Brumicola nitratireducens: GNIT_1015
Help
Entry
GNIT_1015 CDS
T01632
Name
(GenBank) GGDEF domain protein
Organism
gni
Brumicola nitratireducens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
Response_reg
HATPase_c
HisKA
Y_Y_Y
Hpt
DUF7755
PHTF1-2_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEP29152
UniProt:
G4QK30
LinkDB
All DBs
Position
1107693..1111580
Genome browser
AA seq
1295 aa
AA seq
DB search
MLNRLIKCCSLLILLSLSILRVSANDYQYELLNDNDGFTSSIIFSIVQDEDGFLWFGTGF
SGILRYDGKNVVNFKNDPNNPDSLPHDNAGNLILSKQGYLWIGSWGGGAIKFDPSTQVFT
QFQSSLDNPDTISHSSVQSIFEDANGVVWFGTFAGGINRFDKDSQKFKRFSMQDERNSGP
SNNRIWDIKQTKLNELWIATESGLNKLDTVTLKFSYYFPEPDRLLSERNKIRVIETAENG
DLYLGTQNGVVVLDTKLGEFNVIDNPSFPNMGPIYSMIATDFGEYWVTSGHGIFSFSQDD
KTLKKVELGFDDRCSQSIFQDRQGTIWLNCEGVGVYKITQTNIFKTFPDPLVKAAFATEV
ANDNSVLVGTAQNGLFNWRPESNQLTNLIYSETETTFPEIRFITQTSKGDIWYGSSKNLF
KLDERGRQIEVLPPVALREEFERFTDIATDEVDNIWIGTKNLLFVVNTIDLSFDSISIEN
LSTDDYHFSQFYLDPHNNMWVTVQNSLYRWSKDTEELELISSPEPSSNSSEIKDFIYSIL
IDSNDQLWISNKTGLFMVDQKSGARQAISRYFLEQENKGIRLINEDKSGFLWLVTPTGVS
KFNPTSGDFQHYDKRDGLPGSRYFLRPTSSSSDDTIYLSSRDGITYFSPASVKNHSLDEN
TELTNFEVLSTTTKYNIEQIKKQGIKLKFDESNVKFEFATLDLLNARQIQYSYFLEGFDK
DWIENGNNNTATYTNLSGGDYVFRVRAKIKDDLWYDQDLAVNLNVGIPFWERWWMLVVYA
TLILLGILYYLQRQKRAVIKLERQVAEKTADIAQESQKLAAANRIKSQFLANMSHEIRTP
LTTVIGQAEAIICRDVKPEDIYKEVEIIHDSSLYLLALLNDILDLTKIEENKFELEYAPQ
DLHSLLSNINTMFSMQARVKGLSFSLIENLPRPFIINVDGLRLKQILINLLSNALKFTVS
GYVRLEVLLADSRLVFNVEDTGIGISEDQIDLIFGSFTQGDSSIRRRFGGSGLGLHLSNQ
LAVLMNGEITVKSEVDKGSVFTFSMPAPPVMSASDKPRVNLKVDESSSTPLFNGKILLAE
DHSDNRRLISRLLTKLGLTVYTAADGFEALELYKEHSPEVVLMDIQMPRMDGLQAYKALR
DLGCEKPIIALTANAMTNEVDEYFSLGFDGYIEKPIDRQLLISTIATFFNANDDDSMRRA
NSILGNIDMSDLVSEFKTSLISELKHFSAEQEKQDVNALRALAHRLSGASYLFGFAELSR
KATQLETNIKNGKLSFLELEPQIDELINEIRHIIG
NT seq
3888 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttaaatcggttaataaaatgctgtagtttgctgatactgctgtcgcttagtatccta
agggtatcagcgaatgactaccaatatgaattacttaatgataatgacggcttcacgtcg
tcgatcatattttcgatcgtacaagatgaggatggttttctttggtttggtactggtttt
agcggaattttacgttatgacggcaaaaatgttgtcaactttaaaaacgatcctaataat
cctgactccttgccacatgataatgctggaaatttaatactgagtaagcaaggctatctt
tggattggtagttggggtggaggagctattaaattcgatccttccactcaagtatttacg
caatttcagtcctcactcgataaccccgacacaattagccactcttcggtacaaagtatt
ttcgaagatgctaacggcgtagtgtggtttggtacttttgctgggggaatcaacagattt
gataaagacagtcaaaaattcaaacgattctcaatgcaagatgaaagaaacagtggcccc
tcgaataacagaatatgggatataaagcagactaaacttaatgaattatggatagcgacg
gaatctggcctgaacaaactagacaccgttacgcttaaattttcttattacttcccagag
ccagatcgacttctttctgaacgcaataaaatacgtgtaattgaaaccgctgaaaacgga
gacctgtatttaggcacccaaaatggtgtcgtggttttggatacaaaactcggtgaattc
aatgtgatagataatcccagctttcccaatatgggacctatatattcaatgattgctaca
gattttggtgaatactgggtaaccagtggccatggcattttttcattttcccaagatgac
aaaacgctgaaaaaagtagaattgggttttgatgatcgctgtagtcagagtattttccaa
gataggcaaggcaccatttggcttaattgcgaaggcgttggtgtgtataaaattacccag
actaacatctttaaaacgtttcccgacccacttgtcaaggcggcatttgcgactgaagta
gcgaacgacaatagtgttttagtcggtactgcgcaaaatggtctttttaactggagacca
gaaagtaatcagttaactaatttaatttacagcgagacagaaacaactttccctgaaatc
agatttatcactcagacatccaaaggtgatatttggtatggcagttcaaaaaatctattt
aagttagatgagcgaggcaggcaaatagaagttttaccaccggtggcattacgggaagaa
tttgaaaggtttacagatatagcgacggacgaagtggataatatttggattgggaccaaa
aatttactttttgttgtcaatacaatcgatttatcgtttgactctatttcaatagaaaat
ttatctaccgatgattatcacttttctcaattctatttggatccacataacaacatgtgg
gtgacagttcaaaattccttgtatcgttggagtaaagatacagaagagttagagttgata
agtagtcctgagccatcgtccaactctagtgagatcaaagattttatttattcaatcttg
atagatagcaacgatcaattatggatcagtaataaaacaggacttttcatggtcgatcaa
aagtctggtgcgaggcaggccatcagtcgttattttttggaacaagaaaataaaggtatt
cgtttgatcaacgaagacaaaagtggctttttatggctagtgactccaaccggtgttagc
aagtttaatccgaccagtggtgattttcaacattatgataagcgcgatggcttgcctggt
tctcgatattttctcagaccaacaagcagttcctcagacgacaccatctacttgtcaagt
cgcgacggtattacttatttttcaccagcatctgttaaaaatcatagtttggacgaaaac
accgagctcactaattttgaagtattatctactactactaaatacaacatagaacaaata
aagaaacagggaataaagctcaagtttgacgaaagtaacgttaaatttgagtttgcgact
ttagatctcttaaatgcgaggcaaattcaatacagttattttttggaaggctttgataaa
gactggatagaaaacggcaataacaacactgccacctacacaaatttaagtggcggcgac
tatgtatttcgggttcgtgcaaaaataaaggatgatctctggtatgaccaagacctagct
gtaaatttaaatgtaggtatccccttctgggaacggtggtggatgcttgttgtatatgca
acactgattctgctgggcatattgtattatttacaaagacaaaaaagagccgttattaag
ttggaacgtcaagttgcagagaaaaccgcagacatcgctcaagaatcccagaagctagcc
gctgcgaaccgcataaagtcacaattccttgcaaatatgagccacgaaattcgcacgcct
ttgaccacagtaattggtcaggctgaagctattatttgccgtgatgtaaaaccagaagac
atttataaagaggttgaaatcattcacgacagcagtttatacctgctcgcgctcttgaac
gatattctagatttgaccaaaattgaagagaataaatttgagcttgagtatgcacctcaa
gatttacatagtttactaagcaatattaatacgatgttttccatgcaggctcgcgtcaaa
ggactttcgttcagtttaatagagaatttaccacgcccatttattatcaatgtcgacggt
ttacgtttaaaacaaatattaattaacctgctttctaatgccttaaagtttactgtcagt
ggctacgtaagattagaagttttactggcggatagtcgcttagtattcaatgtagaagac
acaggtatcggtataagcgaagaccagatcgatcttatctttggaagttttacccaagga
gacagcagcatacgccgacgttttggtggttcaggtcttggtttgcacctctctaaccag
ttggccgtattaatgaatggtgagataacggtaaaaagcgaagtagacaaaggcagcgta
tttacctttagtatgcctgcgccaccagttatgtcagcatcggacaagccgagagtaaac
cttaaggtagatgaatcgtcgtctacgcctttgtttaatgggaaaatactgctggctgag
gaccactcagataaccgtcgtttgatatcgcgtttgttaaccaagttaggtttaaccgta
tacacggcagctgatggatttgaggctctggagctttacaaagagcattcgcctgaggtt
gttttgatggatattcaaatgcccagaatggacggtttacaggcttacaaggccttgcgt
gatttgggctgtgaaaaaccgatcattgcgttaactgcaaatgcgatgacaaatgaagtt
gatgaatacttttcgctaggcttcgatggctatattgaaaaaccaattgatcgacagctg
ctgatttcaaccatagcaacgttttttaatgctaatgatgacgattctatgcgcagagct
aattcgatacttggaaatattgatatgtcagatttagtaagcgaatttaaaacaagtctg
ataagtgaacttaagcatttcagcgctgagcaggaaaaacaggatgttaatgctctcaga
gcattagctcaccgactttccggtgcttcatatctatttggctttgctgaattaagccga
aaagcaacgcaactcgaaactaatattaaaaatggaaagctaagcttcctcgagcttgag
ccccaaattgatgaattaattaatgaaattaggcatattataggctaa
DBGET
integrated database retrieval system