Gossypium raimondii: 105776247
Help
Entry
105776247 CDS
T04129
Name
(RefSeq) clathrin interactor EPSIN 3 isoform X1
KO
K12471
epsin
Organism
gra
Gossypium raimondii
Pathway
gra04144
Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gra00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
105776247
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
gra04131
]
105776247
Membrane trafficking [BR:
gra04131
]
Endocytosis
Clathrin-mediated endocytosis
Other core components
105776247
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ENTH
ANTH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105776247
NCBI-ProteinID:
XP_012454257
UniProt:
A0A0D2RMF5
LinkDB
All DBs
Position
10:23360925..23369444
Genome browser
AA seq
1139 aa
AA seq
DB search
MKKALGQTVRDLKRGVNKKVLKVPGIEQKVLDATSNEPWGPHGSLLADIAMATRNYHEYQ
IIMAVIWKRISDTGKNWRHVYKGLTVLEHLVAHGSERVIDDIREHAYQISSLSDFQYIDS
SGRDQGSNIRKKSQSLVVLVNDKERIIEVRQKAAANKDKFRSTSTGGMNRAGLGGQGDRY
DYDYQYGYRDDDRYGRYTDSNSRDGDRYSRDNEDRYGRDGYRDDDYKGRSTSVDGDQYGT
RSRSSDRDRAFDDDGDSSRGSNARADDYSQDGSFYRRHEQKFSEQNNGAPPSYEAVNESH
SPVHSERDGETSVAAAPRSSSPPASNNPNLATSDFGNLASPSNKNVEAFNAFDPRVSVSA
ASAGAPVSTPAPAPPTASTSSEIDLLGALSDSWAVVPTLSETPAAEADAHAKGSIPSFAA
NPSASNSGNQGFDDPFGDGPFKAFPSGDAASAQQQISTPATTFQATMSQIMEASQPPSVK
SEIVTGFDFGESFSASAYSTLNASNSQPPSGNSQFLPQDLSDPNQEDDILAEILPPSGPA
NDVASHTVFSAPSSQSSLPVATYGQHAQSGANMYQPAQPSANPHGQLAQPSANPYGQNGQ
PSANPYGQPAQPSANPYGQNGQPSANPYGQPAQPSANPYGQNGHSSANPYGQPVQPSANP
YSQNGQPSANPYGLPAQPSANPYGQSSANPYGQPTQPNAIPYGQSAQPNANPYGQPAQPN
ANPYSQPVQVHANPYGQPAQPNANPYSQPTQPNANPYSQPTQPNANPYGQPVQPSANPYA
QPTQSVSAAPQIPGSAAQSSNGSLMIGSNGPLCSQMAAQPPSPAAPATQFNTGSFISQQG
SAVPVESQSAPQTTNDSGAHNNSDVLGGFFSQPGSNTSVAPQTATPSSIGALAIVPQPSK
DKFEPKSAVWADTLSRGLVNLNISGPKTNPLSDIGVDFDAINRKEKRLEKPAPTAVTSTV
TMGKAMGSGSGIGRAGASVLRAPANPMVGSGMGMGMGGGPVGGVGMGGYGGMNQQPMGMG
MGMNMGMNPGMGMNNMGMNPGMGMSNMGMNPGMGMSNMGMNQGMGMNMGMNPGMGMNNMG
MNRGMEMNNIGMSAGMGMNMGMGQATHMQSQSGMPGGYNPMMGSSAYSQQPHGGDGGYR
NT seq
3420 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaggccttgggccaaactgttagagaccttaagagaggagttaataagaaagtt
cttaaagttcctggaatagagcagaaggttcttgatgccaccagcaatgagccctggggt
cctcatgggtcacttcttgcagatattgcaatggctactagaaactatcatgaataccag
ataatcatggcagtaatctggaaacgtataagtgacactggaaagaattggcgtcatgtc
tacaagggtctgactgttttggagcaccttgttgcccatggatcagagcgtgtcatagat
gacataagagaacacgcatatcaaatatcaagtttgtccgactttcagtacattgattcc
agtggaagggaccagggtagcaatattcgaaaaaaatctcagagccttgtggttcttgta
aatgataaagaaaggataattgaagtaagacagaaggctgcagccaacaaggacaagttt
cggagcacatcaacaggtggaatgaatagggcaggtttggggggacagggggacagatat
gattatgattatcaatatggttatagagatgatgatcggtatggtagatatacagattca
aacagtcgtgatggagatcgctacagcagagataatgaagatcgctatggcagggatggt
tacagggatgatgactacaaaggtagaagtacaagtgttgatggtgatcaatatggcacc
agaagtaggagctctgatagagaccgtgcttttgatgatgatggtgattcatcacggggc
agcaatgctagagctgatgattattctcaggatggaagtttctataggcggcatgagcag
aagttctctgaacaaaataatggtgctcctcctagttatgaagcagtaaatgaatctcat
agtcctgtccatagtgaaagggatggagaaacttcagtagcagctgctcccaggtcatct
tctcctcctgctagcaataatcctaacctagcaacgtctgattttggtaatttagcatct
ccttcaaataaaaatgtggaggctttcaatgcttttgatccacgtgtttcagtttcagct
gcctctgccggtgctcctgtttctacacctgcccctgctcctcccactgcttcaaccagt
tctgaaatagacttactcggtgcactgtcagattcatgggcggttgtgccaactctatct
gaaacccctgctgctgaggctgatgcccatgctaaaggttctataccctcctttgctgct
aatccatcagcatctaactccggaaatcagggttttgatgatccatttggtgatggtcca
tttaaagctttcccttcaggggatgctgcctcagctcagcaacaaatatcgactcccgcg
actactttccaggctacaatgagccaaattatggaagcatctcagccaccttctgtaaaa
tctgagattgtcacaggctttgacttcggggaatcattctctgccagtgcttactccact
ctcaatgcctcaaacagtcaacctccctcaggaaattcacagtttttgcctcaagatttg
tcggatccaaatcaggaagatgatatattggcagaaatccttccaccctctggacctgca
aatgatgtagcttcacatacagtcttttcagcaccatccagccaatcatcactacctgta
gctacttatggccagcatgcacaatcaggtgctaatatgtaccaacccgcgcagccaagt
gcaaatccacatggccagcttgctcagcccagtgctaatccatatggccaaaatgggcaa
ccaagtgctaatccctatggccagcctgcgcagcccagtgctaatccatatggccaaaat
gggcaaccaagtgctaatccctatggccagcctgcgcagcccagtgctaacccatatggc
caaaatgggcactcaagtgctaatccctatggccagcctgtgcagcccagtgctaaccca
tacagccaaaacgggcagccaagtgctaatccctatggcctgcctgctcaacccagtgca
aacccatatggccagtcaagtgctaatccctatggccagccaacacaaccaaatgctatt
ccttatggtcaatctgcacaaccaaatgctaatccgtatggtcaacctgcacaaccaaat
gctaatccatacagccaacctgtacaggtacatgctaatccatatggccaacctgctcag
ccgaatgctaatccatacagccagcctacacagccgaatgctaatccatacagccagcct
acacagccgaatgctaatccatacggccaacctgtacagccaagtgctaatccatatgcc
caacccacacagtctgtatctgcagcccctcaaattccaggatctgctgctcagagcagc
aatgggagcttaatgataggttctaatggtcctctctgttcacaaatggctgctcaacct
ccaagtcctgctgcaccagctactcagtttaacactggaagctttatttcacagcagggt
tctgctgtgccagttgagtcgcagagtgctcctcaaaccacaaacgattcaggtgcacat
aataacagtgatgtcctgggaggctttttttcacaaccaggatcgaacacttcagtggcg
ccacagactgctactccctcatcaataggagcacttgctatagttccgcaaccctcgaag
gataaatttgagcccaagtcagcagtttgggctgatacattgagcagaggactggtcaat
ttgaatatatctggacctaaaacaaacccactgtctgatattggagttgactttgatgct
attaatcggaaggaaaagaggttggaaaagcctgccccaactgcagtaacgtctactgtc
acaatgggtaaagctatgggatctggttctggaattggccgtgctggtgctagtgttctc
agagctccagcaaatcctatggtgggttccggcatgggtatgggaatgggtggtggtcct
gttggaggtgttggcatgggaggctacggtggtatgaatcaacaacctatgggcatggga
atggggatgaacatgggtatgaacccaggcatggggatgaacaacatgggcatgaatcca
ggcatggggatgagcaatatgggcatgaatccaggcatggggatgagcaatatgggcatg
aatcaaggcatggggatgaacatgggcatgaatccaggcatggggatgaacaacatgggc
atgaatcgaggcatggagatgaacaatataggcatgagcgcaggcatggggatgaacatg
ggaatggggcaggcaacccacatgcaatcacaaagtgggatgcctggcggttacaaccct
atgatgggttccagtgcctactctcaacagccacatggtggtgatggtggttaccggtga
DBGET
integrated database retrieval system
