Gossypium raimondii: 105785845
Help
Entry
105785845 CDS
T04129
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC105785845 isoform X1
Organism
gra
Gossypium raimondii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
105785845
NCBI-ProteinID:
XP_052489815
LinkDB
All DBs
Position
1:40949101..40961730
Genome browser
AA seq
2889 aa
AA seq
DB search
MMISKHFFHVLSIVLFLSFSFPYAHFTGIDQDSTNLHPLPVSLGSSSFSSSGSFKHSSSS
HASQSFKSSHSLKSSENHGDASGHGSSSMSHSSSASGSSSHSSSSSHSGSFKSSGSFKGS
SSPVDSNNSKDSGLGHGDSSSSTTSSSLSGSSHSKASNSLSHSSSSSHSGSWKGSSSFED
SNNSKDSSLGHGDSRSSGTSSSLSGSSHSKSSSSLSHSSSSSHYGSWKGSSSFGDSNKSK
DSSSAMATHSSLGSGDNFSKSKGSDSSETSKSGNSSSLSGSINSMGSNSSKTFNSALGST
ASNSSKSSSSNNSKDSSSATASGSSSSLGSSNSKASGLSAHSSFEKHGGATGHGSSSLSH
SVSASGSSSHSGSYSHSSSSSHSSSFKHSNSGSSSSSTNSGSNNSKDSSSDAASHSSLSQ
GASNTVSSSSSHSNSLNHGGSTSHGSSSLSHSSSTSGSSSKSSLSSHSGSSATNSSTNSG
SNNSKDSDSTTTSQSSLNHKASNSSASSSSLSGSSNYKVSGLSANSSSSSHSGSSAANSS
INSGSNHSKDSDSTTASQSSLNHGASSSSTSSDSLSGSNSSKAFGSSSDSSSFKHSGSGA
SNSSTNIGSNNSNDSVSTAASQSTLNRGASNSSSSSGSLSGSSNYKAYGSSSNSISSSHS
GSFNHFGSIAGNSSTNSGSNSSKGSDSTTASQSSLNHKASNSSASSGSLSGSRNYKASSS
SSNSSLSSHSGSFKHSGSSAANSSTNSGLNNSKDSSPTTASKSSLEHEASGSSTSSGSLS
GSSNSKASGFSSHSNSINHGGATGHSSFSLSHSSSASHSSSYSHSGSFEHSGSFKGSGSS
VDSSNSKDSGSGATHSSSSSGASGSSTSSSSLSGLNNSTNSKTSDSSLSHDASGSSTSLG
SNNSKDSKSSSNSGTSSSSADSNSLSGFNNSKGSGSFQTSNSSSNLSASGSSTGSNSLSN
SNNSKGSNNSKSSKTSSSSSDLDASSSSKGFGSDNSQSSDSSQTSQAGSSGSTTGLGSLS
SSNNSKSSDSSKTSNSSSSYDAHGSGSGSVSSSNNSKGFGSSKTSGSSSGSNRYKSSMSD
SSVCGNSKSSRTKNTSACTGTSSSVTDGSTTSTPPPSPPKGDGYSKASSSSSGSEGYKSS
TSDSSVSGNSKASSTKNESASMGTDASATNGSTTFIPTSPSTGSDGSKSSTSNPSGTTTS
VTNGPTASTPSSSPSTGVSSFTTNSHKGSGHTSSSNFAHSSSFTASGHSSASHSYGFKAS
GSSSGSEGYKSSTSDSPVSGNSKASSTKNESASMGTNASATNGSTTFIPTSPSTGSDGSK
SSTSNPSGTTTSVTNGPTASTPSSSPSTGVSSFTTNSHKGSGHTSSSNFAHSGSSTASGH
SSESHSYGFKASGSSSGSEGYKSSTSDSPVSGNSKASSTKNESASMGTNASATNGSTTFI
PTSPSTGSDGSKSSTSNPSGTSTSVTNGPTASTPSSSPSTGVSSFTTNSHKGSGHTSSSN
FAHSGSFTASGHSSASHSYGFKASGSSSGSEGYKSSTSDSSVSGNSKASSTKNESASMGT
DASATNGSTTFIPTSPSTGSDGSKSSTSNPSGTSTSVTNGPTASTPSSSPSTGVSSFTTN
NHKGSGHTSSSNFAHSGSFTASGHSSASHSYGFKASGSSSGSEGYKSSTSDSSVSGNSKA
SSTKNESASMGTNASATNGSTTFIPTSPSTVGSDGSKSSTSNPSATSTKDTDASTGTSTS
VTNGPTASTPSSSPSRDSGHSSASHSSGFKASGSSSGSEGSKSSTSDSSVSGNSKASSTK
NESASMGTNASATNGPTTFIPTSPSTGSEGSKSSTSNPSGTSTSMTNGPTASTPPSSPST
GVSSFTTNSHKGFGHTSSSNVAHSGSFTASSHSSASHSSGFKTPGSSTSTSSSMANGPTT
SGHTPSPSESTISSTNSGSSVGIGSSTSSHSTTSNESGSKTSGFSTNTDSSENNGHKSFS
STLSPSTGTSSHHTNNPITSHHTDLGLSAHTSSFFTSSGSSTSNDFGSKNSGSSLNTSSS
TPFGSSSSPSTSIGSPESNSHMASNHSNSDYSKHTGSSTTSGHSSTGNSFGSKTSSSSTN
IGSATTDGHTATGSTLSASSGSSSHKTNSHMTSSHTKSSSSTHTGSSSHTGSLTTSGSKT
SGSSTNTGSATTDGSATTGSILSHSSGSSSHKTNSHMSSGHTKSGSSTHTGSSKHTGSFT
TSGSKTSGSSTSTGSTTTNGHATTGSATIDGHETTSSISSHSSGSSSHKTNSHSTSAPTK
SCSCTCTPTDSSNHTGSATTDGHTTTGSISSHSSGSSSHKTNSHTTSAHTKSGSSTHTGS
SKHTGSFKTSGSKISGSSTNTGSATTGGHTTTGSISSHSSGSTSHKSNSHTTSTHTKSGS
STHTGSSKHTGSFTTSGHSSTSSDFGSKTSGSSKSTSSSKNNDHVTSGSTSSPSIDYSSP
MTSSTTTSGHTNSESSTSNNFGSKTSGSFRGTNSYDAPGSTNLGISTSSDISMGSGSSKS
SSLENQFSGTFSKVFAFGDSYTDTGNAQSLGILKDFASAFLSSFFQTIDSNLHFEGRSSN
GRLVIDFLCDSLNISLLPPFEVASKNSSINEDCGVNFAVGGSTSLSGDFFTNHKITNNLL
WQGTPLGFQTQIEWFNQFVTKKACNGETVEQCKEQMGNNLVWLGQMGADDFARVIGSSIS
LRWLTDITLGQISKILTTVLDSGARFIVVQGLPPLGCWPLAKLLTPHFAKDEMGCSAVIN
KAIMAHNDLLQKTLEEFRRNYPNATIAYADYFNAFKTVMGNLTEFGFSDGSGACCGVGGG
LNFNLNNLCGMDGTNTCSNPNAYIHWDGIHLTEAMNKQIARLFLLEGFCQPSFVDLIKRH
QSLLQPSLQ
NT seq
8670 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgatttcaaagcatttttttcatgttttatctattgttctcttcttatcattttca
tttccatatgcacatttcacagggattgatcaagattcaaccaaccttcacccacttcca
gtaagcttgggttctagttctttttcaagttccggctcttttaagcattcaagttcttcc
catgcctcccagtcatttaagagttcgcactctttaaagagctctgaaaatcatggtgat
gcttcaggtcatggctcttcctctatgtcacattcaagttcagcttctggctcatcttca
cattctagttcatcttcacattctggatcttttaagagttcaggttcatttaaaggttct
agctctcccgtagattctaataattctaaagattccggtttaggtcatggggattctagt
tcctctacaacttctagttctttatcaggttctagccattctaaagcttctaactcattg
tcacattctagttcatcttcacattctggttcttggaagggttctagctcattcgaagat
tctaacaattctaaggattctagtttaggtcatggggattctagatcctctggaacttct
agttctttatcaggttctagccattccaaatcttccagctcattgtcacattctagttca
tcttcacattatggttcttggaagggttctagctcattcggagattctaacaagtctaag
gattctagttctgctatggctactcactcttcattaggttctggagataattttagcaaa
tctaagggttctgactcatctgaaacttctaagtctggcaactctagttccttatcaggt
tccatcaattcaatgggttctaactcttctaagacttttaactctgcattaggttctact
gcatctaactcttccaaaagctcaagttctaacaattctaaagattctagttctgctaca
gcttctggttcttcttcaagtttaggttctagcaactctaaggcttctggcttatcagca
cattcaagttttgaaaaacatggtggtgctacgggtcatggctcttcctctttatcgcat
tcagtttcagcttcaggctcatcttcacattcaggttcatattcacattctagttcttct
tcacattcaagttcttttaagcattcaaattctggttcttctagctcttctacaaactcg
ggttccaacaattctaaggattctagttctgatgcggcttctcactcttcgttgagtcaa
ggggcttctaatacagtttctagttcatcatcacattccaattctctaaatcatggtggt
tccacgagtcatggttcttcctctttatcacattcaagttcaacttctggatcatcctca
aaatctagtttatcttcacattccggttctagtgctactaactcatccacaaactcgggt
tccaacaattctaaggattctgattctactacaacttctcagtcttcattaaatcataag
gcttctaattcctctgcaagttctagttctttatcaggttctagcaattataaggtttca
ggcttatccgcaaattccagttcatcttcacattctggttctagtgctgctaactcatcc
ataaactcaggttctaaccattctaaggattctgattctacaacggcttctcagtcttca
ttaaatcatggggcttctagttcctccacaagttctgattctttatcaggttctaatagt
tctaaggcttttggctcatcttcagactccagttcttttaagcattctggttctggtgct
tctaactcttccacaaacataggttccaacaattctaatgattctgtttctactgcggct
tctcagtctacattaaatcgtggggcttctaattcctcttcaagttctggttctttatca
ggttctagcaattataaggcttatgggtcatcctcaaattctatttcatcttcgcattct
ggttcttttaatcattttggttctattgctggtaactcctccacaaactcaggttccaac
agttctaagggttctgattctactacggcttctcagtcttcattaaaccataaggcttct
aattcctctgcaagttctggttctttatcaggttctagaaattataaggcttcaagctca
tcctcaaattctagtttatcttcgcattctggttcttttaagcattctggttctagtgct
gctaactcatccacaaattctggtttgaacaattctaaggattctagtcctacaacggct
tctaagtcttcattagaacatgaggcttctggttcctctacaagttctggttctctgtca
ggttctagtaattctaaggcttctggcttttcatcacattccaattctataaatcatggt
ggtgctacaggtcacagctccttctctttgtcacattcaagttcagcttcacattctagt
tcatattcacattctggttcctttgagcattcgggttcttttaagggttctggctcttcc
gtggattctagcaattctaaggattctggttctggtgcgactcactcttcatcaagttct
ggggcttctggttcttctacaagttccagttctttatcaggtttgaataattcgacaaat
tctaagacttcagactcttctttaagtcatgatgcttcaggctcttccacaagtttaggt
tctaacaattccaaggattcaaaatcttcatcaaattctggtacttctagctcttctgca
gactccaattctttatcaggttttaacaattctaaggggtctggatcttttcaaacttca
aactcttcatcaaatcttagtgcatcgggttcctccacagggtcgaattctttatcaaat
tcgaacaattctaaaggttctaacaattctaagagttccaaaacttctagctcttcatcc
gaccttgatgcttctagctcttccaaaggattcggttctgacaattctcaaagttctgac
tcttctcaaacttcacaagctggttcttccggctctaccacaggattagggtcattatca
agttcaaacaattctaagagttctgactcttctaagacttcaaactcgtcatctagttat
gatgctcatggttctgggtctggttctgtatcaagttccaacaattctaaaggttttgga
tcttcaaaaacttcaggctcctcgtcaggttctaaccgatataagtcttcaatgagtgac
tcttcagtttgtggtaattccaagtcttctagaactaaaaatacgagtgcttgcacaggc
actagttcttctgtgactgatggttctactacttcaactcctcctcctagccctccaaaa
ggtgatggatattctaaagcatcaagctcctcatcaggttctgaaggatataagtcttct
acgagtgactcttcagtgtctggtaattctaaggcttcaagtactaaaaatgaaagtgct
tccatgggtaccgatgcttcagcgactaatggttctacgacttttattcctacgagccct
tccacaggttctgacggatcaaagtcttctacaagtaacccttcaggcactactacttca
gtgacaaatggtcctacagcttctactccttcttcgagcccttccacaggcgttagttct
ttcacaactaatagccataagggatctggtcatacaagttcaagcaattttgctcactct
agttcgtttacagcttctggtcactcttccgcaagtcatagttatggttttaaagcttca
ggctcctcatcaggttctgaaggatataagtcttctacgagtgattctccagtgtctggt
aattctaaggcttcaagtactaaaaatgaaagtgcttccatgggtaccaatgcttcagcg
actaatggttctacgacttttattcctacgagcccttccacaggttctgacggatcaaag
tcttctacaagtaacccttcaggcactactacttcagtgacaaatggtcctacagcttct
actccttcttcgagcccttccacaggcgttagttctttcacaactaatagccataaggga
tctggtcatacaagttcaagcaattttgctcactctggttcgtctacagcttctggtcac
tcttccgaaagtcatagttatggttttaaagcttcaggctcctcatcaggttctgaagga
tataagtcttctacgagtgattctccagtgtctggtaattctaaggcttcaagtactaaa
aatgaaagtgcttccatgggtaccaatgcttcagcgactaatggttctacgacttttatt
cctacgagcccttccacaggttctgacggatcaaagtcttctacaagtaacccttcaggc
actagtacttcagtgacaaatggtcctacagcttctactccttcttcgagcccttccacc
ggcgttagttctttcacaactaatagccataagggatctggtcatacaagttcaagcaat
tttgctcactctggttcgtttacagcttctggtcactcttccgcaagtcatagttatggt
tttaaagcttcaggctcctcatcaggttctgaaggatataagtcttctacgagtgattct
tcagtgtctggtaattctaaggcttcaagtactaaaaatgaaagtgcttccatgggtacc
gatgcttcagcgactaatggttctacgacttttattcctacgagcccttccacaggttct
gacggatctaagtcttctacaagtaacccatcaggcactagtacttcagtgacaaatggt
cctacagcttctactccttcttcgagcccttccacaggtgttagttctttcacaactaat
aaccataagggatctggtcatacaagttcaagcaattttgctcactctggttcgtttaca
gcttctggtcactcttccgcaagtcatagttatggttttaaagcttcaggctcttcatca
ggttctgaaggatataagtcttctacgagtgattcttcagtgtctggtaattctaaggct
tcaagtactaaaaatgaaagtgcttccatgggtaccaatgcttcagcgactaatggttct
acgacttttattcctacgagcccttccacagtaggttctgacggatctaagtcttctaca
agtaacccttcagcaactagtactaaagatacggatgcttccacgggcactagtacttca
gtgacaaacggtcctacagcttctaccccttcttcgagtccttccagagattctggtcac
tcttctgcaagtcatagttctggttttaaagcttcaggctcctcatcaggttctgaagga
tctaagtcttctacaagtgactcttcagtttctggtaattctaaggcttcaagtactaaa
aatgaaagtgcttccatgggtaccaatgcttcagcgactaacggtcctacgacttttatt
cctactagcccttccacaggttctgaaggatctaagtcttctacaagtaacccttcaggc
actagtacttcaatgacaaatggtcctacagcttctactcctccttcgagcccttccaca
ggcgttagttctttcacaactaatagccataagggatttggtcatacaagttcaagcaat
gtcgctcactctggctcgtttacagcttctagtcactcttccgcaagtcatagttctggt
tttaaaactccaggttcttccacaagtactagttcgtctatggctaatggacctaccact
tctggtcatactccaagcccttctgaaagtactatttcttctacaaattcaggctcttca
gttggcattggttcttcaacttctagtcactctaccacaagcaatgagtccggctctaaa
acttcaggcttctccacaaacaccgattcttctgagaataatggtcataagagttttagt
tctactttgagtccctccacaggtactagttctcatcatactaataaccctataacttct
catcatacagatttaggcttgtctgcacacaccagttctttttttacttctagtggctct
tcaacaagcaatgattttggttctaaaaattcaggctcctccctgaacactagttcttct
acgcctttcggttcttcttcaagcccatctacaagtataggttctcctgagagtaatagt
catatggcttctaatcattcaaactcggactattctaaacacactggttcttctacaact
tctggccactcttccactggcaatagttttggttccaaaacttcaagctcttccacgaac
attggttctgctacgactgatggccatacagctaccggttctactttgagcgcctcttca
ggttctagttctcataagactaatagtcacatgacttctagtcatacaaaatctagttct
tccacacacaccggttcttccagtcacactggttctttgacaacctctggttccaaaact
tcaggctcttccacaaacactggttctgctacgactgatggcagtgcaactactggttct
attttaagccactcttcaggttctagttctcataagactaatagtcacatgagttccggt
catacaaaatcaggctcttctacacacacaggttcatccaaacacactggttctttcaca
acatctggttccaaaacttcaggctcttccactagcactggttctactacgactaatggc
catgcaactactggttctgctacgattgatggccatgaaactactagttctatttcaagc
cactcttcaggttctagttctcataagactaatagtcacagcacttctgctcctacaaaa
tcttgctcttgcacttgcacgcccaccgactcttccaatcacactggttctgctacaact
gatggccatacaactactggttctatttcgagccactcttcaggttctagttctcataag
actaacagtcacacgacatctgctcatacaaaatctggctcttctacacacacaggttcc
tccaaacacacaggttctttcaaaacctctggttctaaaatttcaggctcttccacaaac
actggttctgctacgactggtggccatacaactactggttctatttcgagccattcttct
ggttctacttctcataagagtaatagtcacacgacttctactcatacaaaatccggctct
tctacacacacaggttcttccaaacacactggttctttcacaacctctggtcactcttcc
acaagtagtgattttggttctaaaacatcaggctcctccaaaagcactagttcttctaag
aataatgatcatgtgacttctggttctacttcgagcccttccatagattacagttctcct
atgactagtagtactacaacttccggtcatacaaattcagaatcttccacaagcaataat
tttggttctaaaacttcgggctcttttagaggcaccaattcttatgatgctcctggttct
acaaacttgggcatttctacaagttctgatatttctatgggttctggctcttctaagagt
tctagtcttgaaaaccaatttagtggtactttttccaaagtttttgcttttggagactca
tatacagacacaggaaatgctcaatcattaggcattttgaaagacttcgcgagtgcattc
ttatcaagcttttttcaaacaatagattcaaacctccattttgagggtagatcaagtaat
ggtcgcttggttattgatttcctttgtgattctctcaacatatccctgttgccaccattt
gaagtggcttccaaaaactctagtatcaatgaagactgtggagtgaactttgcagtggga
ggttcgacatctctttcaggtgatttttttactaatcataaaatcaccaataacttgttg
tggcaaggcactccattaggtttccaaactcaaatagaatggttcaaccagtttgtcaca
aaaaaagcctgcaatggggaaacagtcgaacaatgcaaggaacaaatgggaaacaacctc
gtttggcttgggcaaatgggtgcagatgactttgctcgtgttatagggtcttctatttca
ttgcgttggcttacagatataactctcggtcaaatctccaaaatccttacgacggtgttg
gatagtggcgcaaggttcatcgtggttcaaggactaccgccactagggtgttggccatta
gcaaaattattgactccccactttgccaaggatgaaatgggttgttctgcagttatcaac
aaagcaataatggctcacaatgacctcttacagaagacattagaagaatttcgtagaaac
tatcccaatgctacaattgcatatgctgattatttcaacgcattcaagacagtcatggga
aacctcactgagtttggcttttcagatggatccggtgcatgttgcggcgttggaggtgga
cttaacttcaacttgaacaatctatgtggcatggatggcaccaacacttgtagtaacccg
aatgcttacatccactgggatggaattcatcttacagaagcaatgaacaaacaaattgct
cgtctcttcctccttgaaggcttctgtcaaccatcttttgttgatctaataaaaaggcat
caaagcttacttcaaccctctcttcagtag
DBGET
integrated database retrieval system
