Glycine max (soybean): 547801
Help
Entry
547801 CDS
T01710
Name
(RefSeq) extensin-2
Organism
gmx
Glycine max (soybean)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
547801
NCBI-ProteinID:
XP_040869432
LinkDB
All DBs
Position
20:complement(47655749..47661179)
Genome browser
AA seq
1227 aa
AA seq
DB search
MTARGSDPIRGRLRPQMALALAIALISITLVSVNADGYPYYSPPPPYQYTSPPPPPYLYK
SPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPEKSPAPT
PYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSP
SPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPEKSPAPTPYYYKSPPPPSPTPYYYKSPPPP
SPTPYYYKSPPPPPPYYYKSPPPPSPAPYYYKSPPPPPPYYYKSPPPPPYYYKSPPPPSP
TPYYYKSPPPPSPTPYYYKSPPPPPPYYYKSPPPPSPAPYYYKSPPPPPPYYYKSPPPPP
YYYKSPPPPSPTPYYYKSPPPPSPTPYYYKSPPPPPYYYKSPPPPSPTPYYYKSPPPPSP
TPYYYKSPPPPSPTPYYYKSPPPPPYYYKSPPPPSPTPYYYNSPPPPVVYPPHPYHPHHH
PLIVKVVGKVYSYKCYDWEYPEKSHNKKHLKGAVVEVKCKAGRNIIKAYGETKSNGKYSI
TVKDFNYVKYGPTVCKAKLYAPPKGSPFNIPTKLNEGTDLKVKSKDKYEVVLKAKPFAYA
SKKHFEDCYKPKPSPTPYYYKSPPPPSPVYIYKSPPPPSPTYVYKSPPPPVKSPPYYYQS
PPPPSPKPKPPYYYQSPPPPSPVPKPPYYYQSPPPPSPVYIYKSPPPPSPTYVYKSPPPP
VKSPPYYYQSPPPPSPKPKPPYYYKSPPPPSPKPKPPYYYQSPPPPSPVPKPPYYYQSPP
PPSPVPKPPYYYKSPPPPSPVPKPPYYYQSPPPPSPIPKPPYYYHSPPPPSPSPPPPYYY
KSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPVPKPPYYYHSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPP
PYYYKSPPPPSPVPKPPYYYHSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPVPKPPYYYHSPPPPSP
SPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPVPKPPYYYHSPPPPSPSPPPPYYYKSPP
PPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYHSPPPPKEHVHPPYYYHSPPPPSPSPPPPYYY
KSPPPPSPSPPPPYYYHSPPPPSPSPPPPYYYHSPPPPSPSPPSPYYYKSPPPPSPSPPP
PYYYQSPPPPSPTSHPPYYYKSPPPPTSYPPPPYHYVSPPPPSPSPPPPYHYTSPPPPSP
APAPKYIYKSPPPPVYIYASPPPPIYK
NT seq
3684 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgcaaggggcagcgaccccataaggggtcgtcttcggccgcaaatggccttggcc
ttggccattgctttgatttctatcactttggtttccgttaatgctgatggttacccttac
tattcccctcctccaccttaccagtacacctcaccacctcctcctccttacctctacaag
tctcctcccccaccctctccttcacctcctcctccatactattataaatctccaccacca
ccctctccctcacctccacccccttattattataagtctccaccaccaccttcaccatct
cctccaccaccctattattacaagtctccacctccacctgaaaagtctcccgctccaact
ccctactactataagtctccaccaccaccttctccatctcctccaccaccctactattac
aagtctcctccaccaccatctccctcaccccccccaccttactattacaagtctcctcct
ccaccatctccctcacctccacctccttattattacaagtctccaccaccaccttcacca
tcccctccaccaccttactattacaagtctccgccaccaccttctccttcccctccacca
ccctactattacaagtctccgccaccacctgaaaagtctccagctccaactccttactac
tataagtctcctcctcctccatcaccaactccttactattacaagtctccaccacctccc
tctccaactccgtactactataagtctcctcctccgccgccaccttattactacaagtct
ccacccccaccatccccagctccttactactacaagtctccacccccaccaccaccttat
tactacaagtctcctcccccaccaccttactattacaaatctcctcctcctccatcacca
actccttactattacaagtctccaccacctccctctccaactccgtactactataagtct
cctcctccgccgccaccttattactacaagtctccacccccaccatccccagctccttac
tactacaagtctccacccccaccaccaccttactactacaagtctcctcccccaccacct
tactattacaaatctcctcctcctccatccccaactccctactattataaatctcctcct
cccccttcccccactccttactactacaagtctccacccccaccaccttattattacaaa
tctcctcctcctccctccccaactccctactactacaaatctcctcctcctccttcaccc
actccttactattacaagtctccacctccaccatccccaactccttactattacaagtct
cctcctccaccaccttactattacaaatctcctcctcctccatcccctactccctactac
tataactctcctcctccaccagttgtgtatcccccacacccttaccatccgcaccaccac
cctttgattgtgaaggtagtgggtaaagtctacagctacaagtgttatgactgggagtat
cccgaaaagtctcataacaagaaacacctcaaaggtgctgttgtggaggtgaaatgcaaa
gcaggaagaaatattatcaaggcttatggtgaaactaagagcaacggaaagtatagcatc
acagttaaggacttcaattatgtcaaatatggacctacagtgtgcaaggccaagctttat
gctccacctaagggatcacccttcaacatacctaccaagttgaacgaaggaacagacttg
aaggtgaaatcgaaagacaagtatgaagttgtgcttaaggctaagccatttgcttatgct
tcaaagaagcattttgaagactgctacaagcccaagccttcaccaactccttactactac
aagtcgcctcctcctccatctccagtttacatatacaagtcgccacctcccccatcacct
acttatgtttacaagtcaccacctccacctgtgaagtcacctccatattattatcaatct
ccacctccaccatcaccaaaacctaaacctccatattactatcaatcaccacctccacca
tcaccagtacccaagcctccttattactatcagtctcctcctcctccatctccagtttac
atatacaagtcaccacctcccccatcacctacttatgtttacaagtcaccacctccacct
gtgaagtcacctccatattattatcaatctccacctccaccatcaccaaaacctaagcca
ccatactattacaaatcaccacctccgccttcaccaaaacctaaacctccatattactat
caatcaccacctccaccatcaccagtgcccaagcctccttattactatcaatctcctcct
cctccatcaccggttcctaagccaccatattactacaaatctccacctcctccatcacca
gttcctaagccaccatactattaccagtctccacctccaccatcaccgattcctaaaccc
ccatactattaccactctccacctccaccatcaccttctcctcctcccccatactattat
aaatcaccacccccaccttcaccatcccctcctcctccttactattataaatctccccca
ccaccttcaccagttcctaaacccccatactattaccactctccacctccaccatcacct
tctcctcctcccccatactattataaatcaccacccccaccttcaccatcccctcctcct
ccttactattataaatctcccccaccaccttcaccagttcctaaacctccatactattat
cactctccacccccaccatcaccttctcctcctcccccatactattataaatctccccca
ccaccttcaccagttcctaaacccccatactattaccactctccacctccaccatcacct
tctcctcctcccccatactattataaatcaccacccccaccttcaccatcccctcctcct
ccttactattataaatctcccccaccaccttcaccagttcctaaacccccatactattat
cactctccacctccaccatcaccttctcctcctcccccatactattataaatcaccaccc
ccaccttcaccatcccctcctcctccttactattataaatctcccccaccaccttcacca
tccccaccaccaccttattattatcattccccacctccacctaaagagcatgtacaccct
ccctactactaccactcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccttattattat
aaatcccctccaccaccatccccttctcctcctcccccctactactatcactctccacca
ccaccatctccttctcctcctcctccctactactaccactctccaccaccaccatcccca
tcaccgccgtctccatattattacaaatcccctccacctccatctccatctccaccacct
ccttactactatcaaagtcctcctccaccatctcccacttctcatcctccctattactac
aaatcccctccaccaccaacgtcatatcctccacctccttaccactacgtgagccctcca
ccaccttctccatctcctcccccaccataccattacacatcaccacctcctccttcccca
gctcctgctcccaagtacatttacaaatcacctccacctccggtttatatctatgcttcc
ccacctccacctatctacaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system