Gossypium raimondii: 105794034
Help
Entry
105794034 CDS
T04129
Name
(RefSeq) pumilio homolog 5
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
gra
Gossypium raimondii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PUF
PUF_NOP9
NABP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105794034
NCBI-ProteinID:
XP_012478451
UniProt:
A0A0D2SFT7
LinkDB
All DBs
Position
3:30354587..30364527
Genome browser
AA seq
1011 aa
AA seq
DB search
MATESPMRMIESNGATKWRSSKDALVFDSQLNDMEVEELTMLLKGQKIRGDQTDTVPNRS
GSAPPSMEGSFTALGNLLAQKNTSLTSSLASLSSVIDKCESEEQLRSHPAYFAYYCSNIN
LNPRLPPPLISHENRRLARHIGGFGSNWRATSVDDSGNGSLPFYRTSLTTHKEEVEDDRS
SPIQALDKWAEDSNEPLLEQDLASFPGRHKSLVDLIQEDFPRTPSPVYSQSRSSGITTAD
DPIDHDVNAISSNFSSINSSSKVPESIVGSSDACMDRNALDAHAISLIPHKDSSETSIQS
SQCPEQVVRLSTSSKNDTNVKDAKSDADSPGDVSQSVILSTVESRMRKKQEAQQSHGRNM
PQEYYSSIQPASPHQAQGLPAQASSQGLSHLYSHSRFSSVASQPLLHSSGLTLPMYATAA
PYMTSANPLYANFQPSGLYASQYNIGGYPMNPAFLPPFMGGYPSHAAISLPFDSTASGSS
FNNRTYGASTGENTPHTSDLQHLGHFYGQHGLVLPPSLVDPLHMQYLPNSFSSTYGASVQ
HGHLSSTGASGGQIDSFVQKESSGAAYIGDPKVQPPINGRLSIPNPGKVGSIGGGFYGGH
HSMGVIAQYPTSPVASPLMPSSPVGGMTPLGRRNETRFPPKAGPHSAWQGQRVSSFEDSK
RHSFLEELKSSNARKFELSDIFGRIVEFSVDQHGSRFIQQKLEHCCIEDKESVYKEVLPH
ASRLMTDVFGNYVIQKFFEHGSCEQRNELADQLVGNMLNFSLQMYGCRVIQKALEVIDLD
KKTRLVQELDGHVMKCVRDQNGNHVIQKCIECIPTDRIGFIISAFRGQVATLSTHPYGCR
VIQRVLEHCSNKLQSKCIIDEILDAAYDLSQDQYGNYVTQHVLERGKPHERSHIISKLTG
KIVQMSQHKYASNVVEKCLEYGDGAEREHLVEEIIGQSDENDSLLTMMKDQFANYVVQKV
LEVSNDRQRELLLDRVRVHLNALKKYTYGKHIAARFEQLLGEESDASASGH
NT seq
3036 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaactgagagcccgatgcgaatgatagaaagtaatggggctacaaagtggcgctct
tcaaaggatgctctagtatttgattcacaattgaatgatatggaagtagaggagttgaca
atgcttttgaaaggacaaaaaatccgtggagatcaaacagatacagtgccaaatcgaagt
gggagtgctccaccaagtatggaaggttcatttacagcacttggaaaccttttggctcaa
aagaacactagcctgacttcaagcctggcaagtttgagcagtgtcattgacaagtgtgag
tctgaggagcaactgcgttctcatccagcttattttgcttactattgctccaacattaac
ttaaatccaaggcttccaccgccccttatttcacatgaaaaccgacgcttggcacgccat
attggtggtttcggtagtaactggagagcaacatctgtggatgatagtggcaatgggtca
ttacctttttatcgaacttcactcactacacataaggaggaagttgaggatgatagatca
tcccctatacaagctttagacaagtgggcagaagatagtaatgagcctttgcttgaacaa
gacttagcatctttccctggtcgccacaagagtttggttgatctgatacaggaagacttc
ccccgcaccccttcacctgtgtatagtcagtcacgttcatcaggcatcaccacagcagat
gacccaatagatcatgatgttaatgccatctcgtcaaatttttcttccattaactcttct
tcaaaagtacctgaatcgatcgtgggttcttctgatgcttgcatggatagaaatgccctg
gatgctcatgctattagtttgataccccacaaggattcttcagagacctctattcagagc
tcgcaatgtcctgaacaggtggttagattatcaacatcttcaaaaaatgatacaaatgtg
aaagatgctaagtcagatgcggattcccctggtgatgtttcacagtctgtcatactttcc
actgtagagtccagaatgaggaaaaaacaagaagcacagcagtctcatggaaggaatatg
cctcaagaatattattcatctattcaaccagcttctccacatcaggcccaaggacttcca
gcacaggccagttctcaaggattgagccatctgtatagccattctaggttctcttctgtg
gcatcacaaccattattgcattcttctggactcacgcttcccatgtatgcaacagcagca
ccatatatgacttctgcaaacccactttatgccaattttcagccatctggtctgtatgct
tcacaatacaatatcggtggatatcccatgaatcctgcatttcttcccccatttatgggc
ggatacccttctcatgctgctatttctttgccatttgactctactgcttctggttcaagc
ttcaataatcgaacttatggtgcttcaactggggaaaacactccacatacaagtgattta
cagcatcttggccacttctatgggcagcatggattagtgctgccaccttccttagtcgat
ccacttcatatgcaatacctcccaaattcgtttagcagcacatatggtgcttctgttcag
catggtcatttgtcatcaactggtgcttctgggggccaaattgattcttttgtgcagaaa
gagtcaagtggtgctgcttatattggagatccaaaagttcagcctccaattaatgggagg
ctaagcattccaaatcctgggaaagttggaagtattggtggtggcttttatggaggtcac
cacagcatgggtgttattgcccaataccctacatcaccagttgctagtccgctgatgcca
tcatcaccggtaggtggaatgactcctctaggtcgcagaaatgaaactagatttcctcca
aaagcaggacctcattctgcatggcaaggacagagagtcagcagctttgaggactccaaa
aggcattcctttcttgaagaactgaaatccagcaatgcccgaaaatttgagctctctgat
atatttggtcgtatagttgaattcagtgttgatcaacatgggagtcgatttatccagcag
aagctggagcattgctgtattgaggacaaggagtctgtttacaaagaagtccttccgcat
gcttcaagattaatgactgatgtttttggtaattacgtcattcaaaagttctttgagcat
gggagttgcgagcagcgaaatgaacttgctgatcaactggttggaaatatgttaaacttt
agtctgcaaatgtatggttgtcgtgtgatacagaaggcgttggaagtgattgatctggat
aaaaaaacccgacttgttcaggagcttgatggtcatgttatgaaatgtgtacgtgatcaa
aatgggaatcacgtcatacaaaagtgtatagagtgtatccctactgatagaattgggttt
attatttcggcatttcgtggtcaagttgccaccctttctactcatccctatggttgtcgt
gtcattcagagagttttggagcattgttcaaacaaactgcaaagtaagtgcatcattgat
gaaattttggatgctgcttacgacctttctcaagatcagtatggaaattatgttacccag
catgttttggagaggggaaagccgcatgaaaggagccacattattagcaagttgactggg
aaaattgtacaaatgagtcaacataaatatgcatcaaatgttgttgagaagtgcttggag
tatggtgatggtgctgaacgagagcatttggttgaggagataatcggacagtctgatgaa
aatgactctttattgactatgatgaaggaccaatttgcaaattatgtggtccagaaggtt
cttgaagtaagcaatgatagacaacgggaactattactggatcgtgtaagagttcatctt
aatgctttgaagaaatatacttacgggaaacacattgctgctaggtttgagcaactgctt
ggtgaagaaagcgatgcctcagcgtcggggcattag
DBGET
integrated database retrieval system