KEGG   Gossypium raimondii: 105794394
Entry
105794394         CDS       T04129                                 
Name
(RefSeq) mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 isoform X1
  KO
K15166  mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23
Organism
gra  Gossypium raimondii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:gra00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:gra03021]
    105794394
Transcription machinery [BR:gra03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Mediator complex
    Other mediators
     105794394
SSDB
Motif
Pfam: Med23
Other DBs
NCBI-GeneID: 105794394
NCBI-ProteinID: XP_012479007
UniProt: A0A0D2PTT9
LinkDB
Position
3:complement(45108384..45120833)
AA seq 1603 aa
MDQTQRSVAAAANSRTYQFHPARAAITDLFNLYLGVRNSRQKADDSVREPPNKTQKRVLA
LNRELPPRNEQFLLDFEQLQTQFGDQDQLQSVTESVLISLVIQCCSHAPRAEFLLFALRS
LCSIGYVNWDTFLPSLLSSVASAEGPVSQGSQGVPSVSSSVSQSGMLPSTSVIANASNFQ
SANAASTLTSVHVIGSPAQSTIEPSSGATLSPVKLSDIACNGQPSTTRMDSSIRDNAISN
LRQLCCKMILTGLECNLKPVTQAEIFHHMLNWLVNWDQRQHGNEECDGKSWRLEKALIEW
LHCCLDVIWLLVEEDKCRVPFYELLRSGLQFIENIPDDEALFTLILEIHRRRDMMAMHMQ
MLDQHLHCPTFGTHRILSQTTPNVSVEGVANLRYSPITYPSVLGEPLHGEDLAASIQRGS
LDWERALRCIRHAIRSTPSPDWWKRVLVVAPFYRGSVPTPGAVFTCDMICEGTIDRIVEL
LKLTNSEINCWQEWLVFSDIFFFLMKSGCIDFVDFIDKLGSRLSASDHHILNTNHVTWLL
AQIIRVEHVMTALNTDSRKVETTRKILSFHREDRSSDPNNPQSILLDFISSCQNLRIWSL
NTSTRDYLNNEQLQKGKQIDEWWRQVSKGERMMDYMSMDDKSIGMFWVVSYTMAQPACET
VMNWLSSGGVTELLPGANVQPNERFMVMREVSPLPISLLSGFSMNLYLKLVFQMEESLFA
GQVVPSIAMVETYTRLLLIAPHSLFRSHFSHLAQRNASLLSKPAVTLLVLEIVNYRLLPL
YRYQGKCKPLMYDVTKIISALKGKRGDHRVFRLAENLCINLILSLRDFFSVKREGKGPTE
FTETLNRITIITLAITIKTRGIADADHLLYLQTMLEQILATSQHRWSEKTLCYFPSILRD
LLMTRTDKRGLAIQEWQQSETTVINQCTQLLSSSTEPNYVMTYLNRSFPQHRQYLCAGAW
ILMQGHPENINSGNLARVLREFSPEEVTSNIYTMVDVLLHHIHIELQHGHSLQDLLLKTC
ANLAFFVWTHELIPLDILLLALIDRDDDPHALRIVISLLDRQELQQRVKLYCMNRGPPEH
WLYTGIFKRSDLQNALGNHLSWKERYPTFFDDIVARLLPVIPLVVYRLIENDAIESADRM
LGMYSLFLAYHPLRFTFVRDILAYFYGHLPGKLIVRILNVLDLSKIPFSESFPQHISSSN
PAICPPPEYFATLLLALVNNVIPPLNSNSRTGSMGDASNNSVRGPHNKTPATPQSGPANA
SEGQKAFYQIQDPGTYTQLVLETAVIEILSLPISASQIVSSLIQIVVNIQPTLIQSSNGL
HGASSGAVQGSVLPTSPSGGSTDSAGRSTPSVSGINTSSFVSRSGYTCQQLSCLFIQACG
LLLAQLPPEFHLQLYMEASRIIKESWWLTDGKRSLSELDSAVSYALLDPTWASQDNTSTA
IGNIVALLHSFFSNLPQEWLEGTHVIIQQLRPVTSVAMLRIAFRIMGPLLPRLVTAHNLF
NKILSLLLNTLVDVFGKNTQPPVPVEASEITDLIDYLHHIIHYEGQAGPVQANSKPRPEV
LSICGRAAESLRPDVQHLLTHLKPDVNSSIYAATHPKIAQNPS
NT seq 4812 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatcaaactcagagatcagtggcagcagctgcaaattcccgaacctaccagttccac
cctgcccgagccgccattaccgatctcttcaatctttacttaggagtaagaaatagccgc
caaaaagctgatgattctgttcgagaaccaccgaacaaaacccaaaagcgtgtgctcgct
cttaatagagagcttcctcctcgaaacgagcagttcctcctagattttgagcaacttcag
actcagtttggtgaccaagatcagttgcagtctgtgacagaatctgttctaatatctttg
gttattcagtgctgtagtcatgcacctcgggcagagtttcttctttttgctttacgtagc
ttatgtagtataggctacgttaattgggatacctttttgccatcccttctttcttcagtt
gcctctgcggaagggccagtaagtcaagggagtcagggagtaccttctgtttcatcaagt
gtatcacaatccgggatgctgccatctactagtgtaattgctaacgcttctaattttcag
tctgcgaatgctgcatctacgttaacttcagttcatgttattgggtctccagcacaatct
acaattgaaccttcttcgggtgctactttgtcccccgtaaaattatctgatattgcctgc
aatggtcaaccatctacaactaggatggattcatctatcagagataatgctataagcaat
ttacgtcagctatgctgcaagatgattttaactgggcttgaatgtaatttgaaaccggtg
actcaagctgaaattttccaccatatgctgaattggttggttaattgggatcaaaggcaa
catgggaatgaagaatgtgatggaaagtcctggagactggagaaggctctaattgaatgg
ctgcactgttgtttggatgtaatttggttgttggttgaggaagataaatgcagagtgccc
ttctatgaattactccgaagcggattgcagtttatagaaaatatcccagacgatgaagca
ttgtttacgcttatcttggaaatacataggaggagagatatgatggctatgcatatgcaa
atgttagaccaacaccttcactgccccacatttggaactcatcggatattgtcacagaca
actcctaacgtttctgttgaaggtgtggcaaacttgcggtattcaccaattacatatcca
agtgtgcttggagaaccacttcatggagaggatcttgcagcttctatccagaggggtagt
ttggactgggagagagccttacgttgtataaggcatgctatacgctctactccttctcct
gattggtggaagcgtgtgcttgttgtggcacctttttatcgaggttcagtgcctactcct
ggtgctgtttttacatgtgatatgatttgcgagggaacaattgatagaattgttgagctt
ttgaagttgacaaattcagaaataaattgctggcaggagtggcttgtcttctcagatata
ttcttctttcttatgaaaagtggatgtatagattttgttgattttattgataagctgggt
tcacgcctttcagcaagtgatcaccacattcttaatacaaatcatgttacctggcttctt
gcacaaatcattcgagttgagcatgtcatgacagctttgaatactgattctagaaaggtg
gagacaacaaggaagattctatcatttcacagagaagataggagctctgatcctaataat
ccccaaagcatcctgcttgattttattagcagttgtcaaaacttacgcatttggtcactg
aatacatcaaccagagactacttgaataatgaacagttgcagaaagggaagcaaatagat
gagtggtggagacaagtgagcaaaggggaacgcatgatggattatatgagtatggatgat
aaatcaattgggatgttttgggttgtctcctacacgatggcgcagccagcttgtgaaacg
gtcatgaattggttatcttctggtggagttacagagttgttacctggagcgaatgtacag
cccaatgagagattcatggtgatgcgggaagttagtccattgcctatttcactgttatct
ggcttttcaatgaatctttatttgaagttggtctttcaaatggaagaatctttatttgct
gggcaggttgttcctagtattgctatggttgaaacatacaccagattgttgctcattgca
cctcattcgttatttcgttcgcacttcagtcatttggcacagaggaatgcttctttattg
agcaagcctgcggtgacacttctggtgcttgaaattgtcaactatcgtctgcttccactg
tacaggtaccaaggaaaatgcaaacctctgatgtatgatgttacaaaaataatttctgct
ttaaaaggaaaacggggggatcaccgtgtatttagattggcagagaatttgtgcataaat
ctgattttgtctttgagagactttttctcggtgaaaagggaagggaaggggcccactgaa
ttcacagaaactttaaatcggataactataatcactcttgccatcaccattaaaactcgc
ggaattgcagatgctgatcacctactttaccttcaaactatgttggaacagatattggca
actagccagcatagatggtcagagaaaacactatgttattttccctctattcttcgagat
ctcttaatgacacggacagacaaaagaggacttgcaattcaagaatggcaacagtcagaa
acaacagtgattaaccaatgcacacaacttctttcatcatccaccgaaccaaattatgtc
atgacctatctcaatcgcagtttccctcaacaccgccaatatctgtgtgctggtgcatgg
atattgatgcaagggcatcctgaaaacattaacagtggaaacttggcacgggtattgaga
gaattttcacctgaagaggtgacatccaatatctatacaatggtggatgtattacttcat
cacattcacatagagctgcagcatgggcattccttgcaggaccttttactgaaaacttgt
gcaaacctggccttttttgtttggacccatgagctgattcctttggatatattgcttcta
gcactcattgaccgtgacgatgatccccatgcgctgcgtattgtgataagcttacttgac
aggcaagagcttcaacaaagggtgaaattatactgtatgaatcgtggcccccctgagcat
tggctttacactggaatatttaagcgcagtgacttgcaaaatgcccttggcaatcatctc
tcatggaaggagaggtatcctacattcttcgatgatattgtggcacgtctgcttccagtc
attcccttagttgtttacagacttattgagaatgatgctatagaatctgctgacaggatg
ttgggcatgtattctctatttttagcttaccaccctttgaggtttacatttgttcgtgac
attcttgcatatttctatggtcatctacctggaaagttaattgttcgaatattgaatgta
ctagatctcagcaagattcctttttctgagtcgttccctcagcacattagttcatcaaat
cctgcaatatgtcccccaccagaatattttgcaactcttttattggctctagtgaataat
gtcatacccccattaaacagtaactcaagaactggatcaatgggagatgcttctaataat
tcagtgcgtggtcctcataataaaacccctgcaacacctcagtctgggccagcgaatgct
tctgaaggtcaaaaggcattctatcaaattcaggacccagggacatatactcagctggtt
ctggaaacagccgttatagagattctctctcttcccatttctgcttctcagattgtgtca
tctcttattcaaattgttgtcaacatacaaccaactctgattcagtccagcaatggattg
catggagcttctagtggtgctgtgcaaggttcagttttaccaacatccccttcaggaggc
agtacagatagtgctggcagatcgactccttcagtgtcagggatcaacacctctagtttt
gtttcccgaagtggttacacttgccaacagctttcatgcttatttatccaagcttgtggt
ttgttgttggctcaactccctcctgagtttcacttacagctttacatggaagcttcacga
ataattaaagagagttggtggctaactgatgggaagagatcactgagtgaactagactct
gctgttagctatgctttgttggatccaacatgggcttcccaagataatacctctacggcc
ataggtaatatagttgcattacttcattctttcttcagtaacctcccacaagaatggcta
gagggaacacatgtcattattcaacagctccggccggtaacatcggttgctatgttgaga
atagcattccggataatgggccccttgcttccaagacttgttactgctcacaatcttttt
aacaagattctatcgttactattgaatacactggtggacgtatttggaaaaaacactcaa
ccgccagtccctgtggaagcatcagaaataacagatctgatcgactaccttcaccatatc
atccactacgaaggacaggcagggccagtgcaagccaacagcaagccgaggccagaggtg
ttgagtatttgtgggagagctgcagaaagtctacggccagatgtacagcatcttttaacc
cacttgaaacctgacgttaactcttcaatatatgctgctacgcatccaaagatagctcag
aatccctcctga

DBGET integrated database retrieval system