KEGG   Gemella sp. oral taxon 928: AXE85_02385
Entry
AXE85_02385       CDS       T04256                                 
Name
(GenBank) internalin
Organism
got  Gemella sp. oral taxon 928
SSDB
Motif
Pfam: Strep_his_triad LRR_4 LRR_8 YcxB LRR_14 LRR_6 CLZ LRR_LRWD1 DUF6584
Other DBs
NCBI-ProteinID: AME09087
LinkDB
Position
complement(541402..545304)
AA seq 1300 aa
MTKNNKKKIIITGACGTVVIGLSAFAGYEYGKYSNNYPHQPIHNIAQAKKINYADKISTV
VVSEITEDGYATLHGDHSHFVKGLVPYNAKILESLVYKDDKYVLKDEDIQYELAQGYVIK
VNGKFYYYPKKGVTQTNVVDEKTAREITAHSHHHSHSEGEKEDNYTFNPKDIVSETADGY
VVRHGDHFHYIKKSDLTAQQLAQAKKHGVNTVLASSTAGITTPTSDGYIFKGERDIIGRN
SLGFIVRHGNHQHFIPYSQLRGTKWEYLLSSPSTPSHNHNNTPSVPSTEDNYTFNPKDVV
SEDENGYIVKHGDHYHYIPKKNNNSNNGTQTPDKPKPNTPTQDDKKDFNSILKFPGIHFT
TSDGFLLSENDKITTTSSGISVKHGKHEHFIYYYQLVNSKFENLIPSEYKDKAKDEYAKL
EQEVTKKINYLARKNNADAKEFHFVVTNEGNAIEFKGKTTLLKDIVIDNTADNTKPNDTD
EDKSLQEKINYLAKSLNIDPSTIKVIDTDKGKALVYPHGDHSHTILAKDIDTSKPIEDPH
HNAGADTLKKLGFDDDIIHDIQHASADTDFPTHETDTEKMKEWLKTVKYLNIGQNKDPLK
RKGLDLMPNIEVLGVGFTPIDDITPVYKFKKLRHLYVSKTGIKDYSFIKNIPTLEGIDFS
ENDVDDISFLKDYPNLKLVAAAGNNIKNIDVLKNLKNLESLNLDNNKISDISALKDLTHL
KAVSLENNNITKLDAFNNKPELSRLFLSNNGGLELATLKNNNLEQLTVNNCNIRDLSVVS
NLPKLKNLVANNNKISTLSHLKNAKSLDSVEVNNNNIDRLDFENNTITSLEIKNNKLDNI
NNIHKLTSLENLDASDNEISELPTNKHNKLVNLTLSNNKITTLENVNNLTALKYLTMSNN
YVSTLVLKEKNKTLEYLDISHNNISKEELTIPSGKKIPKGIADNFEKVDGGDVKDNYTLS
ADYITNEAKKLQEEILKLKNEKKLDSKIADELKQKARLIDLDITYSIDKSKNKLISLEKQ
LNEIRKDVKERLTNNQTSHNNDNQGNQNSHHDENEEHKFEFDVNNIIREEGDGYIVKHGD
HNHFVKKSDLTAEQLEQAKKFLANKENGSTTTDKETLAKKKNYIALFYGIKETDIKVENN
TLVFNYKGTVKRLVLSDITVPAMSDDLEADFEKEITALATSMNTTVEHIQVQDGQMIVNH
GDHNHYYPIKSPGWRLYNQNKIPYIEIPKVKGTIDEAVVNNKITELENKAKVVLAKNPAK
LRKVLAWLNNFREVSLAWHVTATDGYLQALATFEKTQLNG
NT seq 3903 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacaaaaaataataagaaaaaaataattattacaggtgcatgtggtacggttgtcatt
ggattatcagcctttgccggatatgaatatggcaaatattctaataattatcctcatcaa
ccaatccacaacatagcacaagcgaaaaaaataaactatgccgataaaatcagcactgtc
gttgtaagtgaaataactgaagacggttatgctactttacatggtgatcatagccatttt
gtaaaagggcttgtaccatataatgccaaaattttagaatctcttgtttataaagatgat
aaatacgtccttaaagatgaagatattcaatacgaattagctcaaggttatgttattaaa
gtaaatggtaaattttactactaccctaaaaagggagtaacccaaacaaatgttgttgac
gaaaaaactgcaagagaaataacagcacattcacatcatcatagccattccgaaggtgaa
aaagaagataactacacttttaatcctaaagatattgttagtgaaactgctgacggctat
gtagttcgtcacggcgatcacttccactatattaaaaaaagtgatttaaccgcccaacaa
ttagcacaagcaaaaaaacacggtgtcaatacagtattagcatcgtcaacagccggaatt
accacacccacaagtgacggttatattttcaaaggagaacgtgatattataggcagaaat
agtttaggttttatcgttcgtcacggtaatcaccaacactttattccatatagccagtta
cgtggcacaaaatgggaatatctattatcttcaccttcaacaccatctcataatcataat
aacacaccttctgtaccttctacagaagataactacacttttaatcctaaagatgttgtt
tctgaagatgaaaatggttatattgttaaacatggtgaccattatcattatattccgaaa
aaaaataataattccaataacggcacacaaacaccggataaacctaaaccgaatacaccc
acacaagatgacaaaaaagattttaacagcatcttaaaattcccgggaattcattttacc
acaagcgacggatttttattgagcgaaaacgacaaaatcactactacttcttccggaatt
tcagtaaaacatggcaaacatgaacattttatctactattaccaacttgttaatagtaaa
tttgaaaacttaattcctagtgaatataaagataaagcaaaagatgaatatgcaaaactg
gagcaagaagtaactaaaaaaattaattaccttgcacgtaaaaataatgctgatgctaaa
gaatttcattttgttgtgacaaatgaaggtaatgcaattgaatttaaaggtaaaacaacg
ttgttaaaagatattgttatcgacaatacagcagataacacaaaacctaatgacacagat
gaagataaatcactacaagaaaaaatcaattatttagcaaaatcgttaaatatcgaccca
tctactattaaagttattgataccgacaaaggaaaagcattagtatatccgcatggcgat
cacagtcatactatcttagcaaaagacattgatacttctaaaccgatagaagatccacat
cacaatgccggtgccgatacacttaaaaaactaggttttgacgatgatattatccatgat
attcaacatgcttctgcggataccgatttccctactcatgaaactgatacagaaaaaatg
aaagaatggttaaaaactgtcaaatatctaaatataggacaaaataaagacccactaaaa
cgtaaaggtcttgaccttatgcctaacattgaagttcttggtgtaggatttacaccgatt
gacgatattacaccggtttataaattcaaaaaattaagacacttatatgtatcaaaaacc
ggtattaaagactattcatttattaaaaatataccaacactggaaggaattgacttttcc
gaaaatgatgttgatgatatttcgttcttaaaagattatcctaatctaaaattagtagcc
gcagccggaaataatattaaaaatattgatgttcttaaaaatcttaaaaacttggaatca
ttaaaccttgataacaataaaattagcgatatttccgctctaaaagatttaacacactta
aaagcggtaagtttggaaaataataatattacaaaacttgatgcctttaataataaacct
gagttaagtcgcttattcttatctaataacggcggtttagaacttgctacacttaaaaat
aataaccttgaacaattaacggtaaataactgtaatattcgtgatttaagtgttgtttcc
aacctacctaaattaaaaaacttggtagcaaataataataaaatttccaccctttcgcat
cttaaaaatgctaaaagtttagattcagttgaagtaaataacaataatatagatcgttta
gactttgagaacaatactattacaagtttggaaattaaaaacaacaaactggataatatt
aataacatacataaattaacatcacttgaaaatcttgatgcaagcgataatgaaattagc
gaacttccaacaaataaacacaacaaactagttaatttaacactaagtaataacaaaatc
acaacactggaaaatgtgaacaaccttactgcattaaaatatttaacaatgtctaataat
tatgtatcgacactagtgctaaaagaaaaaaacaaaacacttgaatatttagatattagt
cataataatatatcaaaagaagaattaaccattcctagcgggaaaaagattcctaaaggt
atagcagataatttcgaaaaagttgacggcggtgatgttaaagataactacacactatct
gccgattatattaccaatgaagcaaaaaaacttcaagaagaaattttaaaacttaaaaat
gagaaaaaattagattctaaaattgctgacgaattaaaacaaaaagcgcgtctcattgat
cttgatattacatacagtatagataaaagtaaaaataaattaatcagcttagaaaaacaa
cttaatgaaatacgcaaagatgttaaagaacgtttaactaataatcaaacatcgcataat
aatgataatcaaggaaatcaaaactctcaccacgatgaaaacgaagaacataaatttgaa
tttgatgttaataatataattcgtgaagaaggtgacggctatattgtaaaacatggcgat
cacaatcattttgttaaaaaatcggatttaaccgctgaacaattagaacaagctaagaaa
tttttagcaaacaaagaaaacggttcaaccactaccgataaagaaactttagctaaaaag
aaaaattatatcgccctattctacggaataaaagaaactgacattaaagtcgaaaataat
acattagtctttaactacaaaggtactgtcaaacgattggtacttagtgacataaccgtt
ccggcgatgagcgatgacttagaagcagattttgaaaaagaaattaccgcactggctacc
agcatgaatacaacggttgaacatatccaagttcaagacggacaaatgatagttaatcat
ggtgatcacaatcactattatccgataaaaagtccgggatggagattatacaaccaaaat
aaaataccttatattgaaattccaaaagtaaaaggaaccattgatgaagctgttgttaat
aacaaaataaccgaattggaaaacaaagcaaaagtcgttttagctaaaaatcctgctaaa
ttaagaaaagttttagcatggcttaataatttcagagaagtcagcctagcttggcacgta
acagcgaccgatggatatttacaagcactggctacttttgaaaaaactcaattaaatggc
taa

DBGET integrated database retrieval system