Paraglaciecola psychrophila: C427_4597
Help
Entry
C427_4597 CDS
T02535
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
gps
Paraglaciecola psychrophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gps00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gps02000
]
C427_4597
Transporters [BR:
gps02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
C427_4597
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
TamB
Porin_7
gag-asp_proteas
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGH46696
UniProt:
K7ATL8
LinkDB
All DBs
Position
complement(4442985..4445159)
Genome browser
AA seq
724 aa
AA seq
DB search
MFKTALILVSTTISLSSLAQSSDLESQEQSIEKIVVNGFKLKQTILETPNSVTVLSRELI
KRANIEDLRDISKVAPNVSVNQIGQVGPTSISIRGIQSNPFVVNRVAVYVDGIPFRDPGT
IQLNNIEQIEILRGPQSTLYGANVNAGIIIINSQAPDGEEGGQIGLKLKAFEGRSTEEVN
GNIYANLNTNLSSIFNFQYEHGDSYVKNIASSIDEQGEINDLALSTRLRYQFNDDTQLNM
IGIYNEIDAPGLYEQEFAPLDIDAYNALYAESFNAGLTVGDFEIANDAPKQTNSKEWALG
LALEKDYDAGVFHVVSSYRNRDDESYGTDLDLTAAAFSAGGTQLKDTFWNLETRFNSADD
EVVQWVIGLNYLYQKRTRKLSTLIGPGNIDDFSPAPEQRFDAKDTAIFGQVIYPLTDQLN
MTFGLRHELASREIEQDAGELDLGALGVFGFPEVAQSEQDKTLIPKFSLSYVFDNELSVY
TTMTKGYLPGNYNLVVAGNGADIANEFGSYDKEQLWSYEIGSKGYLFQNKLFFSVAAFYI
DANTWQENRILTDAEGRVLSTNLISSDAAIKSQGLEAELSGYLTKKLSINLGFGYTDAQY
KDYPFTSTQNLKGNSVYLIPKFDAYLGLIYRFTDHWYVQADLQAIGKTPLNPEGTAVRDM
QYIGGLSAGYETDKWSVSINVENISNQRYAAGQAYQNFLFGDDGNFYAPLASPRMIGLAV
KMTF
NT seq
2175 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcaaaacagcacttatattagtcagcaccactataagcctaagcagcctcgctcag
tcttctgaccttgaaagccaagaacagagtattgaaaaaattgtcgtgaatggttttaag
ctcaaacaaactatccttgaaacgcctaattcggtcactgtattgagtcgtgaactcatc
aaaagggctaatattgaagatctcagggatataagtaaagttgcacctaacgtctcggtc
aatcaaattggtcaggtgggcccaacatcgatttctattcgaggtattcaatctaacccg
ttcgtcgttaaccgagtggcggtttatgtagacggtattccatttcgtgatcctggcacg
atacaacttaataatatcgaacaaattgaaattttacgtggcccgcaaagtaccttatac
ggcgctaatgttaatgccggaattattattattaactcacaagcgcctgatggtgaagaa
ggtgggcagatagggttaaaactaaaggcttttgaaggacgcagcactgaagaagtaaat
ggtaatatttacgctaatctgaataccaatttaagcagcatatttaattttcaatatgaa
catggtgatagctatgtgaaaaatatcgctagctctattgatgaacagggagaaattaat
gatttagccctaagtaccagacttcgttatcaatttaacgatgatacacaactgaatatg
ataggtatttataacgaaattgatgccccaggtctttatgaacaagagtttgcccccttg
gatatcgacgcttataacgcactgtatgctgagtcttttaatgcagggctgacagtaggt
gattttgaaattgccaacgatgcgcccaaacaaaccaattcaaaagagtgggcgttaggg
ttagcgttagaaaaagattatgatgccggcgtttttcatgtggtgagcagctatcgtaat
agagacgatgaatcttatggtactgatttagacctcactgcggccgcttttagtgcaggg
gggactcagttaaaagatactttttggaacctagaaacacgttttaacagtgcagatgat
gaagtggttcaatgggtaattggccttaattacctctatcaaaaacgaacacgtaaatta
tcgacattaataggacctggtaacatcgatgacttttctcccgctccagaacaacgcttt
gacgcaaaagacaccgcaattttcggacaggttatttatcctctgacggatcaacttaac
atgacgtttggtcttcgccacgaattagcatcacgtgagattgagcaagatgcaggcgaa
ctggatttgggcgcactcggtgtgtttggttttcctgaagtcgcacaaagtgagcaggat
aaaactcttattcctaaattctctctaagttatgtatttgataatgagctgagtgtttac
accacaatgaccaaaggttacctacctggcaattacaacctagttgtagctggtaatggc
gctgacattgcaaatgaatttggcagttatgacaaagagcaactctggtcttacgaaata
ggcagcaaagggtatctattccagaacaaattattcttttctgtcgcggcattttatatc
gatgctaacacttggcaggagaatcgtattttaaccgatgctgaaggtcgagttttatca
accaatctgattagctcagatgcagcaataaaaagccaaggtttggaggctgaactgtct
ggatatctgactaaaaagctctccattaatttagggtttggttacaccgatgcccagtac
aaggattatccatttacttctactcaaaacctgaaaggtaatagtgtctacttaataccg
aaatttgatgcctatctaggcctgatttaccgattcacagaccattggtatgtgcaagca
gacttgcaagcaatcggaaaaacgccacttaatccagaaggaactgcggtcagagatatg
caatatattggtgggctgtcagcaggctatgaaacagataaatggtcagtgtcaataaat
gtggaaaatataagtaaccaacgatatgcagcgggacaggcataccagaactttctattt
ggagatgatggtaatttctatgcgcctttggcttcacctagaatgatcgggttggctgta
aaaatgacgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
