Paraglaciecola psychrophila: C427_1560
Help
Entry
C427_1560 CDS
T02535
Name
(GenBank) Snf2 family protein
Organism
gps
Paraglaciecola psychrophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
HDA2-3
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGH43669
UniProt:
K7AXC1
LinkDB
All DBs
Position
1466369..1469581
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MFNKTNLQAALSKQTWAKGLRLYQLNHVVSAALDEQVLRGSVRSESKRNETYLTRFEFDE
SKSRAQAYCNCYLKYDCKHAAALAHHYLENMHVSSASNNMIEEWLNKFSTQESLVFQQEK
GLLYFLNQNSYAPNDYLQLGVQSSSLKKNGGWSRTLTYENLDSYLIKQPYVDDQDVQIIS
SVIRSQNYSNAIHSHKLLKLLVSTGRCFWKNGADLSRQISLGESLKANWQWQTRSAVHKL
DLVLEINNPDITLIKSQPISYYNSKTNHLGLVETDLNSEFDVQFLHSPTFSEEKMPWVLS
KLDMTLGDLAQKLPKPKLKKEFTLARPVPHIRLTTPNENQAYNTQLSLLFAYQGHLVSPF
KKQPQLPSQKDEANIYRDFAFEKMIMESLKTWKFIPQLQSITTNKGFDDGYMMMLQGRQL
NLSFLHNQLPQLKKQGWQVEYDDSFHYQELDTDSVFDANVEQKEGHDFFSIGLNLNIDGQ
SVAAFPILISALEQLPKDILLNDQSYIDNDEKVFVNLSGGKFIALRYQSIRPLLKQFVEL
VMPGVLQDDGTMRLSRFQGHQTLSELDNQGIITQGANKLRHLAEKLRNFNAIQPVPIPKL
LLADLREYQHQGLNWLQFLREYELNGILADDMGLGKTIQTLSHLLVEKEQGRLTGPSLII
APTSVLFNWAKEIDKFTPSLSYIVINGAKRQENFETLDQYDIVITSYPLMLKDAEVHQQH
IYYYLILDEAHYIKNPKTKLYKAMLTLKAEHKLCLTGTPMENHLGEFWAQFNFLLPGFLA
GYQQFSRLFKTPIEKHNDHERKVMLNQRIKPFILRRSKTLIAKELPEKTIIIQTLKIEGK
QAELYESVRLTMDSRLKEIIAAKGLQRSQIEILDALLKLRQVCNHPQLLSLPSAKSIKQS
AKLEFLMETLPEMVEEGRNVLIFSQFTSMLALIETELVASNIPYVKLTGSSKNRQEIVEQ
FQSGKVPVFLISLKAGGVGLNLTAADTVIHFDPWWNPAVENQATDRAYRIGQDKPVFVYK
LIIENSIEEKILQIQNKKAELANALLSEEVSQGNLSLTNDILDTLLAPLT
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaacaaaacaaacttgcaagcagctttaagcaaacaaacttgggcaaaaggatta
agactttaccaattgaatcatgttgttagtgccgctttagatgagcaggttctgagaggc
tcggttagaagtgaatctaagcgaaatgaaacgtatttaactcgttttgaattcgatgaa
agtaaaagccgggctcaggcatattgtaattgttatcttaaatatgattgtaaacatgct
gctgcattggcccaccattatcttgaaaatatgcatgttagttcggcatcaaacaacatg
attgaagaatggctgaataagttttcaactcaagaatctttagtattccagcaagaaaaa
ggactgttgtattttcttaaccagaacagttatgcgcctaatgactacttacaactggga
gttcaaagttctagcttaaagaaaaatggtggttggagccgaactttgacctacgaaaat
ttggatagctacttgattaaacaaccttatgtggatgatcaagatgtgcaaattattagc
tccgtgatcagaagtcagaattactctaacgctattcattcgcataagttattaaaattg
ttggtcagtactgggcgatgtttctggaagaatggcgcagatttaagtcgtcagatttct
ttgggagagtctttaaaagcaaactggcagtggcagacacgcagtgcagtgcacaagctt
gatcttgtactagaaataaataatcctgatattacattgataaagtctcagcctattagt
tactacaattctaaaactaatcatttgggattggttgaaacagatttgaatagtgagttt
gatgtgcagtttttgcatagcccgactttttctgaagagaaaatgccttgggtgttaagt
aaattagatatgacacttggtgatttagcacaaaaattaccgaaaccaaaacttaaaaaa
gaatttactttagcccggcccgtgccgcatatacgcttaactacgccgaatgaaaatcaa
gcttataatactcaactctcattgttgtttgcttatcaagggcatcttgttagccctttt
aaaaaacaacctcaattaccctcgcaaaaagatgaagctaacatttatcgcgatttcgct
tttgaaaagatgatcatggagtcgctcaaaacctggaaatttattcctcaattacaatct
atcactacaaataaaggctttgatgatgggtatatgatgatgttgcaagggcgtcagctt
aatttatcctttttacacaatcagttgccacagttgaaaaagcaaggctggcaagtagag
tacgatgatagttttcactatcaagagttagatactgatagtgtatttgatgccaatgtt
gagcaaaaagaagggcatgactttttctccattggtttgaatttaaatatcgatggtcag
agcgtggctgcttttcctatattaatcagtgcattagaacaacttccgaaagatattttg
ctaaacgatcaaagctatatcgataatgacgaaaaggtgtttgttaacctttcaggtgga
aaatttattgcgctgcgttaccagagtattcggcccctacttaaacagtttgttgaatta
gtcatgcctggcgtgctgcaagacgatggcacgatgcgtttgtcacgatttcaaggtcat
caaactctcagtgaattagacaaccaaggcattatcacccaaggtgcgaataaattgcgc
catttggccgagaagttacgtaatttcaacgcgatccagccagtccccattcccaagtta
ttattggcggatttacgtgaatatcaacatcaaggattgaattggttacagtttttgcga
gaatatgagctgaatggtattttggctgacgatatgggcttaggtaaaacgattcaaaca
ctcagtcatttgttagttgaaaaagagcaaggtcggttgaccgggcctagtttaattatt
gcccctaccagtgtgctatttaattgggcgaaagaaatagacaagtttacgcctagcttg
tcttatatcgtaattaatggggccaaacgccaagagaattttgaaacgttagaccaatac
gatattgtgatcaccagttaccctctgatgctaaaagacgctgaagtgcatcagcagcac
atttattactatttgattttagacgaagctcactacattaagaatcctaaaacgaaactc
tataaagcgatgttgacactcaaggccgagcataagctatgtttgacaggtacacccatg
gaaaaccatctgggtgaattttgggctcaatttaactttttactgcctggctttttagcg
ggttatcaacaatttagccgtttgttcaaaacgccaatagaaaaacacaatgatcatgag
cgtaaagttatgctcaatcaacgtatcaaaccctttatattaaggcgcagcaaaacactc
attgcgaaagaacttcctgaaaaaacgattatcatacaaaccctaaaaattgagggaaaa
caagccgagttatatgagtctgtgcgtttaacgatggactctcgtttgaaagaaatcatt
gccgcaaaaggcctacagcgtagtcaaatcgaaattctggatgcgctattaaaattacgt
caagtctgcaatcatccacagttactttctttgccaagcgctaagtcgattaagcaatcc
gctaagttagagtttttgatggaaaccttgccagagatggttgaagagggcagaaacgtg
ctgattttctcgcagtttactagcatgttagcgttaatagaaacagagctagttgcctct
aatataccctatgtaaagctcacaggcagtagcaaaaatcgccaagagatagttgaacaa
tttcagtctggtaaagtgccagtattcttaattagcttaaaagcgggtggagtaggtctg
aatttaacagccgctgatacggtgatccattttgatccttggtggaatcctgcggtagaa
aatcaagctaccgatcgcgcttaccgtattggtcaagataaacccgtatttgtgtataag
ttgattattgaaaattccattgaagaaaaaattctacagatccaaaataaaaaagcagag
ctggctaatgccctattatcagaggaggtaagccaaggtaatctaagtttaaccaatgat
attttagataccttacttgcaccattgacttaa
DBGET
integrated database retrieval system