Gemella sp. oral taxon 928: AXE85_04850
Help
Entry
AXE85_04850 CDS
T04256
Name
(GenBank) helicase RecD
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
got
Gemella sp. oral taxon 928
Pathway
got03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
got00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
AXE85_04850
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
got03400
]
AXE85_04850
Enzymes [BR:
got01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
AXE85_04850
DNA repair and recombination proteins [BR:
got03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
AXE85_04850
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
HHH_RecD2
UvrD_C_2
OB_YrrC
SH3_13
Viral_helicase1
AAA_11
SLFN-g3_helicase
PhoH
HHH_5
AAA_22
AAA_12
AAA
DEAD
NAT10_TcmA_helicase
UvrD-helicase
nSTAND3
Ribosomal_S13
AAA_29
NPHP3_N
AAA_28
AAA_17
AAA_25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AME09520
LinkDB
All DBs
Position
1072372..1074699
Genome browser
AA seq
775 aa
AA seq
DB search
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YASSIHKAQGSEFDNVIVPFIDSYNFMLNKNLTYTAVTRAKKKLILCGNPNVFYKSIEPT
NTISRQTALEWFFRYNSSDNEFNNKFNEDTILTFKNINIIDPMIGMNDIKPEDFL
NT seq
2328 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gaatttaataataaatttaatgaggatactatactaacttttaaaaatattaatataata
gacccgatgatcggtatgaatgatataaaaccggaagactttctatag
DBGET
integrated database retrieval system
