Gossypium raimondii: 105789028
Help
Entry
105789028 CDS
T04129
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
gra
Gossypium raimondii
Pathway
gra03015
mRNA surveillance pathway
gra03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gra00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
105789028
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
105789028
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
gra03041
]
105789028
Spliceosome [BR:
gra03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
105789028
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105789028
NCBI-ProteinID:
XP_012471680
UniProt:
A0A0D2MP34
LinkDB
All DBs
Position
2:44306411..44309464
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MYGQDGDEAAPPSYGGGYGVSGGYGGGGGGYGGGGRGGSGGHGGRGGGGRGGGGGYGGGY
QNRGGGGGYQGGERAGRGGGGRGGGRGGSGRDGDWLCPNPSCGNLNFARRVECNKCGAPS
PAGAGGDRGSGSTGGGYSRGGGGGYGGNRGGRDGGRGGYDSGRNNNYDGGRGGNNDNRSS
GSRGGSYGSSQGVEDSGYGQVPPPAPNSYGGNYPPAPNTYGGNANYGMDSVPPPTSYTGG
PTSYPPSYGGPVGGYAGEGLSDARTGGRGGPPGGYDGGYGSGGPRNQGGGYGGPPVEAPA
KIKQCDGNCGDSCDNSRIYITNLPPDVTIEELRDLFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIK
IYTDEKGNQKGDAVLSYEDPQAAHSAGGFFHNHVMRGYAIGVAMAEKTAPKVYDHGGGKG
GYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHHHGGNRSRPY
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggtcaagacggagacgaagctgctccgccttcatatggaggtggttacggcgtt
tctggaggctatggaggcggcggcgggggttatggtggaggcggacgaggtggaagtgga
ggtcatgggggtcgaggtggaggcggcagaggaggtggtggaggatatggcggtggttat
caaaatcgaggaggcggtggaggttatcaaggaggagagcgtgctggaagaggtggcggc
ggaagaggtggtggccgtggtggaagcggccgtgatggtgattggctttgccctaacccc
agctgtgggaacttgaactttgcaagaagagttgaatgtaacaaatgcggtgcaccatct
cctgcgggtgctggtggtgatcgtggtagtggtagtactggtggtggttatagcagaggt
ggtggtgggggatatggcggtaatcgtggaggtagagatgggggtagaggtggttatgat
agtggtaggaataacaactatgatggaggcagaggtggaaacaatgataatagaagcagt
ggtagtagaggtggttcttatggaagtagtcaaggggtagaagatagtgggtatggtcaa
gttcctcctccagcacccaattcttatggtgggaattatccacctgctcctaatacatat
ggtgggaatgcaaattatggaatggattcagtccctccacctacaagctatactggtgga
cctacatcataccctccatcttatggtggccctgtgggtggctatgctggtgagggtttg
agtgatgcacggactggtggtcgtggtggacctcctggtggatatgacggtgggtatggt
tctggtggtcctcgaaatcagggaggtggttatggtggtcctcctgttgaagcaccagct
aagatcaagcagtgtgacggcaactgtggggattcttgcgacaactcaagaatatacata
acaaatttgccacctgatgttactattgaagaattaagagacctttttggcggcattgga
caagttggaagaattaagcagaagcgtggctataaagatcaatggccatggaatattaaa
atatacacagatgagaaaggaaaccagaaaggtgatgcagttttgtcttatgaagatcct
caggctgcccactctgctggcggtttctttcacaatcatgtcatgagaggctatgcaatc
ggagtggctatggcagagaagactgcgcccaaagtatatgatcatggaggtggtaaaggt
ggctacggaggtggtggcgacaggcgcagggatagttacagagatggtggttctggtcca
gataggcatcaccatggcggaaatcgttcgcgcccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
