaatcagatgttgataatcaccagagatatcttttt
ggtaggcaaggtggtcaagaacatgggaagcaacatgcctatttaaagaaatctgaatca
gcacacctgcaaaattcaagagcaagcagcaggagtgggtcagatctcaacaatccatcc
ttggataggcaggttgagctacaaaagtctactgttccttccaataactcatatttcaaa
ggatcacctacctcccattttagtagaggaggaagtatgccaccccagtaccagccttta
gatagtacaaattcctcatttggtaactatggtctgagtggctatgctggaaatccagca
ttggcatccttgatgactaaccaacttggcactggtaatctgccacccttgtttgaaaat
gttgctgcagcatcagcaatggcatcccctggaatggacttgagaattcttggaggtggt
ttggcttctggagctgctgctccatctgatgtgcataatcttggtaggatgggaaatcaa
attccaggcagtgctcttcaggctccttttgtcgatccaatgtatcttcagtacctgagg
acgtctgagtttgctgcggcacaacttgctgctctcaatgacccctctgtggacaggaac
tacttaggcaattcatacatgaatttacttgagcttcagaaagcttatcttgggtctatc
ctctcgcctcaaaaatcccaatacaatgtaccgctgggtggtaaatcaggcagctccact
cctcatggttattatggaaatcctgcatatggtgtcgggatgtcttacccaggaagtcca
atggcaaactctgttgtatccacttccccagttggatctgcaagtcctgttaggcacaat
gaactgaatatgcgttttgcttctggaatgaggaatttggccggggtcatgggaccttgg
catgcagatactgggaacattgatgaaagttttgcttcttctctgttggaagagtttaaa
accaataaaacaaagtgttttgagctctctgaaattgcgggtcatgttgttgnnngtagt
gcggatcaatatgggagtcgatttattcaacaaaagcttgaaacagctactacagaagaa
aaaaacatggtttatcaggaaatcatgccacattcccttgctttgatgactgatgtcttt
ggtaattatgtggttcaaaagttttttgagcatggacttgcatcccagagaagagaatta
gccaacaaacttcttggtcatgttctgacacttagccttcaaatgtatggttgccgtgtc
atccagaaggccattgaagttgttgatctggatcagaagatagagatggttcaagagctt
gatggtaatgtcatgcgctgtgtacgcgatcagaatggtaatcatgtcattcagaagtgt
attgaatgtgtccctgaagatgctatccactttattgtctcaacattttttgatcaagtt
gtgaccctatcaacacatccgtatggttgccgggtgatacagagagtgctggaacattgc
aaagaccctacaacacagcagaaagttatggatgaaattttaggtgcagttagcatgtta
gctcaggatcagtatggcaactacgttgttcagcatgtgctggaacatgggaagcctcat
gagcgttcttgtataataaaggaattagcaggcaagatagttcaaatgagtcaacagaag
tttgcctccaatgttgtagagaaatgtttgacctttggaggtccttctgagcgccaatta
ctagtgagtgagatgcttgggaccaccgatgaaaatgagcctcttcaggcgatgatgaaa
gatcaatttgcaaattacgttgtacaaaaggtgctggaaacttgtgatgatcaacaacgt
gagctgattctttcccgaattaaggttcatttgaatgcattgaaaaagtacacctatgga
aaacacatcgtcacgcgtgtagaaaaacttgttgctgctggagaaaggagaatagctgct
caggctcctcctcaacctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system